| 研究課題/領域番号 |
20700269
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
生体生命情報学
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
志賀 元紀 京都大学, 化学研究所, 助教 (20437263)
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| 研究期間 (年度) |
2008 – 2009
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| 研究課題ステータス |
完了 (2009年度)
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| 配分額 *注記 |
2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2009年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2008年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
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| キーワード | バイオインフォマティクス / 生物ネットワーク / 遺伝子機能解析 / クラスタリング / 教師有り学習 / データ統合 / 遺伝子発現量 / 遺伝子ネットワーク / データマイニング / 頻出パターンマイニング / 統計的検定 / 半教師あり学習 |
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| 研究概要 |
本研究では、生物ネットワークと関連情報を統合的に解析するデータマイニング法を開発した。新たに開発した手法は、複数の相互作用ネットワーク上の遺伝子(ノード)のクラスタリング法および機能予測法、遺伝子発現量とネットワークを統合するクラスタリングに基づく遺伝子機能のアノテーション法、また、統計的なアプローチと頻出パターンの抽出手法を組み合わせることにより相互作用の要素を高速に予測する手法である。
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