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放線菌のゲノム解析を応用した有用物質生産系の構築

研究課題

研究課題/領域番号 20710154
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 応用ゲノム科学
研究機関北里大学

研究代表者

小松 護  北里大学, 北里生命科学研究所, 研究員 (40414057)

研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2009年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2008年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード産業微生物ゲノム / 放線菌 / ゲノム / 応用微生物 / 有用物質生産 / バイオインフォマティクス / Streptomyces avermitilis / アミノグリコシド抗生物質 / ストレプトマイシン / カスガマイシン / リボスタマイシン / 抗生物生産 / ポリケチド抗生物質
研究概要

産業微生物であるS.avermitilisのゲノム再編成により構築したSUKA株の種々の化合物に対する物質生産性試験を行った。SUKA株はアミノグリコシド、ポリケチド、ペプチド、テルペン化合物において生合成遺伝子の供給元の微生物を超える顕著に高い生産性を示した。よって、SUKAは生産性が低い有用な二次代謝産物生産のため異種発現宿主として利用することが期待される。

報告書

(3件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (54件)

すべて 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (42件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Genome-minimized Streptomyces host for the heterologous expression of secondary metabolism.2010

    • 著者名/発表者名
      Komatsu M, Uchiyama T, Omura S, Cane DE, Ikeda H. Komatsu M, Uchiyama T, Omura S, Cane DE, Ikeda H.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 107巻

      ページ: 2646-2651

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] In vitro characterization of the sitespecific recombination system based on actinophage TG1 integrase.2010

    • 著者名/発表者名
      Morita K, Yamamoto T, Fusada N, Komatsu M, Ikeda H, Hirano N, Takahashi H.
    • 雑誌名

      Mol. Genet. Genomics 282巻

      ページ: 607-616

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome-minimized Streptomyces host for the heterologous expression of secondary metabolism.2010

    • 著者名/発表者名
      komatsu M.
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS) 107(6)

      ページ: 2646-2651

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The site-specific recombination system of actinophage TG1.2009

    • 著者名/発表者名
      Morita K, Yamamoto T, Fusada N, Komatsu M, Ikeda H, Hirano N, Takahashi H.
    • 雑誌名

      FEMS Microbiol. Lett. 297巻

      ページ: 234-240

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome mining in Streptomyces avermitilis: A biochemical Baeyer-Villiger reaction and discovery of a new branch of the pentalenolactone family tree.2009

    • 著者名/発表者名
      Jiang J, Tetzlaff CN, Takamatsu S, Iwatsuki M, Komatsu M, Ikeda H, Cane DE.
    • 雑誌名

      Biochemistry 14;48巻

      ページ: 6431-6440

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Antibiotic overproduction by rpsL and rsmG mutants of various actinomycetes.2009

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Y, Komatsu M, Okamoto S, Tokuyama S, Kaji A, Ikeda H, Ochi K.
    • 雑誌名

      Appl. Environ. Microbiol. 75巻

      ページ: 4919-4922

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Antibiotic overproduction by rpsl and rsmG mutants of various actinomycetes.2009

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Y.
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology 75(14)

      ページ: 4919-4922

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome mining in Streptomyces avermitilis : A biochemical Baeyer-Villiger reaction and discovery of a new branch of the pentalenolactone family tree.2009

    • 著者名/発表者名
      Jiang J.
    • 雑誌名

      Biochemistry 14;48(27)

      ページ: 6431-6440

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The site-specific recombination system of actinophage TG1.2009

    • 著者名/発表者名
      Morita K.
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology letters 297(2)

      ページ: 234-240

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] In vitro characterization of the site-specific recombination system based on actinophage TG1 12009

    • 著者名/発表者名
      Morita K.
    • 雑誌名

      Molecular Genetics and Genomics 282(6)

      ページ: 607-616

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 原核細胞生物におけるテルペン合成酵素遺伝子の包括的解析2010

    • 著者名/発表者名
      池田治生
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 分裂酵母におけるアクチノファージTG1部位特異的組換え酵素、インテグラーゼ(TG1 integrase)を用いたゲノムへの遺伝子導入2010

    • 著者名/発表者名
      房田直記
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] アクチノファージTG1の産生するSer型インテグラーゼを用いた迅速なクローニング法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      森田健太郎
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] アクチノファージTG1の産生するSer型インテグラーゼを用いた迅速なクローニング法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      森田健太郎
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 分裂酵母におけるアクチノファージTG1部位特異的組換え酵素、インテグラーゼ(TG1 integrase)を用いたゲノムへの遺伝子導入2010

    • 著者名/発表者名
      房田直記
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 原核細胞生物におけるテルペン合成酵素遺伝子の包括的解析2010

    • 著者名/発表者名
      池田治生
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 16員環マクロライドbafilomycinの生合成研究2010

    • 著者名/発表者名
      沼田淳
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-03-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 16員環マクロライドbafilomycinの生合成研究2010

    • 著者名/発表者名
      沼田淳
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス
    • 年月日
      2010-03-29
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 産業微生物の二次代謝産物生産に対する緊縮制御因子ppGppの応用2010

    • 著者名/発表者名
      小松護
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-03-28
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Streptomyces avermitilisにおける新規テルペン化合物の生産2010

    • 著者名/発表者名
      内山琢麻
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-03-28
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] アクチノファージφK38-1の産生するセリン型インテグレースによる部位特異的組換え系の構築と解析2010

    • 著者名/発表者名
      山下晃代
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-03-28
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] アクチノファージφK38-1の産生するセリン型インテグレースによる部位特異的組換え系の構築と解析2010

    • 著者名/発表者名
      山下晃代
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キヤンパス
    • 年月日
      2010-03-28
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces avermitilisにおける新規テルペン化合物の生産2010

    • 著者名/発表者名
      内山琢麻
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス
    • 年月日
      2010-03-28
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 産業微生物の二次代謝産物生産に対する緊縮制御因子ppGppの応用2010

    • 著者名/発表者名
      小松護
    • 学会等名
      2010年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス
    • 年月日
      2010-03-28
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces avermitilisにおける異種菌株由来テルペン化合物の生産2009

    • 著者名/発表者名
      内山琢麻
    • 学会等名
      2009年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      秋田市
    • 年月日
      2009-07-17
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Streptomyces avermitilisにおけるアミノグリコシド抗生物質の生産2009

    • 著者名/発表者名
      小松護
    • 学会等名
      2009年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      秋田市
    • 年月日
      2009-07-17
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Streptomyces avermitilisにおける異種菌株由来テルペン化合物の生産2009

    • 著者名/発表者名
      内山琢麻
    • 学会等名
      2009年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      秋田ビューホテル(秋田市)
    • 年月日
      2009-07-17
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Streptomyces avermitilisにおけるアミノグリコシド抗生物質の生産2009

    • 著者名/発表者名
      小松護
    • 学会等名
      2009年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      秋田ヒューホテル(秋田市)
    • 年月日
      2009-07-17
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] リファンピシン耐性(rpoB)変異の導入による各種抗生物質生産力の増強と休眠遺伝子の活性化2009

    • 著者名/発表者名
      田中幸徳
    • 学会等名
      2009年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      秋田市
    • 年月日
      2009-07-16
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] リファンピシン耐性(rpoB)変異の導入による各種抗生物質生産力の増強と休眠遺伝子の活性化2009

    • 著者名/発表者名
      田中幸徳
    • 学会等名
      2009年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      秋田ビューホテル(秋田市)
    • 年月日
      2009-07-16
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] アクチノファージTG1インテグラーゼの部位特異的組換えに関わる配列要素の解析2009

    • 著者名/発表者名
      山本智之
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] アクチノファージTG1の産生するSer型インテグラーゼによる部位読的組換え機構の解析2009

    • 著者名/発表者名
      森田健太郎
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 産業利用放線菌を宿主としたアミノグリコシド抗生物質の生産2009

    • 著者名/発表者名
      小松護
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 16員環マクロライドBafilomycinの側鎖生合成遺伝子の解析2009

    • 著者名/発表者名
      沼田淳
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 16員環マクロライドBafilomycinの生合成遺伝子群の解析2009

    • 著者名/発表者名
      奈良綾子
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 産業利用放線菌を宿主としたアミノグリコシド抗生物質の生産2009

    • 著者名/発表者名
      小松護
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 16員環マクロライドBafilomycinの生合成遺伝子群の解析2009

    • 著者名/発表者名
      奈良綾子
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 16員環マクロライドbafilomycinの側鎖生合成遺伝子の解析2009

    • 著者名/発表者名
      沼田淳
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] アクチノファージTG1の産生するSer型インテグラーゼによる部位特異的組換え機構の解析2009

    • 著者名/発表者名
      森田健太郎
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] アクチノファージTG1インテグラーゼの部位特異的組換えに関わる配列要素の解析2009

    • 著者名/発表者名
      山本智之
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 異なったストレプトマイシン耐性変異(rsmG及びrpsL)導入による放線菌の抗生物質生産性の増強2009

    • 著者名/発表者名
      田中幸徳
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-28
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Streptomyces avermitilisの生産するzizaene類の生合成解析2009

    • 著者名/発表者名
      高松智
    • 学会等名
      日本薬学会第128年会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2009-03-28
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 異なったストレプトマイシン耐性変異(rsmF及びrpsL)導入による放線菌の抗生物質生産性の増強2009

    • 著者名/発表者名
      田中幸徳
    • 学会等名
      2009年度日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 年月日
      2009-03-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Identification of genes for bacterial monoterpene biosynthesis.2008

    • 著者名/発表者名
      Komatsu M
    • 学会等名
      UK-Japan Workshop 2008, Genomics ofAntibiotic producing Actinomycetes: Implications and Applications
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-11-01
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Identification of genes for bacterial monoterpene biosynthesis2008

    • 著者名/発表者名
      小松護
    • 学会等名
      UK-Japan Workshop 2008, Genomics of Antibiotic-producing Actinomycetes : Implications and Applications
    • 発表場所
      東京都市ケ谷
    • 年月日
      2008-11-01
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 微生物ゲノムデーターベースからの異種物質(2-methylisobomeol)生合成遺伝子の同定2008

    • 著者名/発表者名
      小松護
    • 学会等名
      2008年度グラム陽性細菌のゲノム生物学研究会
    • 発表場所
      東京都代々木
    • 年月日
      2008-09-06
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 16員環マクロライドBafilomycinの生合成遺伝子群の解析2008

    • 著者名/発表者名
      奈良綾子
    • 学会等名
      2008年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      山梨市
    • 年月日
      2008-07-11
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 16員環マクロライドBafilomycinの生合成遺伝子群の解析2008

    • 著者名/発表者名
      奈良綾子
    • 学会等名
      2008年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      山梨県山梨市
    • 年月日
      2008-07-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ストレプトマイシン弱耐性変異rsmG導入によるStreptomyces属の二次代謝の変化2008

    • 著者名/発表者名
      田中幸徳
    • 学会等名
      2008年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      山梨市
    • 年月日
      2008-07-10
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 微生物ゲノムデーターベースからの異臭物質(2-methylisoborneol)生合成遺伝子の同定2008

    • 著者名/発表者名
      小松護
    • 学会等名
      2008年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      山梨市
    • 年月日
      2008-07-10
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ストレプトマイシン弱耐性変異rsmG導入によるStreptomyces属の二次代謝能の変化2008

    • 著者名/発表者名
      田中幸徳
    • 学会等名
      2008年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      山梨県山梨市
    • 年月日
      2008-07-10
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 微生物ゲノムデーターベースからの異種物質(2-methyhsobomeol)生合成遺伝子の同定2008

    • 著者名/発表者名
      小松護
    • 学会等名
      2008年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      山梨県山梨市
    • 年月日
      2008-07-10
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://avermitilis.ls.kitasato-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://avermitilis.ls.kitasato-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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