不安定化塩基対に選択的に結合する新規低分子リガンドの開発

• 研究課題/領域番号: 20710179
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物分子科学
• 研究機関: 独立行政法人産業技術総合研究所
• 研究代表者: 小島 直 独立行政法人産業技術総合研究所, ゲノムファクトリー研究部門, 主任研究員 (30356985)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2009年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2008年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: 塩基対 / ミスマッチ塩基対 / 損傷塩基 / 検出 / 低分子リガンド / 疎水性相互作用 / 親水性相互作用 / 合成化学 / 分子認識 / 遺伝子 / 核酸

研究概要

本研究では、ミスマッチ塩基対や損傷塩基対のようなDNA二本鎖内に生じる不安定化された部位に対して、選択的に結合する低分子リガンドの開発を目指した。その結果、リガンドへの芳香族基の導入、および陽電荷基の導入がいずれも脱塩基部位への結合を向上させることを示し、脱塩基部位に対して高選択的に結合する小分子リガンドの開発を達成した。

研究成果

• [雑誌論文] Construction of highly reactive probes for abasic site detection by introduction of an aromatic and a guanidine residue into an aminooxy group (2009)
  • 著者名/発表者名: Kojima, N., Takebayashi, T., Mikami, A., Ohtsuka, E., Komatsu, Y.
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc. 131 ページ: 13208-13209
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient synthesis of oligonucleotide conjugates on solid-support using an (aminoethoxycarbonyl)- aminohexyl group for 5'-terminal modification (2009)
  • 著者名/発表者名: Kojima, N., Takebayashi, T., Mikami, A., Ohtsuka, E., Komatsu, Y.
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem. Lett. 19 ページ: 2144-2147
  • 査読あり
• [雑誌論文] Construction of highly reactive probes for abasic site detection by introduction of an aromatic and a guanidine residue into an aminooxy group (2009)
  • 著者名/発表者名: Naoshi Kojima
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 131 ページ: 13208-13209
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient synthesis of oligonucleotide conjugates on solid-support using an (aminoethoxycarbonyl)aminohexyl group for 5'-terminal modification (2009)
  • 著者名/発表者名: Naoshi Kojima
  • 雑誌名: Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 19 ページ: 2144-2147
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of novel chemical probes to detect abasic sites in DNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Naoshi Kojima
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symposium Series 53 ページ: 45-46
• [雑誌論文] Comparison of the chemical properties of a novel amino-linker with various amino modifications (2008)
  • 著者名/発表者名: Kojima, N., Takebayashi, T., Mikami, A., Sugino, M., Ohtsuka, E., Komatsu, Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser. 52 ページ: 463-464
• [雑誌論文] Construction of an aminooxy derivative for RNA and DNA labeling (2008)
  • 著者名/発表者名: Komatsu, Y., Kojima, N., Takebayashi, T., Mikami, A., Sugino, M., Ohtsuka, E.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser. 52 ページ: 393-394
• [雑誌論文] Comparison of the chemical properties of a novel amino-linker with various aminomodifications (2008)
  • 著者名/発表者名: Kojima, N.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symposium Series 52 ページ: 463-464
• [雑誌論文] Construction of an aminooxy derivative for RNA and DNA labeling (2008)
  • 著者名/発表者名: Kojima, N.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symposium Series 52 ページ: 393-394
• [学会発表] DNA脱塩基部位に高効率で反応する試薬の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小島直、小松知志恵、三上暁子、大塚榮子、小松康雄
  • 学会等名: 日本環境変異原学会第38回大会
  • 発表場所: 静岡県清水市
  • 年月日: 2009-11-26
• [学会発表] Development of novel chemical probes to detect abasic sites in DNA (2009)
  • 著者名/発表者名: 小島直、小松知志恵、三上暁子、大塚榮子、小松康雄
  • 学会等名: 第6回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: 岐阜県高山市
  • 年月日: 2009-09-29
• [学会発表] Development of novel chemical probes to detect abasic sites in DNA (2009)
  • 著者名/発表者名: 小島直
  • 学会等名: 6^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry and 36^<th> Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 岐阜県高山市
  • 年月日: 2009-09-29
• [学会発表] 新規アミノ化試薬の開発と, 固相上でのオリゴヌクレオチド修飾反応への応用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小島直、小松知志恵、三上暁子、杉野麻衣子、大塚榮子、小松康雄
  • 学会等名: 第18回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 岐阜県岐阜市
  • 年月日: 2008-11-17
• [学会発表] 新規アミノ化試薬の開発と、固相上でのオリゴヌクレオチド修飾反応への応用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小島直
  • 学会等名: 第18回アンチセンスシンポジウム
  • 発表場所: 岐阜大学
  • 年月日: 2008-11-17
• [学会発表] Comparison of the chemical properties of a novel amino-linker with various amino modifications (2008)
  • 著者名/発表者名: 小島直、小松知志恵、三上暁子、杉野麻衣子、大塚榮子、小松康雄
  • 学会等名: 第35回核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2008-09-11
• [学会発表] Construction of an aminoxy derivative for RNA and DNA labeling (2008)
  • 著者名/発表者名: 小松康雄、小島直、小松知志恵、三上暁子、杉野麻衣子、大塚榮子
  • 学会等名: 第35回核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2008-09-11
• [学会発表] Comparison of the chemical properties of a novel amino-linker with various aminomodifications (2008)
  • 著者名/発表者名: 小島直
  • 学会等名: 第35回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2008-09-11
• [学会発表] Construction of an aminooxy for RNA and DNA kabeling (2008)
  • 著者名/発表者名: 小松康雄
  • 学会等名: 第35回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2008-09-11
• [備考]
  • URL: http://unit.aist.go.jp/bpri/bpri-bimo/index.html