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RNAの単分子発現解析をめざしたナノ構造体の構築とAFM観察

研究課題

研究課題/領域番号 20750126
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生体関連化学
研究機関東京大学

研究代表者

葛谷 明紀  東京大学, 大学院・工学系研究科, 助教 (00456154)

研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2009年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2008年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードDNA / ナノ構造体 / タンパク / ナノアレイ / ストレプトアビジン / ナノテクノロジー / DNAナノテクノロジー / DNA Origami / AFM / mRNA / 発現解析 / 選択的切断
研究概要

長鎖の一本鎖DNAを折りたたんで自在な二次元ナノ構造体を作成するDNA Origamiの技術を応用し、ナノメートルサイズのウェルが複数組み込まれた200nm x 35nmの棒状ナノ構造体の作成を行った。ウェルの中にビオチンを2分子修飾することで、構造体内の全てのウェルを区別しながら、望みの位置、数のウェルのみにストレプトアビジンを取り込み、従来にない精密、かつ強固なタンパクナノアレイの作成に成功した。

報告書

(3件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (27件)

すべて 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 12件) 学会発表 (14件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] DNA Origami: Fold, Stick, and Beyond2010

    • 著者名/発表者名
      Akinori Kuzuya, Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Nanoscale 2

      ページ: 310-322

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNA Origami : Fold, Stick, and Beyond2010

    • 著者名/発表者名
      KUZUYA, Akinori, KOMIYAMA, Makoto
    • 雑誌名

      Nanoscale 2

      ページ: 310-322

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Asymmetric Secondary and Tertiary Streptavidin/DNA Complexes Selectively Formed in a Nanometer-Scale DNA Well2010

    • 著者名/発表者名
      NUMAJIRI, Kentaro, KUZUYA, Akinori, KOMIYMA, Makoto
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry 21

      ページ: 338-344

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Precise Site-Selective Termination of DNA Replication by Caging The 3-Position of Thymidine and Its Application to Polymerase Chain Reaction2009

    • 著者名/発表者名
      Akinori Kuzuya, Fuminori Okada, Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chem. 20

      ページ: 1924-1929

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Design and Construction of a Box-Shaped 3D-DNA Origami2009

    • 著者名/発表者名
      Akinori Kuzuya, Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      ページ: 4182-4184

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Precisely Programmed and Robust 2D Streptavidin Nanoarray Using Periodical Nanometer-Scale Wells in DNA Origami Assembly2009

    • 著者名/発表者名
      Akinori Kuzuya, Mayumi Kimura, Kentaro Numajiri, Naohiro Koshi, Toshiyuki Ohnishi, Fuminori Okada, Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      ChemBioChem 10

      ページ: 1811-1815

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient Site-selective RNA Activation and Scission Achieved by Geometry Control of Acridine Intercalation in RNA/DNA Heteroduplex2009

    • 著者名/発表者名
      Akinori Kuzuya, Yun Shi, Keita Tanaka, Kenzo Machida, Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Chem. Lett. 38

      ページ: 432-433

    • NAID

      10025121696

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Design and Construction of a Box-Shaped 3D-DNA Origami2009

    • 著者名/発表者名
      KUZUYA, Akinori, KOMIYAMA, Makoto
    • 雑誌名

      Chemical Communications 1

      ページ: 4182-4184

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Precisely Programmed and Robust 2D Streptavidin Nanoarrays by Using Periodical Nanometer-Scale Wells Embedded in DNA Origami Assembly2009

    • 著者名/発表者名
      KUZUYA, Akinori, 他6名
    • 雑誌名

      ChemBioChem 10

      ページ: 1811-1815

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effcient Site-selective RNA Activation and Scission Achieved by Geometry Control of Acridine Intercalation in RNA/DNA Heteroduplex2009

    • 著者名/発表者名
      KUZUYA, Akinori
    • 雑誌名

      Chemistry Letters 38

      ページ: 432-433

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single-Molecule Accommodation of Streptavidin in Nanometer-Scale Wells Formed in DNA Nanostructures2008

    • 著者名/発表者名
      Akinori Kuzuya, Kentaro Numajiri, Mayumi Kimura, Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp. Ser. 52

      ページ: 681-682

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single-Molecule Accommodation of Streptavidin in Nanometer-Scale Wells Formed in DNA Nanostructures2008

    • 著者名/発表者名
      KUZUYA, Akinori
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symposium Series 52

      ページ: 681-682

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] DNA Origamiによる箱形三次元ナノ構造体の作成2010

    • 著者名/発表者名
      葛谷, 明紀
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      近畿大学
    • 年月日
      2010-03-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA Ohgami による箱形三次元ナノ構造体の作成2010

    • 著者名/発表者名
      葛谷, 明紀
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      近畿大学
    • 年月日
      2010-03-29
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] DNA origamiを足場にした機能性ナノマテリアルの選択的固定化2009

    • 著者名/発表者名
      葛谷, 明紀
    • 学会等名
      計測自動制御学会システム・情報部門学術講演会2009
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2009-11-26
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA origami を足場にした機能性ナノマテリアルの選択的固定化2009

    • 著者名/発表者名
      葛谷, 明紀
    • 学会等名
      計測自動制御学会システム・情報部門学術講演会2009
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2009-11-26
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] DNAナノ構造体に組み込んだナノメートルサイズのウェルへのゲスト分子の選択的取り込み2009

    • 著者名/発表者名
      葛谷, 明紀
    • 学会等名
      第58回高分子討論会
    • 発表場所
      熊本大学
    • 年月日
      2009-09-18
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書 2009 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA origamiによるナノメートルサイズの箱の作製2009

    • 著者名/発表者名
      葛谷, 明紀
    • 学会等名
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2009-09-14
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA origami によるナノメートルサイズの箱の作製2009

    • 著者名/発表者名
      葛谷明紀
    • 学会等名
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2009-09-14
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ナノメートルサイズのウェルを組み込んだDNA origamiの構築とゲスト分子のサイズ選択的取り込み2009

    • 著者名/発表者名
      葛谷, 明紀
    • 学会等名
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2009-09-13
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ナノメートルサイズのウェルを組み込んだDNA origami の構築とゲスト分子のサイズ選択的取り込み2009

    • 著者名/発表者名
      葛谷明紀
    • 学会等名
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2009-09-13
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Streptavidin nanoarray formed on a tape-like DNA nanostructure equipped with nanometer-sized wells2009

    • 著者名/発表者名
      KUZUYA, Akinori
    • 学会等名
      FNANO2010
    • 発表場所
      Snowbird, Utah, USA
    • 年月日
      2009-04-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書 2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ナノメートルサイズのウェルを複数組み込んだDNA Origamiの構築とタンパクナノアレイ作成への応用2009

    • 著者名/発表者名
      葛谷, 明紀
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス
    • 年月日
      2009-03-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] DNAで作ったナノメートル空問内におけるストレプトアビジンの選択的DNA修飾2009

    • 著者名/発表者名
      沼尻, 健太郎
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス
    • 年月日
      2009-03-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] DNAで作ったナノメートル空間内におけるストレプトアビジンの選択的DNA修飾2008

    • 著者名/発表者名
      沼尻, 健太郎
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部
    • 年月日
      2008-03-30
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ナノメートルサイズのウェルを複数組み込んだDNA Origamiの構築とタンパクナノアレイ作成への応用2008

    • 著者名/発表者名
      葛谷, 明紀
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部
    • 年月日
      2008-03-30
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.mkomi.rcast.u-tokyo.ac.jp/member/kuzuya.htm

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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