原生生物有中心粒太陽虫のEST解析

• 研究課題/領域番号: 20770062
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 長崎大学
• 研究代表者: 坂口 美亜子 長崎大学, 熱帯医学研究所, 助教 (50400651)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2009年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2008年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 分子系統 / 原生生物 / 太陽虫 / 最尤法 / 分子進化

研究概要

Raphidiophrys contractilisのcDNAライブラリを用いたパイロシーケンスによるランダムなクローンの遺伝子配列決定を行った。これらのうち、127遺伝子配列によるデータセットを用いて分子系統解析を行った結果、R. contractilisはTelonema subtilisやcryptomonad、haptophyteと共に単系統を形成した。また、この単系統グループはStramenopiles、Alveolates、Rhizariaと姉妹群となることが示された。以上の解析の結果から、有中心粒太陽虫はchromalveolateスーパーグループに近縁性を持つことが示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Tracing back EFL gene evolution in the cryptomonads-haptophytes assemblage: Separate origins of EFL genes in haptophytes, photosynthetic cryptomonads, and goniomonads. (2009)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi M, Takishita K, Matsumoto T, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: Gene 441(1-2) ページ: 126-131
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene sampling can bias multi-gene phylogenetic inferences: the relationship between red algae and green plants as a case study. (2009)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y, Nakajima Y, Sato M, Sakaguchi M, Hashimoto T
  • 雑誌名: Mol Biol Evol 26(5) ページ: 1171-1178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Large-scale phylogenomic analyses reveal that two enigmatic protist lineages, Telonemia and Centroheliozoa, are related to photosynthetic chromalveolates. (2009)
  • 著者名/発表者名: Burki F, Inagaki Y, Brate J, Archibald JM, Keeling PJ, Cavalier-Smith T, Sakaguchi M, Hashimoto T, Horak A, Kumar S, Klaveness D, Jakobsen K, Pawlowski J, Shalchian-Tabrizi K
  • 雑誌名: Genome Biol Evol 1 ページ: 231-238
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tracing back EFL gene evolution in the cryptomonads-haptophytes assemblage : Separate origins of EFL genes in haptophytes, photosynthetic cryptomonads, and goniomonads (2009)
  • 著者名/発表者名: M.Sakaguchi, K.Takishita, T.Matsumoto, T.Hashimoto, Y.Inagaki
  • 雑誌名: Gene 441 ページ: 126-131
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene sampling can bias multi-gene phylogenetic inferences : the relationship between red algae and green plants as a case study (2009)
  • 著者名/発表者名: Inagaki Y, Nakajima Y, Sato M, Sakaguchi M, Hashimoto T
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 26 ページ: 1171-1178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Large-scale phylogenomic analyses reveal that two enigmatic protist lineages, Telonemia and Centroheliozoa, are related to photosynthetic chromalveolates (2009)
  • 著者名/発表者名: Burki F, Inagaki Y, Brate J, Archibald JM, Keeling PJ, Cavalier-Smith T, Sakaguchi M, Hashimoto T, Horak A, Kumar S, Klaveness D, Jakobsen K, Pawlowski J, Shalchian-Tabrizi K
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 1 ページ: 231-238
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tracing back EFL gene evolution in the cryptomonads-haptophy tes assemblage : Separate origins of EFL genes in haptophytes, photosynthetic cryptomonads, and goniomonads (2009)
  • 著者名/発表者名: M. Sakaguchi, K. Takishita, T. Matsumoto, T. Hashimoto, Y. I nagaki
  • 雑誌名: Gene (印刷中)(掲載確定)
  • 査読あり
• [学会発表] 遺伝子データ解析によるテロネマ類と有中心粒太陽虫の系統的位置 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲垣祐司, Fabien Burki, Jon Brate, John Archibald, Patrick Keeling, Thomas Cavalier-Smith, 坂口美亜子, 橋本哲男, Ales Horak Ales Horak, Dag Klaveness, Kjetill Jakobsen, Jan Pawlowski, Kamran Shalchian-Tablizi
  • 学会等名: 日本進化原生生物研究会
  • 発表場所: 仙台市・宮城教育大学
  • 年月日: 2009-07-05
• [学会発表] Updating the distribution of elongation factor-like genes in eukaryotes (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Sakaguchi, K. Takishita, T. Matsumoto, T. Hashimoto, Y. Inagaki
  • 学会等名: International society for evolutionary protistology
  • 発表場所: カナダ・ハリファックス大学
  • 年月日: 2008-07-23
• [学会発表] Updating the distribution of elongation factor-like genes in euk aryotes (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Sakaguchi, K. Takishita, T. Matsumoto, T. Hashimoto, Y. I nagaki
  • 学会等名: International society for evolutionary proti stology
  • 発表場所: カナダ・ハリファックズ大学
  • 年月日: 2008-07-23