細胞質ダイニンのストークドメインの構造研究

• 研究課題/領域番号: 20770118
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 志波 智生 東京大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (80401206)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2009年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2008年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: モーター蛋白質 / X 線結晶構造解析 / 多波長異常分散法 / セレノメチオニン / ダイニン / 微小官 / X線結晶構造解析

研究概要

モータ蛋白質であるダイニンの微小管の認識メカニズムを明らかにするためにマウスダイニンストークドメインの結晶化条件の探索を行ったところ、単結晶を得ることに成功した。セレノメチオニン化した蛋白質を作成し、多波長異常分散法で解析を行ったところcoiled-coilの領域の部分構造を得ることができた。得られた部分構造は、報告されている構造と比較するとセレンの異常分散効果から計算されるメチオニン残基の位置がずれていることが明らかになった。

研究成果

• [雑誌論文] Overproduction, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of Trypanosoma brucei gambiense glycerol kinase (2010)
  • 著者名/発表者名: Balogun, E.O., Inaoka, D.K., Kido, Y., Shiba, T., Nara, T., Aoki, T., Honma, T., Tanaka, A., Inoue, M., Matsuoka, Michels, P.S., Harada, S., Kita, K.
  • 雑誌名: Acta Cryst F66 ページ: 304-308
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of cyanide-insensitive alternative oxidase from Trypanosoma brucei brucei (2010)
  • 著者名/発表者名: Kido, Y., Shiba, T., Inaoka, D.K., Sakamoto, K., Nara, T., Aoki, T., Honma, T., Tanaka, A., Inoue, M., Matsuoka, S., Moore, A., Harada, S., Kita, K.
  • 雑誌名: Acta Cryst F66 ページ: 275-278
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of cyanide-insensitive alternative oxidase from Trypanosoma brucei brucei (2010)
  • 著者名/発表者名: Yasutoshi Kido
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F F66 ページ: 275-278
  • 査読あり
• [雑誌論文] Overproduction, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of Trypanosoma brucei gambiense glycerol kinase (2010)
  • 著者名/発表者名: Emmanuel Oluwadare Balogun
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F F66 ページ: 304-308
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional importance of Crenarchaeaspecific extra-loop revealed by an X-ray structure of a hetero-tetrameric crenarchaeal splicing endonuclease (2009)
  • 著者名/発表者名: Yoshinari1, S., Shiba, T., Inaoka, D.K., Itoh, T., Kurisu, G., Harada, S., Kita, K., Watanabe, Y.
  • 雑誌名: Nucleic. Acids Res. 37 ページ: 4787-4798
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray studies of the chromophore-binding domain of cyanobacteriochrome AnPixJ from Anabaena sp. PCC 7120 (2009)
  • 著者名/発表者名: Narikawa, R., Muraki, N., Shiba, T., Ikeuchi, M., Kurisu, G.
  • 雑誌名: Acta Cryst F65 ページ: 159-162
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional importance of Crenarchaea-specific extra-loop revealed by an X-ray structure of a hetero-tetrameric crenarchaeal splicing endonuclease (2009)
  • 著者名/発表者名: Shigeo Yoshinaril
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 37 ページ: 4787-4798
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray studies of the chromophorebinding domain of (2009)
  • 著者名/発表者名: Rei Narikawa, Norifumi Muraki, T
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F F65 ページ: 159-162
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structures of Trypanosoma cruzi Dihydroorotate Dehydrogenase Complexed with Substrates and Products: Atomic Resolution Insights into Mechanisms of Dihydroorotate Oxidation and Fumarate Reduction (2008)
  • 著者名/発表者名: Inaoka, D.K., Sakamoto, K., Shimizu, H., Shiba, T., Kurisu, G., Nara, T., Aoki, T., Kita, K., Harada, S.
  • 雑誌名: Biochemistry 47 ページ: 10881-10891
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structures of Trypanosoma cruzi Dihydroorotate Dehydrogenase Complexed with Su (2008)
  • 著者名/発表者名: Daniel Ken Inaoka, Kimitoshi Sak
  • 雑誌名: Biochemistry 47 ページ: 10881-10891
  • 査読あり
• [学会発表] Crystallographic studies of ferredoxin-NAD(P)+ reductase from Chlorobium tepidum (2008)
  • 著者名/発表者名: Shiba, T., Muraki, N., Seo, D., Sakurai, T., Kurisu, G.
  • 学会等名: 第21回国際結晶学会議
  • 発表場所: 大阪国際会議場
  • 年月日: 2008-08-29
• [学会発表] Crystallographic studies of ferredoxinNAD(P)+ reductase from Chlorobium tepidum (2008)
  • 著者名/発表者名: Tomoo Shiba , Norifumi Muraki, D
  • 学会等名: The International Union of Crystallography (IUCr) 2008
  • 発表場所: 大阪