DNA修復における損傷・ミスマッチ部位認識機構の1分子イメージング

• 研究課題/領域番号: 20770131
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 横田 浩章 京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 講師 (90415547)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2009年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2008年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 1分子計測(SMD) / 超精密計測 / ナノバイオ / 分子認識 / 核酸

研究概要

DNA修復機構の素過程を1分子レベルで解明することを目的とし、大腸菌のヌクレオチド除去修復、ミスマッチ修復でDNA損傷除去に重要な役割を果たしているヘリケースを中心に、修復タンパク質群の遺伝子のクローニング、発現、精製を行い、蛍光標識、基質DNAの作製、1分子観察系の確立を行った。これらをもとに、DNA-タンパク質間、タンパク質-タンパク質間相互作用の1分子イメージングを行い、ヘリケースのDNAへの結合モード、会合状態を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Single-molecule visualization of binding modes of helicase to DNA on PEGylated surfaces. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yokota, H., Han Y.W., Allem, J. -F., Xi, X.G., Bensimon, D., Croquette, V., Ito, Y., Harada, Y.
  • 雑誌名: Chem. Lett. 38 ページ: 308-309
  • NAID: 10025120568
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single-molecule Visualization of Binding Modes of Helicase to DNA on PEGylated Surfaces (2009)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Yokota
  • 雑誌名: Chemistry Letters 38 ページ: 308-309
  • NAID: 10025120568
  • 査読あり
• [学会発表] Single-Molecule Visualization of the Oligomeric form of Escherichia coli UvrD helicase in vitro (2010)
  • 著者名/発表者名: Yokota H.
  • 学会等名: International Symposium on Hydration and ATP Energy
  • 発表場所: Hotel Iwanumaya, Akiu, Sendai, Japan
  • 年月日: 2010-03-09
• [学会発表] Single-Molecule Visualization of the Oligomeric Form of Escherichia coli UvrD Helicase In Vitro (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Yokota
  • 学会等名: International Symposium on Hydration and ATP Energy
  • 発表場所: Hotel Iwanumaya(仙台市)
  • 年月日: 2010-03-09
• [学会発表] Single-molecule visualization of the oligomeric form of Escherichia coli UvrD helicase in vitro (2010)
  • 著者名/発表者名: Yokota H.
  • 学会等名: Biophysical Society 54th Annual Meeting
  • 発表場所: Moscone Center (サンフランシスコ)
  • 年月日: 2010-02-22
• [学会発表] Single-Molecule Visualization of the Oligomeric Form of Escherichia coli UvrD Helicase In Vitro (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Yokota
  • 学会等名: Biophysical Society 54th Annual Meeting
  • 発表場所: Moscone Center(サンフランシスコ)
  • 年月日: 2010-02-22
• [学会発表] Single-molecule observation of DNA/helicase interactions. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yokota, H.
  • 学会等名: The 13th Membrane Research Forum & The 6th iCeMS International Symposium Featuring Nan-Meso Membrane Mechanisms
  • 発表場所: ホテルフジタ京都(京都市)
  • 年月日: 2010-01-28
• [学会発表] Single-molecule observation of DNA/helicase interactions (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Yokota
  • 学会等名: The 13th Membrane Research Forum & The 6th iCeMS International Symposium Featuring Nan-Meso Membrane Mechanisms
  • 発表場所: ホテルフジタ京都
  • 年月日: 2010-01-28
• [学会発表] Single-molecule observation of DNA-helicase interactions. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yokota, H.
  • 学会等名: 第47回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: アスティ徳島(徳島市)
  • 年月日: 2009-11-01
• [学会発表] Single-molecule observation of DNA-helicase interactions (2009)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Yokota
  • 学会等名: 第47回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: アスティ徳島
  • 年月日: 2009-11-01
• [学会発表] Single-molecule imaging of DNA-protein interactions (2009)
  • 著者名/発表者名: Yokota, H.
  • 学会等名: 第5回阪大ナノサイエンス・ナノテクノロジー国際シンポジウム
  • 発表場所: 大阪大学銀杏会館(吹田市)
  • 年月日: 2009-09-02
• [学会発表] Single-molecule imaging of DNA-protein interactions (2009)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Yokota
  • 学会等名: 第5回阪大ナノサイエンス・ナノテクノロジー国際シンポジウム
  • 発表場所: 大阪大学
  • 年月日: 2009-09-02
• [学会発表] マイクロビーズとマイクロ流路を組み合わせた新規プロテインアレイの開発」科研費・特定領域研究・「マルチスケール操作によるシステム細胞工学(バイオ操作)」 (2009)
  • 著者名/発表者名: 横田浩章
  • 学会等名: 第7回公開シンポジウム
  • 発表場所: 東京エレクトロンホール宮城
  • 年月日: 2009-03-06
• [学会発表] マイクロビーズとマイクロ流路を組み合わせた新規プロテインアレイの開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 横田浩章
  • 学会等名: 科研費・特定領域研究・「マルチスケール操作によるシステム細胞工学(バイオ操作)」第7回公開シンポジウム
  • 発表場所: 東京エレクトロンホール宮城
  • 年月日: 2009-03-06
• [学会発表] DNAヘリカーゼUvrDの機能単位の1分子解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 横田浩章
  • 学会等名: 2009年生体運動研究合同班会議
  • 発表場所: 東京大学・数理科学研究科棟・大講義室(目黒区)
  • 年月日: 2009-01-11
• [学会発表] DNAヘリカーゼUvrDの機能単位の1分子解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 横田浩章
  • 学会等名: 2009年生体運動研究合同班会議
  • 発表場所: 東京大学・数理科学研究科棟
  • 年月日: 2009-01-11
• [学会発表] 同時計測顕微鏡によるDNA-ヘリカーゼ相互作用の1分子観察 (2008)
  • 著者名/発表者名: Yokota, H.
  • 学会等名: 日本生物物理学会第46回年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡市)
  • 年月日: 2008-12-04
• [学会発表] 同時計測顕微鏡によるDNA-ヘリカーゼ相互作用の1分子観察 (2008)
  • 著者名/発表者名: 横田浩章
  • 学会等名: 日本生物物理学会第46回年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2008-12-04
• [学会発表] Single-molecule observation of DNA/helicase interaction. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yokota, H.
  • 学会等名: The GRC on Single Molecule Approaches to Biology Colby-Sawyer College
  • 発表場所: NH, USA
  • 年月日: 2008-08-21
• [学会発表] Single-molecule observation of DNA/helicase interaction (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Yokota
  • 学会等名: The GRC on Single Molecule Approaches to Biology
  • 発表場所: Colby-Sawyer College (NH, USA)
  • 年月日: 2008-08-21
• [産業財産権] 蛍光顕微鏡装置 (2010)
  • 発明者名: 白川昌宏、原田慶恵、横田浩章、吉成洋祐、辻成悟
  • 権利者名: 国立大学法人京都大学、日本電子株式会社
  • 産業財産権番号: 2010-021619
  • 出願年月日: 2010-02-02
• [産業財産権] 蛍光顕微鏡装置 (2010)
  • 発明者名: 白川昌宏, 原田慶恵, 横田浩章, 吉成洋祐, 辻成悟
  • 権利者名: 国立大学法人京都大学、日本電子株式会社
  • 産業財産権番号: 2010-021619
  • 出願年月日: 2010-02-02