大腸菌低分子RNAによる遺伝子発現抑制系の解析

• 研究課題/領域番号: 20770137
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 森田 鉄兵 鈴鹿医療科学大学, 薬学部・薬学科, 助手 (10444366)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2009年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2008年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: 小分子RNA / mRNA抑制 / 転写後制御 / 大腸菌 / 低分子RNA / 遺伝子発現制御

研究概要

本研究は大腸菌低分子RNA (small RNA : sRNA)による遺伝子発現抑制系を詳細に解明することを目的にする。SgrS sRNAは標的であるptsG mRNAに塩基対形成により作用し、ptsG mRNAの翻訳阻害、および不安定化を誘起する。本研究により、SgrS/ ptsG mRNA間の塩基対形成がptsG mRNAの翻訳阻害に十分であることを見いだした。またptsG mRNAの翻訳阻害に十分なSgrS/ ptsG mRNA間塩基対の最小領域を明らかにした。これらの結果は、原核生物に広く存在するHfq結合型sRNAの作動原理の解明につながる。

研究成果

• [雑誌論文] A minimal base-pairing region of a bacterial small RNA SgrS required for translation repression of ptsG mRNA (2010)
  • 著者名/発表者名: 牧貴美香、森田鉄兵、大鷹弘紀、饗場弘二
  • 雑誌名: Molecular Microbiology ページ: 782-792
  • 査読あり
• [雑誌論文] A minimal base-pairing region of a bacterial small RNA SgrS required for translational repression of ptsG mRNA (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki, K., Morita, T., Otaka, H., Aiba, H.
  • 雑誌名: Mol.Microbiol. 76 ページ: 782-792
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Plasmodium HU homolog, which binds the plastid DNA sequence-independent manner, is essential for the parasite's survival (2009)
  • 著者名/発表者名: Sasaki N, Hirai M, Maeda K, Yui R, Itoh K, Namiki S, Morita T, Hata M, Murakami-Murofushi K, Matsuoka H, Kita K, Sato S.
  • 雑誌名: FEBS lett. 583(9) ページ: 1446-1450
  • 査読あり
• [雑誌論文] RNA, but not proteins, is directly responsible for translational silencing by a bacterial Hfq-binding small RNA (2008)
  • 著者名/発表者名: 牧貴美香、宇野可奈子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 雑誌名: Proceeding of National Academy of Sciences of the U.S.A. 105(30) ページ: 10332-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analyses of mRNA destabilization and translation inhibition mediated by Hfq-binding small RNAs (2008)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、牧貴美香、八木美江子、饗場弘二
  • 雑誌名: Methods in Enzymology 447 ページ: 359-78
  • 査読あり
• [雑誌論文] RNA, but not proteins, is directly responsible for translational silencing by a bacterial Hfq-banding small RNA (2008)
  • 著者名/発表者名: Kimika MAKI, Kanako UNO, Teppei MORITA and Hiroji AIBA
  • 雑誌名: Proceeding of National Academy of Sciences of the U. S. A. 105(30) ページ: 10332-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analyses of mRNA destabilization and translation inhibition mediated by Hfq-binding small RNAs (2008)
  • 著者名/発表者名: Teppei MORITA, Kimika MAKI, Mieko YAGI and Hiroii AIBA
  • 雑誌名: Methods in Enzymology 447 ページ: 359-78
• [学会発表] ptsG mRNAの翻訳抑制に重要なSgrS最小領域の同定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 牧貴美香、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第46回日本細菌学会中部支部会
  • 発表場所: 名城大学、名古屋市
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] 大腸菌RNase E/Hfqの結合領域の同定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第46回日本細菌学会中部支部会
  • 発表場所: 名城大学、名古屋市
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] ptsG mRNAの翻訳抑制に重要なSgrS最小領域の同定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 牧貴美香、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第46回日本細菌学会中部支部会
  • 発表場所: 名城大学(愛知県名古屋市)
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] 大腸菌RNase E/Hfqの結合領域の同定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第46回日本細菌学会中部支部会
  • 発表場所: 名城大学(愛知県名古屋市)
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] 遺伝子発現抑制機能におけるSgrS3'末端領域の役割 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ、新潟市
  • 年月日: 2009-07-28
• [学会発表] 合成RNAによるptsG mRNAの翻訳抑制 (2009)
  • 著者名/発表者名: 牧貴美香、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ、新潟市
  • 年月日: 2009-07-27
• [学会発表] sRNAによるポリシストロニックなmRNAの発現抑制の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ、新潟市
  • 年月日: 2009-07-27
• [学会発表] 大腸菌RNase E/Hfqの結合領域の同定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ、新潟市
  • 年月日: 2009-07-27
• [学会発表] 合成RNAによるptsG mRNAの翻訳抑制 (2009)
  • 著者名/発表者名: 牧貴美香、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ(新潟県新潟市)
  • 年月日: 2009-07-27
• [学会発表] 遺伝子発現抑制機能におけるSgrS3'末端領域の役割 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ(新潟県新潟市)
  • 年月日: 2009-07-27
• [学会発表] sRNAによるポリシストロニックなmRNAの発現抑制の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ(新潟県新潟市)
  • 年月日: 2009-07-27
• [学会発表] 大腸菌RNase E/Hfqの結合領域の同定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第11回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ(新潟県新潟市)
  • 年月日: 2009-07-27
• [学会発表] 遺伝子発現抑制機能におけるSgrS3'末端領域の重要性の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大鷹弘紀、森田鉄兵、本間道夫、饗場弘二
  • 学会等名: 第6回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: KKRホテル熱海、熱海市
  • 年月日: 2009-06-12
• [学会発表] sRNAによるポリシストロニックなmRNAの発現抑制の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、森田鉄兵、本間道夫、饗場弘二
  • 学会等名: 第6回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: KKRホテル熱海、熱海市
  • 年月日: 2009-06-12
• [学会発表] 遺伝子発現抑制機能におけるSgrS3'末端領域の重要性の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大鷹弘紀、森田鉄兵、本間道夫、饗場弘二
  • 学会等名: 第6回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: KKRホテル熱海
  • 年月日: 2009-06-11
• [学会発表] sRNAによるポリシストロニックなmRNAの発現抑制の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、森田鉄兵、本間道夫、饗場弘二
  • 学会等名: 第6回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: KKRホテル熱海
  • 年月日: 2009-06-11
• [学会発表] Heterogenety of RNA degradosome of Escherichia coli: RNase E forms several distinct complexes with partner proteins. (2008)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: JSPS-DST Asian Academic Seminar
  • 発表場所: Bangalore、India
  • 年月日: 2008-12-28
• [学会発表] アミノ酸枯渇時のリボソーム停滞によるmRNAの切断とトランス翻訳 (2008)
  • 著者名/発表者名: 李霞、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第10回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター、札幌市
  • 年月日: 2008-07-25
• [学会発表] バクテリアにおけるHfq/sRNAによる翻訳阻害はタンパク質ではなくsRNAが直接の要因である (2008)
  • 著者名/発表者名: 牧貴美香、宇野可奈子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第10回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター、札幌市
  • 年月日: 2008-07-23
• [学会発表] 大腸菌small RNAによる標的mRNAの分解機構とその役割 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2008
  • 発表場所: 関西セミナーハウス、京都
  • 年月日: 2008-06-04