• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

比較トランスクリプトミクスを利用したザゼンソウ低温応答遺伝子群の解析

研究課題

研究課題/領域番号 20780070
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 応用生物化学
研究機関岩手大学

研究代表者

稲葉 靖子  岩手大学, 農学部, 研究員 (80400191)

研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2010年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2009年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2008年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード発熱植物 / ザゼンソウ / 低温応答 / トランスクリプトミクス / SuperSAGE / Super SAGE
研究概要

寒冷地に自生するザゼンソウは、開花後1-2週間にわたり生殖器官である肉穂花序で発熱することが知られている。多くの植物において見出されている凍結耐性誘導型の低温ストレス回避機構とは異なり、ザゼンソウは発熱することにより低温ストレスを回避していると考えられている。本研究では、ザゼンソウの低温応答遺伝子群を同定して、モデル植物シロイヌナズナ等ですでに報告されている低温応答遺伝子群との比較解析を行うことにより、両者の共通点および相違点を探ることを目的としている。
当該年度はまず、発熱するザゼンソウ花序の低温誘導前後のサンプルから調製した26bpのSuperSAGEタグと本植物花序のESTライブラリーとのアノテーションを行い、シロイヌナズナ等の他のモデル植物におけるタグデータベースとの比較解析を行った。その結果、ザゼンソウでは低温誘導前後に関係なく、ミトコンドリアの生合成や呼吸機能に関わる遺伝子群の発現レベルが高くなっていることが明らかとなった。一方で、生化学および形態学的な手法により、ザゼンソウの発熱組織では呼吸機能の活発なミトコンドリアが豊富に含まれていることが明らかとなり、この特徴は近縁種であり発熱しないミズバショウと比べても顕著であった。以上の結果から、ザゼンソウの発熱組織はミトコンドリア機能を活発に動作させるための堅固な生体システムを構築していることが示唆された。現在、低温誘導前後で発現パターンの変動する遺伝子群を抽出する作業に着手しており、他植物における低温応答遺伝子群との相違について検討を進めている。

報告書

(2件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (4件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Developmental changes and organelle biogenesis in the reproductive organ of thermogenic skunk cabbage(Symplocarpus renifolius)2009

    • 著者名/発表者名
      稲葉靖子
    • 雑誌名

      Journal of Experimental Botany 60

      ページ: 3909-3922

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] What is critical for plant thermogenesis? Differences in mitochondrial activity and protein expression between thermogenic and non-thermogenic skunk cabbages2009

    • 著者名/発表者名
      稲葉靖子
    • 雑誌名

      Planta 231

      ページ: 121-130

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 発熱するザゼンソウ-大量のミトコンドリアを発見-2009

    • 著者名/発表者名
      稲葉靖子
    • 雑誌名

      科研費NEWS 3

      ページ: 16-16

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular Identity of Uncoupling Proteins in Thermogenic Skunk Cabbage2008

    • 著者名/発表者名
      稲葉靖子
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology 49

      ページ: 1911-1916

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 熱産生における脱共役タンパク質の役割と適応進化2008

    • 著者名/発表者名
      稲葉靖子
    • 雑誌名

      化学と生物 46(招聘論文)

      ページ: 841-849

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ザゼンソウとミズバショウの比較による植物熱産生機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      稲葉靖子
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2010年度大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス(東京都)
    • 年月日
      2010-03-28
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Super SAGE法を利用したザゼンソウ熱産生関連遺伝子の探索2009

    • 著者名/発表者名
      飛田耶馬人(代表者 : 稲葉靖子)
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡・福岡国際会議場
    • 年月日
      2009-03-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ザゼンソウの発熱ステージ移行にともなう生殖器官の発達とオルガネラダイナミクス2009

    • 著者名/発表者名
      稲葉靖子
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      名古屋・名古屋大学
    • 年月日
      2009-03-21
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Developmental changes and organelle biogenesis in the reproductive organs of thermogenic skunk cabbage2009

    • 著者名/発表者名
      稲葉靖子
    • 学会等名
      Plant Biology 2009
    • 発表場所
      ハワイコンベンションセンター(ハワイ・ホノルル)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [図書] 温度と生命システムの相関学(岩手大学21世紀COEプログラム事業編)2009

    • 著者名/発表者名
      稲葉靖子
    • 出版者
      東海大学出版会(掲載確定)
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://news7al.atm.iwate-u.ac.jp/zazensou/nedo/itoinaba.html

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://news7al.atm.iwate-u.ac.jp/zazensou/nedo/

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

URL: 

公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi