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魚類資源における日本海―太平洋間の適応的分化の検出:エコゲノミクス解析

研究課題

研究課題/領域番号 20780139
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 水産学一般
研究機関公立大学法人福井県立大学

研究代表者

小北 智之  公立大学法人福井県立大学, 海洋生物資源学部, 講師 (60372835)

研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2009年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2008年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード適応的分化 / 局所適応 / 自然選択 / 魚類 / 海洋生態系 / エコゲノミクス / 適応進化 / 自然淘汰 / 遺伝資源
研究概要

海洋環境における種内の適応的分化を検出することを目的に、日本列島に広く分布する遡河回遊魚シロウオをモデル系とした集団ゲノム学的解析を行った。本種には、日本海集団と太平洋集団の間に対照的な表現型分化が存在するが、多数のマイクロサテライトマーカーと形質変異の候補遺伝子マーカーを用いたゲノムスキャンを実施したところ、日本海集団のゲノム中に正の自然選択の痕跡が存在することが強く示唆され、両集団の間には適応的な分化が生じていると考えられた。

報告書

(3件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (12件)

  • [雑誌論文] 自然集団の適応的分化の検出-モデル系としての日本在来魚-2010

    • 著者名/発表者名
      小北智之、山平寿智
    • 雑誌名

      月刊海洋 42巻

      ページ: 317-322

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 歴史的変動海洋環境におけるシロウオ集団の適応的分化-エコゲノミクスからのアプローチ-2010

    • 著者名/発表者名
      小北智之
    • 雑誌名

      月刊海洋 42巻

      ページ: 353-362

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Heterochronic differences in fin development between latitudianl populations of the medaka Oryzais latipes (Actinopterygii : Adrianichthyidae)2009

    • 著者名/発表者名
      M.Kawajiri, T.Kokita, K.Yamahira
    • 雑誌名

      Biological Journal of the linnean Society 97

      ページ: 571-580

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of polymorphic trinucleotide and dinucleotide microsateRite loci for the ice goby, Leucopsarion petersii2008

    • 著者名/発表者名
      T. Kokita, S. Takahashi
    • 雑誌名

      Molecular Ecology Resources 8

      ページ: 305-307

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Population genetic structure of the neon damselfish(Pomacentrus coeles tis)in the northwest Pacific Ocean2008

    • 著者名/発表者名
      SY. Liu, T. Kokita, CF. Dai
    • 雑誌名

      Marine Biology 154

      ページ: 745-753

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 集団ゲノミクス解析によるシロウオ海域特異的適応遺伝子の探索2010

    • 著者名/発表者名
      小北智之、高橋明香、熊田裕喜
    • 学会等名
      平成22年日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      日本大学(藤沢市)
    • 年月日
      2010-03-27
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 集団ゲノミクス解析によるシロウオ海域特異的適応遺伝子の探索2010

    • 著者名/発表者名
      小北智之・高橋明香・熊田裕喜
    • 学会等名
      平成22年日本水産学会
    • 発表場所
      日本大学(藤沢市)
    • 年月日
      2010-03-27
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 湖番種における浸透性交雑と雑種個体の生活史パターン2010

    • 著者名/発表者名
      小北智之・熊田裕喜・奥田昇
    • 学会等名
      第57回日本生態学会
    • 発表場所
      東京大学(東京都)
    • 年月日
      2010-03-18
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 魚類研究における適応的分化の検出方法2009

    • 著者名/発表者名
      小北智之、山平寿智
    • 学会等名
      年会シンポジウム「日本在来魚における適応的分化:その実態とエコゲノミクスへの展望」、2009年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      東京海洋大学(東京都)
    • 年月日
      2009-10-12
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 変動環境下の適応進化:シロウオ日本海型と太平洋型を用いたゲノムスキャンから2009

    • 著者名/発表者名
      小北智之
    • 学会等名
      年会シンポジウム「日本在来魚における適応的分化:その実態とエコゲノミクスへの展望」、2009年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      東京海洋大学(東京都)
    • 年月日
      2009-10-12
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 魚類研究における適応的分化の検出方法.年会シンポジウム「日本在来魚における適応的分化:その実態とエコゲノミクスへの展望」2009

    • 著者名/発表者名
      小北智之・山平寿智
    • 学会等名
      2009年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      東京海洋大学(東京都)
    • 年月日
      2009-10-12
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 変動環境下の適応進化:シロウオ日本海型と太平洋型を用いたゲノムスキャンから.年会シンポジウム「日本在来魚における適応的分化:その実態とエコゲノミクスへの展望」2009

    • 著者名/発表者名
      小北智之
    • 学会等名
      2009年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      東京海洋大学(東京都)
    • 年月日
      2009-10-12
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] シロウオ日本海型と太平洋型の適応的分化に関与した遺伝子座の探索:ゲノムスキャンを用いた解析2008

    • 著者名/発表者名
      高橋明香、小北智之
    • 学会等名
      2008年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      愛媛大学(松山市)
    • 年月日
      2008-09-22
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] シロウオ日本海型と太平洋型の適応的分化に関与した遺伝子座の探索 : ゲノムスキャンを用いた解析2008

    • 著者名/発表者名
      高橋明香・小北智之
    • 学会等名
      2008年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      愛媛大学(松山)
    • 年月日
      2008-09-22
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ハリヨ雄の子の保護行動における集団間変異2008

    • 著者名/発表者名
      小北智之・森誠一
    • 学会等名
      2008年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      愛媛大学(松山)
    • 年月日
      2008-09-22
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 海洋環境変化と生物の小進化、ワークショップ「人為的環境下における進化のメカニズム、及び保全策への応用」2008

    • 著者名/発表者名
      小北智之
    • 学会等名
      第10回日本進化学会大会
    • 発表場所
      東京大学(東京都)
    • 年月日
      2008-08-23
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 「海洋環境変化と生物の小進化」ワークショップ「人為的環境下における進化のメカニズム、及び保全策への応用」2008

    • 著者名/発表者名
      小北智之
    • 学会等名
      日本進化学会第10回大会
    • 発表場所
      東京大学(東京)
    • 年月日
      2008-08-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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