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DNA鑑定による国産銘柄鶏、特にさつま地鶏の市場価値と食の安全・安心に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 20780200
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 応用動物科学
研究機関鹿児島大学

研究代表者

下桐 猛  鹿児島大学, 農学部, 助教 (40315403)

研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2009年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2008年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード育種 / ゲノム / 畜産学 / 遺伝学 / 育種学 / 動物
研究概要

さつま地鶏は鹿児島県で飼養されている国産銘柄種であり、天然記念物である薩摩鶏にロードアイランドレッドを交雑して造成された集団である。本研究では、ニワトリSNPを用いた費用効率が高くかつハイスループットな解析システムの確立とさつま地鶏の品種鑑定を目的とし、以下の研究を行った。研究1)安価で迅速なゲノムDNA抽出法の確立を目的として,植物で確立されたガラス繊維ろ紙を適用し、条件検討を行った。研究2)わが国でヒトゲノム解析用に開発され、96種類のSNPsによる遺伝子型を同時に判別できるDigiTag2法をニワトリSNP解析に応用し、ニワトリSNP検出システムの開発を行い、実際に薩摩鶏とロードアイランドレッドを含む5鶏集団89羽に利用した。
研究1)ニワトリ血球の希釈倍率50倍~200倍で1μg程度のゲノムDNAが得られ,LA-PCRによって約5kbの産物も確認できた.2.サンプル吸着後の保存は,室温で4週間までDNA抽出が可能であることを確認した.本法は,1サンプル当たりの費用が10円程度で,コスト面で優れ,16個体の血球からおよそ1時間でゲノムDNAが抽出できた.
研究2)DigiTag2解析の結果、1)供試した全89羽の個体識別ができた。2)総合同値確率は8.00×10^<-20>と計算され、10^<19>羽程度のニワトリの識別が可能であることが示唆された。全世界のニワトリの飼養羽数が1.84×10^<10>羽(FAO,2009)であることから、現在の解析で十分な識別能を有することが示唆された。3)NJ系統樹は5集団がそれぞれ独立したクラスターを構成し、分類することが出来た。以上、SNPを用いた品種識別技術への応用の可能性が示唆された。

報告書

(3件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (11件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (13件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Allele distributions and frequencies of the six prion protein gene (PRNP) polymorphisms in Asian native cattle, Japanese breeds, and mythun (Bos frontalis).2010

    • 著者名/発表者名
      Shimogiri T., Msalya G., Myint S.L., Okamoto S., Kawabe K., Tanaka K., Mannen H., Minezawa M., Namikawa T., Amano T., Yamamoto Y., Maeda Y.
    • 雑誌名

      Biochemical Genetics (印刷中)

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 家畜・家禽のゲノムDNA抽出におけるガラスろ紙法の検討2010

    • 著者名/発表者名
      工藤美雪, 河邊弘太郎, 大久津昌治, 岡本 新, 山口浩, 安江博, 前田芳實, 下桐猛
    • 雑誌名

      鹿児島大学農学部附属農場研究報告 32

      ページ: 13-17

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Indels within promoter and intron 1 of bovine prion protein gene modulate the gene expression levels in the medulla oblogata of two Japanese cattle breeds2010

    • 著者名/発表者名
      Mdslys, Shimogiri, ら
    • 雑誌名

      Animal Genetics (印刷中)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 家畜・家禽のゲノムDNA抽出におけるガラスろ紙法の検討2010

    • 著者名/発表者名
      工藤、下桐, ら
    • 雑誌名

      鹿児島大学農学部附属農場研究報告 (印刷中)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] Gene and haplotypes polymorphisms of the prion gene (PRNP) in Japanese Brown, Japanese native and Holstein cattle.2009

    • 著者名/発表者名
      Msalya G., Shimogiri T., Okamoto S., Kawabe K., Minezawa M., Namikawa T., Maeda Y.
    • 雑誌名

      Animal Science Journal 80(5)

      ページ: 520-527

    • NAID

      10027887352

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Assignment of 128 genes localized on human chromosome 14q to the I MpRH map.2009

    • 著者名/発表者名
      Shimogiri, ら
    • 雑誌名

      Animal Genetics 40

      ページ: 538-542

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gene and haplotypes polymorphisms of the Prion gene (PRNP) in Japanese Brown, Japanese native and Holstein cattle2009

    • 著者名/発表者名
      Msalya, Shimogiri, ら
    • 雑誌名

      Animal Science Journal 80

      ページ: 520-527

    • NAID

      10027887352

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ブタの放射線雑種細胞パネルを用いた高密度遺伝子地図の作成2009

    • 著者名/発表者名
      下桐猛, 安江博
    • 雑誌名

      動物遺伝育種研究 37

      ページ: 113-120

    • NAID

      10026420386

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] An integrated RH map of porcine chromosome 10.2009

    • 著者名/発表者名
      Ma, Shimogiri, ら
    • 雑誌名

      BMC Genomics 10

      ページ: 211-211

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 鹿児島県における黒毛和種肥育牛の産肉成績の年次推移2009

    • 著者名/発表者名
      金、下桐, ら
    • 雑誌名

      鹿児島大学農学部学術報告 59

      ページ: 1-12

    • NAID

      120001332042

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] Genotypic frequency in Asian native chicken populations and gsue expression using insulin-like growth factor 1 (IGW1) gene promoter nolvmornhism2009

    • 著者名/発表者名
      Hla Hla Moe, ら
    • 雑誌名

      Journal of Poultry Science 46

      ページ: 1-5

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] DigiTag2法を用いたニワトリSNPの解析について2009

    • 著者名/発表者名
      下桐猛
    • 学会等名
      第15回動物遺伝育種シンポジウム
    • 発表場所
      群馬会館(群馬県前橋市)
    • 年月日
      2009-11-10
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ニワトリδ2クリスタリン遺伝子の発現に関する研究:精巣におけるセンス鎖とアンチセンス鎖の存在2009

    • 著者名/発表者名
      下桐, ら
    • 学会等名
      日本動物遺伝育種学会第10回記念大会
    • 発表場所
      群馬会館(群馬県前橋市)
    • 年月日
      2009-11-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] DigiTag2法による鹿児島県の在来鶏を含む5鶏品種のSNP_s解析2009

    • 著者名/発表者名
      工藤、下桐, ら
    • 学会等名
      日本動物遺伝育種学会第10回記念大会
    • 発表場所
      群馬会館(群馬県前橋市)
    • 年月日
      2009-11-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Study of Insertion and Deletion (indel) Polymorphism as Genetic Markers in Myanmar Native Chickens2009

    • 著者名/発表者名
      Aye Aye Maw, Shimogiri, ら
    • 学会等名
      第2回日本暖地畜産学会長崎大会
    • 発表場所
      長崎大学文教キャンパス(長崎県長崎市)
    • 年月日
      2009-10-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] InDelマーカーを用いたニワトリ3品種の多型解析2009

    • 著者名/発表者名
      山本、下桐, ら
    • 学会等名
      第2回日本暖地畜産学会長崎大会
    • 発表場所
      長崎大学文教キャンパス(長崎県長崎市)
    • 年月日
      2009-10-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] DigiTag2法を用いたヤケイ・ニワトリ集団のSNP解析2009

    • 著者名/発表者名
      安江博・下桐猛・工藤美雪・長坂直比路・西田奈央・岡本新・徳永勝士・西堀正英
    • 学会等名
      日本動物遺伝育種学会第10回記念大会
    • 発表場所
      群馬会館(群馬県)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] DigiTag2法による鹿児島県の在来鶏を含む5鶏品種のSNPs解析2009

    • 著者名/発表者名
      工藤美雪・下桐猛・西田奈央・丹羽孝介・西堀正英・木下圭司・岡本新・前田芳實・徳永勝士・安江博
    • 学会等名
      日本動物遺伝育種学会第10回記念大会
    • 発表場所
      群馬会館(群馬県)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] わが国で開発されたDigiTag2法によるニワトリSNPsの同時検出2008

    • 著者名/発表者名
      下桐猛, ら
    • 学会等名
      日本動物遺伝育種学会第9回大会
    • 発表場所
      岡山大学農学部
    • 年月日
      2008-11-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 家畜・家禽のゲノムDNA抽出におけるガラスろ紙法の検討2008

    • 著者名/発表者名
      工藤美雪, ら
    • 学会等名
      第59回西日本畜産学会佐賀大会
    • 発表場所
      佐賀大学農学部
    • 年月日
      2008-10-26
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] わが国で開発されたDigiTag2法によるニワトリSNPsの同時検出2008

    • 著者名/発表者名
      下桐猛・西田奈央・丹羽孝介・西堀正英・工藤美雪・平岩秀樹・岡本新・前田芳實・徳永勝士・安江博
    • 学会等名
      日本動物遺伝育種学会第9回大会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 家畜・家禽のゲノムDNA抽出におけるガラスろ紙法の検討2008

    • 著者名/発表者名
      工藤美雪・下桐猛・平岩秀樹・河邊弘太郎・岡本新・前田芳實・安江博
    • 学会等名
      第59回西日本畜産学会
    • 発表場所
      佐賀大学(佐賀県)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Expression of the chickenδ2-crystallin gene: Occurrence of sense and antisense RNAs in testis2008

    • 著者名/発表者名
      T. SHIMOGIRI, J. KAWAKAMI, A. MATSUMOTO, M. NISHIBORI, S. OKAMOTO, Y. MAEDA, H. YASUE.
    • 学会等名
      XXXI International Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG2008)
    • 発表場所
      RAI Conference Center (Amsterdam)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Expression of the chicken δ2-crystallin gene : Occurrence of se nse and antisense RNAs in testis2008

    • 著者名/発表者名
      T Shimogiri, ら
    • 学会等名
      ISAG2008
    • 発表場所
      RAI conference centre(アムステルダム)
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考] 下桐猛、DigiTag2法を用いたニワトリSNPの解析について、第15回動物遺伝育種シンポジウム、群馬会館(群馬県前橋市)、2009年11月

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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