植物における混数性(mixoploidy)のエピジェネティクス

• 研究課題/領域番号: 20780240
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用分子細胞生物学
• 研究機関: 大阪教育大学
• 研究代表者: 鈴木 剛 大阪教育大学, 教育学部, 准教授 (10314444)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2011年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2010年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2009年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2008年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: 遺伝子 / 染色体工学 / 育種学 / 遺伝学 / 植物 / 染色体 / バイオテクノロジー / エピジェネティクス / 形質転換体 / タバコ

研究概要

混数性現象が遺伝することが明らかになっている形質転換タバコを用いて、免疫染色などの細胞遺伝学的解析により染色体レベルでDNAメチル化やヒストン修飾程度を比較した。さらに、BACクローンを利用してFISHや塩基配列を解析することにより、混数性染色体のゲノム特性を調べた。これらの解析から、染色体レベルやDNAレベルでの混数性タバコのエピジェネティックな状態を明らかにし、混数性を生み出すメカニズムについて考察した。

研究成果

• [雑誌論文] Random BAC FISH of monocot plants reveals differential distribution of repetitive DNA elements in small and large chromosome species (2012)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G., Ogaki, Y., Hokimoto, N., Xiao, L., Kikuchi-Taura, A., Harada, C., Okayama, R., Tsuru, A., Onishi, M., Saito, N., Do, G. S., Lee, S. H., Ito, T., Kanno, A., Yamamoto, M., and Mukai, Y.
  • 雑誌名: Plant Cell Rep 巻: 31 ページ: 621-628
  • 査読あり
• [雑誌論文] Random BAC FISH of monocot plants reveals differential distribution of repetitive DNA elements in small and large chromosome species (2012)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G., et al
  • 雑誌名: Plant Cell Report 巻: 31 号: 4 ページ: 621-628
  • DOI: 10.1007/s00299-011-1178-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Coexistence of NtCENH3 and two retrotransposons in tobacco centromeres (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagaki, K., Shibata, F., Suzuki, G., Kanatani, A., Ozaki, S., Hironaka, A., Kashihara, K., and Murata, M.
  • 雑誌名: Chromosome Res 巻: 19 ページ: 591-605
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transgenic rice plants harboring the grain hardness-locus region of Aegilops tauschii (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G., Wada, H., Goto, H., Nakano, A., Oba, H., Deno, T., Rahman, S., and Mukai, Y.
  • 雑誌名: Plant Cell Rep 巻: 30 ページ: 2293-2301
  • 査読あり
• [雑誌論文] Coexistence of NtCENH3 and two retrotransposons in tobacco centromeres (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagaki, K., et al
  • 雑誌名: Chromosome Research 巻: 19 号: 5 ページ: 591-605
  • DOI: 10.1007/s10577-011-9219-2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transgenic rice plants harboring the grain hardness-locus region of Aegilops tauschii (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G., et al
  • 雑誌名: Plant Cell Report 巻: 30 号: 12 ページ: 2293-2301
  • DOI: 10.1007/s00299-011-1134-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of CDC48 in Allium cepa (2010)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G., Shiomi, M., Morihana, S., and Mukai, Y.
  • 雑誌名: Chromosome Sci 巻: 13 ページ: 27-29
  • NAID: 10028105747
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA methylation and histone modification in onion chromosomes (2010)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G., Shiomi, M., Morihana, S., Yamamoto, M., and Mukai, Y.
  • 雑誌名: Genes Genet. Syst 巻: 85 ページ: 377-382
  • NAID: 10029515991
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA methylation and histone modification in onion chromosomes. (2010)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G., Shiomi, M., Morihana, S., Yamamoto, M., Mukai, Y.
  • 雑誌名: Genes Genet.Syst. 85 ページ: 377-382
  • NAID: 10029515991
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA methylation and histone modification in onion chromosomes (2010)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G., et al.
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 85 ページ: 377-382
  • NAID: 10029515991
  • 査読あり
• [雑誌論文] Visualization of multiple T-DNA loci by FISH on extended DNA fibers (2009)
  • 著者名/発表者名: Imazawa, T., Suzuki, G., Nakano, A., Yamamoto, M., and Mukai, Y.
  • 雑誌名: Plant Biotech 巻: 26 ページ: 421-425
  • NAID: 10026136261
  • 査読あり
• [雑誌論文] Recent progress in plant reproduction research : the story of the male gametophyte through to successful fertilization (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G.
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol 巻: 50 ページ: 1857-1864
  • NAID: 10027343986
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bioactive beads-mediated transformation of rice with large DNA fragments containing Aegilops tauschii genes (2009)
  • 著者名/発表者名: Wada, N., Kajiyama, S., Akiyama, Y., Kawakami, S., No, D., Uchiyama, S., Otani, M., Shimada, T., Nose, N., Suzuki, G., Mukai, Y., and Fukui, K.
  • 雑誌名: Plant Cell Rep 巻: 28 ページ: 759-768
  • 査読あり
• [雑誌論文] Visualization of multiple T-DNA loci by FISH on extended DNA fibers. (2009)
  • 著者名/発表者名: Imazawa, T., Suzuki, G., et al.
  • 雑誌名: Plant Biotechnology 26 ページ: 421-425
  • NAID: 10026136261
  • 査読あり
• [雑誌論文] Recent progress in plant reproduction research : the story of the male gametophyte through to successful fertilization. (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G.
  • 雑誌名: Plant and Cell Physiology 50 ページ: 1857-1864
  • NAID: 10027343986
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bioactive beads-mediated transformation of rice with large DNA fragments containing Aegilops tauschii genes. (2009)
  • 著者名/発表者名: Wada, N., Kajiyama, S., Akiyama, Y., Kawakami, S., No, D., Uchiyama, S., Otani, M., Shimada, T., Nose, N., Suzuki, G., et al.
  • 雑誌名: Plant Cell Report 28 ページ: 759-768
  • 査読あり
• [雑誌論文] 大きな植物染色体上でDNAを光らせる挑戦 (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木剛
  • 雑誌名: 生物の科学・遺伝 巻: 62 ページ: 73-77
• [雑誌論文] Pilot sequencing of onion genomic DNA reveals fragments of transposable elements, low gene densities, and significant gene enrichment after methyl filtration (2008)
  • 著者名/発表者名: Jakse, J., Meyer, J. D. F., Suzuki, G., McCallum, J., Cheung, F., Town, C. D. and Havey, M. J.
  • 雑誌名: Mol. Genet. Genomics 巻: 280 ページ: 287-292
  • 査読あり
• [雑誌論文] Separated transcriptomes of male gametophyte and tapetum in rice : validity of a laser microdissection(LM) microarray (2008)
  • 著者名/発表者名: Suwabe, K., Suzuki, G., Takahashi, H., Shiono, K., Endo, M., Yano, K., Fujita, M., Masuko, H., Saito, H., Fujioka, T., Kaneko, F., Kazama, T., Mizuta, Y., Kawagishi-Kobayashi, M., Tsutsumi, N., Kurata, N., Nakazono, M. and Watanabe, M.
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol 巻: 49 ページ: 1407-1416
  • NAID: 10027333829
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mixoploidy in transgenic tobacco. (2008)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G., Tsujii, Y., Miwa, M., Saito, Y., Imazawa, T., Nakano, A., Yamamoto M., Mukai, Y.
  • 雑誌名: Adv.Chromosome Sci. 3 ページ: 133-133
• [雑誌論文] 大きな植物染色体上でDNAを光らせる挑戦 (2008)
  • 著者名/発表者名: 鈴木剛
  • 雑誌名: 生物の科学・遺伝 62 ページ: 73-77
• [雑誌論文] Pilot sequencing of onion genomic DNA reveals fragments of transposable elements, low gene densities, and significant gene enrichment after methyl filtration (2008)
  • 著者名/発表者名: Jakse, J., Meyer, J. D. F., Suzuki, G., et.al.
  • 雑誌名: Mol. Genet. Genomics 280 ページ: 287-292
  • 査読あり
• [雑誌論文] Separated transcriptomes of male gametophyte and tapetum in rice : validity of a laser microdissection (LM) microarray (2008)
  • 著者名/発表者名: Suwabe, K., Suzuki, G. et.al.
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol 49 ページ: 1407-1416
  • NAID: 10027333829
  • 査読あり
• [学会発表] タバコ動原体由来BACの塩基配列解析によるタバコ動原体特異的反復配列の同定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 長岐清孝, 柴田洋, 鈴木剛, 村田稔
  • 学会等名: 第61回染色体学会年会
  • 発表場所: 船橋
  • 年月日: 2010-11-07
• [学会発表] 形質転換タバコに見られる混数性 (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐々井直人, 斉藤優, 三輪美佳, 辻井由香, 鈴木剛
  • 学会等名: 第60回染色体学会年会
  • 発表場所: 松江
  • 年月日: 2009-11-12
• [学会発表] Mixoploidy in transgenic tobacco (2008)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G., Tsujii, Y., Miwa, M., Saito, Y., Imazawa, T., Nakano, A., Yamamoto M. and Mukai, Y.
  • 学会等名: 3rd Asian Chromosome Colloquium
  • 発表場所: Osaka, Japan
  • 年月日: 2008-12-01
• [学会発表] Mixoploidy in transgenic tobacco. (2008)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G.
  • 学会等名: 3rd Asian Chromosome Colloquium
  • 発表場所: Osaka, Japan
  • 年月日: 2008-12-01
• [学会発表] Mixoploidy in transgenic tobacco (2008)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, G.
  • 学会等名: 3^<rd> Asian Chromosome Colloquium
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2008-12-01