DNA 複製後修復に働くMUTYH-PCNA 複合体の新生鎖修復機構の構造学的研究

• 研究課題/領域番号: 20790040
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 物理系薬学
• 研究機関: 熊本大学
• 研究代表者: 中村 照也 熊本大学, 大学院・生命科学研究部, 助教 (40433015)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2009年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2008年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: 構造生物学 / X線結晶構造解析 / DNA修復 / タンパク質複合体

研究概要

DNA修復酵素であるMUTYHとDNA複製に関わるタンパク質PCNAの修復複合体のX線結晶構造解析を行い,そのDNA複製後修復機構および,MUTYHが関与する遺伝性疾患の発症機構を原子レベルで解明することを目的に研究を行った.結晶化実験に適したMUTYHおよびPCNAの精製に成功し,そしてMUTYH複合体の結晶化条件の探索を行い,結晶構造決定への前進となる成果を得た.

研究成果

• [雑誌論文] Structural and dynamic features of the MutT protein in the recognition of nucleotides with the mutagenic 8-oxoguanine base (2010)
  • 著者名/発表者名: Teruya Nakamura, Sachiko Meshitsuka, Seiju Kitagawa, Nanase Abe, Junichi Yamada, Tetsuya Ishino, Hiroaki Nakano, Teruhisa Tsuzuki, Takefumi Doi, Yuji Kobayashi, Satoshi Fujii, Mutsuo Sekiguchi, Yuriko Yamagata
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 285 ページ: 444-452
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of the glutamic acid 54 residue in transthyretin stability and thyroxine binding (2010)
  • 著者名/発表者名: Masanori Miyata, Takashi Sato, Mineyuki Mizuguchi, Teruya Nakamura, Shinji Ikemizu, Yuko Nabeshima, Seiko Susuki, Yoshiaki Suwa, Hiroshi Morioka, Yukio Ando, Mary Ann Suico, Tsuyoshi Shuto, Tomoaki Koga, Yuriko Yamagata, Hirofumi Kai
  • 雑誌名: Biochemistry 49 ページ: 114-123
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural and dynamic features of the MutT protein in the recognition of nucleotides with the mutagenic 8-oxoguanine base (2010)
  • 著者名/発表者名: Teruya Nakamura
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 285 ページ: 444-452
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of the Glutamic Acid 54 Residue in Transthyretin Stability and Thyroxine Binding (2010)
  • 著者名/発表者名: Masanori Miyata
  • 雑誌名: Biochemistry 49 ページ: 114-123
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fast binding kinetics and conserved 3D structure underlie the antagonistic activity of mutant TNF: useful information for designing artificial proteo-antagonists (2009)
  • 著者名/発表者名: Yohei Mukai, Teruya Nakamura, Yasuo Yoshioka, Hiroko Shibata, Yasuhiro Abe, Tetsuya Nomura, Madoka Taniai, Tsunetaka Ohta, Shinsaku Nakagawa, Shin-ichi Tsunoda, Haruhiko Kamada, Yuriko Yamagata, Yasuo Tsutsumi
  • 雑誌名: J. Biochem. 146 ページ: 167-172
  • NAID: 10026302534
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the tumour necrosis factor alpha-tumour necrosis factor receptor type 2 complex (2009)
  • 著者名/発表者名: Yohei Mukai, Teruya Nakamura, Yasuo Yoshioka, Shin-ichi Tsunoda, Haruhiko Kamada, Shinsaku Nakagawa, Yuriko Yamagata, Yasuo Tsutsumi
  • 雑誌名: Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun. 65 ページ: 295-298
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure-function relationship of tumor necrosis factor (TNF) and its receptor interaction based on 3D structural analysis of a fully active TNFR1-selective TNF mutant (2009)
  • 著者名/発表者名: Yohei Mukai, Hiroko Shibata, Teruya Nakamura, Yasuo Yoshioka, Yasuhiro Abe, Tetsuya Nomura, Madoka Taniai, Tsunetaka Ohta, Shinji Ikemizu, Shinsaku Nakagawa, Shin-ichi Tsunoda, Haruhiko Kamada, Yuriko Yamagata, Yasuo Tsutsumi
  • 雑誌名: J. Mol. Biol. 385 ページ: 1221-1229
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fast binding kinetics and conserved 3D structure underlie the antagonistic activity of mutant TNF : useful information for designing artificial proteo-antagonists (2009)
  • 著者名/発表者名: Yohei Mukai
  • 雑誌名: J.Biochem. 146 ページ: 167-172
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure-function relationship of tumor necrosis factor(TNF)and its receptor interaction based on 3D structural analysis of a fully active TNFR1-selective TN F mutant (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Mukai
  • 雑誌名: J. Mol. Biol. 385 ページ: 1221-1229
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the tumour necrosis factor alpha-tumour necrosis factor receptor type 2 complex (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Mukai
  • 雑誌名: Acta Cryst. F 65 ページ: 295-298
  • 査読あり
• [学会発表] 動的タンパク質結晶学により捕らえた8-oxo-dGTPaseの求核水分子の活性化機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村照也
  • 学会等名: 特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」, 第6回公開シンポジウム
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター, 大阪
  • 年月日: 2009-12-02
• [学会発表] 動的蛋白質結晶学により捕らえた8-oxo-dGTPaseの求核水分子の活性化機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村照也
  • 学会等名: 特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第6回公開シンポジウム
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター
  • 年月日: 2009-12-02
• [学会発表] Visualization of the Mn2+ dependent 8-oxo-dGTP hydrolysis reaction in E. coli MutT crystal (2009)
  • 著者名/発表者名: Teruya Nakamura
  • 学会等名: 第19回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
  • 発表場所: 大阪大学銀杏会館, 大阪
  • 年月日: 2009-06-12
• [学会発表] Visualization of the Mn^<2+> dependent 8-oxo-dGTP hydrolysis reaction in E.coli MutT crystal (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村照也
  • 学会等名: 第19回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
  • 発表場所: 大阪大学銀杏会館
  • 年月日: 2009-06-12
• [学会発表] 機能未知であるヒト一回膜貫通型タンパク質のC末ドメインの立体構造に基づく機能予測 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村照也
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本全日空ホテルニュースカイ, 熊本
  • 年月日: 2009-05-20
• [学会発表] ヒトMTH1の酸化ヌクレオチドに対する幅広い基質特異性の構造学的基盤 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村照也
  • 学会等名: 第26回PFシンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場, つくば
  • 年月日: 2009-03-25
• [学会発表] High-resolution X-ray diffraction study of the hMTH1 mutant (2008)
  • 著者名/発表者名: Teruya Nakamura
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
  • 発表場所: 大阪国際会議場, 大阪
• [学会発表] High-resolution X-ray diffraction study of the hMTH1 mutant (2008)
  • 著者名/発表者名: 中村照也
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography(IUCr2008)
  • 発表場所: 大阪国際会議場(グランキューブ大阪)