難解析性タンパク質リガンドの探索のための新規化合物評価系の構築と応用

• 研究課題/領域番号: 20790098
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 創薬化学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 大石 真也 京都大学, 薬学研究科, 講師 (80381739)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2009年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2008年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: CXCR4 / スクリーニング / ケモカイン / HIV / 構造活性相関

研究概要

腫瘍の転移やHIVの感染に関与するケモカイン受容体CXCR4へ結合する化合物を効率的に探索するためのスクリーニング系を構築した。まず、CXCR4拮抗剤由来の蛍光プローブを作成し、プローブの受容体への結合量をフローサイトメトリーにより定量する方法が有効であることを見出した。また、CXCR4の内因性リガンドであるSDF-1の特定の部位に蛍光標識基を導入したプローブが、CXCR4発現細胞における受容体の局在を指標とする化合物評価系に有用であることを明らかにした。さらに、新しい化合物評価系の実証研究として、CXCR4拮抗剤FC131からの非ペプチド誘導体の創製研究を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Synthesis and biological evaluation of selective CXCR4 antagonists containing alkene dipeptide isosteres. (2010)
  • 著者名/発表者名: Narumi T., Hayashi R., Tomita K., Kobayashi K., Tanahara N., Ohno H., Naito T., Kodama E., Matsuoka M., Oishi S., Fujii N.
  • 雑誌名: Org.Biomol.Chem. 8(3) ページ: 616-621
• [雑誌論文] Synthesis and biological evaluation of selective CXCR4 antagonists containing alkene dipeptide isosteres (2010)
  • 著者名/発表者名: Narumi T, Ohno H, Oishi S, Fujii N, et al.
  • 雑誌名: Org.Biomol.Chem. 巻: 8 ページ: 616-621
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bioorganic synthesis of a recombinant HIV-1 fusion inhibitor, SC35EK, with an N-terminal pyroglutamate capping group from recombinant protein. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kajiwara K., Watanabe K., Tokiwa R., Kurose T., Ohno H., Tsutsumi H., Hata Y., Izumi K., Kodama E., Matsuoka M., Oishi S., Fujii N.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 17(23) ページ: 7964-7970
• [雑誌論文] Bioorganic synthesis of end-capped anti-HIV peptides by simultaneous cyano-cysteine-mediated cleavages of recombinant proteins. (2009)
  • 著者名/発表者名: Tanaka M., Kajiwara K., Tokiwa R., Watanabe K., Ohno H., Tsutsumi H., Hata Y., Izumi K., Kodama E., Matsuoka M., Oishi S., Fujii N.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 17(21) ページ: 7487-7492
• [雑誌論文] Design and synthesis of membrane fusion inhibitors against the feline immunodeficiency virus. (2009)
  • 著者名/発表者名: Oishi S., Kodera Y., Nishikawa H., Kamitani H., Watabe T., Ohno H., Tochikura T., Shimane K., Kodama E., Matsuoka M., Mizukoshi F., Tsujimoto H., Fujii N.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 17(14) ページ: 4916-4920
• [雑誌論文] Expression of CXCR4, a G-protein-coupled receptor for CXCL12 in yeast identification of new-generation inverse agonists. (2009)
  • 著者名/発表者名: Evans B.J., Wang Z., Broach J.R., Oishi S., Fujii N., Peiper S.C.
  • 雑誌名: Methods Enzymol. 460 ページ: 399-412
• [雑誌論文] Peptide bond mimicry by (E)-alkene and (Z)-fluoroalkene peptide isosteres : synthesis and bioevaluation of alpha-helical anti-HIV peptide analogues. (2009)
  • 著者名/発表者名: Oishi S., Kamitani H., Kodera Y., Watanabe K., Kobayashi K., Narumi T., Tomita K., Ohno H., Naito T., Kodama E., Matsuoka M., Fujii N.
  • 雑誌名: Org.Biomol.Chem. 7(14) ページ: 2872-2877
• [雑誌論文] Chemokine receptor CXCR4 as a therapeutic target for neuroectodermal tumors. (2009)
  • 著者名/発表者名: Hyunsuk S., Oishi S., Fujii N.
  • 雑誌名: Semin.Cancer Biol. 19(2) ページ: 123-134
• [雑誌論文] Structure-activity relationship study on polyglutamine binding peptide QBP1 (2009)
  • 著者名/発表者名: Tomita K, Oishi S, et al.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 巻: 17 ページ: 1259-1263
  • 査読あり
• [雑誌論文] Amino acid-based synthesis of trifluoromethylalkene dipeptide isosteres by alcohol-assisted nucleophilic trifluoromethylation and organozinc-ccopper-mediated SN2' alkylation (2009)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi K, Oishi S, et al.
  • 雑誌名: J.Org.Chem. 巻: 74 ページ: 4626-4629
  • 査読あり
• [雑誌論文] Peptide bond mimicry by (E)-alkene and (Z)-fluoroalkene peptide isosteres : synthesis and bioevaluation of a-helical anti-HIV peptide analogues (2009)
  • 著者名/発表者名: Oishi S, et al.
  • 雑誌名: Org.Biomol.Chem. 巻: 7 ページ: 2872-2877
  • 査読あり
• [雑誌論文] Expression of CXCR4, a G-protein-coupled receptor for CXCL12 in yeast identification of new-generation inverse agonists (2009)
  • 著者名/発表者名: Evans BJ, Oishi S, Fujii N, et al
  • 雑誌名: Methods Enzymol. 巻: 460 ページ: 399-412
  • 査読あり
• [雑誌論文] Design and synthesis of membrane fusion inhibitors against the feline immunodeficiency virus (2009)
  • 著者名/発表者名: Oishi S, et al.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 巻: 17 ページ: 4916-4920
  • 査読あり
• [雑誌論文] X-ray crystallographic study of an HIV-1 fusion inhibitor with the gp41 S138A substitution (2009)
  • 著者名/発表者名: Watabe T, Oishi S, et al.
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 巻: 392 ページ: 657-665
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bioorganic synthesis of end-capped anti-HIV peptides by simultaneous cyanocysteine-mediated cleavages of recombinant proteins (2009)
  • 著者名/発表者名: Tanaka M, Oishi S, et al.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 巻: 17 ページ: 7487-7492
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bioorganic synthesis of a recombinant HIV-1 fusion inhibitor, SC35EK, with an N-terminal pyroglutamate capping group (2009)
  • 著者名/発表者名: Kajiwara K, Oishi S, et al.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 巻: 17 ページ: 7964-7970
  • NAID: 120002098852
  • 査読あり
• [雑誌論文] Diastereoselective synthesis of highlyfunctionalized fluoroalkene dipeptide isosteres and its application to Fmoc-based solid phase synthesis of a cyclic pentapeptide mimetic. (2008)
  • 著者名/発表者名: Narumi T., Tomita K., Inokuchi E., Kobayashi K., Oishi S., Ohno H., Fujii N.
  • 雑誌名: Tetrahedron 64(19) ページ: 4332-4346
• [雑誌論文] Synthesis of highly functionalized alkene dipeptide isosteres and its application to the structure-activity relationship study on bioactive peptides. (2008)
  • 著者名/発表者名: Oishi S., Narumi T., Ohno H., Otaka A., Fujii N.
  • 雑誌名: J.Synth.Org.Chem.Jpn. 66(9) ページ: 846-857
  • NAID: 10024278609
• [雑誌論文] Novel screening systems for HIV-1 fusion mediated by two extra-virion heptad repeats of gp41. (2008)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa H., Kodama E., Sakakibara A., Fukudome A., Izumi K., Oishi S., Fujii N., Matsuoka M.
  • 雑誌名: Antivir.Res. 80(1) ページ: 71-76
  • NAID: 120002790066
• [雑誌論文] dentification of novel nonpeptide CXCR4 antagonists by ligand-based design approach. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ueda S., Kato M., Inuki S., Ohno H., Evans B., Wang Z., Peiper S.C., Izumi K., Kodama E., Matsuoka M., Nagasawa H., Oishi S., Fujii N.
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem.Lett. 18(14) ページ: 4124-4129
• [雑誌論文] Diastereoselective synthesis of highly functionalized fluoroalkene dipeptide isosteres and its application to Fmoc-based solid phase synthesis of a cyclic pentapeptide mimetic (2008)
  • 著者名/発表者名: Narumi T., Oishi S., et.al.
  • 雑誌名: Tetrahedron 64 ページ: 4332-4346
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient synthesis of trifluoromethyl and related trisubstituted alkene dipeptide isosteres by palladium-catalyzed carbonylation of amino acid-derived allylic carbonates (2008)
  • 著者名/発表者名: Inokuchi E., Oishi S., et.al.
  • 雑誌名: J. Org. Chem. 73 ページ: 3942-3945
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel screening systems for HIV-1 fusion mediated by two extra-virion hentad repeats of gp41 (2008)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa H., Oishi S., et.al.
  • 雑誌名: Antivir. Res. 80 ページ: 71-76
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of novel nonpeptide CXCR4 antagonists by ligand-based design approach (2008)
  • 著者名/発表者名: Ueda S., Oishi S., et.al.
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem. Lett. 18 ページ: 4124-4129
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis of highly functionalized alkene dipeptide isosteres and its application to the structure-activity relationship study on bioactive peptides (2008)
  • 著者名/発表者名: Oishi S., et.al.
  • 雑誌名: J. Synth. Org. Chem. Jpn. 66 ページ: 846-857
  • NAID: 10024278609
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chemokine receptor CXCR4 as a therapeutic target for neuroectodermal tumors (2008)
  • 著者名/発表者名: Hyunsuk S., Oishi S., et.al.
  • 雑誌名: Semin. Cancer Biol 19 ページ: 123-134
  • 査読あり
• [学会発表] Development of novel GPR54 agonists14th International Congress of Endocrinology (2010)
  • 著者名/発表者名: Shinya Oishi, Kenji Tomita, Hiroaki Ohno, Nobutaka Fujii.
  • 学会等名: Satellite Symposium.
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2010-03-30
• [学会発表] 薬剤耐性株に有効な抗HIV活性ペプチドの創製と発現生産プロセスの開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大石真也、梶原一美、田中理紀、大野浩章、藤井信孝
  • 学会等名: 日本薬学会第130年会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] ウイルスの変異に学ぶ抗HIV活性ペプチドのデザイン (2009)
  • 著者名/発表者名: 大石真也
  • 学会等名: 第28回メディシナルケミストリーシンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-11-26
• [学会発表] アルケン型ジペプチドイソスターの合成とケモカイン受容体CXCR4拮抗剤の構造活性相関研究への応用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 林亮子、大石真也, 他
  • 学会等名: 第28回メディシナルケミストリーシンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-11-25
• [学会発表] 有機銅-亜鉛複合試薬を用いたトリフルオロメチルアルケンジペプチドイソスターの新規合成法の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小林数也、大石真也, 他
  • 学会等名: 第35回反応と合成の進歩シンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-11-16
• [学会発表] 抗HIV活性ペプチドSC35EKの生物有機化学的合成 (2009)
  • 著者名/発表者名: 梶原一美、大石真也, 他
  • 学会等名: 第46回ペプチド討論会
  • 発表場所: 金沢
  • 年月日: 2009-11-05
• [学会発表] 固相上におけるペプチド鎖へのDTPAの新規標識法の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 増田亮、大石真也, 他
  • 学会等名: 第46回ペプチド討論会
  • 発表場所: 北九州
  • 年月日: 2009-11-04
• [学会発表] ケモカイン受容体CXCR4選択的蛍光プローブを活用した化合物評価系の構築 (2009)
  • 著者名/発表者名: 棚原憲子、大石真也, 他
  • 学会等名: 第46回ペプチド討論会
  • 発表場所: 北九州
  • 年月日: 2009-11-04
• [学会発表] ケモカイン受容体CXCR4選択的蛍光プローブを活用した新規化合物評価系の構築 (2009)
  • 著者名/発表者名: 棚原憲子、大石真也, 他
  • 学会等名: 第59回日本薬学会近畿支部総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2009-10-24
• [学会発表] アルケン型ジペプチドイソスターの合成とケモカイン受容体CXCR4拮抗剤の構造活性相関研究への応用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 林亮子、大石真也, 他
  • 学会等名: 第59回日本薬学会近畿支部総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2009-10-24
• [学会発表] Bioorganic Synthesis of End-Capped HIV-1 Fusion Inhibitory Peptides (2009)
  • 著者名/発表者名: Kajiwara K, Oishi S, et al.
  • 学会等名: 8th Australian Peptide Conference
  • 発表場所: Queensland Australia
  • 年月日: 2009-10-12
• [学会発表] Efficient Synthesis of Trifluoromethyl and Related Trisubstituted Alkene Dipeptide Isosteres by Pd-Catalyzed Carbonylation of Amino Acid-Derived Allylic Carbonates (2009)
  • 著者名/発表者名: Inokuchi E, Oishi S, et al.
  • 学会等名: 8th Australian Peptide Conference
  • 発表場所: Queensland Australia
  • 年月日: 2009-10-12
• [学会発表] Synthesis and Application of Novel Fluorescent-Labeled CXCR4 Antagonists (2009)
  • 著者名/発表者名: 増田亮、大石真也, 他
  • 学会等名: 第10回文部科学省特定領域研究「がん」5領域 若手研究者ワークショップ
  • 発表場所: 蓼科
  • 年月日: 2009-09-02
• [学会発表] アルケン型ジペプチドイソスターの合成とケモカイン受容体CXCR4拮抗剤の構造活性相関研究への応用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 林亮子、大石真也, 他
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー研究会第4回年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-05-18
• [学会発表] 多様なジペプチドイソスターの分岐的合成とGPR54アゴニストへの応用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 富田健嗣、大石真也, 他
  • 学会等名: 第27回メディシナルケミストリーシンポジウム
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2008-11-26
• [学会発表] 多様なジペプチドイソスターの分岐的合成と応用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 富田健嗣、大石真也, 他
  • 学会等名: 第28回有機合成若手セミナー
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2008-11-12
• [学会発表] ジペプチドイソスターの分岐型合成による酵素耐性GPR54アゴニストの創出 (2008)
  • 著者名/発表者名: 富田健嗣、大石真也, 他
  • 学会等名: 第34回反応と合成の進歩シンポジウム
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2008-11-04
• [学会発表] 求核的CF3化反応による立体選択的トリフルオロメチルアルケン型ジペプチドイソスターの合成研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小林数也、大石真也, 他
  • 学会等名: 第45回ペプチド討論会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-10-29
• [学会発表] 求核的CF3化反応による立体選択的トリフルオロメチルアルケン型ジペプチドイソスターの合成研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小林数也、大石真也, 他
  • 学会等名: 第58回日本薬学会近畿支部総会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-10-25
• [学会発表] ケモカイン受容体CXCR4に対する蛍光標識リガンドの創製と応用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 増田亮、大石真也, 他
  • 学会等名: 第58回日本薬学会近畿支部総会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-10-25
• [学会発表] CXCR4受容体アンタゴニストの蛍光標識体の創製と応用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 増田亮、大石真也, 他
  • 学会等名: 第41回若手ペプチド夏の勉強会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2008-08-04
• [学会発表] ペプチド結合とペプチドミメティクス (2008)
  • 著者名/発表者名: 大石真也
  • 学会等名: 第41回若手ペプチド夏の勉強会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2008-08-03
• [学会発表] 環状ペプチドをリードとする非ペプチド性CXCR4拮抗剤の開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大石真也、加藤学、上田聡、井貫晋輔、大野浩章、Barry Evans、Zi-xuan Wang、Stephen C.Peiper、藤井信孝
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー研究会第3回年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-05-19
• [学会発表] CXCR4受容体アンタゴニストの蛍光標識体の創製と応用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 増田亮、大石真也, 他
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー研究会第3回年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-05-19
• [学会発表] 環状ベプチドをリードとする非ペプチド性CXCR4拮抗剤の開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大石真也, 他
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー研究会第3回年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-05-19
• [図書] インシリコ創薬科学 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大石真也, 他
  • 総ページ数: 210
  • 出版者: 京都廣川書店
• [図書] インシリコ創薬科学(3.2節・3.3節)
  • 著者名/発表者名: 掛谷秀昭、大石真也、矢倉徹、藤井信孝
  • 出版者: 京都廣川書店
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.pharm.kyoto-u.ac.jp/seizo/publication.htm
• [備考]
  • URL: http://www.pharm.kyoto-u.ac.jp/seizo/home.htm
• [備考]
  • URL: http://www.pharm.kyoto-u.ac.jp/seizo/home.htm
• [産業財産権] 麹菌を用いた抗HIVペプチドの生産方法 (2010)
  • 発明者名: 大石真也, 他
  • 権利者名: 月桂冠、科学技術振興機構
  • 産業財産権番号: 2010-030875
  • 出願年月日: 2010-02-16
• [産業財産権] 酵母を用いた抗HIVペプチドの生産方法 (2010)
  • 発明者名: 大石真也, 他
  • 権利者名: 科学技術振興機構、月桂冠
  • 産業財産権番号: 2010-046273
  • 出願年月日: 2010-03-03
• [産業財産権] 修飾ペプチド及びその製造方法 (2009)
  • 発明者名: 藤井信孝、松岡雅雄、児玉栄一、大石真也、田中理紀、秦洋二、堤浩子、梶原一美、常盤礼
  • 権利者名: 科学技術振興機構、京都大学、月桂冠
  • 産業財産権番号: 2009-164647
  • 出願年月日: 2009-07-13
• [産業財産権] 修飾ペプチド及びその製造方法 (2009)
  • 発明者名: 大石真也, 他
  • 権利者名: 科学技術振興機構、京都大学、月桂冠
  • 産業財産権番号: 2009-164647
  • 出願年月日: 2009-07-13
• [産業財産権] メタスチン誘導体およびその用途 (2009)
  • 発明者名: 藤井信孝、大石真也、富田健嗣
  • 権利者名: 国立大学法人京都大学、武田薬品工業株式会社
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2009-04-28
  • 取得年月日: 2015-02-27
• [産業財産権] METASTIN DERIVATIVE AND USE THEREOF (2009)
  • 発明者名: Nobutaka Fujii, Shinya Oishi, Kenji Tomita
  • 権利者名: Kyoto University, Takeda Pharmaceutical Company
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2009-04-28
  • 取得年月日: 2013-11-26
  • 外国
• [産業財産権] Metastin derivative and use thereof (2009)
  • 発明者名: Nobutaka Fujii, Shinya Oishi, Kenji Tomita
  • 権利者名: Kyoto University, Takeda Pharmaceutical Company
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2009-04-28
  • 取得年月日: 2017-06-07
  • 外国
• [産業財産権] メタスチン誘導体およびその用途 (2008)
  • 発明者名: 藤井信孝、大石真也、富田健嗣
  • 権利者名: 京都大学、武田薬品工業
  • 産業財産権番号: 2008-119235
  • 出願年月日: 2008-04-30
• [産業財産権] メタスチン誘導体およびその用途 (2008)
  • 発明者名: 藤井、大石, 他
  • 権利者名: 泉都大学・武田薬品工業
  • 産業財産権番号: 2008-000001
  • 出願年月日: 2008-04-30
• [産業財産権] Eg5阻害剤 (2008)
  • 発明者名: 藤井、大石, 他
  • 権利者名: 京都大学・ファルマIP
  • 産業財産権番号: 2008-331963
  • 出願年月日: 2008-12-16