タイリングアレイを用いたレンサ球菌感染症の発症機構の解明

• 研究課題/領域番号: 20790111
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 環境系薬学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 丸山 史人 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (30423122)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2009年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2008年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: 微生物・感染症学 / タイリングアレイ / トランスクリプトーム / non-coding RNA / A群レンサ球菌 / non- codingRNA / レンサ球菌

研究概要

A群レンサ球菌のゲノムは,GC含量が低いために,転写因子・転写に関わる遺伝子領域の特定が容易ではない.本研究では,cDNAアレイおよびタイリングアレイを用いて,宿主細胞内に侵入した本菌RNAの網羅的な発現解析法の確立を行った.その結果,non-coding RNAは58個にも及んでいた.また,宿主の免疫に対抗して生存するために必要な遺伝子を抽出することができた.その結果,本菌は新規non-coding RNAや機能未知の遺伝子群を利用することにより,多彩な病原性を発揮しているものと考えられた.

研究成果

• [雑誌論文] Comparative genomic analyses of Streptococcus mutans provide insights into chromosomal shuffling and species-specific content (2009)
  • 著者名/発表者名: F. Maruyama, M. Kobata, K. Kurokawa, K. Nishida, A. Sakurai, K. Nakano, R. Nomura, S. Kawabata, T. Ooshima, K. Nakai, M. Hattori, S. Hamada, I. Nakagawa
  • 雑誌名: BMC Genomics 10 ページ: 358-358
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cost effective DNA sequencing and template preparation from bacterial colonies and plasmids. (2009)
  • 著者名/発表者名: F. Maruyama*, T. Nozawa*, C. Aikawa, A. Sakurai, I. Nakagawa
  • 雑誌名: ournal of Bioscience and Bioengineering 104 ページ: 471-473
  • NAID: 110007225791
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative genomic analyses of Streptococcus mutans provide insights into chromosomal shuffling and species-specific content (2009)
  • 著者名/発表者名: F.Maruyama, M.Kobata, K.Kurokawa, K.Nishida, A.Sakurai, K.Nakano, R.Nomura, S.Kawabata, T.Ooshima, K.Nakai, M.Hattori, S.Hamada, I.Nakagawa
  • 雑誌名: BMC Genomics 10 ページ: 358-358
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cost effective DNA sequencing and template preparation from bacterial colonies and plasmids (2009)
  • 著者名/発表者名: F.Maruyama, T.Nozawa, C.Aikawa, A.Sakurai, I.Nakagawa
  • 雑誌名: Journal of Bioscience and Bioengineering 104 ページ: 471-473
  • NAID: 110007225791
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cost- effective DNA sequencing and Template Preparation from Bacterial Colony and Plasmid. (2009)
  • 著者名/発表者名: F. Maruyama
  • 雑誌名: J. Biosci. Bioeng. in press
  • NAID: 110007225791
  • 査読あり
• [雑誌論文] Application of real- time long and short polymerase chain reaction for sensitive monitorinE of the fate of extracellular nlasmid DNA. (2008)
  • 著者名/発表者名: F. Maruyama
  • 雑誌名: Microb. Environ. 233 ページ: 229-236
  • 査読あり
• [雑誌論文] Streptococcus pyogenes degrades extracellular matrix in chondrocytes via MMP- 1 (2008)
  • 著者名/発表者名: A. Sakurai
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun 373 ページ: 450-454
  • 査読あり
• [雑誌論文] Current and future biotechnological applications of bacterial phytases and phvtase- producine bacteria. (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Jorquera
  • 雑誌名: Microb. Environ. 23 ページ: 182-191
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reactive oxygen species induced by fibronectin-mediated Streptococcus pyogenes invasion trigger apoptotic cell death in infected epithelial cells.
  • 著者名/発表者名: C. Aikawa, T. Nozawa, F. Maruyama, K. Tsumoto, S. Hamada, I. Nakagawa
  • 雑誌名: Cellular Microbiology (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reactive oxygen species induced by fibronectin-mediated Streptococcus pyogenes invasion trigger apoptotic cell death in infected epithelial cells
  • 著者名/発表者名: C.Aikawa, T.Nozawa, F.Maruama, K.Tsumoto, S.Hamada, I.Nakagawa
  • 雑誌名: Cellular Microbiology (In press)
  • 査読あり
• [学会発表] レンサ球菌属ゲノム情報に基づく種特異的進化機構の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 丸山史人
  • 学会等名: 第83回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2010-03-27
• [学会発表] ビブリオ科細菌における薬剤耐性プラスミド全塩基配列解析とその伝達機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 野中里佐・丸山史人・宮本学・黒川顕・増田道明
  • 学会等名: 日本微生物生態学会
  • 発表場所: 広島
  • 年月日: 2009-11-21
• [学会発表] 次世代シーケンサーの基礎と細菌学への応用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 丸山史人
  • 学会等名: 第3回細菌学・若手コロセウム
  • 発表場所: 宮崎
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] 芳香族化合物による土壌撹乱に対するバクテリア群集の環境応答のメタゲノム解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 森宙史, 加藤広海, 堂園亜由美, 大坪嘉行, 宮腰昌利, 丸山史人, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 永田裕二, 黒川顕, 津田雅孝
  • 学会等名: 細菌学若手コロッセウム
  • 発表場所: 宮崎
  • 年月日: 2009-10-26
• [学会発表] Species-specific evolutionary strategies revealed from genome and transcriptome of Streptococcus pyogenes and S. mutans (2009)
  • 著者名/発表者名: F. Maruyama, H. Mori, C. Aikawa, T. Nozawa, K. Kurokawa, I. Nakagawa
  • 学会等名: ProkaGENOMICS 2009
  • 発表場所: Goettingen, Germany
  • 年月日: 2009-10-04
• [学会発表] A visualization tool for comparative community analyses using nearest relatives (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Mori, F. Maruyama, K. Kurokawa
  • 学会等名: ProkaGENOMICS 2009
  • 発表場所: Goettingen, Germany
  • 年月日: 2009-10-04
• [学会発表] Species-specific evolutionary strategies revealed from genome and transcriptome of Streptococcus pyogenes and S.mutans (2009)
  • 著者名/発表者名: F.Maruyama, H.Mori, C.Aikawa, T.Nozawa, K.Kurokawa, I.Nakagawa
  • 学会等名: ProkaGENOMICS 2009
  • 発表場所: Goettingen, Germany
  • 年月日: 2009-10-04
• [学会発表] 口腔領域レンサ球菌による宿主上皮細胞への付着侵入と炎症の誘導 (2009)
  • 著者名/発表者名: 桜井敦朗, 岡橋暢夫, 中田匡宣, 寺尾豊, 丸山史人, 川端重忠, 大嶋隆
  • 学会等名: 第18回Lancefieldレンサ球菌研究会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2009-06-26
• [学会発表] 口腔領域レンサ球菌による宿主上皮細胞への付着侵入と炎症の誘導 (2009)
  • 著者名/発表者名: 桜井敦朗, 岡橋暢夫, 中田匡宣, 寺尾豊, 丸山史人, 川端重忠, 大嶋隆
  • 学会等名: 第18回 Lancefield レンサ球菌研究会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2009-06-26
• [学会発表] Streptococcus mutansおよびS. pyogenesゲノム・トランスクリプトームからみた種分化機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 丸山史人, 大野雅幸, 相川知広, 野澤孝志, 桜井敦朗, 中川一路
  • 学会等名: 日本細菌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2009-03-12
• [学会発表] A群レンサ球菌の全ゲノム発現解析に基づく細胞内生存機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大野雅幸, 丸山史人, 相川知広, 野澤孝志, 桜井敦朗, 中川一路
  • 学会等名: 日本細菌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2009-03-12
• [学会発表] オートファジー誘導によるA群レンサ球菌感染上皮の細胞死制御機構の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 相川知広, 野澤孝志, 大野雅幸, 丸山史人, 中川一路
  • 学会等名: 日本細菌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2009-03-12
• [学会発表] A群レンサ球菌感染時にオートファジーを誘導するNLRファミリーと相互作用する宿主因子の機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 野澤孝志, 桜井敦朗, 大野雅幸, 相川知広, 丸山史人, 中川一路
  • 学会等名: 日本細菌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2009-03-12
• [学会発表] Streptococuss mutansおよびS.pyogenesゲノム・トラノスクリプトームからみた種分化機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 丸山史人
  • 学会等名: 日本細菌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2009-03-12
• [学会発表] Streptococcus mutansおよびS. pyogenesゲノム・トランスクリプトームからみた種分化機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 丸山史人, 大野雅幸, 相川知広, 野澤孝志, 桜井敦朗, 中川一路
  • 学会等名: ゲノム微生物学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-03-05
• [学会発表] Streptococcus muansおよびS.pyogenesゲノム・トランーヌクリプトームからみた種分化機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 丸山史人
  • 学会等名: ゲノム微生物学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-03-05
• [学会発表] Group A streptococcus transcriptome aynamics insiae numan cell reveals bacterial adaptation and survival against innate immune systems (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Ono
  • 学会等名: The 8th Awaji International Forum on Infection and Immunity
  • 発表場所: Hyogo
  • 年月日: 2008-09-08
• [学会発表] Ilaentirication or minimum structure or patnogen- associatea molecular pattern and the recognition mechanism'in autophagy induction against group (2008)
  • 著者名/発表者名: T. Nozawa
  • 学会等名: The 8th Awaji International Forum on Infection and Immunity
  • 発表場所: Hyogo
  • 年月日: 2008-09-08
• [学会発表] 比較ゲノム・トランスクリトームにつくStreptococcus mutansおよびS.pyogenesの種レベルでの進化機構の解明 (2008)
  • 著者名/発表者名: 丸山史人
  • 学会等名: 特定領域研究「ゲノム」4領域合同班会議
  • 発表場所: 兵庫
  • 年月日: 2008-08-25
• [学会発表] 比ゲノム・トランスクリトームにつくStreptococcus mutansおよびS.pyogenesゲノム進化機能の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 丸山史人
  • 学会等名: 第2回細菌学・若手コロッセウム
  • 発表場所: 神奈川
  • 年月日: 2008-08-03
• [図書] 難培養微生物研究の最新技術II-ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望-Current Technology and Perspectives for Yet-uncultivated Microbial Resources (2010)
  • 著者名/発表者名: 森宙史、丸山史人、黒川顕
  • 出版者: シーエムシー出版(未定(印刷中))