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PPARγ発現調節機構の研究

研究課題

研究課題/領域番号 20890055
研究種目

若手研究(スタートアップ)

配分区分補助金
研究分野 代謝学
研究機関東京大学

研究代表者

脇 裕典  東大, 医学部附属病院 (00466765)

研究期間 (年度) 2008 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
3,302千円 (直接経費: 2,540千円、間接経費: 762千円)
2009年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2008年度: 1,742千円 (直接経費: 1,340千円、間接経費: 402千円)
キーワード発生・分化 / 糖尿病 / ゲノム / 転写調節 / クロマチン
研究概要

(A)'エピジェネティクスによるPPARg発現ポテンシャルの制御機構の検討発生分化の制御転写因子の発現ポテンシャルの維持に重要とされるエピジェネティクス変化がPPARgの発現制御に果たす役割を検討するために、抗体(抗H3K4me3、H3K27me3、H3K9me3、H3/4ac抗体など)を用いたクロマチン免疫沈降の系を、胎児線維芽細胞、3T3-L1/F442A細胞、NIH-3T3細胞において確立した。胎児線維芽細胞において、分化に重要な転写因子の発現ポテンシャルを規定するヒストン修飾H3K4me3,H3K27me3('bivalent' mark)を、また分化に伴うH3K4me3のみの活性型への変化が認められ、ヒストン修飾制御が分化における分化制御因子の発現制御のメカニズムのひとつであることが示唆された。
(B)ヒトPPARg-BACの3T3-F442A細胞への導入による長距離発現制御領域の同定と機能アッセイ入手したヒトPPARgを含むBACクローンを、RecA/RecET組み換え法でKan/neoカセットを導入したクローンを作成した。カセットの導入はサザンブロッティングにより確認した。現在3T3-F442A細胞に導入後、安定発現細胞株を複数株クローニング中である。
(C)PPARg遺伝子領域の比較ゲノミクスによる高相同性領域の検索多種動物間のゲノムデータベース上認められたPPARg近傍の高相同性領域のピークをリポーターベクターpGL3にクローニングを行っている。
(A-1)Chromosome Conformation Capture(3C法)によるPPARg遺伝子領域のクロマチン高次構造の変化の解析クロマチン高次構造の変化がPPARgの発現制御に果たす役割を検討するために、3T3-L1/F442A、NIH-3T3、C2C12を中心に3C法の実験系の最適化を現在行っている。

報告書

(1件)
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Chromosome conformation capture (3C)を用いたエピジェネティクス解析2008

    • 著者名/発表者名
      脇裕典, 山内敏正, 門脇孝
    • 雑誌名

      内分泌・糖尿病科 27(6)

      ページ: 585-591

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Identification of PPARgamma/RXR Binding Sites and Two Splicing Variants with Alternative Promoters in AdipoR2 genomic region in Adipocytes by Genome-wide ChIPseq Profiling2009

    • 著者名/発表者名
      Hironori Waki, Kenichi Wakabayashi, Toshimasa Yamauchi, Jing Yu, Tatsuhiko Kodama, Hiroyuki Aburatani, Juro Sakai, and Takashi Kadowaki
    • 学会等名
      Chromatin Conference: Histones, Nucleosomes, Chromosomes and Genor
    • 発表場所
      Singapore
    • 年月日
      2009-02-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2016-04-21  

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