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メソフルイド分散系の非平衡直接数値シミュレーション

研究課題

研究課題/領域番号 20H00129
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分13:物性物理学およびその関連分野
研究機関京都大学

研究代表者

山本 量一  京都大学, 工学研究科, 教授 (10263401)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
44,330千円 (直接経費: 34,100千円、間接経費: 10,230千円)
2023年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
2022年度: 11,830千円 (直接経費: 9,100千円、間接経費: 2,730千円)
2021年度: 11,830千円 (直接経費: 9,100千円、間接経費: 2,730千円)
2020年度: 13,000千円 (直接経費: 10,000千円、間接経費: 3,000千円)
キーワードソフトマター / シミュレーション / 流体力学 / 直接数値計算 / コロイド分散系 / 微粒子分散系 / マイクロスイマー / アクティブマター
研究開始時の研究の概要

メソフルイド分散系とは、相分離流体や高分子流体などのメソスケールの構造を有する流体中に粒子が分散した状態を表す名称である。メソフルイド分散系の内部には非常に遅いダイナミクスが存在するため、ミクロな分子シミュレーションを用いることは現実的でない。また内部に非平衡状態が容易に出現するため、マクロな計算流体力学をそのまま適用することもできない。注目するメソスケールの時間変化を捉えられる直接数値シミュレーション手法の開発が必要である。本研究では手法の構築にとどまらず、第三者が利用可能なソフトウェアを開発・公開することで、ソフトマター分野における計算科学の社会実装を目指す。

研究成果の概要

ミュレーションによる実用的なソフトマターの材料・プロセス設計を想定し,3つの研究項目:1)ナノ微粒子分散系のダイナミクス,2)コロイドガラス系のダイナミクス,
3)アクティブ粒子系のダイナミクス,について,マルチスケール・マルチフィジックスシミュレーションを適用し,成果を得た.特に,細胞の集団運動に対する細胞周期の役割や,粘弾性流体中でのマイクロスイマーの回転および泳動形態による泳動速度が変化するメカニズム,水溶液中を自己推進する触媒型マイクロモーターの推進機構の理解に関して,大きな成果を得ることに成功した.

研究成果の学術的意義や社会的意義

分子動力学法や計算流体力学法など,既存のシミュレーション法ではソフトマターの膨大な自由度のごく一部しか同時に扱うことが出来ず,異なるスケールの運動を同時にまるごとシミュレーションすることは不可能であった.我々は,この問題を解決するために粗視化モデリングとマルチスケール・マルチフィジックスモデリングの2つのアプローチを用いてこの分野の研究を牽引している. これまでは純粋に科学的・学術的な興味が主体であり,材料やプロセスを設計するためのツールとして使える段階に至っていなかったが,本研究の成果はその克服につながるものである.

報告書

(6件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (71件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (5件) 雑誌論文 (16件) (うち国際共著 10件、 査読あり 16件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (45件) (うち国際学会 27件、 招待講演 9件) 備考 (5件)

  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] Universite´de Montpellier(フランス)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Warwick(英国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Dynamics of microswimmers near a liquid?liquid interface with viscosity difference2023

    • 著者名/発表者名
      Feng Chao、Molina John J.、Turner Matthew S.、Yamamoto Ryoichi
    • 雑誌名

      Physics of Fluids

      巻: 35 号: 5

    • DOI

      10.1063/5.0148008

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Dynamics of a Model Microswimmer in the Vicinity of a Liquid Droplet2023

    • 著者名/発表者名
      Feng Chao、Molina John J.、Yamamoto Ryoichi
    • 雑誌名

      Journal of the Physical Society of Japan

      巻: 92 号: 7

    • DOI

      10.7566/jpsj.92.074802

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Direct numerical simulations of a microswimmer in a viscoelastic fluid2023

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi Takuya、Jung Gerhard、Matsuoka Yuki、Nakayama Yasuya、Molina John J.、Yamamoto Ryoichi
    • 雑誌名

      Soft Matter

      巻: 19 号: 37 ページ: 7109-7121

    • DOI

      10.1039/d3sm00600j

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Learning to swim efficiently in a nonuniform flow field2023

    • 著者名/発表者名
      Sankaewtong Krongtum、Molina John J.、Turner Matthew S.、Yamamoto Ryoichi
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 107 号: 6

    • DOI

      10.1103/physreve.107.065102

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Rational social distancing in epidemics with uncertain vaccination timing2023

    • 著者名/発表者名
      Schnyder Simon K.、Molina John J.、Yamamoto Ryoichi、Turner Matthew S.
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 18 号: 7 ページ: e0288963-e0288963

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0288963

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Rational social distancing policy during epidemics with limited healthcare capacity2023

    • 著者名/発表者名
      Schnyder Simon K.、Molina John J.、Yamamoto Ryoichi、Turner Matthew S.
    • 雑誌名

      PLOS Computational Biology

      巻: 19 号: 10 ページ: e1011533-e1011533

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1011533

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Direct numerical simulations of isolated rigid particles; Validation of smooth profile method2023

    • 著者名/発表者名
      Uzair Muhammad、Qasim M. Danyal、Bhatti M. Aashan、Zaidi Ali Abbas、Molina John J.、Yamamoto Ryoichi、Hamid Adnan
    • 雑誌名

      Powder Technology

      巻: 418 ページ: 118280-118280

    • DOI

      10.1016/j.powtec.2023.118280

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Collective Motion of Quincke Rollers with Fully Resolved Hydrodynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Imamura Shun、Sawaki Kohei、Molina John J.、Turner Matthew S.、Yamamoto Ryoichi
    • 雑誌名

      Advanced Theory and Simulations

      巻: 6 号: 4 ページ: 2200683-2200683

    • DOI

      10.1002/adts.202200683

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Dynamics of microswimmers near a soft penetrable interface2022

    • 著者名/発表者名
      Feng Chao、Molina John J.、Turner Matthew S.、Yamamoto Ryoichi
    • 雑誌名

      Physical Review Research

      巻: 4 号: 4 ページ: 043202-043202

    • DOI

      10.1103/physrevresearch.4.043202

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Competition between cell types under cell cycle regulation with apoptosis2022

    • 著者名/発表者名
      Li Jintao、Schnyder Simon K.、Turner Matthew S.、Yamamoto Ryoichi
    • 雑誌名

      Physical Review Research

      巻: 4 号: 3 ページ: 033156-033156

    • DOI

      10.1103/physrevresearch.4.033156

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mechanochemical subcellular-element model of crawling cells2022

    • 著者名/発表者名
      Mitsusuke Tarama, Kenji Mori, Ryoishi Yamamoto
    • 雑誌名

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      巻: 10 ページ: 1046053-1046053

    • DOI

      10.3389/fcell.2022.1046053

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Relation between dynamic heterogeneities observed in scattering experiments and four-body correlations2022

    • 著者名/発表者名
      Kanayama Kohsei、Hoshino Taiki、Yamamoto Ryoichi
    • 雑誌名

      Physical Review Research

      巻: 4 号: 2

    • DOI

      10.1103/physrevresearch.4.l022006

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] コロイド分散系の直接数値計算2021

    • 著者名/発表者名
      山本 量一
    • 雑誌名

      粉砕

      巻: 65 号: 0 ページ: 11-17

    • DOI

      10.24611/micromeritics.2022006

    • NAID

      130008129283

    • ISSN
      0429-9051, 2432-2075
    • 年月日
      2021-12-15
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role of the Cell Cycle in Collective Cell Dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      Li Jintao、Schnyder Simon K.、Turner Matthew S.、Yamamoto Ryoichi
    • 雑誌名

      Physical Review X

      巻: 11 号: 3 ページ: 031025-031025

    • DOI

      10.1103/physrevx.11.031025

    • NAID

      120007141956

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Smoothed profile method for direct numerical simulations of hydrodynamically interacting particles2021

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Ryoichi、Molina John Jairo、Nakayama Yasuya
    • 雑誌名

      Soft Matter

      巻: - 号: 16 ページ: 4226-4253

    • DOI

      10.1039/d0sm02210a

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamics of a chiral swimmer sedimenting on a flat plate2020

    • 著者名/発表者名
      Fadda Federico、Molina John Jairo、Yamamoto Ryoichi
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 101 号: 5 ページ: 52608-52608

    • DOI

      10.1103/physreve.101.052608

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Direct numerical simulations of active particles with fully resolved hydrodynamics2024

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      Advanced core-to-core network for the physics of self-organizing active matter, workshop in Wenzhou
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Simulations of hydrodynamically interacting particles2024

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      JNCASR - CECAM Conference - MD@60
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Direct Numerical Simulations (DNS)of active particles in complex environments2023

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      New statistical physics in living matter: non equilibrium states under adaptive control, Workshop at the Isaac Newton Institute for Mathematical Sciences
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Dynamics of microswimmers in complex media: influence of interface or viscoelasticity2023

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      StatPhysHK 2023: A Satellite Meeting of The XXVIII IUPAP International Conference on Statistical Physics
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Direct numerical simulations (DNS) of active particles with fully resolved hydrodynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      28th International Conference on Statistical Physics, Statphys28
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Direct numerical simulations (DNS) of active particles with fully resolved hydrodynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Kenta Ogawa
    • 学会等名
      28th International Conference on Statistical Physics, Statphys28
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] KAPSELによる粒子分散系の直接数値シミュレーション2023

    • 著者名/発表者名
      山本量一
    • 学会等名
      OCTA20周年記念講演会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Direct Numerical Simulations (DNS)of active particles with fully resolved hydrodynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      Active Matter in Complex Environments
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Direct numerical simulations of microswimmers in viscoelastic fluids2023

    • 著者名/発表者名
      Takuya Kobayashi
    • 学会等名
      The 16th International Workshop for East Asian Young Rheologist
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Direct Numerical Simulation of Metallodielectric Janus Particles2023

    • 著者名/発表者名
      John J. Molina
    • 学会等名
      APS March Meeting 2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Direct numerical simulations of a model microswimmer near a liquid-liquid interface2023

    • 著者名/発表者名
      Chao Feng
    • 学会等名
      Active Matter Workshop 2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 直接数値計算による自己推進粒子のダイナミクス2023

    • 著者名/発表者名
      山本量一
    • 学会等名
      生物とソフトマターに関する理論とシミュレーションについての研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Dynamics of micro-swimmers near deformable and penetrable interfaces2022

    • 著者名/発表者名
      Chao Feng
    • 学会等名
      APPC15: The 15th Asia Pacific Physics Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Microswimmers in viscoelastic fluids2022

    • 著者名/発表者名
      Takuya Kobayashi
    • 学会等名
      APPC15: The 15th Asia Pacific Physics Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Learning to swim efficiently in a nonuniform flow field2022

    • 著者名/発表者名
      Krongtum Sankaewtong
    • 学会等名
      The International Soft Matter Conference (ISMC 2022)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] DNS of active particles with fully resolved hydrodynamics2022

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      The International Soft Matter Conference (ISMC 2022)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Direct numerical simulations of active particles with fully resolved hydrodynamics2022

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      25th Anniversary Symposium of German-japanese Joint Research Project on Nonequilibrium Statistical Physics Perspective for Future Collaboration
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Direct numerical simulations of active particles with fully resolved hydrodynamics2022

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      KPS 70th Anniversary and 2022 Fall Meeting
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Direct Numerical Simulations (DNS)of active particleswith fully resolved hydrodynamics2022

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      The 31st International Toki Conference on Plasma and Fusion Research (ITC31)Expanding academic world emerging from fusion science
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 粘弾性流体中を泳動するマイクロスイマー:回転運動による速度上昇2022

    • 著者名/発表者名
      小林巧弥
    • 学会等名
      日本物理学会 2022年秋季大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] コロイド分散系の直接数値計算2022

    • 著者名/発表者名
      山本量一
    • 学会等名
      ホソカワ粉体工学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 直接数値計算による粘弾性流体中を泳動するマイクロスイマーのダイナミクス2022

    • 著者名/発表者名
      小林巧弥
    • 学会等名
      第70回レオロジー討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 粘弾性流体中を泳動するモデル微生物の直接数値計算2022

    • 著者名/発表者名
      小林巧弥
    • 学会等名
      第10回ソフトマター研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 粒子分散系の直接数値シミュレーターKAPSELの紹介2022

    • 著者名/発表者名
      山本量一
    • 学会等名
      先端化学・材料技術部会 CC分科会 高分子WG勉強会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Competition between two cell types under cell cycle regulation with apoptosis2022

    • 著者名/発表者名
      Jintao Li
    • 学会等名
      American Physical Society (APS) March Meeting 2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Collective Dynamics of Quincke Rollers with Fully Resolved Hydrodynamics2022

    • 著者名/発表者名
      Shun Imamura
    • 学会等名
      American Physical Society (APS) March Meeting 2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Rational policy design for epidemics2022

    • 著者名/発表者名
      Simon K. Schnyder
    • 学会等名
      American Physical Society (APS) March Meeting 2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Nash Neural Networks2022

    • 著者名/発表者名
      John J. Molina
    • 学会等名
      American Physical Society (APS) March Meeting 2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Rational policy design for epidemics2021

    • 著者名/発表者名
      Simon K. Schnyder
    • 学会等名
      27th International Conference on Computing in Economics and Finance
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] DNS of self-propelled particles2021

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      RIMS Workshop Mathematical Mechanobiology
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Direct numerical simulation of Quincke rollers2021

    • 著者名/発表者名
      Ryoichi Yamamoto
    • 学会等名
      11th Liquid Matter Conference
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Cell migration and colony growth in a monolayer of model cells2021

    • 著者名/発表者名
      Simon K. Schnyder
    • 学会等名
      11th Liquid Matter Conference
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The role of the cell cycle in collective cell dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      Jintao Li
    • 学会等名
      Physics meets Biology 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Rational policy design for epidemics2021

    • 著者名/発表者名
      Simon K. Schnyder
    • 学会等名
      24.5th Workshop on Economics with Heterogeneous Interacting Agents 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Role of the Cell Cycle in Collective Cell Dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      Simon K. Schnyder
    • 学会等名
      RIMS Workshop on Mathematical Mechanobiology
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] X 線散乱実験と分子シミュレーションの連携による過冷却液体の動 的構造の解明2021

    • 著者名/発表者名
      金山昂生
    • 学会等名
      日本物理学会2021年秋季大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 直接数値計算による液滴乾燥過程のダイナミクス2021

    • 著者名/発表者名
      小林巧弥
    • 学会等名
      第69回レオロジー討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] X線散乱実験と分子シミュレーションの連携による過冷却液体の動的構造の解明2021

    • 著者名/発表者名
      金山昂生
    • 学会等名
      第35回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Role of the Cell Cycle in Collective Cell Dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      Simon K. Schnyder
    • 学会等名
      Active Matter Workshop 2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Mechanical competition between different cell types2021

    • 著者名/発表者名
      Jintao Li
    • 学会等名
      Active Matter Workshop 2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] A mechano-chemical cell cycle for growing cell colonies2021

    • 著者名/発表者名
      Simon Schnyder
    • 学会等名
      American Physical Society (APS) March Meeting
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] MDシミュレーションによるせん断流下での過冷却液体の解析2021

    • 著者名/発表者名
      金山 昂生
    • 学会等名
      化学工学会第86年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 直接数値計算による二成分流体コロイド分散系の粘弾性の評価2020

    • 著者名/発表者名
      金山 昂生
    • 学会等名
      第68回レオロジー討論会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 直接数値計算によるヤヌス粒子の誘起電荷電気泳動2020

    • 著者名/発表者名
      江里口 拓哉
    • 学会等名
      第68回レオロジー討論会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 直接数値計算によるクインケローラーの挙動解析2020

    • 著者名/発表者名
      佐脇 航平
    • 学会等名
      第68回レオロジー討論会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] Soft Matter Engineering Lab.

    • URL

      https://sm.cheme.kyoto-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] KAPSEL-5 HP

    • URL

      https://kapsel-dns.com/v5/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] Welcome to KAPSEL-5 HP

    • URL

      https://kapsel-dns.com/v5/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] Welcome to KAPSEL-4 HP

    • URL

      https://kapsel-dns.com/v4/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] KAPSEL HP

    • URL

      https://kapsel-dns.com/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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