• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

次世代型高速AFMの開発と生体分子の詳細機能動態解析

研究課題

研究課題/領域番号 20H00327
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分28:ナノマイクロ科学およびその関連分野
研究機関金沢大学

研究代表者

古寺 哲幸  金沢大学, ナノ生命科学研究所, 教授 (30584635)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
44,590千円 (直接経費: 34,300千円、間接経費: 10,290千円)
2023年度: 9,490千円 (直接経費: 7,300千円、間接経費: 2,190千円)
2022年度: 9,880千円 (直接経費: 7,600千円、間接経費: 2,280千円)
2021年度: 12,870千円 (直接経費: 9,900千円、間接経費: 2,970千円)
2020年度: 12,350千円 (直接経費: 9,500千円、間接経費: 2,850千円)
キーワード原子間力顕微鏡 / 一分子イメージング / タンパク質 / 核酸 / 生体分子 / 生物物理学
研究開始時の研究の概要

高速AFMの誕生により、生体分子の形状とダイナミクスの同時観察が初めて可能となった。しかし、現在の高速AFMの時間分解能では観察できない生命現象の諸過程はまだまだ多い。そこで本研究では、現在の高速AFMの時間分解能を律するデバイス群を大幅に改良し、より高い時間分解能を持った次世代型高速AFMの研究開発を推進する。また、開発した新規の高速AFMを用いてバイオ応用研究を進め、精製した生体分子および、オルガネラや真核細胞表面の生体分子の詳細動態解析を通じて、開発した顕微鏡の性能を示すとともに、生物学的に意義深い新知見を得ることを目的とする。

研究成果の概要

高速AFMは、機能中の生体分子の形状と動きを同時に観察できるユニークな顕微鏡である。しかし、従来の時間分解能では観察できない生命現象はたくさんある。そこで、より広範な生命現象にアクセスできる顕微鏡の開発を目指して、高速AFMの時間分解能を律していたZスキャナー、カンチレバーの振幅計測器、カンチレバーの応答速度を大幅に短くすることに成功した。さらに、開発したデバイスを含んだ高速AFMを用いて、リボソームストーク複合体に翻訳因子が集合する過程やCRISPR-Cas3がDNAを巻取りながらDNAを長距離に渡って切断する様子などの観察に成功し、生物学的に意義深い新知見を得ることができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

イメージング技術の発明や発展は、これまで見えなかった世界や現象を新たに“見る”ことを可能にするため、いつの時代も新しい科学の進展につながってきた。とりわけ生命科学の分野においては、現象の新発見とその詳細理解が、新たな診断・治療法、医薬品の開発に直結するため、その寄与は大きい。本研究では、機能中の生体分子の形状と動きを同時に観察できるユニークな顕微鏡法である高速AFMの時間分解能を大幅に向上させるデバイス群を開発することに成功した。人類の可視化範囲を広げることに寄与したと言えるため、研究成果の学術的・社会的意義は大きいと考える。

報告書

(6件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (106件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (11件) 雑誌論文 (46件) (うち国際共著 20件、 査読あり 46件、 オープンアクセス 39件) 学会発表 (29件) (うち国際学会 8件、 招待講演 12件) 図書 (1件) 備考 (14件) 産業財産権 (5件)

  • [国際共同研究] Emory University/Colorado State University(米国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] Vilnius University(リトアニア)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] ShanghaiTech University/Fudan University(中国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] CNRS UMR9198(フランス)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] IISER Thiruvananthapuram(インド)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Emory University(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Emory University(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Zernike Instituut(オランダ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Nong Lam University/Ho Chi Minh City Open Universit/Rubber Research Institute of Vietnam(ベトナム)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] UUSER TVM(インド)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Colorado State University/Univ. Colorado Sch. Med./University of Iowa College of Medicine(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] S100A11 promotes focal adhesion disassembly via myosin II-driven contractility and Piezo1-mediated Ca2+ entry2024

    • 著者名/発表者名
      Mohammed Tareg Omer、Lin You-Rong、Akter Lucky、Weissenbruch Kai、Ngo Kien Xuan、Zhang Yanjun、Kodera Noriyuki、Bastmeyer Martin、Miyanari Yusuke、Taoka Azuma、Franz Clemens M.
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 137 号: 2

    • DOI

      10.1242/jcs.261492

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Atom Filtering Algorithm and GPU-Accelerated Calculation of Simulation Atomic Force Microscopy Images2024

    • 著者名/発表者名
      Amyot Romain、Kodera Noriyuki、Flechsig Holger
    • 雑誌名

      Algorithms

      巻: 17 号: 1 ページ: 38-38

    • DOI

      10.3390/a17010038

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Removing the parachuting artifact using two-way scanning data in high-speed atomic force microscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Kubo Shintaroh、Umeda Kenichi、Kodera Noriyuki、Takada Shoji
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 20 号: 1 ページ: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.0006

    • ISSN
      2189-4779
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] BioAFMviewer software for simulation atomic force microscopy of molecular structures and conformational dynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Amyot Romain、Kodera Noriyuki、Flechsig Holger
    • 雑誌名

      Journal of Structural Biology: X

      巻: 7 ページ: 100086-100086

    • DOI

      10.1016/j.yjsbx.2023.100086

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] PQBP5/NOL10 maintains and anchors the nucleolus under physiological and osmotic stress conditions2023

    • 著者名/発表者名
      Jin Xiaocen、Tanaka Hikari、Jin Meihua、Fujita Kyota、Homma Hidenori、Inotsume Maiko、Yong Huang、Umeda Kenichi、Kodera Noriyuki、Ando Toshio、Okazawa Hitoshi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 1-20

    • DOI

      10.1038/s41467-022-35602-w

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Spatiotemporal resolution in high-speed atomic force microscopy for studying biological macromolecules in action2023

    • 著者名/発表者名
      Umeda Kenichi、McArthur Steven J、Kodera Noriyuki
    • 雑誌名

      Microscopy

      巻: 72 号: 2 ページ: 151-161

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfad011

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] High-Speed Atomic Force Microscopy Reveals Spontaneous Nucleosome Sliding of H2A.Z at the Subsecond Time Scale2023

    • 著者名/発表者名
      Morioka Shin、Sato Shoko、Horikoshi Naoki、Kujirai Tomoya、Tomita Takuya、Baba Yudai、Kakuta Takahiro、Ogoshi Tomoki、Puppulin Leonardo、Sumino Ayumi、Umeda Kenichi、Kodera Noriyuki、Kurumizaka Hitoshi、Shibata Mikihiro
    • 雑誌名

      Nano Letters

      巻: 23 号: 5 ページ: 1696-1704

    • DOI

      10.1021/acs.nanolett.2c04346

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamics of Target DNA Binding and Cleavage by Staphylococcus aureus Cas9 as Revealed by High-Speed Atomic Force Microscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Puppulin Leonardo、Ishikawa Junichiro、Sumino Ayumi、Marchesi Arin、Flechsig Holger、Umeda Kenichi、Kodera Noriyuki、Nishimasu Hiroshi、Shibata Mikihiro
    • 雑誌名

      ACS Nano

      巻: 17 号: 5 ページ: 4629-4641

    • DOI

      10.1021/acsnano.2c10709

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Purification of Na+-Driven MotPS Stator Complexes and Single-Molecule Imaging by High-Speed Atomic Force Microscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Terahara Naoya、Kodera Noriyuki
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2646 ページ: 109-124

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-3060-0_10

    • ISBN
      9781071630594, 9781071630600
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural Dynamics of Amyloid-β Protofibrils and Actions of Anti-Amyloid-β Antibodies as Observed by High-Speed Atomic Force Microscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Watanabe-Nakayama Takahiro、Tsuji Mayumi、Umeda Kenichi、Oguchi Tatsunori、Konno Hiroki、Noguchi-Shinohara Moeko、Kiuchi Yuji、Kodera Noriyuki、Teplow David B.、Ono Kenjiro
    • 雑誌名

      Nano Letters

      巻: 23 号: 13 ページ: 6259-6268

    • DOI

      10.1021/acs.nanolett.3c00187

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dynamic Solution Structures of Whole Human NAP1 Dimer Bound to One and Two Histone H2A-H2B Heterodimers Obtained by Integrative Methods2023

    • 著者名/発表者名
      Ohtomo Hideaki、Yamane Tsutomu、Oda Takashi、Kodera Noriyuki、Kurita Jun-ichi、Tsunaka Yasuo、Amyot Romain、Ikeguchi Mitsunori、Nishimura Yoshifumi
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 435 号: 15 ページ: 168189-168189

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2023.168189

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Imaging single CaMKII holoenzymes at work by high-speed atomic force microscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Tsujioka Shotaro、Sumino Ayumi、Nagasawa Yutaro、Sumikama Takashi、Flechsig Holger、Puppulin Leonardo、Tomita Takuya、Baba Yudai、Kakuta Takahiro、Ogoshi Tomoki、Umeda Kenichi、Kodera Noriyuki、Murakoshi Hideji、Shibata Mikihiro
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 9 号: 26

    • DOI

      10.1126/sciadv.adh1069

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Predicting the placement of biomolecular structures on AFM substrates based on electrostatic interactions2023

    • 著者名/発表者名
      Amyot Romain、Nakamoto Kaho、Kodera Noriyuki、Flechsig Holger
    • 雑誌名

      Frontiers in Molecular Biosciences

      巻: 10 ページ: 1264161-1264161

    • DOI

      10.3389/fmolb.2023.1264161

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamic action of an intrinsically disordered protein in DNA compaction that induces mycobacterial dormancy2023

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama Akihito、Shimizu Masahiro、Narita Tomoyuki、Kodera Noriyuki、Ozeki Yuriko、Yokoyama Akira、Mayanagi Kouta、Yamaguchi Takehiro、Hakamata Mariko、Shaban Amina?Kaboso、Tateishi Yoshitaka、Ito Kosuke、Matsumoto Sohkichi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 52 号: 2 ページ: 816-830

    • DOI

      10.1093/nar/gkad1149

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural Dynamics of E6AP E3 Ligase HECT Domain and Involvement of a Flexible Hinge Loop in the Ubiquitin Chain Synthesis Mechanism2023

    • 著者名/発表者名
      Takeda Kazusa、Flechsig Holger、Muro Ikumi、Amyot Romain、Kobayashi Fuminori、Kodera Noriyuki、Ando Toshio、Konno Hiroki
    • 雑誌名

      Nano Letters

      巻: 23 号: 24 ページ: 11940-11948

    • DOI

      10.1021/acs.nanolett.3c04150

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Kinetochore-microtubule attachment in human cells is regulated by the interaction of a conserved motif of Ska1 with EB12023

    • 著者名/発表者名
      Radhakrishnan Renjith M.、Kizhakkeduth Safwa T.、Nair Vishnu M.、Ayyappan Shine、Lakshmi R. Bhagya、Babu Neethu、Prasannajith Anjaly、Umeda Kenichi、Vijayan Vinesh、Kodera Noriyuki、Manna Tapas K.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 号: 2 ページ: 102853-102853

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102853

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Novel DNA Aptamer for CYP24A1 Inhibition with Enhanced Antiproliferative Activity in Cancer Cells2022

    • 著者名/発表者名
      Biyani Madhu、Yasuda Kaori、Isogai Yasuhiro、Okamoto Yuki、Weilin Wei、Kodera Noriyuki、Flechsig Holger、Sakaki Toshiyuki、Nakajima Miki、Biyani Manish
    • 雑誌名

      ACS Applied Materials, and Interfaces

      巻: 14 号: 16 ページ: 18064-18078

    • DOI

      10.1021/acsami.1c22965

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dynamic mechanisms of CRISPR interference by Escherichia coli CRISPR-Cas32022

    • 著者名/発表者名
      Yoshimi Kazuto、Takeshita Kohei、Kodera Noriyuki、Shibumura Satomi、Yamauchi Yuko、Omatsu Mine、Umeda Kenichi、Kunihiro Yayoi、Yamamoto Masaki、Mashimo Tomoji
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 4917-4917

    • DOI

      10.1038/s41467-022-32618-0

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Guide to studying intrinsically disordered proteins by high-speed atomic force microscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Kodera Noriyuki、Ando Toshio
    • 雑誌名

      Methods

      巻: 207 ページ: 44-56

    • DOI

      10.1016/j.ymeth.2022.08.008

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Importance of annexin V N-terminus for 2D crystal formation and quick purification protocol of recombinant annexin V2022

    • 著者名/発表者名
      Yamada Ryusei、Trang Tran Ngoc、Flechsig Holger、Takeda Toshiki、Kodera Noriyuki、Konno Hiroki
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 17 号: 12 ページ: e0278553-e0278553

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0278553

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Actin-binding domain of Rng2 sparsely bound on F-actin strongly inhibits actin movement on myosin II2022

    • 著者名/発表者名
      Hayakawa Yuuki、Takaine Masak、Ngo Kien Xuan、Imai Taiga、Yamada Masafumi D、Behjat Arash Badami、Umeda Kenichi、Hirose Keiko、Yurtsever Ayhan、Kodera Noriyuki、Tokuraku Kiyotaka、Numata Osamu、Fukuma Takeshi、Ando Toshio、Nakano Kentaro、Uyeda Taro QP
    • 雑誌名

      Life Science Alliance

      巻: 6 号: 1 ページ: e202201469-e202201469

    • DOI

      10.26508/lsa.202201469

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Visualization of intrinsically disordered proteins by high-speed atomic force microscopy.2022

    • 著者名/発表者名
      N. Kodera, T. Ando
    • 雑誌名

      Curr. Opin. Struct. Biol.

      巻: 72 ページ: 260-266

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2021.11.014

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Extracellular vesicles contribute to the metabolism of transthyretin amyloid in hereditary transthyretin amyloidosis2022

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi H, Kawahara H, Kodera N, Kumaki A, Tada Y, Sakai K, Ono K, Yamada M, Hanayama R
    • 雑誌名

      Front Mol Biosci

      巻: 9 ページ: 839917-839917

    • DOI

      10.3389/fmolb.2022.839917

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A high-speed piezoelectric Z-scanner with a resonance frequency above 1.1 MHz for high-speed atomic force microscopy.2022

    • 著者名/発表者名
      M. Shimizu, C. Okamoto, K. Umeda, S. Watanabe, T. Ando, N. Kodera
    • 雑誌名

      Rev. Sci. Instrum.

      巻: 93 号: 1 ページ: 013701-013701

    • DOI

      10.1063/5.0072722

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] High-speed atomic force microscopy reveals a three-state elevator mechanism in the citrate transporter CitS2022

    • 著者名/発表者名
      Maity Sourav、Trinco Gianluca、Buzon Pedro、Anshari Zaid R.、Kodera Noriyuki、Ngo Kien Xuan、Ando Toshio、Slotboom Dirk J.、Roos Wouter H.
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 119 号: 6 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1073/pnas.2113927119

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Native cyclase-associated protein and actin from Xenopus laevis oocytes form a unique 4:4 complex with a tripartite structure2021

    • 著者名/発表者名
      Kodera Noriyuki、Abe Hiroshi、Nguyen Phuong Doan N.、Ono Shoichiro
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 296 ページ: 100649-100649

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.100649

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] High-Speed Atomic Force Microscopy Reveals Spatiotemporal Dynamics of Histone Protein H2A Involution by DNA Inchworming2021

    • 著者名/発表者名
      Nishide Goro、Lim Keesiang、Mohamed Mahmoud Shaaban、Kobayashi Akiko、Hazawa Masaharu、Watanabe-Nakayama Takahiro、Kodera Noriyuki、Ando Toshio、Wong Richard W.
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      巻: 12 号: 15 ページ: 3837-3846

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.1c00697

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Movements of Mycoplasma mobile Gliding Machinery Detected by High-Speed Atomic Force Microscopy2021

    • 著者名/発表者名
      K. Kobayashi, N. Kodera, T. Kasai, YO. Tahara, T. Toyonaga, M. Mizutani, I. Fujiwara, T. Ando, M. Miyata
    • 雑誌名

      mBio

      巻: 12 号: 3 ページ: e00040-21

    • DOI

      10.1128/mbio.00040-21

    • NAID

      120007044470

    • URL

      https://ocu-omu.repo.nii.ac.jp/records/2020097

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] An ultra-wide scanner for large-area high-speed atomic force microscopy with megapixel resolution2021

    • 著者名/発表者名
      Marchesi Arin、Umeda Kenichi、Komekawa Takumi、Matsubara Takeru、Flechsig Holger、Ando Toshio、Watanabe Shinji、Kodera Noriyuki、Franz Clemens M.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 13003-13003

    • DOI

      10.1038/s41598-021-92365-y

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Modeling of DNA binding to the condensin hinge domain using molecular dynamics simulations guided by atomic force microscopy2021

    • 著者名/発表者名
      Koide Hiroki、Kodera Noriyuki、Bisht Shveta、Takada Shoji、Terakawa Tsuyoshi
    • 雑誌名

      PLOS Computational Biology

      巻: 17 号: 7 ページ: e1009265-e1009265

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1009265

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Ultrastructure of influenza virus ribonucleoprotein complexes during viral RNA synthesis2021

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Nakano, Yukihiko Sugita, Noriyuki Kodera, Sho Miyamoto, Yukiko Muramoto, Matthias Wolf, and Takeshi Noda
    • 雑誌名

      Commun. Biol.

      巻: 4 号: 1 ページ: 858-858

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02388-4

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Chained Structure of Dimeric F1-like ATPase in Mycoplasma mobile Gliding Machinery2021

    • 著者名/発表者名
      T. Toyonaga, T. Kato, A. Kawamoto, N. Kodera, T. Hamaguchi, YO. Tahara, T. Ando, K. Namba, M. Miyata
    • 雑誌名

      mBio

      巻: 12 号: 4 ページ: e01414-21

    • DOI

      10.1128/mbio.01414-21

    • NAID

      120007124373

    • URL

      https://ocu-omu.repo.nii.ac.jp/records/2020098

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] C9orf72-derived arginine-rich poly-dipeptides impede phase modifiers2021

    • 著者名/発表者名
      Nanaura Hitoki、Aiba Yuichiro、Nakanishi Mari、Shiota Tomo、Hibino Masaki、Kikuchi Sotaro、Nagata Riko、Morikawa Naritaka、Iguchi Naohiko、Kiriyama Takao、Nagamori Shushi、Sugie Kazuma、Saio Tomohide、Yoshizawa Takuya、Mori Eiichiro et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 5301-5301

    • DOI

      10.1038/s41467-021-25560-0

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Architecture of zero-latency ultrafast amplitude detector for high-speed atomic force microscopy.2021

    • 著者名/発表者名
      K. Umeda, C. Okamoto, M. Shimizu, S. Watanabe, T. Ando, N. Kodera
    • 雑誌名

      Appl. Phys. Lett.

      巻: 119 号: 18 ページ: 181602-181602

    • DOI

      10.1063/5.0067224

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Macrocyclic Peptide-Conjugated Tip for Fast and Selective Molecular Recognition Imaging by High-Speed Atomic Force Microscopy2021

    • 著者名/発表者名
      L. Pupplin, D. Kanayama, N. Terasaka, K. Sakai, N. Kodera, K. Umeda, A. Sumino, M. Arin, W. Wei, H. Tanaka, T. Fukuma, H. Suga, K. Matsumoto, M. Shibata
    • 雑誌名

      ACS Applied Materials & Interfaces

      巻: 13(46) 号: 46 ページ: 54817-54829

    • DOI

      10.1021/acsami.1c17708

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamics of oligomer and amyloid fibril formation by yeast prion Sup35 observed by high-speed atomic force microscopy2020

    • 著者名/発表者名
      Konno H, Watanabe-Nakayama T, Uchihashi T, Okuda M, Zhu L, Kodera N, Kikuchi Y, Ando T, Taguchi H
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. U S A

      巻: 117 号: 14 ページ: 7831-7836

    • DOI

      10.1073/pnas.1916452117

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Diversity of physical properties of bacterial extracellular membrane vesicles revealed through atomic force microscopy phase imaging2020

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi Yousuke、Obana Nozomu、Toyofuku Masanori、Kodera Noriyuki、Soma Takamitsu、Ando Toshio、Fukumori Yoshihiro、Nomura Nobuhiko、Taoka Azuma
    • 雑誌名

      Nanoscale

      巻: 12 号: 14 ページ: 7950-7959

    • DOI

      10.1039/c9nr10850e

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular and functional analysis of pore-forming toxin Monalysin from entomopathogenic bacterium Pseudomonas entomophila2020

    • 著者名/発表者名
      2.Nonaka S†, Salim E†, Kamiya K*, Hori A, Nainu F, Asri RM, Masyita A, Nishiuchii T, Takeuchi S, Kodera N*, Kuraishi T*
    • 雑誌名

      Front. Immunol.

      巻: 11 ページ: 520-520

    • DOI

      10.3389/fimmu.2020.00520

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Spatiotemporally tracking of nano-biofilaments inside the nuclear pore complex core2020

    • 著者名/発表者名
      Mohamed Mahmoud Shaaban、Hazawa Masaharu、Kobayashi Akiko、Guillaud Laurent、Watanabe-Nakayama Takahiro、Nakayama Mizuho、Wang Hanbo、Kodera Noriyuki、Oshima Masanobu、Ando Toshio、Wong Richard W.
    • 雑誌名

      Biomaterials

      巻: 256 ページ: 120198-120198

    • DOI

      10.1016/j.biomaterials.2020.120198

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] High-Speed AFM Reveals Molecular Dynamics of Human Influenza A Hemagglutinin and Its Interaction with Exosomes2020

    • 著者名/発表者名
      Lim Keesiang、Kodera Noriyuki、Wang Hanbo、Mohamed Mahmoud Shaaban、Hazawa Masaharu、Kobayashi Akiko、Yoshida Takeshi、Hanayama Rikinari、Yano Seiji、Ando Toshio、Wong Richard W.
    • 雑誌名

      Nano Letters

      巻: 20 号: 9 ページ: 6320-6328

    • DOI

      10.1021/acs.nanolett.0c01755

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Self- and Cross-Seeding on α-Synuclein Fibril Growth Kinetics and Structure Observed by High-Speed Atomic Force Microscopy2020

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Watanabe-Nakayama, Maika Nawa, Hiroki Konno, Noriyuki Kodera, Toshio Ando, David B Teplow, Kenjiro Ono
    • 雑誌名

      ACS Nano

      巻: 14 号: 8 ページ: 9979-9989

    • DOI

      10.1021/acsnano.0c03074

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Millisecond Conformational Dynamics of Skeletal Myosin II Power Stroke Studied by High-Speed Atomic Force Microscopy2020

    • 著者名/発表者名
      Matusovsky Oleg S.、Kodera Noriyuki、MacEachen Caitlin、Ando Toshio、Cheng Yu-Shu、Rassier Dilson E.
    • 雑誌名

      ACS Nano

      巻: 15 号: 2 ページ: 2229-2239

    • DOI

      10.1021/acsnano.0c06820

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Direct visualization of translational GTPase factor pool formed around the archaeal ribosomal P-stalk by high-speed AFM2020

    • 著者名/発表者名
      Imai Hirotatsu、Uchiumi Toshio、Kodera Noriyuki
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 117 号: 51 ページ: 32386-32394

    • DOI

      10.1073/pnas.2018975117

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural and dynamics analysis of intrinsically disordered proteins by high-speed atomic force microscopy2020

    • 著者名/発表者名
      Kodera Noriyuki、Noshiro Daisuke、Dora Sujit K.、Mori Tetsuya、Habchi Johnny、Blocquel David、Gruet Antoine、Dosnon Marion、Salladini Edoardo、Bignon Christophe、Fujioka Yuko、Oda Takashi、Noda Nobuo N.、Sato Mamoru、Lotti Marina、Mizuguchi Mineyuki、Longhi Sonia、Ando Toshio
    • 雑誌名

      Nature Nanotechnology

      巻: 16 号: 2 ページ: 181-189

    • DOI

      10.1038/s41565-020-00798-9

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Resolving the data asynchronicity in high-speed atomic force microscopy measurement via the Kalman Smoother2020

    • 著者名/発表者名
      Kubo Shintaroh、Kato Suguru、Nakamura Kazuyuki、Kodera Noriyuki、Takada Shoji
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 342-351

    • DOI

      10.1038/s41598-020-75463-1

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Visualizing dynamic actin cross‐linking processes driven by the actin‐binding protein anillin2019

    • 著者名/発表者名
      Matsuda Kyohei、Sugawa Mitsuhiro、Yamagishi Masahiko、Kodera Noriyuki、Yajima Junichiro
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 594 号: 8 ページ: 1237-1247

    • DOI

      10.1002/1873-3468.13720

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Video imaging of biological molecules in action by high-speed atomic force microscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Noriyuki Kodera
    • 学会等名
      The 40th International Conference of the Microscopy Society of Thailand
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Recent progress in high-speed atomic force microscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Noriyuki Kodera, Kenichi Umeda, Kazuma Tatsumi, Karen Kamoshita
    • 学会等名
      9th Multifrequency AFM Conference
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] High-speed atomic force microscopy for studying dynamic behaviors of biomolecules2023

    • 著者名/発表者名
      Noriyuki Kodera
    • 学会等名
      NanoBiocom2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Video imaging of biological molecules in action by high-speed AFM2023

    • 著者名/発表者名
      Noriyuki Kodera
    • 学会等名
      NanospecFY2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] タンパク質分子の形状と動きを直接観察できる高速原子間力顕微鏡2022

    • 著者名/発表者名
      古寺哲幸
    • 学会等名
      第26回日本がん分子標的治療学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Recent progress in high-speed atomic force microscopy technologies2022

    • 著者名/発表者名
      Noriyuki Kodera, Kenichi Umeda
    • 学会等名
      AFM BioMed Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Historical description of some of the famous model system studied in AFM, Development and current limitations in high-speed AFM2022

    • 著者名/発表者名
      Noriyuki Kodera
    • 学会等名
      The Computational Biophysics of Atomic Force Microscopy
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Direct observation of the functional dynamics by which CAP1 interacts with F-actin and cofilin by high-speed AFM2022

    • 著者名/発表者名
      Phuong Doan, N. Nguyen, Hiroshi Abe, Shoichiro Ono, Noriyuki Kodera
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 高速AFMの更なる高速化に向けたZ-スキャナの共振制御装置2022

    • 著者名/発表者名
      巽 和真, 梅田 健一, 安藤 敏夫, 古寺 哲幸
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 高速原子間力顕微鏡のさらなる高速化を目指した超微小カンチレバーの開発2022

    • 著者名/発表者名
      片山 紀希, 梅田 健一, 安藤 敏夫, 古寺 哲幸
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 高速AFMによる100-nmサイズの分子集団の直接観察2022

    • 著者名/発表者名
      古寺哲幸
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] High-speed AFM visualizes translational GTPase factor pool formed around the ribosomal P-stalk2022

    • 著者名/発表者名
      今井 大達, 内海 利男, 古寺 哲幸
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 高速AFM による生体分子の動態計測2021

    • 著者名/発表者名
      古寺哲幸
    • 学会等名
      ナノプローブテクノロジー第167 委員会 第98 回研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 高速原子間力顕微鏡 による生体分子の動態計測2021

    • 著者名/発表者名
      古寺哲幸
    • 学会等名
      第31回日本メイラード学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 原子間力顕微鏡の固有ノイズ:パラシューティングの除去手法開発2021

    • 著者名/発表者名
      久保進太郎、梅田健一、古寺哲幸、高田彰二
    • 学会等名
      分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 原子間力顕微鏡によるタンパク質グリケーションの可視化2021

    • 著者名/発表者名
      新村朱子、木下結衣、原島愛、棟居聖一、木村久美、Nontaphat Leerach、大島由、林謙次郎、田中麻莉子、後藤久典、古寺哲幸、山本靖彦
    • 学会等名
      第31回日本メイラード学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] SSX1に示唆される新規の DNA 結合ドメインとその溶液中構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      高橋 花南, 古寺 哲幸, 宮ノ入 洋平, 千田 美紀, 加藤 広介, 堀越 直樹, 竹中 聡, 岩崎 憲治
    • 学会等名
      第94回日本生化学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] SSX1 に示唆される新規の DNA 結合ドメインのその溶液中構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      高橋 花南, 古寺 哲幸, 宮ノ入 洋平, 千田 美紀, 加藤 広介, 堀越 直樹, 竹中 聡, 岩崎 憲治
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 高速 AFM によるヒストン H2A-DNA 相互作用およびその凝集性のリアルタイムダイナミクスの解明2021

    • 著者名/発表者名
      西出 梧朗, Lim Keesiang, 小林 亜紀子, 羽澤 勝治, 中山 隆宏, 古寺 哲幸, 安藤 敏夫, Wong Richard
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 微小管末端標識と高速 AFM による可視化2021

    • 著者名/発表者名
      樋口 雄希, 古寺 哲幸, 林 郁子
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] パッチクランプ機能付き高速AFMの開発2021

    • 著者名/発表者名
      松原猛、渡辺信嗣、梅田健一、角野歩、安藤敏夫、古寺哲幸
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 滑膜肉腫関連タンパク質SS18-SSX1の新規機能2021

    • 著者名/発表者名
      高橋花南, 古寺哲幸, 宮ノ入洋平, 加藤広介, 西村正宏, 堀越直樹, 胡桃坂仁志, 竹中聡, 岩崎憲治
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 高速AFMを用いたユビキチンリガーゼE6APの構造動態のリアルタイム観察2021

    • 著者名/発表者名
      武田 春冴、室 郁弥、古寺 哲幸、安藤 敏夫、紺野 宏記
    • 学会等名
      令和3年度生物物理学会中部支部講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] CAP1-induced extensive dissociation of cofilin from cofilin-saturated actin filaments revealed by high-speed AFM2021

    • 著者名/発表者名
      Phuong Doan N Nguyen, Hiroshi Abe, Shoichiro Ono, Noriyuki Kodera
    • 学会等名
      令和3年度生物物理学会中部支部講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 超微小カンチレバーの実用化に向けた高速AFM光学システムの改良2021

    • 著者名/発表者名
      片山 紀希、梅田 健一、古寺 哲幸
    • 学会等名
      令和3年度生物物理学会中部支部講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Improving the temporal resolution of high-speed AFM2020

    • 著者名/発表者名
      Noriyuki Kodera,Masahiro Shimizu,Chihiro Okamoto,Kenichi Umeda,Shinji Watanabe,Toshio Ando
    • 学会等名
      8th Multifrequency AFM Conference
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] バイオ高速 AFM の性能向上と機能付加にむけて2020

    • 著者名/発表者名
      古寺哲幸
    • 学会等名
      第81回応用物理学会秋季学術講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 高速AFMによるレット症候群の原因タンパク質MeCP2の一分子動態観察2020

    • 著者名/発表者名
      古寺哲幸
    • 学会等名
      ブルッカージャパンナノ計測事業部主催シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Single-molecule visualization of intrinsically disordered Rett syndrome protein, MeCP2 by high-speed Atomic Force Microscopy2020

    • 著者名/発表者名
      Noriyuki Kodera
    • 学会等名
      4th NanoLSI Symposium - Bio-imaging, sensing and manipulation for medical science -
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [図書] 相分離生物学の全貌(現代化学増刊46)、「66 高速原子間力顕微鏡」を古寺哲幸、今井大達で執筆2020

    • 著者名/発表者名
      白木 賢太郎
    • 総ページ数
      400
    • 出版者
      東京化学同人
    • ISBN
      9784807913466
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 抗酸菌における決定的な休眠誘導機構を発見 -天然変性タンパク質による新規のDNA凝集メカニズム-

    • URL

      https://nanolsi.kanazawa-u.ac.jp/highlights/29790/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] ヒストンシャペロンとヒストンの複合体構造を 統合的な相関構造解析法により初めて解明

    • URL

      https://nanolsi.kanazawa-u.ac.jp/highlights/27756/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] 国産ゲノム編集技術CRISPR-Cas3 が二本鎖DNA を切断する仕組みを解明

    • URL

      https://www.kanazawa-u.ac.jp/rd/110105

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 高速AFMが解明するタンパク質の世界

    • URL

      https://www.kanazawa-u.ac.jp/research/researcher/kokokara/research45

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 古寺哲幸の研究紹介

    • URL

      https://nanolsi.kanazawa-u.ac.jp/en/research/researchers/noriyuki-kodera/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
  • [備考] 画期的な顕微鏡法でタンパク質研究を深める

    • URL

      https://www.kanazawa-u.ac.jp/research/researcher/re-voice/rv3

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 時間遅れゼロの超高速振幅計測法の開発に成功~高速AFMのさらなる高速化・低侵襲化に期待~

    • URL

      https://nanolsi.kanazawa-u.ac.jp/achievements/achievements-18299/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 世界初!マイコプラズマの滑走運動における分子モーター の動きをナノレベルで検出!

    • URL

      https://nanolsi.kanazawa-u.ac.jp/achievements/achievements-16945/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] ~驚愕の生命進化~世界初!ATP合成酵素から変化した滑走のツインモーターの構造を明らかに

    • URL

      https://nanolsi.kanazawa-u.ac.jp/achievements/achievements-18965/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 【ココカラ】Research45「高速AFMが解明するタンパク質の世界」/金沢大学研究紹介動画

    • URL

      https://www.youtube.com/watch?v=WS9PLrVbCfk&t=62s

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 金沢大学生物物理学研究室

    • URL

      http://biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/index.htm

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] ナノ生命科学研究所 古寺哲幸 研究紹介

    • URL

      https://nanolsi.kanazawa-u.ac.jp/research/researchers/noriyuki-kodera/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] ナノ生命科学研究所 古寺哲幸 Researcher’s Voice #3

    • URL

      https://www.kanazawa-u.ac.jp/research/re-voice/rv3

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] ナノ生命科学研究所 古寺哲幸 Research45「高速AFMが解明するタンパク質の世界」

    • URL

      https://www.kanazawa-u.ac.jp/research/kokokara/research45

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [産業財産権] 信号処理装置、駆動制御装置、及び、走査型プローブ顕微鏡2022

    • 発明者名
      古寺哲幸、巽和真、梅田健一、安藤敏夫
    • 権利者名
      古寺哲幸、巽和真、梅田健一、安藤敏夫
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2022-141581
    • 出願年月日
      2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [産業財産権] 走査型プローブ顕微鏡およびZ駆動装置2020

    • 発明者名
      古寺哲幸, 清水将裕, 安藤敏夫
    • 権利者名
      古寺哲幸, 清水将裕, 安藤敏夫
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2020
    • 取得年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [産業財産権] マニピュレータ機能付き原子間力顕微鏡2020

    • 発明者名
      古寺哲幸, 高野純ら他4名
    • 権利者名
      古寺哲幸, 高野純ら他4名
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2020
    • 取得年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [産業財産権] 電気生理学的解析を可能にした原子間力顕微鏡2020

    • 発明者名
      古寺哲幸, 米川拓臣, 執行航希, 渡邉信嗣, 安藤敏夫
    • 権利者名
      古寺哲幸, 米川拓臣, 執行航希, 渡邉信嗣, 安藤敏夫
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2020
    • 取得年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [産業財産権] チャンバーアレイの製造方法2020

    • 発明者名
      古寺哲幸,豐田貴大,内橋貴之
    • 権利者名
      古寺哲幸,豐田貴大,内橋貴之
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2020
    • 取得年月日
      2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi