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クロマチン上で起こる転写と共役した二重鎖切断修復の分子機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20H00449
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
研究機関東京大学

研究代表者

胡桃坂 仁志  東京大学, 定量生命科学研究所, 教授 (80300870)

研究分担者 香川 亘  明星大学, 理工学部, 教授 (70415123)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
44,850千円 (直接経費: 34,500千円、間接経費: 10,350千円)
2022年度: 16,640千円 (直接経費: 12,800千円、間接経費: 3,840千円)
2021年度: 16,640千円 (直接経費: 12,800千円、間接経費: 3,840千円)
2020年度: 11,570千円 (直接経費: 8,900千円、間接経費: 2,670千円)
キーワード二重鎖切断修復 / 相同組換え / 転写と共役したDNA修復 / クロマチン転写 / クロマチン構造変換 / クロマチン再構成 / クライオ電子顕微鏡 / ゲノム / 遺伝子 / 癌 / 蛋白質 / 放射線
研究開始時の研究の概要

相同組換えは分裂細胞のゲノムDNAの安定維持に必須である。一方、非分裂細胞では、DNA二重鎖切断を正確に修復する機構として独自のDNA修復機構の存在が考えられている。しかし、その実体については不明な点が多い。そこで本研究では、非分裂細胞で起こる正確性の高いDNA修復経路として転写と共役した二重鎖切断修復(TC-HR)に着目し、クロマチン再構成技術、in vitro組換え試験系、そしてX線結晶構造解析およびクライオ電子顕微鏡構造解析を融合してその分子機構を解明することを目的とする。本研究によって、DNA修復経路の破綻が引き起こす疾患の治療法の開発に重要な知見を与えることが期待される。

研究成果の概要

転写と共役した二重鎖切断修復(TC-HR)は、非分裂細胞で生じる正確性の高い二重鎖切断修復機構であり、ゲノムDNAの安定的維持に寄与する。本研究では、真核生物のゲノムDNA収納様式であるクロマチン上でのTC-HRの分子機構の解明を目指した。クロマチン再構成技術やタンパク質精製技術、試験管内クロマチン転写試験などの生化学的解析、クライオ電子顕微鏡を用いた構造生物学的解析により、TC-HRで機能する全長RAD52の構造、クロマチン転写によるDNA損傷認識のメカニズム、DNA修復で機能するタンパク質とクロマチンの複合体構造などを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

DNAの二重鎖切断は重篤な損傷であり、この損傷が細胞内で適切に修復されない場合、がんをはじめとする様々な疾患の原因となることが明らかになっている。特に、TC-HRなどの転写と共役したDNA修復経路の破綻は、神経疾患などの原因となることが報告されている。したがって、本研究におけるTC-HRの分子機構解明やクロマチン上でのDNA損傷修復関連タンパク質の機能および構造の解明は、学術的意義はもとより、医療や産業など社会的にも大いに意義があると考える。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (87件)

すべて 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (24件) (うち国際共著 4件、 査読あり 23件、 オープンアクセス 23件) 学会発表 (57件) (うち国際学会 6件、 招待講演 13件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Stony Brook University/The University of Colorado(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] National University of Ireland Galway(アイルランド)

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      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] NIHES/University of North Dakota(米国)

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      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] FMI(スイス)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] The cryo-EM structure of full-length RAD52 protein contains an undecameric ring2023

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita Chiaki、Takizawa Yoshimasa、Saotome Mika、Ogino Shun、Kurumizaka Hitoshi、Kagawa Wataru
    • 雑誌名

      FEBS Open Bio

      巻: 13 号: 3 ページ: 408-418

    • DOI

      10.1002/2211-5463.13565

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Biochemical characterization of the RNA-binding and RNA-DNA strand exchange activities of the human RAD52 protein2023

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya Ryohei、Saotome Mika、Kinoshita Chiaki、Kamoi Kazuki、Kagawa Wataru
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: - 号: 1 ページ: 59-69

    • DOI

      10.1093/jb/mvad019

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural studies of functional nucleosome complexes with transacting factors2022

    • 著者名/発表者名
      KURUMIZAKA Hitoshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the Japan Academy. Ser. B: Physical and Biological Sciences

      巻: 98 号: 1 ページ: 1-14

    • DOI

      10.2183/pjab.98.001

    • NAID

      130008140789

    • ISSN
      0386-2208, 1349-2896
    • 年月日
      2022-01-11
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural and biochemical analyses of the nucleosome containing Komagataella pastoris histones2022

    • 著者名/発表者名
      Fukushima Yutaro、Hatazawa Suguru、Hirai Seiya、Kujirai Tomoya、Ehara Haruhiko、Sekine Shun-ichi、Takizawa Yoshimasa、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 172 号: 2 ページ: 79-88

    • DOI

      10.1093/jb/mvac043

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural basis for binding diversity of acetyltransferase p300 to the nucleosome2022

    • 著者名/発表者名
      Hatazawa Suguru、Liu Jiuyang、Takizawa Yoshimasa、Zandian Mohamad、Negishi Lumi、Kutateladze Tatiana G.、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 25 号: 7 ページ: 104563-104563

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.104563

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Nucleosome Structures Built from Highly Divergent Histones: Parasites and Giant DNA Viruses2022

    • 著者名/発表者名
      Sato Shoko、Dacher Mariko、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Epigenomes

      巻: 6 号: 3 ページ: 22-22

    • DOI

      10.3390/epigenomes6030022

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Method for Evaluating Effects of Non-coding RNAs on Nucleosome Stability2022

    • 著者名/発表者名
      Dacher Mariko、Fujita Risa、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      piRNA: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology

      巻: 2509 ページ: 195-208

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2380-0_12

    • ISBN
      9781071623794, 9781071623800
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis of nucleosome disassembly and reassembly by RNAPII elongation complex with FACT2022

    • 著者名/発表者名
      Ehara Haruhiko、Kujirai Tomoya、Shirouzu Mikako、Kurumizaka Hitoshi、Sekine Shun-ichi
    • 雑誌名

      Science

      巻: 377 号: 6611

    • DOI

      10.1126/science.abp9466

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Chromatin structure meets cryo-EM: Dynamic building blocks of the functional architecture2022

    • 著者名/発表者名
      Takizawa Yoshimasa、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

      巻: 1865 号: 7 ページ: 194851-194851

    • DOI

      10.1016/j.bbagrm.2022.194851

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural basis for p53 binding to its nucleosomal target DNA sequence2022

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Masahiro、Takizawa Yoshimasa、Nozawa Kayo、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      PNAS Nexus

      巻: 1 号: 4

    • DOI

      10.1093/pnasnexus/pgac177

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cryo-electron microscopy structure of the H3-H4 octasome: A nucleosome-like particle without histones H2A and H2B2022

    • 著者名/発表者名
      Nozawa Kayo、Takizawa Yoshimasa、Pierrakeas Leonidas、Sogawa-Fujiwara Chizuru、Saikusa Kazumi、Akashi Satoko、Luk Ed、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 119 号: 45

    • DOI

      10.1073/pnas.2206542119

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural basis of RNA polymerase II transcription on the chromatosome containing linker histone H12022

    • 著者名/発表者名
      Hirano Rina、Ehara Haruhiko、Kujirai Tomoya、Uejima Tamami、Takizawa Yoshimasa、Sekine Shun-ichi、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 7287-7287

    • DOI

      10.1038/s41467-022-35003-z

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural insight into replicative helicase loading in Escherichia coli2022

    • 著者名/発表者名
      Horikoshi Naoki、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: - 号: 6 ページ: 605-607

    • DOI

      10.1093/jb/mvac023

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural basis for DNA sequence recognition by pioneer factors in nucleosomes.2021

    • 著者名/発表者名
      Kagawa W, Kurumizaka H.
    • 雑誌名

      Current Opinion in Structural Biology

      巻: 71 ページ: 59-64

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2021.05.011

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Human SIRT2 and SIRT3 deacetylases function in DNA homologous recombinational repair2021

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Takeshi、Takizawa Kazuya、Ui Ayako、Hama Michio、Kagawa Wataru、Sugasawa Kaoru、Tajima Katsushi
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 26 号: 5 ページ: 328-335

    • DOI

      10.1111/gtc.12842

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Sequence-dependent nucleosome formation in trinucleotide repeats evaluated by in vivo chemical mapping2021

    • 著者名/発表者名
      Koji Katsumata, Yuichi Ichikawa, Tomohiro Fuse, Hitoshi Kurumizaka, Akio Yanagida , Takeshi Urano, Hiroaki Kato, Mitsuhiro Shimizu
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      巻: 556 ページ: 179-184

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.03.155

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Chromatin structure-dependent histone incorporation revealed by a genome-wide deposition assay2021

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Tachiwana, Mariko Dacher, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yosuke Seto, Ryohei Katayama, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka, Noriko Saitoh
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 10

    • DOI

      10.7554/elife.66290

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cryo-EM structure of the nucleosome core particle containing <i>Giardia lamblia</i> histones2021

    • 著者名/発表者名
      Sato Shoko、Takizawa Yoshimasa、Hoshikawa Fumika、Dacher Mariko、Tanaka Hiroki、Tachiwana Hiroaki、Kujirai Tomoya、Iikura Yukari、Ho Cheng-Han、Adachi Naruhiko、Patwal Indu、Flaus Andrew、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 49 号: 15 ページ: 8934-8946

    • DOI

      10.1093/nar/gkab644

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Modeling population size independent tissue epigenomes by ChIL‐seq with single thin sections2021

    • 著者名/発表者名
      Maehara Kazumitsu、Tomimatsu Kosuke、Harada Akihito、Tanaka Kaori、Sato Shoko、Fukuoka Megumi、Okada Seiji、Handa Tetsuya、Kurumizaka Hitoshi、Saitoh Noriko、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki
    • 雑誌名

      Molecular Systems Biology

      巻: 17 号: 11 ページ: 8934-8946

    • DOI

      10.15252/msb.202110323

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Unusual nucleosome formation and transcriptome influence by the histone H3mm18 variant2021

    • 著者名/発表者名
      Hirai Seiya、Tomimatsu Kosuke、Miyawaki-Kuwakado Atsuko、Takizawa Yoshimasa、Komatsu Tetsuro、Tachibana Taro、Fukushima Yutaro、Takeda Yasuko、Negishi Lumi、Kujirai Tomoya、Koyama Masako、Ohkawa Yasuyuki、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 50 号: 1 ページ: 72-91

    • DOI

      10.1093/nar/gkab1137

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Contributions of Histone Variants in Nucleosome Structure and Function2021

    • 著者名/発表者名
      Kurumizaka Hitoshi、Kujirai Tomoya、Takizawa Yoshimasa
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 433 号: 6 ページ: 166678-166678

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2020.10.012

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Histone variant H2A.B-H2B dimers are spontaneously exchanged with canonical H2A-H2B in the nucleosome2021

    • 著者名/発表者名
      Rina Hirano, Yasuhiro Arimura, Tomoya Kujirai, Mikihiro Shibata, Aya Okuda, Ken Morishima, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama, Hitoshi Kurumizaka
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 4 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1038/s42003-021-01707-z

    • NAID

      120006960298

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Nucleosome binding by the pioneer transcription factor OCT42020

    • 著者名/発表者名
      Echigoya Kenta、Koyama Masako、Negishi Lumi、Takizawa Yoshimasa、Mizukami Yuka、Shimabayashi Hideki、Kuroda Akari、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 11832-11832

    • DOI

      10.1038/s41598-020-68850-1

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Interaction of the pioneer transcription factor GATA3 with nucleosomes2020

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Hiroki、Takizawa Yoshimasa、Takaku Motoki、Kato Daiki、Kumagawa Yusuke、Grimm Sara A.、Wade Paul A.、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 4136-4136

    • DOI

      10.1038/s41467-020-17959-y

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Structural dynamics of the nucleosome during transcription elongation2022

    • 著者名/発表者名
      Kurumizaka Hitoshi
    • 学会等名
      The 2022 (6th) Telluride Workshop on Chromatin Structure and Dynamics
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural insights into chromatin dynamics during gene expression2022

    • 著者名/発表者名
      Kurumizaka Hitoshi
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory "Epigenetics & Chromatin" Meeting
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 転写におけるヌクレオソーム構造のダイナミクス2022

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、江原晴彦、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クロマトソーム上での転写伸長機構に関する解析2022

    • 著者名/発表者名
      平野里奈、江原晴彦、鯨井智也、関根俊一、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 転写因子p53によるヌクレオソーム中のDNA配列認識機構の構造的研究2022

    • 著者名/発表者名
      西村正宏
    • 学会等名
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡によるヒトヌクレオソームの高分解能構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      滝沢由政、佐藤祥子、何承翰、ダネフラドスティン、胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 新しいクロマチン基盤構造 H3-H4 オクタソームのクライオ電子顕微鏡解析2022

    • 著者名/発表者名
      野澤佳世、滝沢由政、七種和美、明石知子、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子転写におけるクロマチン構造ダイナミクス2022

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      2022年度国立遺伝学研究所クロマチン研究会 令和4年度遺伝研研究会 (クロマチン・細胞核構造の動的変換とゲノム機能制御)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] エピジェネティックな遺伝子制御のクロマチン構造基盤2022

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 病原性寄生虫Giardia lambliaのクロマチン基盤構造2022

    • 著者名/発表者名
      佐藤 祥子、滝沢 由政、Dacher Mariko、田中大貴、立和名博昭、飯倉ゆかり、鯨井智也、Ho Cheng-Han、安達成彦、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] リンカーヒストンH1を含むヘテロクロマチン基盤構造のクライオ電顕解析2022

    • 著者名/発表者名
      何承翰、鯨井智也、滝沢由政、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 転写におけるクロマチン構造の維持機構2022

    • 著者名/発表者名
      赤津綜隆、江原晴彦、鯨井智也、藤田理紗、滝沢由政、関根俊一、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] メタノール資化酵母 K. pastorisヌクレオソームにおける転写解析およびcryo-EM構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      福島友太郎、畠澤卓、平井誠也、鯨井智也、江原晴彦、関根俊一、滝沢由政、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンアセチル化酵素p300によるヌクレオソーム結合の構造基盤2022

    • 著者名/発表者名
      畠澤卓、Liu Jiuyang、滝沢由政、Zandian Mohamad、根岸瑠美、Kutateladze Tatiana G.、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンN末端テールがヌクレオソームの機能に与える影響2022

    • 著者名/発表者名
      大石匠美、畠澤卓、鯨井智也、江原晴彦、関根俊一、滝沢由政、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 核内タンパク質による高次クロマチン形成機構の構造生物学的解析2022

    • 著者名/発表者名
      堀越直樹、三宅諒祐、曽川千鶴、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡による色素性乾皮症E群タンパク質DDB2の紫外線損傷認識機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      松本翔太、滝沢由政、小笠原光雄、橘春奈、山元淳平、岩井成憲、菅澤薫、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 転写におけるクロマチン構造とダイナミクス2022

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンH3バリアントを標的とした細胞核抽出クロマチンの構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      塩井琢郎、畠澤卓、大川恭行、滝沢由政、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡解析から明らかになった新しいサブヌクレオソーム・H3-H4オクタソームの構造機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      野澤佳世、滝沢由政、七種和美、明石知子、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] H3-H4オクタソーム上で起こる転写機構の解析2022

    • 著者名/発表者名
      大井茉祐子、野澤佳世、西村正宏、滝沢由政、鯨井智也、江原晴彦、関根俊一、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] piRNA因子Rhinoとヌクレオソームの複合体構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      大畑健汰、大角健、滝沢由政、塩見美喜子、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ピキア酵母ヌクレオソームの立体構造および転写解析2022

    • 著者名/発表者名
      福島友太郎、畠澤卓、平井誠也、鯨井智也、江原晴彦、滝沢由政、関根俊一、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンH3バリアントH3.8を含むヌクレオソームの性状解析2022

    • 著者名/発表者名
      平井誠也、鯨井智也、大川恭行、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 転写共役修復におけるRNAポリメラーゼII-ヌクレオソーム複合体の構造ダイナミクス2022

    • 著者名/発表者名
      大角健、鯨井智也、滝沢由政、江原晴彦、関根俊一、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クロマチン結合因子DEKの構造とクロマチン制御機構2022

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、越後谷健太、岸雄介、滝沢由政、佐伯麻衣、増本博司、木村宏、後藤由季子、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 細胞核内より抽出したクロマチンユニットのクライオ電顕構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      滝沢由政、畠澤卓、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヒトRAD52の液-液相分離におけるC末端側領域の役割2022

    • 著者名/発表者名
      木下千明、土屋怜平、鴨井一輝、滝沢由政、胡桃坂仁志、香川亘
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 生化学的解析から見えてきたRAD52のRNA依存的DNA修復における機能2022

    • 著者名/発表者名
      土屋怜平、五月女美香、木下千明、鴨井一輝、荻野駿、香川亘
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 転写伸長におけるヌクレオソームの崩壊と再構築機構の構造生物学的解析2022

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、江原晴彦、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第40回染色体ワークショップ・第21回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヌクレオソームにおけるヒストンN末端テールによる転写制御2022

    • 著者名/発表者名
      大石匠美、畠澤卓、赤津綜隆、鯨井智也、林剛介、江原晴彦、関根俊一、滝沢由政、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第40回染色体ワークショップ・第21回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クロマチン構造生物学の現状と将来2022

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      2021年度中性子構造生物学研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒトRAD52による液-液相分離2021

    • 著者名/発表者名
      鴨井一輝、香川亘
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] RAD52タンパク質が触媒するDNA二重鎖切断修復の正確性2021

    • 著者名/発表者名
      五月女美香、中島菜花子、相澤由有希、木下千明、安田武嗣、香川亘
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] DNA修復におけるRAD52のRNA上での機能の生化学的解析2021

    • 著者名/発表者名
      土屋怜平、五月女美香、木下千明、鴨井一輝、荻野駿、香川亘
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] DNA修復タンパク質RAD52のクライオ電子顕微鏡構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      木下千明、滝沢由政、五月女美香、荻野駿、胡桃坂仁志、香川亘
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] RAD52タンパク質による液滴形成2021

    • 著者名/発表者名
      鴨井一輝、土屋怜平、香川亘
    • 学会等名
      第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] DNA-RNA鎖交換反応におけるRAD52C末端側領域の役割2021

    • 著者名/発表者名
      土屋怜平、五月女美香、木下千明、鴨井一輝、荻野駿、香川亘
    • 学会等名
      第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Structural studies for chromatin as a regulator of the genome function2021

    • 著者名/発表者名
      Kurumizaka Hitoshi
    • 学会等名
      Vienna Biocenter general seminar series
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural Studies of DNA Function in Nucleosomes2021

    • 著者名/発表者名
      Kurumizaka Hitoshi
    • 学会等名
      The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural basis for genome regulation by chromatin2021

    • 著者名/発表者名
      Kurumizaka Hitoshi
    • 学会等名
      Pacifichem 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 細胞核内のクロマチン構造ユニットの解析2021

    • 著者名/発表者名
      畠澤 卓、滝沢 由政、胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ピキア酵母ヌクレオソームのCryo-EM構造解析および生化学的解析2021

    • 著者名/発表者名
      福島 友太郎、畠澤 卓、滝沢 由政、鯨井 智也、江原 春彦、関根 俊一、胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Nucleosome contribution to epigenetic genome regulation2021

    • 著者名/発表者名
      Kurumizaka Hitoshi
    • 学会等名
      Biophysical Society 65th Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural Studies for Nucleosome Core Particle Complexed with Its Binding Factors2021

    • 著者名/発表者名
      Kurumizaka Hitoshi
    • 学会等名
      RIKEN BDR Symposium
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡によるクロマチン構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      令和2年度 よこはまNMR研究会総会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒストンバリアントH2A.Bを含むヌクレオソームの 新規動態の解析2021

    • 著者名/発表者名
      平野里奈、有村 泰宏、鯨井 智也、柴田 幹大、奥田 綾、守島 健、井上 倫太郎、杉山 正明、胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第38回染色体ワークショップ
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] パイオニア転写因子OCT4のヌクレオソームへの結合メカニズムの解明2021

    • 著者名/発表者名
      越後谷健太、小山昌子、根岸瑠美、滝沢由政、水上優夏、島林秀伎、黒田明里、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第14回エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] エピジェネティクスの根幹を担うクロマチン機能構造の可視化2020

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クライオEM 単粒子解析によるクロマチンダイナミクスの理解2020

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      日本中性子科学会2020年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クロマチン構造による遺伝子発現のエピジェネティック制御2020

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クロマチンダイナミクスの構造生物学的研究2020

    • 著者名/発表者名
      胡桃坂 仁志
    • 学会等名
      第16回日本臨床プロテオゲノミクス研究会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA損傷認識タンパク質DDB2による新たなクロマチン動態制御機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      松本翔太、CAVADINI Simone、BUNKER Richard D.、GRAND Rslph S.、山本淳平、SCHUEBELER Dirk、岩井成憲、菅澤薫、胡桃坂仁志、THOMAE Nicolas H.
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] パイオニア転写因子GATA3による標的ヌクレオソームへの結合メカニズム2020

    • 著者名/発表者名
      田中大貴、滝沢由政、高久誉大、熊川雄祐、WADE Paul A、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] RAD52・RPA・DNA三者複合体のin vitro再構成2020

    • 著者名/発表者名
      荻野 駿、五月女 美香、香川 亘
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] RAD52が触媒するRNAに依存したDNA修復の生化学的解析2020

    • 著者名/発表者名
      土屋 怜平、五月女 美香、荻野 駿、鴨井 一輝、香川 亘
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] ヒトRAD52のD-loop形成活性2020

    • 著者名/発表者名
      鴨井 一輝、五月女 美香、香川 亘
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [図書] 実験医学 増刊号Vol.40 No.12「セントラルドグマの新常識」 『転写・翻訳の驚きの新機構と再定義されるDNA・RNA・タンパク質の世界』第2章「転写の新常識」1.「クロマチンにおける転写機構の新たな知見」2022

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、胡桃坂仁志
    • 総ページ数
      264
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758104043
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 東京大学 定量生命科学研究所 胡桃坂仁志研究室

    • URL

      https://www.iqb.u-tokyo.ac.jp/kurumizakalab/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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