• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

上皮内肺がん等の全ゲノムシークエンス解析による新規ドライバー遺伝子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 20H00545
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分55:恒常性維持器官の外科学およびその関連分野
研究機関国立研究開発法人国立がん研究センター

研究代表者

河野 隆志  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (80280783)

研究分担者 鈴木 絢子  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (00770348)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
44,980千円 (直接経費: 34,600千円、間接経費: 10,380千円)
2023年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2022年度: 12,740千円 (直接経費: 9,800千円、間接経費: 2,940千円)
2021年度: 13,130千円 (直接経費: 10,100千円、間接経費: 3,030千円)
2020年度: 14,430千円 (直接経費: 11,100千円、間接経費: 3,330千円)
キーワード肺がん / ゲノム / 遺伝子 / 治療標的 / 癌 / 遺伝学 / 病理学
研究開始時の研究の概要

喫煙者を主体とした欧米肺がんのゲノム解析が大規模に進むものの、遺伝子変化の多様さから、新規ドライバー遺伝子の同定は滞っている。申請者は、欧米症例と比べ遺伝子変異数が1/10レベルと少ない肺発がん初期病変の外科的手術摘出標本の凍結サンプルや非喫煙者腺がんを多数所有している。また、RET点変異など新たな候補ドライバー変化を本サンプルで予備的に同定している。そこで本課題では、長鎖全ゲノム・エピゲノムシークエンス等を含めた先駆的な全ゲノムシークエンス解析をこれらの検体に対して行い、新規ドライバー遺伝子変化やその治療的意義を解明するとともに、ドライバー遺伝子変化を介さない肺発がん機構の特徴を解明する。

研究成果の概要

上皮内肺がん、微小浸潤腺がんのゲノム変化に基づき、早期肺発がん機構のメカニズムを明らかにした(Suzuki et al, Nat Comm, 2023)。がん遺伝子変化は初期肺腫瘍の形成に働き、がん抑制遺伝子の変異は、初期腫瘍の悪性化に働くことが明らかにされた。グローバルなDNA低メチル化とそれに伴うコピー数変化、大規模構造変化は悪性化に寄与すると推察された。RET遺伝子変異の中に新規がん原性変異を見出し、その活性化やがん化能はRETキナーゼ阻害薬により抑えられることを証明した。以上より、RET遺伝子の点変異は、肺がんなど複数のがん種の発がんに寄与し、治療標的分子となることが明らかになった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

世界的にも貴重な上皮内肺がん、微小浸潤腺がんのゲノム変化を明らかにすることで、これまで明らかにされていなかった早期肺腫瘍形成の分子機構が明らかになり、その成果を国際一流紙に報告することができた。この知見は今後の肺がん予防や早期発見・治療のための基盤情報となると期待される。また、がん遺伝子変化陰性例にみられるRET遺伝子変異が、がん原性変異であり、既存RET阻害薬の治療標的となることが明らかにされた。今後、コンパニオン検査への本情報の組み込みなどがんゲノム医療への実装が望まれる。

報告書

(6件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (38件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (7件) 雑誌論文 (15件) (うち国際共著 3件、 査読あり 15件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 2件、 招待講演 9件) 備考 (2件) 産業財産権 (1件)

  • [国際共同研究] Crick Institute(英国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] NCI(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] トロント大学(カナダ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Crick研究所(英国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] NCI(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] The CRICK Institute(英国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] NCI, NIH(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Passive Smoking?Induced Mutagenesis as a Promoter of Lung Carcinogenesis2024

    • 著者名/発表者名
      Mochizuki Akifumi、Shiraishi Kouya、Honda Takayuki、Higashiyama Ryoko Inaba、Sunami Kuniko、Matsuda Maiko、Shimada Yoko、Miyazaki Yasunari、Yoshida Yukihiro、Watanabe Shun-Ichi、Yatabe Yasushi、Hamamoto Ryuji、Kohno Takashi
    • 雑誌名

      Journal of Thoracic Oncology

      巻: in press 号: 7 ページ: 984-994

    • DOI

      10.1016/j.jtho.2024.02.006

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole-genome sequencing reveals the molecular implications of the stepwise progression of lung adenocarcinoma2023

    • 著者名/発表者名
      Haga Y, Sakamoto Y, Kajiya K, Kawai H, Oka M, Motoi N, Shirasawa M, Yotsukura M, Watanabe S, Arai M, Zenkoh J, Shiraishi K, Seki M, Kanai A, Shiraishi Y, Yatabe Y, Matsubara D, Suzuki Y, Noguchi M, Kohno T, Suzuki A.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 8375-8375

    • DOI

      10.1038/s41467-023-43732-y

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Clinicopathological characteristics and molecular analysis of lung cancer associated with ciliated muconodular papillary tumor/bronchiolar adenoma2023

    • 著者名/発表者名
      Higashiyama Masahiro、Motoi Noriko、Yotsukura Masaya、Yoshida Yukihiro、Nakagawa Kazuo、Yagishita Shigehiro、Shirasawa Masayuki、Yoshida Tatsuya、Shiraishi Kouya、Kohno Takashi、Ohe Yuichiro、Watanabe Shun‐ichi
    • 雑誌名

      Pathology International

      巻: 73 号: 5 ページ: 188-197

    • DOI

      10.1111/pin.13316

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Novel Calcium-Binding Ablating Mutations Induce Constitutive RET Activity and Drive Tumorigenesis2022

    • 著者名/発表者名
      Tabata Junya、Nakaoku Takashi、Araki Mitsugu、Yoshino Ryunosuke、Kohsaka Shinji、Otsuka Ayaka、Ikegami Masachika、Ui Ayako、Kanno Shin-ichiro、Miyoshi Keiko、Matsumoto Shigeyuki、Sagae Yukari、Yasui Akira、Sekijima Masakazu、Mano Hiroyuki、Okuno Yasushi、Okamoto Aikou、Kohno Takashi
    • 雑誌名

      Cancer Research

      巻: 82 号: 20 ページ: 3751-3762

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-22-0834

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Long-Term Prognosis and Prognostic Indicators of Stage IA Lung Adenocarcinoma2022

    • 著者名/発表者名
      Yotsukura Masaya、Muraoka Yuji、Yoshida Yukihiro、Nakagawa Kazuo、Shiraishi Kouya、Kohno Takashi、Yatabe Yasushi、Watanabe Shun-ichi
    • 雑誌名

      Annals of Surgical Oncology

      巻: 30 号: 2 ページ: 851-858

    • DOI

      10.1245/s10434-022-12621-x

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phasing analysis of lung cancer genomes using a long read sequencer2022

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto Yoshitaka、Miyake Shuhei、Oka Miho、Kanai Akinori、Kawai Yosuke、Nagasawa Satoi、Shiraishi Yuichi、Tokunaga Katsushi、Kohno Takashi、Seki Masahide、Suzuki Yutaka、Suzuki Ayako
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 3464-3464

    • DOI

      10.1038/s41467-022-31133-6

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Accounting for EGFR mutations in epidemiological analyses of non-small cell lung cancers: Examples based on the International Lung Cancer Consortium data2022

    • 著者名/発表者名
      Schmid S, Jiang M, Brown MC, Fares A, Garcia M, Soriano J, Dong M, Thomas S, Kohno T, etal.
    • 雑誌名

      Cancer Epidemiol Biomarkers Prev

      巻: 31 号: 3 ページ: 679-687

    • DOI

      10.1158/1055-9965.epi-21-0747

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The relationship between body-mass index and overall survival in non-small cell lung cancer by sex, smoking status, and race: A pooled analysis of 20,937 International lung Cancer consortium (ILCCO) patients2021

    • 著者名/発表者名
      Jiang Mei、Fares Aline F.、Shepshelovich Daniel、Yang Ping、Christiani David、Zhang Jie、Shiraishi Kouya、et al
    • 雑誌名

      Lung Cancer

      巻: 152 ページ: 58-65

    • DOI

      10.1016/j.lungcan.2020.11.029

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Activity and Immune Correlates of Programmed Death-1 Blockade Therapy in Patients With Advanced Large Cell Neuroendocrine Carcinoma2021

    • 著者名/発表者名
      Shirasawa Masayuki、Yoshida Tatsuya、Takayanagi Daisuke、Shiraishi Kouya、Yagishita Shigehiro、Sekine Katsutoshi、Kanda Shintaro、Matsumoto Yuji、Masuda Ken、Shinno Yuki、Okuma Yusuke、Goto Yasushi、Horinouchi Hidehito、Hamada Akinobu、Kohno Takashi、Yamamoto Noboru、Watanabe Shun-ichi、Ohe Yuichiro、Motoi Noriko
    • 雑誌名

      Clinical Lung Cancer

      巻: 22 号: 4 ページ: 282-291

    • DOI

      10.1016/j.cllc.2021.02.003

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Long-term prognosis of patients with resected adenocarcinoma in situ and minimally invasive adenocarcinoma of the lung.2021

    • 著者名/発表者名
      Yotsukura M, Asamura H, Motoi N, Kashima J, Yoshida Y, Nakagawa K, Shiraishi K, Kohno T, Yatabe Y, Watanabe SI.
    • 雑誌名

      J Thorac Oncol

      巻: 16 号: 8 ページ: 1312-1320

    • DOI

      10.1016/j.jtho.2021.04.007

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Differential Immune-Related Microenvironment Determines Programmed Cell Death Protein-1/Programmed Death-Ligand 1 Blockade Efficacy in Patients With Advanced NSCLC2021

    • 著者名/発表者名
      Shirasawa M, Yoshida T, Shimoda Y, Takayanagi D, Shiraishi K, Kubo T, Mitani S, Matsumoto Y, Masuda K, Shinno Y, Okuma Y, Goto Y, Horinouchi H, Ichikawa H, Kohno T, Yamamoto N, Matsumoto S, Goto K, Watanabe SI, Ohe Y, Motoi N.
    • 雑誌名

      J Thorac Oncol

      巻: 16 号: 1 ページ: 2078-2090

    • DOI

      10.1038/s41598-021-98527-2

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Upregulation of FGF9 in Lung Adenocarcinoma Transdifferentiation to Small Cell Lung Cancer2021

    • 著者名/発表者名
      Ishioka Kota、Yasuda Hiroyuki、Hamamoto Junko、Terai Hideki、Emoto Katsura、Kim Tae-Jung、Hirose Shigemichi、Kamatani Takashi、Mimaki Sachiyo、Arai Daisuke、Ohgino Keiko、Tani Tetsuo、Masuzawa Keita、et al
    • 雑誌名

      Cancer Research

      巻: 81 号: 14 ページ: 3916-3929

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-20-4048

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Vaginal Transmission of Cancer from Mothers with Cervical Cancer to Infants2021

    • 著者名/発表者名
      Arakawa A, Ichikawa H, Kubo T, Motoi N, Kumamoto T, Nakajima M, Yonemori K, Noguchi E, Sunami K, Shiraishi K, Kakishima H, Yoshida H, Hishiki T, Kawakubo N, Kuroda T, Kiyokawa T, Yamada K, Yanaihara N, et al, and Kohno T, Ogawa C.
    • 雑誌名

      New England Journal of Medicine

      巻: 384 号: 1 ページ: 42-50

    • DOI

      10.1056/nejmoa2030391

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] DNA hypermethylation of the ZNF132 gene participates in the clinicopathological aggressiveness of 'pan-negative'-type lung adenocarcinomas.2021

    • 著者名/発表者名
      Hamada K, Tian Y, Fujimoto M, Takahashi Y, Kohno T, Tsuta K, Watanabe SI, Yoshida T, Asamura H, Kanai Y, Arai E.
    • 雑誌名

      Carcinogenesis

      巻: 42 号: 2 ページ: 169-179

    • DOI

      10.1093/carcin/bgaa115

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Long-read sequencing for non-small-cell lung cancer genomes2020

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto Y, Xu L, Seki M, Yokoyama TT, Kasahara M, Kashima Y, Ohashi A, Shimada Y, Motoi N, Tsuchihara K, Kobayashi SS, Kohno T, Shiraishi Y, Suzuki A, Suzuki Y.
    • 雑誌名

      Genome Res

      巻: 30 号: 9 ページ: 1243-57

    • DOI

      10.1101/gr.261941.120

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Lung cancer medicine and prevention utilizing germline information2023

    • 著者名/発表者名
      Kohno T
    • 学会等名
      第82回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Drug susceptibility model for RET resistance mutations through combined in vitro and in silico analyses2023

    • 著者名/発表者名
      Nakaoku T, Maruyama K, Nukaga S, Kohno T.
    • 学会等名
      第82回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Development of a 3D-structure-based drug response model to help annotating kinase mutations for precision medicine2023

    • 著者名/発表者名
      Maruyama K, Nakaoku T, Nukaga S, Kohno T
    • 学会等名
      第82回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Development of a 3D-structure-based drug response model to help annotating kinase mutations for precision medicine2023

    • 著者名/発表者名
      Maruyama K, Nakaoku T, Araki M, Nukaga S, Okuno Y, Kohno T
    • 学会等名
      CBI学会2023年大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Whole genome sequencing-based precision cancer medicine in Japan2023

    • 著者名/発表者名
      Kohno T
    • 学会等名
      第20回日本臨床腫瘍学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 長鎖シークエンス技術を用いた非小細胞肺がんオミクス解析2023

    • 著者名/発表者名
      鈴木絢子
    • 学会等名
      令和4年度国際がん研究シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ロングリード全ゲノムシークエンスとフェーズ情報解析による肺がんゲノム変異パターンの解明2022

    • 著者名/発表者名
      鈴木絢子、坂本祥駿、鈴木穣
    • 学会等名
      第81回日本肺癌学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 非喫煙者肺がん・喫煙者肺がんの病因とゲノム解析2022

    • 著者名/発表者名
      河野隆志
    • 学会等名
      第 116 回日本肺癌学会 関西支部学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 肺がんと遺伝子、わかったこと、わからないこと2021

    • 著者名/発表者名
      河野隆志
    • 学会等名
      第62回日本肺癌学会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ロングリードシークエンス技術を駆使した早期および進行肺がんの比較全ゲノム解析2021

    • 著者名/発表者名
      鈴木絢子
    • 学会等名
      第62回日本肺癌学会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Molecular Epidemiology of Asian Lung Cancer2020

    • 著者名/発表者名
      Takashi Kohno, Kouya Shiraishi, Takashi Nakaoku
    • 学会等名
      IASLC 2020 WCLC World Conference on Lung Cancer
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Targeting RET-VUS in precision oncology using molecular dynamics simulation2020

    • 著者名/発表者名
      Takashi Nakaoku, Junya Tabata, Mitsugu Araki, Yasushi Okuno, Takashi Kohno
    • 学会等名
      第79回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] The Landscape of oncogenic function of RET tyrosine kinase2020

    • 著者名/発表者名
      Junya Tabata, Takashi Nakaoku, Takashi Kohno
    • 学会等名
      第79回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 1-2 早期肺発がん機構の研究

    • URL

      https://www.ncc.go.jp/jp/ri/division/genome_biology/project/010/20170906193233.html

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] 最適化がん治療の研究

    • URL

      https://www.ncc.go.jp/jp/ri/division/genome_biology/project/020/20190125.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [産業財産権] RETキナーゼ阻害剤によるがん治療の有効性を判定する方法2022

    • 発明者名
      河野隆志、中奥敬史
    • 権利者名
      河野隆志、中奥敬史
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2022-089905
    • 出願年月日
      2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi