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流域におけるノロウイルスの動態把握と流行予測

研究課題

研究課題/領域番号 20H00632
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分63:環境解析評価およびその関連分野
研究機関山口大学

研究代表者

赤松 良久  山口大学, 大学院創成科学研究科, 教授 (30448584)

研究分担者 中尾 遼平  山口大学, 大学院創成科学研究科, 准教授(特命) (10814618)
嶋寺 光  大阪大学, 大学院工学研究科, 准教授 (20647367)
栗田 喜久  九州大学, 農学研究院, 准教授 (40725058)
間普 真吾  山口大学, 大学院創成科学研究科, 教授 (70434321)
乾 隆帝  福岡工業大学, 社会環境学部, 教授 (20723844)
鬼倉 徳雄  九州大学, 農学研究院, 教授 (50403936)
源 利文  神戸大学, 人間発達環境学研究科, 教授 (50450656)
水上 洋一  山口大学, 大学研究推進機構, 教授 (80274158)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
44,590千円 (直接経費: 34,300千円、間接経費: 10,290千円)
2023年度: 9,490千円 (直接経費: 7,300千円、間接経費: 2,190千円)
2022年度: 11,310千円 (直接経費: 8,700千円、間接経費: 2,610千円)
2021年度: 9,230千円 (直接経費: 7,100千円、間接経費: 2,130千円)
2020年度: 14,560千円 (直接経費: 11,200千円、間接経費: 3,360千円)
キーワードノロウイルス / DNA/RNA / 環境DNA / 流域 / 海綿 / パッシブサンプラー / 流行予測 / 流動シミュレーション / 二枚貝
研究開始時の研究の概要

ノロウイルスをはじめとした病原ウイルスの人から人への感染経路についてはこれまで多くの検討がなされているものの,環境中や食品を通しての感染経路については不明な部分が多く,流行予測を行うのが難しいのが現状である.そこで,本研究はノロウイルスをはじめとした病原ウイルスの流域内の大気・水中における動態および食品(特に濾過食性の二枚貝)における蓄積メカニズムを,最新の検出技術を用いて明らかにする.さらに,大気・水の流動シミュレーションを用いることにより,ノロウイルスの流行予測モデルの開発し,ノロウイルスの流行を防除する仕組みを構築する.

研究成果の概要

水中および大気中のウイルスを対象に,乾燥海綿をフィルターとして効率的に回収する方法を開発した.また,本手法を用いて陸域~河川~海域におけるノロウイルス濃度の定量の結果,下水処理場以外から流入したノロウイルスの存在が,河川水およびカキへの汚染を引き起こして いる可能性が示唆された.さらに,3次元環境流体モデル(Fantom Refined)によるシミュレーションによる河川~海域でのノロウイルス濃度の推定から,河川水では処理水からの汚染による負荷を過小評価しており,海域での実際の汚染はより広範囲に広がっている可能性が高いと考えられた.

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究により,水中および大気中の微量なウイルスを乾燥海綿を活用して効率的に回収可能であることが明らかとなっており,この手法は環境中のDNA/RNAの回収に広く活用される可能性がある.本研究により,陸域~河川~海域の一連の流域におけるノロウイルスの挙動を,実測およびシミュレーションにより把握することが可能であることが示された.本手法を活用して河口域の貝類の汚染を予測・防除することによって,我が国おいて年間930億円の経済損失をもたらしているともいわれるノロウイルスの根絶の可能性があり,社会的に意義は高い.

報告書

(6件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 11件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] Multiple recombination events between endogenous retroviral elements and feline leukemia virus2024

    • 著者名/発表者名
      Ngo Minh Ha、AbuEed Loai、Kawasaki Junna、Oishi Naoki、Pramono Didik、Kimura Tohru、Sakurai Masashi、Watanabe Kenji、Mizukami Yoichi、Ochi Haruyo、Anai Yukari、Odahara Yuka、Umehara Daigo、Kawamura Maki、Watanabe Shinya、Miyake Ariko、Nishigaki Kazuo
    • 雑誌名

      Journal of Virology

      巻: 98 号: 2

    • DOI

      10.1128/jvi.01400-23

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Detection and identification of factors in the atrium responsible for blood pressure regulation in patients with hypertension2024

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura Kenshi、Mengyan Wei、Kume Shinichiro、Kurokawa Tatsuki、Miyamoto Shinji、Mizukami Yoichi、Ono Katsushige
    • 雑誌名

      Heart and Vessels

      巻: 39 号: 5 ページ: 464-474

    • DOI

      10.1007/s00380-024-02362-0

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Xylobiose treatment strengthens intestinal barrier function by regulating claudin 2 and heat shock protein 27 expression in human Caco‐2 cells2023

    • 著者名/発表者名
      Rini Dina Mustika、Nakamichi Yusuke、Morita Tomotake、Inoue Hiroyuki、Mizukami Yoichi、Yamamoto Yoshinari、Suzuki Takuya
    • 雑誌名

      Journal of the Science of Food and Agriculture

      巻: 104 号: 4 ページ: 2518-2525

    • DOI

      10.1002/jsfa.13111

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] G-protein-coupled estrogen receptor prevents nuclear factor-kappa B promoter activation by <i>Helicobacter pylori</i> cytotoxin-associated gene A in gastric cancer cells2023

    • 著者名/発表者名
      OKAMOTO Mariko、MIURA Atsushi、ITO Ryota、KAMADA Toshiki、MIZUKAMI Yoichi、KAWAMOTO Keiko
    • 雑誌名

      The Journal of Veterinary Medical Science

      巻: 85 号: 12 ページ: 1348-1354

    • DOI

      10.1292/jvms.23-0054

    • ISSN
      0916-7250, 1347-7439
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human TMEM2 is not a catalytic hyaluronidase, but a regulator of hyaluronan metabolism via HYBID (KIAA1199/CEMIP) and HAS2 expression2023

    • 著者名/発表者名
      Sato Shinya、Miyazaki Megumi、Fukuda Shinji、Mizutani Yukiko、Mizukami Yoichi、Higashiyama Shigeki、Inoue Shintaro
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 号: 6 ページ: 104826-104826

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.104826

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Jo-1 Antibodies From Myositis Induce Complement-Dependent Cytotoxicity and TREM-1 Upregulation in Muscle Endothelial Cells2023

    • 著者名/発表者名
      Honda Masaya、Shimizu Fumitaka、Sato Ryota、Mizukami Yoichi、Watanabe Kenji、Takeshita Yukio、Maeda Toshihiko、Koga Michiaki、Kanda Takashi
    • 雑誌名

      Neurology - Neuroimmunology Neuroinflammation

      巻: 10 号: 4 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1212/nxi.0000000000200116

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Application of a quantitative PCR method for monitoring of geosmin-producing Anabaena spp. in a Japanese reservoir.2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshihisa Akamatsu, Ryohei Nakao, Hiromu Motozawa, Koji Furukawa, Yoshihisa Kurita
    • 雑誌名

      Landscape and Ecological Engineering.

      巻: vol.19 号: 1 ページ: 87-93

    • DOI

      10.1007/s11355-022-00533-7

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ethanolamine plasmalogens derived from whale brain stimulate both follicle‐stimulating hormone and luteinizing hormone secretion by bovine gonadotrophs2023

    • 著者名/発表者名
      Saito Risa、Bando Takeharu、Kotaniguchi Miyako、Tamura Tsutomu、Kuno Tomoe、Watanabe Kenji、Mizukami Yoichi、Kitamura Shinichi、Kadokawa Hiroya
    • 雑誌名

      Animal Science Journal

      巻: 94 号: 1 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1111/asj.13839

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantitative environmental DNA metabarcoding shows high potential as a novel approach to quantitatively assess fish community2022

    • 著者名/発表者名
      Tsuji Satsuki、Inui Ryutei、Nakao Ryohei、Miyazono Seiji、Saito Minoru、Kono Takanori、Akamatsu Yoshihisa
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-022-25274-3

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pre-centrifugation before DNA extraction mitigates extraction efficiency reduction of environmental DNA caused by the preservative solution (benzalkonium chloride) remaining in the filters2022

    • 著者名/発表者名
      Satsuki Tsuji, Ryohei Nakao, Minoru Saito, Toshifumi Minamoto ,Yoshihisa Akamatsu
    • 雑誌名

      Limnology

      巻: 23 号: 1 ページ: 9-16

    • DOI

      10.1007/s10201-021-00676-w

    • NAID

      40022800291

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 宅配車を活用したクラウド型車載雨量モニタリングシステムの実証実験2021

    • 著者名/発表者名
      藤井晴香;赤松良久;齋藤和興;齋藤大騎;齋藤亮;福丸大智
    • 雑誌名

      河川技術論文集

      巻: 27 ページ: 63-68

    • NAID

      130008114021

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] 異なる粒子保持径のガラスフィルターから得られた魚類の環境DNAメタバーコーディングと採集調査の比較2020

    • 著者名/発表者名
      INUI Ryutei、NAKAO Ryohei、MIYAZONO Seiji、SAITO Minoru、AKAMATSU Yoshihisa、KONO Takanori、KOBAYASHI Kanta
    • 雑誌名

      土木学会論文集B1(水工学)

      巻: 76 号: 2 ページ: I_1297-I_1302

    • DOI

      10.2208/jscejhe.76.2_I_1297

    • NAID

      130008122559

    • ISSN
      2185-467X
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Landslide Area Segmentation of Synthetic Aperture Radar Images Using U-net with Convolutional Autoencoder Trained by Pre-training and Fine-tuning2024

    • 著者名/発表者名
      Shingo Mabu
    • 学会等名
      The Twenty-Ninth International Symposium on Artificial Life and Robotics 2024
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Evaluation of the efficacy of sponges as a passive environmental DNA sampler2023

    • 著者名/発表者名
      Ryohei Nakao
    • 学会等名
      The eDNA Society International Meeting 2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 大気環境DNAを用いた哺乳類および鳥類の調査手法の検討2023

    • 著者名/発表者名
      中尾 遼平
    • 学会等名
      応用生態工学会第26回京都大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] パッシブサンプリングツールを用いた環境DNA調査の施行2023

    • 著者名/発表者名
      今村 史子
    • 学会等名
      応用生態工学会第26回京都大会(2023)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] SARS-CoV-2 に対する長期下水モニタリングにおけるパッシブサンプラーの適用性と流行の早期検知の可能性2023

    • 著者名/発表者名
      稲葉愛美
    • 学会等名
      第58回日本水環境学会年会(2023年度)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 山口県内下水処理場および周辺河川におけるノロウイルスの通年動態とカキへの蓄積2023

    • 著者名/発表者名
      赤松良久
    • 学会等名
      第58回日本水環境学会年会(2023年度)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Landslide Area Segmentation of Synthetic Aperture Radar Images Using U-net with Convolutional Autoencoder Trained by Pre-training and Fine-tuning2023

    • 著者名/発表者名
      Shingo Mabu
    • 学会等名
      The Twenty-Ninth International Symposium on Artificial Life and Robotics 2024
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 感染症病棟下水中の SARAS-CoV-2 濃度によるウイルス濃縮法(Direct capture 法)の評価と入院患者数との相関分析2022

    • 著者名/発表者名
      稲葉愛美
    • 学会等名
      第74回 2022年度(令和4) 土木学会中国支部研究発表会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 乾燥海綿を用いた下水ウイルスのパッシブサンプリング法の開発2022

    • 著者名/発表者名
      稲葉愛美
    • 学会等名
      第56回水環境学会年会2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ロボット分注装置を用いた新型コロナウイルスPCR検査の迅速解析方法の開発2022

    • 著者名/発表者名
      水上 洋一
    • 学会等名
      第32回日本医学看護学教育学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 空気中の環境DNA分析に適したエアーサンプリング法の検討2021

    • 著者名/発表者名
      大中臨
    • 学会等名
      令和3年度環境DNA学会第4回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 環境 DNA 調査のためのパッシブサンプリング法に関する基礎的検討2021

    • 著者名/発表者名
      中尾遼平
    • 学会等名
      令和3年度環境DNA学会第4回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 乾燥海綿を用いた下水ウイルスのパッシブサンプリング法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      稲葉愛美
    • 学会等名
      第56回水環境学会年会2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 感染症病棟下水中の SARAS-CoV-2 濃度によるウイルス濃縮法(Direct capture 法)の評価と入院患者数との相関分析2021

    • 著者名/発表者名
      稲葉愛美
    • 学会等名
      第56回水環境学会年会2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNAメタバーコーディングの空間解像度調整に関する検討~フィルターの粒子保持径に着目して~2020

    • 著者名/発表者名
      乾 隆帝
    • 学会等名
      応用生態工学会福岡 2020九州地区事例・研究発表会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] エアーサンプラーを用いた空気中の環境DNA分析の可能性検討2020

    • 著者名/発表者名
      中尾遼平
    • 学会等名
      第3回環境DNA学会大会・第36回個体群生態学会大会合同大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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