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データ駆動に基づく記述子構築法と有機合成反応および触媒反応予測への展開

研究課題

研究課題/領域番号 20H02747
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分33020:有機合成化学関連
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

矢田 陽  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 材料・化学領域, 研究チーム長 (70619965)

研究分担者 椿 真史  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 研究員 (80803874)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2022年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2021年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2020年度: 7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円)
キーワード機械学習 / 転移学習 / 有機合成 / 触媒 / 触媒反応 / 収率予測
研究開始時の研究の概要

人工知能(AI)技術を活用するためには一般的には大量のデータが必要である。しかし、実験化学においてはコストや時間が掛かる実験を実施しなければデータが収集できないため、AIをいかに活用するかは重要な課題である。特に、触媒開発や反応開発等の新しい分子の創成が要求される分野では、少数のデータでいかに予測性能の高いモデルが構築できるかが重要となる。本研究では、有機化学や触媒化学分野において、少数データに対して予測性能の高い機械学習モデルを構築するための新しい方法論の構築に挑戦する。代表者の矢田と分担者の椿に加えて、研究協力者として永田賢二主任研究員 (物質・材料研究機構)を加えて本研究を実施する。

研究成果の概要

本研究では、有機化学や触媒化学分野において、少数データに対して予測性能の高い機械学習モデルを構築するための新しい方法論の構築に取り組んだ。具体的には、まず、有機化合物の情報(入力)と量子化学計算値(出力)とを相関づけて、グラフニューラルネットワーク(GNN)による機械学習モデルを構築した。この機械学習モデルの最終中間層を取り出して触媒反応の収率や選択性などの予測モデルの入力として活用できることを明らかにした。また、本手法に活用可能な有機化合物の独自データベースの構築に取り組み、約6000の有機リン化合物のデータベースの構築に成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究成果は、コストや時間が掛かる実験を実施しなければデータが収集できない実験科学において、少数のデータでも予測性能の高い機械学習モデルを構築するための方法論を提供するものである。大量のデータが収集できない分野は多岐に渡ると考えられ、本研究技術はそのような分野にも波及して幅広く応用されることが期待され、学術的および社会的意義は大きいと考えている。また、有機合成化学・触媒化学分野においても、新たなAIの活用方法を提供することで、新しい原理・原則の発見と化学の進歩につながると同時に、本研究代表者が目指す触媒の自動発見に向けて大きく前進すると期待している。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (19件) (うち国際学会 3件、 招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Pt-Catalyzed selective oxidation of alcohols to aldehydes with hydrogen peroxide using continuous flow reactors2021

    • 著者名/発表者名
      Kon Yoshihiro、Nakashima Takuya、Yada Akira、Fujitani Tadahiro、Onozawa Shun-ya、Kobayashi Sh?、Sato Kazuhiko
    • 雑誌名

      Organic & Biomolecular Chemistry

      巻: 19 号: 5 ページ: 1115-1121

    • DOI

      10.1039/d0ob02213f

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ensemble Learning Approach with LASSO for Predicting Catalytic Reaction Rates2020

    • 著者名/発表者名
      Yada Akira、Sato Kazuhiko、Matsumura Tarojiro、Ando Yasunobu、Nagata Kenji、Ichinoseki Sakina
    • 雑誌名

      Synlett

      巻: - 号: 18 ページ: 1843-1848

    • DOI

      10.1055/a-1304-4878

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Learning excited states from ground states by using an artificial neural network2020

    • 著者名/発表者名
      Kiyohara Shin、Tsubaki Masashi、Mizoguchi Teruyasu
    • 雑誌名

      npj Computational Materials

      巻: 6 号: 1 ページ: 1-6

    • DOI

      10.1038/s41524-020-0336-3

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Quantum Deep Field: Data-Driven Wave Function, Electron Density Generation, and Atomization Energy Prediction and Extrapolation with Machine Learning2020

    • 著者名/発表者名
      Masashi Tsubaki and Teruyasu Mizoguchi
    • 雑誌名

      Physical Review Letters

      巻: 125 号: 20 ページ: 206401-206401

    • DOI

      10.1103/physrevlett.125.206401

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] On the equivalence of molecular graph convolution and molecular wave function with poor basis set2020

    • 著者名/発表者名
      Masashi Tsubaki、Teruyasu Mizoguchi
    • 雑誌名

      Advances in Neural Information Processing Systems 33 (NeurIPS 2020)

      巻: 33 ページ: 1982-1993

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 機械学習による触媒反応最適化の基礎2023

    • 著者名/発表者名
      矢田陽
    • 学会等名
      日本化学会 第103春季年会(2023)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] データ駆動型触媒化学2023

    • 著者名/発表者名
      矢田陽
    • 学会等名
      第6回 SPIRITS生物-無機-有機融合化学セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 触媒インフォマティクス2023

    • 著者名/発表者名
      矢田陽
    • 学会等名
      最近の化学工学講習会71 「カーボンニュートラルに貢献する触媒・反応工学」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Machine Learning Prediction of Catalytic Activity toward Rapid Design of Innovative Catalyst2022

    • 著者名/発表者名
      Akira Yada
    • 学会等名
      22nd Tateshina Conference on Organic Chemistry
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] キャタリストインフォマティクス:触媒開発から医薬品合成への貢献を目指して2022

    • 著者名/発表者名
      矢田陽
    • 学会等名
      筑波大学 トランスボーダー医学研究センター 情報医学研究部門 第四回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] データ駆動型触媒設計・開発の現状と今後2022

    • 著者名/発表者名
      矢田陽
    • 学会等名
      第2回錯体化学会フロンティアセミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 合成化学者が合成化学にAIを活用するためには?2022

    • 著者名/発表者名
      矢田陽
    • 学会等名
      日本化学会 第102春季年会(2022)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] キャタリストインフォマティクスによる触媒設計2021

    • 著者名/発表者名
      矢田陽
    • 学会等名
      第16回ケムステVシンポ「マテリアルズインフォマティクス」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] キャタリストインフォマティクス:触媒×人工知能による触媒設計2021

    • 著者名/発表者名
      矢田陽
    • 学会等名
      有機合成夏期セミナー「明日の有機合成化学」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] キャタリストインフォマティクス -触媒化学と機械学習の融合-2021

    • 著者名/発表者名
      矢田陽
    • 学会等名
      接着・接合技術コンソーシアム 第1回データ駆動WG
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] キャタリストインフォマティクスによる触媒反応の収率予測2021

    • 著者名/発表者名
      矢田陽
    • 学会等名
      化学反応経路探索のニューフロンティア2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Machine learning approach for prediction of reaction yield-aiming at the discovery of innovative catalysts2021

    • 著者名/発表者名
      Akira Yada
    • 学会等名
      The 2021 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Materials and Process Informatics in Organic Synthesis and Catalyst2021

    • 著者名/発表者名
      Akira Yada
    • 学会等名
      The Material Research Meeting 2021 (MRM2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] キャタリストインフォマティクスによる触媒活性予測2021

    • 著者名/発表者名
      矢田 陽
    • 学会等名
      第14回触媒劣化セミナー
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 分子機能予測のための人工知能技術2021

    • 著者名/発表者名
      矢田 陽
    • 学会等名
      第4回 食・触コンソーシアム シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] キャタリストインフォマティクスによる触媒活性予測2021

    • 著者名/発表者名
      矢田 陽
    • 学会等名
      日本化学会「R&D懇話会214回」AI を活用した研究開発の現状と展望~超超PJ における研究事例~
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 深層学習に基づく波動関数・電子構造の記述子表現と転移学習への応用2021

    • 著者名/発表者名
      椿 真史
    • 学会等名
      日本化学会 第101春季年会 (2021)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 創薬と新材料開発のための人工知能2021

    • 著者名/発表者名
      椿 真史
    • 学会等名
      情報処理学会全国大会 2021
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] キャタリストインフォマティクスによる触媒反応の収率予測2020

    • 著者名/発表者名
      矢田 陽
    • 学会等名
      化学工学会第51回秋季大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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