• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

大規模ポリマーライブラリを利用した細菌叢メトリクス

研究課題

研究課題/領域番号 20H02774
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分34020:分析化学関連
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

冨田 峻介  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (50726817)

研究分担者 菅井 祥加  筑波大学, 数理物質系, 助教 (10905566)
湯本 勲  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究部門付 (30358303)
宮崎 歴  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究部門長 (70358125)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
18,070千円 (直接経費: 13,900千円、間接経費: 4,170千円)
2022年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2021年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2020年度: 9,490千円 (直接経費: 7,300千円、間接経費: 2,190千円)
キーワードバイオメトリクス / パターン認識 / ブロック共重合体 / マイクロバイオーム / 腸内細菌 / バイオセンシング / 機械学習 / 細菌叢 / 凝集誘起発光 / 高分子
研究開始時の研究の概要

細菌の集合は“細菌叢”と呼ばれ、古くから食品等の発酵に利用されている。最近では、ヒトの消化器に生息する細菌叢が疾患と深く関わっており、細菌叢組成の改善によってそれらを治療できる可能性が明らかになってきた。こうした産業的・医学的に重要な細菌叢を人間の制御下に置くには、細菌叢の状態を簡易に評価するための分析技術の開発が必須である。本研究では、これまでに研究代表者が開発してきた、ポリマーアレイと機械学習を融合した“パターン認識センシング”の技術を細菌叢評価に展開し、細菌叢の状態情報を出力可能な“細菌叢メトリクス”を創製することを目的とする。

研究成果の概要

腸内細菌叢の解析は、健康管理や疾病治療において極めて重要であると認識されつつある。本研究では、細菌叢の特徴を蛍光性のブロック共重合体群を用いて蛍光パターンに変換し、これをパターン認識技術によって解析することで、細菌叢の状態を簡易かつ迅速に同定できる分析技術“細菌叢メトリクス”の開発を推進した。凝集誘起発光ユニットを有する12種類の異なる構造のブロック共重合体群を新規に合成し、これを用いて分析をしたところ、腸内由来細菌株やの大腸菌株の識別、さらには、腸内細菌叢の分析によりマウスの睡眠障害を検出することに成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究により確立された蛍光性ブロック共重合体群とパターン認識技術を組み合わせた細菌叢メトリクス技術は、標準的な腸内細菌叢分析法であるメタゲノム解析とは異なる観点から腸内細菌叢の状態を評価することを可能にするうえ、メタゲノム解析よりも迅速、簡便、かつ安価に実施できるという長所をもつ。ポリマーや解析法を腸内細菌叢分析により適した形に改良し、睡眠障害以外のマウスの健康異常やヒトの糞便試料への適用を推進することで、将来的に個人の健康状態のモニタリングや腸内細菌叢の改善を目的とした食品開発のためのスクリーニング技術など、幅広い分野に広く波及すると期待される。

報告書

(5件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果発表報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2024 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 9件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (15件) (うち招待講演 8件) 図書 (1件) 備考 (2件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] A polymer-based chemical tongue for the non-invasive monitoring of osteogenic stem-cell differentiation by pattern recognition of serum-supplemented spent media2022

    • 著者名/発表者名
      Tomita Shunsuke、Ishihara Sayaka、Kurita Ryoji
    • 雑誌名

      Journal of Materials Chemistry B

      巻: 10 号: 37 ページ: 7581-7590

    • DOI

      10.1039/d2tb00606e

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Damage-free evaluation of cultured cells based on multivariate analysis with a single-polymer probe2022

    • 著者名/発表者名
      Sugai Hiroka、Tomita Shunsuke、Ishihara Sayaka、Shiraki Kentaro、Kurita Ryoji
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 58 号: 79 ページ: 11083-11086

    • DOI

      10.1039/d2cc03308a

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polymer-based chemical-nose systems for optical-pattern recognition of gut microbiota2022

    • 著者名/発表者名
      Tomita Shunsuke、Kusada Hiroyuki、Kojima Naoshi、Ishihara Sayaka、Miyazaki Koyomi、Tamaki Hideyuki、Kurita Ryoji
    • 雑誌名

      Chemical Science

      巻: 13 号: 20 ページ: 5830-5837

    • DOI

      10.1039/d2sc00510g

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 味覚の仕組みを模倣して複雑なバイオ試料を判別するセンシング技術2022

    • 著者名/発表者名
      冨田 峻介
    • 雑誌名

      Bio九州

      巻: 234 ページ: 10-14

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Chemical tongues: biomimetic recognition using arrays of synthetic polymers2022

    • 著者名/発表者名
      Tomita Shunsuke
    • 雑誌名

      Polymer Journal

      巻: - 号: 7 ページ: 851-862

    • DOI

      10.1038/s41428-022-00636-w

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A polymer-based chemical tongue for the non-invasive monitoring of osteogenic stem-cell differentiation by pattern recognition of serum-supplemented spent media2022

    • 著者名/発表者名
      Tomita Shunsuke、Ishihara Sayaka、Kurita Ryoji
    • 雑誌名

      ChemRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.26434/chemrxiv-2022-fpm9s

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Affinity Diversification of a Polymer Probe for Pattern-recognition-based Biosensing Using Chemical Additives2021

    • 著者名/発表者名
      OKADA Hiroki、MIMURA Masahiro、TOMITA Shunsuke、KURITA Ryoji
    • 雑誌名

      Analytical Sciences

      巻: 37 号: 5 ページ: 713-719

    • DOI

      10.2116/analsci.20SCP23

    • NAID

      130008036585

    • ISSN
      0910-6340, 1348-2246
    • 年月日
      2021-05-10
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Pattern-recognition-based Identification of Proteases and Their Complexes by a One-component Array Composed of a Dansyl-modified Charged Polymer2021

    • 著者名/発表者名
      Tomita Shunsuke、Kurita Ryoji
    • 雑誌名

      Sensors and Materials

      巻: 33 号: 1 ページ: 233

    • DOI

      10.18494/SAM.2021.3074

    • ISSN
      0914-4935, 2435-0869
    • 年月日
      2021-01-22
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 分子アレイデバイスと多変量解析による生体試料評価法2020

    • 著者名/発表者名
      冨田 峻介, 菅井 祥加, 南木 創, 栗田 僚二
    • 雑誌名

      電気化学

      巻: 88 号: 3 ページ: 262-271

    • DOI

      10.5796/denkikagaku.20-TE0006

    • NAID

      130007897246

    • ISSN
      2433-3255, 2433-3263
    • 年月日
      2020-09-05
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] A Biomimetic Sensor Array Based on a Single Fluorescent Block-copolymer for the Pattern Recognition of Proteins2020

    • 著者名/発表者名
      Tomita Shunsuke、Sugai Hiroka、Ishihara Sayaka、Hosokai Takuya、Kurita Ryoji
    • 雑誌名

      Chemistry Letters

      巻: 49 号: 12 ページ: 1447-1451

    • DOI

      10.1246/cl.200438

    • NAID

      130007956014

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A Multichannel Pattern-Recognition-Based Protein Sensor with a Fluorophore-Conjugated Single-Stranded DNA Set2020

    • 著者名/発表者名
      Okada Mari、Sugai Hiroka、Tomita Shunsuke、Kurita Ryoji
    • 雑誌名

      Sensors

      巻: 20 号: 18 ページ: 5110-5110

    • DOI

      10.3390/s20185110

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Microfluidic Sensing System with a Multichannel Surface Plasmon Resonance Chip: Damage-Free Characterization of Cells by Pattern Recognition2020

    • 著者名/発表者名
      Sugai Hiroka、Tomita Shunsuke、Ishihara Sayaka、Yoshioka Kyoko、Kurita Ryoji
    • 雑誌名

      Analytical Chemistry

      巻: 92 号: 22 ページ: 14939-14946

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.0c02220

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 機械学習と分子アレイを融合した高精度バイオセンシング技術2022

    • 著者名/発表者名
      冨田 峻介
    • 学会等名
      第20回 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chemical tongue: 味覚の模倣によって試料の特徴を捉えるバイオ分析ツール2022

    • 著者名/発表者名
      冨田 峻介
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 第3回タタバイオ分子クラブ2022

    • 著者名/発表者名
      冨田 峻介
    • 学会等名
      Chemical tongue: 味覚を模倣して複雑なバイオ試料を味わう技術
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 多変量解析ソフトウェアを利用したバイオ分析データのビジュアル化入門2021

    • 著者名/発表者名
      冨田 峻介
    • 学会等名
      第81回分析化学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chemical tongue:ヒトの味覚を模倣したバイオ試料認識技術2021

    • 著者名/発表者名
      冨田 峻介
    • 学会等名
      奈良県立医科大学V-iCliniX講座 2021年度セミナー
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Polymer-based chemical tongue:ヒトの味覚を模倣したバイオ試料認識ツール2021

    • 著者名/発表者名
      冨田 峻介
    • 学会等名
      2021年度北海道高分子若手研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 日本分析化学会第70年会2021

    • 著者名/発表者名
      菅井祥加,冨田峻介,石原紗綾夏,栗田僚二
    • 学会等名
      蛍光団修飾ポリリジンを用いたパターン認識に基づく培養細胞の非破壊的評価
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Polymer-based Biomimetic Sensing Systems for the Recognition of Gut Microbiome2021

    • 著者名/発表者名
      Shunsuke Tomita, Hiroyuki Kusada, Naoshi Kojima, Sayaka Ishihara, Koyomi Miyazaki, Hideyuki Tamaki, Ryoji Kurita
    • 学会等名
      第31回日本MRS年次大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Chemical tongue: Biomimicry sensing of complex bioanalytes using arrays of nanomaterials and polymers2021

    • 著者名/発表者名
      Shusnuke Tomita, Ryoji kurita
    • 学会等名
      Pacifichem2020
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 表面プラズモン共鳴の応答パターンを出力可能なマイクロ流体デバイスによる細胞評価2021

    • 著者名/発表者名
      菅井祥加,冨田峻介,石原紗綾夏,吉岡恭子,栗田僚二
    • 学会等名
      2020年度細胞アッセイ研究会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] パターン認識に基づいて細胞を評価するセンサチップの開発2021

    • 著者名/発表者名
      菅井祥加,冨田峻介,石原紗綾夏,吉岡恭子,栗田僚二
    • 学会等名
      SATテクノロジー・ショーケース 2021
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 表面プラズモン共鳴の特徴パターンを出力するマルチチャネル型チップによる培養細胞の非破壊的評価2020

    • 著者名/発表者名
      菅井祥加,冨田峻介,石原紗綾夏,吉岡恭子,栗田僚二
    • 学会等名
      第80回分析化学討論会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] DNAの交差応答性を利用したタンパク質の特徴パターン情報の出力2020

    • 著者名/発表者名
      冨田峻介, 菅井祥加, 三村真大, 石原紗綾夏, 白木賢太郎, 栗田僚二
    • 学会等名
      第69回高分子学会年次大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 高分子ライブラリを用いた生体模倣センシングシステムの構築2020

    • 著者名/発表者名
      冨田峻介
    • 学会等名
      高分子学会 関東支部 茨城地区活動講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Pattern-recognition-based Biomimetic Sensing Systems Using Polymer Libraries2020

    • 著者名/発表者名
      Shunsuke Tomita
    • 学会等名
      第30回日本MRS年次大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] 相分離生物学の全貌(現代化学増刊46), 白木 賢太郎 編2020

    • 著者名/発表者名
      菅井 祥加、冨田 峻介
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      東京化学同人
    • ISBN
      9784807913466
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] Bio/synthetic polymer team

    • URL

      https://staff.aist.go.jp/s.tomita/index.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
  • [備考] Bio/synthetic polymer team

    • URL

      https://staff.aist.go.jp/s.tomita/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [産業財産権] 生物学的試料の分析方法2024

    • 発明者名
      冨田 峻介、石原 紗綾夏、栗田 僚二、菅井 祥加
    • 権利者名
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2024-089028
    • 出願年月日
      2024
    • 関連する報告書
      研究成果発表報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-03-27  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi