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生体組織における細胞間相互作用の次元拡張オミクス解析

研究課題

研究課題/領域番号 20H02862
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分37010:生体関連化学
研究機関自治医科大学

研究代表者

口丸 高弘  自治医科大学, 医学部, 准教授 (10570591)

研究分担者 岩野 智  国立研究開発法人理化学研究所, 脳神経科学研究センター, 客員研究員 (10734832)
近藤 科江  東京工業大学, 生命理工学院, 教授 (40314182)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2022年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
2021年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2020年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
キーワード細胞間相互作用 / オミクス解析 / 蛍光タンパク質 / 転移 / 近接細胞蛍光標識 / 1細胞オミクス / 1細胞オミクス解析 / 次元拡張
研究開始時の研究の概要

生体組織において、細胞間相互作用は組織恒常性の維持や疾患の発生・亢進に決定的な役割を担う。本研究では、実験モデル動物の生体組織において、特定の細胞と近接して相互作用する細胞をその場で蛍光標識し、破砕組織から相互作用パートナーの同定を可能にすると共に、パートナー細胞に相互作用した時間過程情報を記録する新規の近接細胞の蛍光標識技術を開発する。このような技術を用いた細胞間相互作用の時間動態解析と1細胞オミクス解析を組み合わせることで、従来スナップショット解析であった1オミクスアプローチの解析次元を拡張し、生体組織における細胞間相互作用の未解決問題に取り組む。

研究成果の概要

分割型GFPシステムを利用して、ある特定の細胞に近接する細胞をその場で蛍光標識する技術sGRAPHICに、蛍光タイマータンパク質を組み込むことで、細胞間相互作用の時間情報を蛍光タンパク質の発色の変化から推定するシステムの構築を試みた。赤色蛍光タイマータンパク質を用いた新規の分割型蛍光タンパク質の構築には成功したものの、その半減期の短さから、細胞間相互作用の時間情報を効果的に取得するにはさらなる改良が必要であった。また、並行してsGRAPHICシステムをがん転移モデルにおける細胞間相互作用解析に実装し、オミクス解析に基づいて、がん細胞と肝細胞の相互作用を媒介し得る分子を同定した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

がん転移は、がん患者における90%以上の死亡原因となっている。転移の成立には、がん細胞と組織構成細胞間の細胞間相互作用が重要な役割を果たしており、その分子機構を包括的かつ高解像度で理解できれば新しい治療手法の考案につながる。本研究では、転移過程における、がん細胞と組織構成細胞間の細胞間相互作用を解析するために、蛍光タンパク質標識とオミクス解析に基づいた新規技術の開発とその実装に取り組んだ。その一例として、マウスの肝転移モデルの解析を進め、肝転移における新たな治療標的候補分子を明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] 細胞間相互作用可視化光技術を使ったがん転移形成過程の1細胞オミクス解析2021

    • 著者名/発表者名
      峯岸美紗, 門之園哲也, 近藤科江, 口丸高弘
    • 雑誌名

      JSMI Report

      巻: 15 ページ: 17-20

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Combining optical tagging system with single-cell RNA-seq for investigating metastatic niche cells2022

    • 著者名/発表者名
      口丸 高弘
    • 学会等名
      第31回 日本がん転移学会学術集会・総会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生体組織における細胞間相互作用の光記録技術による疾患メカニズムの1細胞オミクス解析2021

    • 著者名/発表者名
      口丸高弘
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会 第15回年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 細胞間相互作用可視化光技術を使ったがん転移形成過程の1細胞オミクス解析2021

    • 著者名/発表者名
      峯岸美紗、門之園哲哉、近藤科江、口丸高弘
    • 学会等名
      第15回日本分子イメージング学会 学会総会・学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 近接細胞蛍光標識技術を用いた生体組織におけるがん-間質細胞相互作用の解析2021

    • 著者名/発表者名
      口丸高弘
    • 学会等名
      日本薬学会 第141回年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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