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開花期制御を実現するための栄養開花メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 20H02892
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分38010:植物栄養学および土壌学関連
研究機関国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構

研究代表者

田中 伸裕  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 作物研究部門, 主任研究員 (60646230)

研究分担者 神谷 岳洋  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (40579439)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2023年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2022年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2021年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2020年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
キーワード低栄養 / 開花期 / イネ / 栄養開花 / 窒素 / GWAS / 開花 / 栄養条件 / 元素分析
研究開始時の研究の概要

GWASやQTL解析などによって栄養開花に関わる遺伝子を同定、改変することで、開花期が土壌の栄養条件に影響を受けないrobustなイネの作出を行う。加えて栄養欠乏条件で栽培したイネのスペクトル情報を取得することで、非破壊的な栄養診断技術の確率を目指す。この栄養診断によって、圃場で栽培するイネの栄養状態から、開花期を推測が可能になる。

研究実績の概要

本研究は土壌の栄養に開花期が影響を受けにくいロバストな作物の作出を目指している。開花期は穀物生産において最重要な農業形質の一つであり、開花期が揃わないことは、収穫作業の非効率化につながる。また、近年はイネでも利用されているハイブリッド育種において、2親の開花期が一致することは重要である。
我々は特に低窒素条件において開花期が促進する現象に着目し、その栄養開花機構と名付けて、そのメカニズムの解明を進めている。
2022年度は新たに作成した硝酸代謝に関わる転写因子の機能欠損体の表現型解析を行い、通常窒素濃度条件でのみ、野生型と比べて生育不良を示すことなどを明らかにした。
また異なる窒素濃度条件で栽培した野生型と、前述の硝酸代謝に関わる転写因子の機能欠損体を用いたRNA-seqを実施した。得られた発現データは現在解析中である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

GWASによって得られていた栄養開花制御に関わる候補遺伝子について、ゲノム編集による機能欠損体を複数のイネ品種で作成し、その開花応答を調査済みである。また、新たな栄養開花制御因子の探索を目指して、作成したゲノム編集個体を異なる窒素濃度環境下で栽培した時の発現データを取得した。

今後の研究の推進方策

2022年度に取得した低窒素条件のRNA-seqデータから、栄養開花に関わる新規遺伝子の同定を試みる。得られた候補遺伝子については、ゲノム編集を用いた機能欠損体を作出し、その機能解析を進める。
また、すでに同定している栄養開花制御因子である転写因子について、その下流因子の同定を試みる。具体的には転写因子にGFPを連結させたコンストラクト導入イネを作出し、GFP抗体を用いてChIP-Seqを行う。得られた候補遺伝子と、前述のRNA-seqデータの比較から、転写因子の下流で機能する新規栄養開花遺伝子を探索する。

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2022 2020

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 3件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件)

  • [雑誌論文] ゲノム情報を活用した遺伝資源の整備2022

    • 著者名/発表者名
      田中伸裕、江花薫子
    • 雑誌名

      JATAFF Journal

      巻: 10 ページ: 50-54

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Ionomic Profiling of Rice Genotypes and Identification of Varieties with Elemental Covariation Effects2022

    • 著者名/発表者名
      Chengming Zhang、Tanaka Nobuhiro、Dwiyanti Maria Stefanie、Shenton Matthew、Maruyama Hayato、Shinano Takuro、Qingnan Chu、Jun Xie、Watanabe Toshihiro
    • 雑誌名

      Rice Science

      巻: 29 号: 1 ページ: 76-88

    • DOI

      10.1016/j.rsci.2021.12.007

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] イネの無機栄養吸収蓄積と成長制御に関する分子生理遺伝学的研究2020

    • 著者名/発表者名
      田中伸裕
    • 雑誌名

      日本土壌肥料学雑誌

      巻: 91 ページ: 333-334

    • NAID

      130007925025

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Investigation of the Genetic Diversity of a Rice Core Collection of Japanese Landraces using Whole-Genome Sequencing2020

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Nobuhiro、Shenton Matthew、Kawahara Yoshihiro、Kumagai Masahiko、Sakai Hiroaki、Kanamori Hiroyuki、Yonemaru Jun-ichi、Fukuoka Shinichi、Sugimoto Kazuhiko、Ishimoto Masao、Wu Jianzhong、Ebana Kaworu
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 61 号: 12 ページ: 2087-2096

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa125

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Whole-genome sequencing of the NARO World Rice Core Collection (WRC) as the basis for diversity and association studies2020

    • 著者名/発表者名
      Tanaka N, Shenton M, Kawahara Y, Kumagai M, Sakai H, Kanamori H, Yonemaru J, Fukuoka S, Sugimoto K, Ishimoto M, Wu J, Ebana K
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol.

      巻: Epub ahead of print 号: 5 ページ: 922-932

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa019

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2023-12-25  

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