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酢酸菌のペリプラズミック代謝工学

研究課題

研究課題/領域番号 20H02902
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分38020:応用微生物学関連
研究機関山口大学

研究代表者

藥師 寿治  山口大学, 大学研究推進機構, 教授 (30324388)

研究分担者 阿野 嘉孝  愛媛大学, 農学研究科, 准教授 (00403642)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
18,070千円 (直接経費: 13,900千円、間接経費: 4,170千円)
2022年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2021年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2020年度: 10,270千円 (直接経費: 7,900千円、間接経費: 2,370千円)
キーワード応用微生物学 / 発酵 / バイオテクノロジー / 酵素 / 酢酸菌 / 代謝工学 / 応用微生物 / イメージング / タンパク質細胞内局在
研究開始時の研究の概要

酢酸菌はペリプラズム空間と呼ばれる細胞表層に物質酸化系持つという特徴を持つ。ここに,酸化反応以外の代謝系を移植する「ペリプラズミック代謝工学」を施す。細胞質での代謝に比べて,①細胞質への取り込みや細胞質からの排出に関わる時間とエネルギーの抑制,②毒性物質そのもの,あるいは毒性の中間体を経る代謝経路の構築,③代謝上不安定で短寿命な化合物の生産,に優位性がある。ペリプラズム空間で営まれる代謝の,物質生産における優位性を実験で検証する。これを達成するために,酸化反応に加え,脱水,水和,脱炭酸反応をペリプラズム空間に持ち込む。この実現によって代謝工学分野に新しい可能性を提示する。

研究成果の概要

酢酸菌は,細胞表層に特徴的な物質酸化系を持ち,酢酸発酵やビタミンC生産におけるソルボース発酵などに利用されてきた。バクテリアの細胞内区画であるペリプラズム空間での代謝には,細胞質での代謝に比べて利点があると考え,ペリプラズムでの代謝を拡張する「ペリプラズミック代謝工学」の可能性を検証した。最初,天然では細胞質に局在する脱水酵素(リアーゼ)のペリプラズムへの移行を試みた。次に天然では細胞質に局在する異性化酵素の移行を試みた。いずれも代謝速度が上昇した。ペリプラズムへの輸送に関わるタンパク質を発現させることによっても代謝速度の上昇が観察された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

持続可能な発展的経済活動の必要性や二酸化炭素排出低減が訴えられている中,微生物を用いた物質生産は廃棄物利用や環境負荷の低減という意味で魅力的なソリューションの一つである。本研究は,古くから物質生産に利用されている酢酸菌を用いた,新しい概念の代謝工学の検証を行った。いくつかの良好な結果を得ることができたので,当初期待していた新しい代謝工学の有効性を確認することができた。本菌でのさらなる展開はさることながら,大腸菌などの他の微生物を用いた展開が想定できる。この研究が,広く微生物による代謝工学の考え方を変え,新しい物質生産系の構築という形で波及していくことを期待する。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (6件) 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 6件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (8件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] ユーリッヒ研究所(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] カセサート大学/ラジャマンガラ工科大学/メイファールアン大学(タイ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] カセサート大学/ラジャマンガラ工科大学(タイ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] ユーリッヒ研究所(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] カセサート大学/ラジャマンガラ工科大学(タイ)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] ユーリッヒ研究所(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Development of efficient 5-ketogluconate production system by Gluconobacter japonicus2022

    • 著者名/発表者名
      Kataoka N, Naoki K, Ano Y, Matsushita K, Yakushi T.
    • 雑誌名

      Appl Microbiol Biotechnol.

      巻: 106 号: 23 ページ: 7751-7761

    • DOI

      10.1007/s00253-022-12242-0

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Periplasmic dehydroshikimate dehydratase combined with quinate oxidation in Gluconobacter oxydans for protocatechuate production2022

    • 著者名/発表者名
      Nagaki K, Kataoka N, Theeragool G, Matsutani M, Ano Y, Matsushita K, Yakushi T.
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem.

      巻: 86 号: 8 ページ: 1151-1159

    • DOI

      10.1093/bbb/zbac090

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Membrane-bound D-mannose isomerase of acetic acid bacteria: finding, characterization, and application.2022

    • 著者名/発表者名
      Osao Adachi, Naoya Kataoka, Kazunobu Matsushita, Yoshihiko Akakabe, Toshihiro Harada, Toshiharu Yakushi.
    • 雑誌名

      Bioscience. Biotechnology. Biochem.

      巻: 86 号: 7 ページ: 938-948

    • DOI

      10.1093/bbb/zbac049

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of 3 phylogenetically distinct membrane-bound D-gluconate dehydrogenases of Gluconobacter spp. and their biotechnological application for efficient 2-keto-D-gluconate production2022

    • 著者名/発表者名
      Kataoka Naoya、Saichana Natsaran、Matsutani Minenosuke、Toyama Hirohide、Matsushita Kazunobu、Yakushi Toshiharu
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 86 号: 5 ページ: 681-690

    • DOI

      10.1093/bbb/zbac024

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Mutations in degP and spoT Genes Mediate Response to Fermentation Stress in Thermally Adapted Strains of Acetic Acid Bacterium Komagataeibacter medellinensis NBRC 32882022

    • 著者名/発表者名
      Kataoka N., Matsutani M., Matsumoto N., Oda M., Mizumachi Y., Ito K., Tanaka S., and Kanesaki Y., Yakushi T., and Matsushita K.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 13 ページ: 802010-802010

    • DOI

      10.3389/fmicb.2022.802010

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dissection and Reconstitution Provide Insights into Electron Transport in the Membrane-Bound Aldehyde Dehydrogenase Complex of Gluconacetobacter diazotrophicus2022

    • 著者名/発表者名
      Miah Roni、Nina Shun、Murate Takeru、Kataoka Naoya、Matsutani Minenosuke、Ano Yoshitaka、Matsushita Kazunobu、Yakushi Toshiharu
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology

      巻: 204 号: 3 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1128/jb.00558-21

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Relocation of dehydroquinate dehydratase to the periplasmic space improves dehydroshikimate production with Gluconobacter oxydans strain NBRC32442021

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Kentaro、Nagaki Kakeru、Matsutani Minenosuke、Adachi Osao、Kataoka Naoya、Ano Yoshitaka、Theeragool Gunjana、Matsushita Kazunobu、Yakushi Toshiharu
    • 雑誌名

      Applied Microbiology and Biotechnology

      巻: 105 号: 14-15 ページ: 5883-5894

    • DOI

      10.1007/s00253-021-11476-8

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Major aldehyde dehydrogenase AldFGH of Gluconacetobacter diazotrophicus is independent of pyrroloquinoline quinone but dependent on molybdopterin for acetic acid fermentation2021

    • 著者名/発表者名
      Miah Roni、Nina Shun、Murate Takeru、Kataoka Naoya、Matsutani Minenosuke、Matsushita Kazunobu、Yakushi Toshiharu
    • 雑誌名

      Applied Microbiology and Biotechnology

      巻: 105 号: 6 ページ: 2341-2350

    • DOI

      10.1007/s00253-021-11144-x

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The Auxiliary NADH Dehydrogenase Plays a Crucial Role in Redox Homeostasis of Nicotinamide Cofactors in the Absence of the Periplasmic Oxidation System in Gluconobacter oxydans NBRC32932020

    • 著者名/発表者名
      Sriherfyna Feronika Heppy、Matsutani Minenosuke、Hirano Kensuke、Koike Hisashi、Kataoka Naoya、Yamashita Tetsuo、Nakamaru-Ogiso Eiko、Matsushita Kazunobu、Yakushi Toshiharu
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology

      巻: 87 号: 2 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1128/aem.02155-20

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 酢酸菌Gluconobacter thailandicus の2つの第二級アルコール脱水素酵素が関与する2,3-ブタンジオール代謝2023

    • 著者名/発表者名
      浅野連太朗,小東 陽,後藤 勝,平田花織,吉冨 宙,片岡 尚也,松下 一信,藥師 寿治
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] グルコノバクター属酢酸菌の細胞表層酸化系代謝の細胞増殖における役割2023

    • 著者名/発表者名
      吉冨 宙,平田花織,片岡 尚也,松下 一信,藥師 寿治
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Acetobacter pasteurianus の酢酸耐性因子AarCとそのパラログによる酢酸代謝2023

    • 著者名/発表者名
      村上 果穂,片岡 尚也,松下 一信,松谷 峰之介,藥師 寿治
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Komagataeibacter 属酢酸菌の遺伝子操作法の開発2022

    • 著者名/発表者名
      山下 璃貢,片岡 尚也,松谷 峰之介,Gunjana Theeragool,松下 一信,藥師 寿治
    • 学会等名
      日本農芸化学会中四国支部 第62回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 酢酸菌膜結合型アルデヒド脱水素酵素における鉄・硫黄クラスターの関与2022

    • 著者名/発表者名
      和泉 理緒,Roni Miah,片岡 尚也,松下 一信,藥師 寿治
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Acinetobacter baylyi 由来ペリプラズム型デヒドロシキミ酸脱水酵素の異種発現とプロトカテク酸生産への利用2022

    • 著者名/発表者名
      永木 翔、松谷 峰之介、片岡 尚也、松下 一信、藥師 寿治
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] キナ酸からプロトカテク酸を生産するための酢酸菌のペリプラズミック代謝工学2021

    • 著者名/発表者名
      永木翔,松谷峰之介,片岡尚也,松下一信,藥師寿治
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 酵素の細胞内局在を改変することによる酢酸菌のペリプラズミック酸化系の拡張2020

    • 著者名/発表者名
      中村謙太郎,永木翔,松谷峰之介,片岡尚也,松下一信,足立収生,藥師寿治
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 山口大学応用微生物学研究室

    • URL

      http://ds0n.cc.yamaguchi-u.ac.jp/~obi/index.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [備考] 山口大学中高温微生物研究センター

    • URL

      https://ds0n.cc.yamaguchi-u.ac.jp/~yurctmr/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書 2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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