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フィコビリソーム-四量体光化学系I超複合体の構造生物学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 20H02914
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分38030:応用生物化学関連
研究機関公益財団法人高輝度光科学研究センター (2022)
岡山大学 (2020-2021)

研究代表者

加藤 公児  公益財団法人高輝度光科学研究センター, 構造生物学推進室, テニュアトラック研究員 (30452428)

研究分担者 長尾 遼  静岡大学, 農学部, 准教授 (30633961)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
17,940千円 (直接経費: 13,800千円、間接経費: 4,140千円)
2022年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2021年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2020年度: 9,230千円 (直接経費: 7,100千円、間接経費: 2,130千円)
キーワード生体超分子複合体 / 光化学系タンパク質 / 構造生物学 / クライオ電子顕微鏡 / X線結晶構造解析
研究開始時の研究の概要

シアノバクテリアや植物のチラコイド膜上に存在する光化学系Ⅰ(PSI)は光エネルギーを化学エネルギーに変換する光合成反応の中心的な役割を担っている。本研究では、PSIと特異的に相互作用するアンテナタンパク質(PBS)と四量体PSIから構成される超複合体の構造と生育環境中の光条件に応答したエネルギー変換機構をX線結晶構造解析、クライオ電子顕微鏡単粒子解析、分光学的解析を駆使して解明する。本研究内容は光合成生物の環境適応と深く関わっており、環境条件に応答した超複合体形成機構の解明を通して適応進化の謎に迫ることができる。

研究成果の概要

シアノバクテリア、各種藻類そして植物が行う光合成は、太陽の光エネルギーを化学エネルギーに変換し、同時に酸素分子を発生させる。この光エネルギー変換は、主に光化学系I(PSI)と光化学系II(PSII)という2つの膜タンパク質複合体が担っており、光駆動型の電荷分離と一連の電子伝達反応を行う。
本研究では、PSIとアンテナタンパク質から構成される超複合体の構造と生育環境中の条件に応答したエネルギー変換機構をX線結晶構造解析、クライオ電子顕微鏡単粒子解析、その他の生化学的解析を使い明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

立体構造解析によって生物の多様性を明らかにした本研究の知見は生物が行う光合成のメカニズムの解明、そして効率化へとつながる。このような知見を人工光合成研究に取り入れることで、高効率光エネルギー伝達システムの構築が進展し、持続可能な社会の実現へ近づくことが期待できる。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 2件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (8件) (うち招待講演 5件) 備考 (6件)

  • [雑誌論文] Structure of a monomeric photosystem I core associated with iron-stress-induced-A proteins from Anabaena sp. PCC 71202023

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Kato Koji、Hamaguchi Tasuku、Ueno Yoshifumi、Tsuboshita Naoki、Shimizu Shota、Furutani Miyu、Ehira Shigeki、Nakajima Yoshiki、Kawakami Keisuke、Suzuki Takehiro、Dohmae Naoshi、Akimoto Seiji、Yonekura Koji、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 920-920

    • DOI

      10.1038/s41467-023-36504-1

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Biochemical and spectroscopic characterization of PSI-LHCI from the red alga Cyanidium caldarium2023

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Ueno Yoshifumi、Furutani Miyu、Kato Koji、Shen Jian-Ren、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: 1 号: 3 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1007/s11120-023-00999-y

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure of a tetrameric photosystem I from a glaucophyte alga Cyanophora paradoxa2022

    • 著者名/発表者名
      Kato Koji、Nagao Ryo、Ueno Yoshifumi、Yokono Makio、Suzuki Takehiro、Jiang Tian-Yi、Dohmae Naoshi、Akita Fusamichi、Akimoto Seiji、Miyazaki Naoyuki、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 1679-1679

    • DOI

      10.1038/s41467-022-29303-7

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural basis for different types of hetero-tetrameric light-harvesting complexes in a diatom PSII-FCPII supercomplex2022

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Kato Koji、Kumazawa Minoru、Ifuku Kentaro、Yokono Makio、Suzuki Takehiro、Dohmae Naoshi、Akita Fusamichi、Akimoto Seiji、Miyazaki Naoyuki、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 1764-1764

    • DOI

      10.1038/s41467-022-29294-5

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural basis for the absence of low-energy chlorophylls in a photosystem I trimer from Gloeobacter violaceus2022

    • 著者名/発表者名
      Kato Koji、Hamaguchi Tasuku、Nagao Ryo、Kawakami Keisuke、Ueno Yoshifumi、Suzuki Takehiro、Uchida Hiroko、Murakami Akio、Nakajima Yoshiki、Yokono Makio、Akimoto Seiji、Dohmae Naoshi、Yonekura Koji、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 11 ページ: 1-34

    • DOI

      10.7554/elife.73990

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Excitation-energy transfer in heterocysts isolated from the cyanobacterium Anabaena sp. PCC 7120 as studied by time-resolved fluorescence spectroscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Yokono Makio、Ueno Yoshifumi、Nakajima Yoshiki、Suzuki Takehiro、Kato Ka-Ho、Tsuboshita Naoki、Dohmae Naoshi、Shen Jian-Ren、Ehira Shigeki、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1863 号: 1 ページ: 148509-148509

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2021.148509

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] High-resolution cryo-EM structure of photosystem II reveals damage from high-dose electron beams2021

    • 著者名/発表者名
      Kato Koji、Miyazaki Naoyuki、Hamaguchi Tasuku、Nakajima Yoshiki、Akita Fusamichi、Yonekura Koji、Shen Jian-Ren
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 4 号: 1 ページ: 382-382

    • DOI

      10.1038/s42003-021-01919-3

    • NAID

      120006999357

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Molecular organizations and function of iron-stress-induced-A protein family in Anabaena sp. PCC 71202021

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Yokono Makio、Ueno Yoshifumi、Suzuki Takehiro、Kato Koji、Kato Ka-Ho、Tsuboshita Naoki、Jiang Tian-Yi、Dohmae Naoshi、Shen Jian-Ren、Ehira Shigeki、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1862 号: 1 ページ: 148327-148327

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2020.148327

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Basic pH-induced modification of excitation-energy dynamics in fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins isolated from a pinguiophyte, Glossomastix chrysoplasta2021

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Yokono Makio、Ueno Yoshifumi、Kato Ka-Ho、Tsuboshita Naoki、Shen Jian-Ren、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1862 号: 1 ページ: 148306-148306

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2020.148306

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhancement of excitation-energy quenching in fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins isolated from a diatom Phaeodactylum tricornutum upon excess-light illumination2021

    • 著者名/発表者名
      Nagao Ryo、Yokono Makio、Ueno Yoshifumi、Suzuki Takehiro、Kumazawa Minoru、Kato Ka-Ho、Tsuboshita Naoki、Dohmae Naoshi、Ifuku Kentaro、Shen Jian-Ren、Akimoto Seiji
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1862 号: 2 ページ: 148350-148350

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2020.148350

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] GraFix 法を用いた化学架橋による不安定なタンパク質複合体のクライオ電顕単粒子解析2022

    • 著者名/発表者名
      加藤 公児, 長尾 遼, 秋田 総理, 宮崎 直幸, 沈 建仁
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 鉄欠乏条件下で誘導されるフィコビリソームと光化学系Iの強固な結合2022

    • 著者名/発表者名
      清水 翔太、加藤 公児、鈴木 健裕、堂前 直、沈 建仁、長尾 遼
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 高分解能クライオ電顕マップを用いた補因子の同定2021

    • 著者名/発表者名
      加藤 公児, 長尾 遼, 沈 建仁, 秋田 総理, 宮崎 直幸
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 立体構造解析のイロハ ~光化学系膜タンパク質複合体を例に~2021

    • 著者名/発表者名
      加藤 公児
    • 学会等名
      第28回光合成セミナー2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 立体構造解析に向けたGloeobacter violaceus由来フィコビリソームの精製2021

    • 著者名/発表者名
      坪下直樹、加藤公児、沈建仁、長尾遼
    • 学会等名
      第28回光合成セミナー2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Anabaenaから調製されたPSI-PBS超複合体の特性解析2021

    • 著者名/発表者名
      清水翔太、加藤公児、沈建仁、長尾遼
    • 学会等名
      第28回光合成セミナー2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 機能構造研究に基づく光合成色素蛋白質の分子進化2021

    • 著者名/発表者名
      長尾遼
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光合成を支える葉緑体色素タンパク質複合体の機能・構造・進化2021

    • 著者名/発表者名
      長尾遼
    • 学会等名
      第23回植物オルガネラワークショップ
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 究代表者のwebページ

    • URL

      https://researchmap.jp/katokoji

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] プレスリリースのwebページ

    • URL

      https://www.okayama-u.ac.jp/tp/release/release_id1053.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 研究代表者のwebページ

    • URL

      https://researchmap.jp/katokoji

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [備考] プレスリリースのwebページ

    • URL

      https://www.okayama-u.ac.jp/tp/release/release_id952.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] プレスリリースのwebページ

    • URL

      https://www.okayama-u.ac.jp/tp/release/release_id950.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] プレスリリースのwebページ

    • URL

      https://www.okayama-u.ac.jp/tp/release/release_id948.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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