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トウガラシの種間雑種不和合性を司るエピスタシス遺伝子と打破遺伝子の特定

研究課題

研究課題/領域番号 20H02981
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分39030:園芸科学関連
研究機関近畿大学

研究代表者

細川 宗孝  近畿大学, 農学部, 教授 (40301246)

研究分担者 白澤 健太  公益財団法人かずさDNA研究所, 先端研究開発部, 室長 (60527026)
安井 康夫  京都大学, 農学研究科, 助教 (70293917)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2023年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2022年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2021年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2020年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円)
キーワードエピスタシス / 種間雑種 / 座止 / トウガラシ / 交雑不和合性 / 自己免疫 / 生殖隔離 / Capsicum / 種間交雑 / Capsicum annuum / Capsicum chinense / タカノツメ / Bionano / 連鎖地図 / リファレンス / 交雑不和合性遺伝子 / 細胞質 / 雑種不破合性 / 打破遺伝子
研究開始時の研究の概要

1. C. annuumの細胞質を持つ場合には、BDMモデルに従い第7および第10染色体に座乗する2遺伝子座の遺伝子型で交雑和合性が決まる。
2. C. chinenseの細胞質を持つ場合には、核の遺伝子型によらず座止(縮葉形質)となる。
3. C. annuum‘カリフォルニア・ワンダー’の遺伝子は核型や細胞質型によらず座止を抑制する。
Capsicum属の交雑和合性・不和合性を明らかにするために、以上の3点に関わる遺伝子を特定する必要がある。

研究成果の概要

トウガラシ(Capsicum)では5つの栽培種が存在する. 本研究では種間交雑での座止を引き起こす原因を明らかにすることを目的とし,原因遺伝子の探索を行った. 交雑分離集団を用いてQTL-seqを行った結果, 座止は2つの優性補足遺伝子によって発現するエピスタシス現象であることが分かった. これら2つの遺伝子をそれぞれA(a)遺伝子, B(b)遺伝子とし, それぞれは第7染色体, 第10染色体に座乗することが分かった. またB(b)遺伝子の候補領域を約266 Kbpに絞ることができ, 自己免疫に関わる特定の遺伝子がB(b)遺伝子の候補遺伝子として考えられた.

研究成果の学術的意義や社会的意義

トウガラシの種間交雑は長年、研究されてきたがその原因は不明のままであった。現象から自己免疫反応が関わっていることは予想されていたが、どのようなエピスタシス経路があるのかは興味の対象となっている。我々は独自の交雑分離集団を用いて、ほぼ一つの遺伝子座を特定することができた。この研究は、植物の生殖隔離の進化などの学術的な研究に発展しうる。園芸学的には、Capicumの種間雑種によるHybrid vigorの獲得や、香りや光合成の性質を改変した新たな品種育成などの応用研究につながると考えている。

報告書

(5件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2022 2021 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Chromosome-scale genome assembly of a Japanese chili pepper landrace, <i>Capsicum annuum</i> ‘Takanotsume’2022

    • 著者名/発表者名
      Shirasawa Kenta、Hosokawa Munetaka、Yasui Yasuo、Toyoda Atsushi、Isobe Sachiko
    • 雑誌名

      DNA Research

      巻: 30 号: 1

    • DOI

      10.1093/dnares/dsac052

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] トウガラシのRNA分解活性を制御するRNase MC-like遺伝子の同定2024

    • 著者名/発表者名
      山崎 彬・白澤健太・山田寛子・細川宗孝
    • 学会等名
      園芸学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Capsicum 種間交雑で生育異常を引き起こす C. annuum 側の候補遺伝子の特定2024

    • 著者名/発表者名
      岸麻理奈・白澤健太・倉田大地・山崎彬・細川宗孝
    • 学会等名
      園芸学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] トウガラシの高温下での花粉発芽率に関連する第3染色体と第6染色体上の2遺伝子座の相互作用2021

    • 著者名/発表者名
      山崎彬・細川宗孝・白澤健太・中野龍平・中﨑鉄也
    • 学会等名
      園芸学会近
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] シシトウの低辛味形質の遺伝2021

    • 著者名/発表者名
      村上賢治・田渕翔大・栃折真澄・細川宗孝
    • 学会等名
      園芸学会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 日本を代表するトウガラシ「鷹の爪」の全ゲノムを解読~多様なトウガラシを生み出すための基盤に~

    • URL

      https://www.kindai.ac.jp/news-pr/news-release/2023/01/037703.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 日本を代表するトウガラシ「鷹の爪」の全ゲノムを解読~多様なトウガラシを生み出すための基盤に~

    • URL

      https://www.kazusa.or.jp/news/pr20230111/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 日本を代表するトウガラシ「鷹の爪」の全ゲノムを解読~多様なトウガラシを生み出すための基盤に~

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2023-01-12-2

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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