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動物の生体における組織特異的mRNAプロセシングの進行過程の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20H03181
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43010:分子生物学関連
研究機関琉球大学

研究代表者

黒柳 秀人  琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30323702)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2022年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2021年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2020年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
キーワード遺伝子発現制御 / 新生RNA / 線虫 / スプライシング / 転写後プロセシング / 塩基修飾 / 代謝標識 / 長鎖シーケンシング解析 / RNAプロセシング / mRNA前駆体 / 遺伝子発現 / 組織特異性
研究開始時の研究の概要

真核生物のmRNA前駆体の選択的プロセシングはタンパク質の多様性を創出する重要な遺伝子発現機構であり、多細胞生物の多くの遺伝子で組織特異的な制御が見られる。本研究では、線虫の生体で組織特異的にRNAを濃縮する手法を開発し、組織特異的選択的プロセシングの概要を明らかにする。さらに、組織特異的制御因子の変異体を用いて同様の解析を行い、選択的mRNAプロセシングの制御機構を体系的に理解することを目指す。

研究成果の概要

線虫をモデル多細胞生物として、個体レベルでの転写途中の新生mRNA前駆体を代謝標識し精製する方法、および生体内新生mRNA前駆体の標識・精製する方法を確立した。そして、mRNA前駆体の品質管理機構を欠損する線虫変異体株から得られた新生mRNA前駆体の長鎖シーケンシング解析により、mRNA前駆体の選択的プロセシング機構と共役する品質管理機構に依存して遺伝子発現制御が行われる遺伝子をゲノムワイドに明らかにした。また、それらの遺伝子のうち、mRNA前駆体のスプライス部位の塩基修飾による選択的スプライシングの制御で遺伝子発現がされる例を全生物を通じて初めて明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

mRNA前駆体のプロセシング動態および品質管理機構と共役する遺伝子発現制御が多細胞生物の個体レベルで明らかになるのは初めてである。哺乳類では個体レベルで同様の方法を適用しても同様の結果を得ることは実質的に困難である。また、転写後の塩基修飾が直接的にスプライシングに影響を与える例を始めて見出したものである。本研究成果は、哺乳類を含む他の多細胞動物における転写と共役したmRNAの転写後プロセシングによる遺伝子発現制御機構を考察する上で基礎となる重要な知見を与えるものである。

報告書

(4件)
  • 2023 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件) 図書 (1件) 備考 (3件)

  • [国際共同研究] University of Pittsburgh Sch Medicine(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Oslo(ノルウェー)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Structure of the<i>Caenorhabditis elegans</i>m6A methyltransferase METT10 that regulates SAM homeostasis2023

    • 著者名/発表者名
      Ju Jue、Aoyama Tomohiko、Yashiro Yuka、Yamashita Seisuke、Kuroyanagi Hidehito、Tomita Kozo
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 51 号: 5 ページ: 2434-2446

    • DOI

      10.1093/nar/gkad081

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Simultaneous measurement of nascent transcriptome and translatome using 4-thiouridine metabolic RNA labeling and translating ribosome affinity purification2023

    • 著者名/発表者名
      Imai Hirotatsu、Utsumi Daisuke、Torihara Hidetsugu、Takahashi Kenzo、Kuroyanagi Hidehito、Yamashita Akio
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 51 号: 14 ページ: e76-e76

    • DOI

      10.1093/nar/gkad545

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Alternative splicing of a single exon causes a major impact on the affinity of Caenorhabditis elegans tropomyosin isoforms for actin filaments2023

    • 著者名/発表者名
      Ono Shoichiro、Watabe Eichi、Morisaki Keita、Ono Kanako、Kuroyanagi Hidehito
    • 雑誌名

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      巻: 11 ページ: 1208913-1208913

    • DOI

      10.3389/fcell.2023.1208913

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] ナンセンスコドン介在的mRNA分解(NMD)と共役した選択的スプライシングによる遺伝子発現の制御2022

    • 著者名/発表者名
      Hidehito Kuroyanagi
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 94 号: 6 ページ: 868-874

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2022.940868

    • ISSN
      0037-1017
    • 年月日
      2022-12-25
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] m <sup>6</sup> A‐mediated alternative splicing coupled with nonsense‐mediated mRNA decay regulates SAM synthetase homeostasis2021

    • 著者名/発表者名
      Watabe Eichi、Togo‐Ohno Marina、Ishigami Yuma、Wani Shotaro、Hirota Keiko、Kimura‐Asami Mariko、Hasan Sharmin、Takei Satomi、Fukamizu Akiyoshi、Suzuki Yutaka、Suzuki Tsutomu、Kuroyanagi Hidehito
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: 40 号: 14

    • DOI

      10.15252/embj.2020106434

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Loss of <i>Caenorhabditis elegans</i> homologue of human MOB4 compromises life span, health life span and thermotolerance2021

    • 著者名/発表者名
      Jahan Momotaj、Iwasa Hiroaki、Kuroyanagi Hidehito、Hata Yutaka
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 26 号: 10 ページ: 798-806

    • DOI

      10.1111/gtc.12891

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Alternative splicing through m6A modification at a 3' splice site for SAM synthetase homeostasis2021

    • 著者名/発表者名
      Eichi Watabe, Marina Togo-Ohno, Yuma Ishigami, Keiko Hirota, Akiyoshi Fukamizu, Yutaka Suzuki, Tsutomu Suzuki and Hidehito Kuroyanagi
    • 学会等名
      26th Annual Meeting of the RNA Society
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Alternative splicing through m6A modification at a 3’ splice site for SAM synthetase homeostasis2021

    • 著者名/発表者名
      Eichi Watabe, Marina Togo-Ohno, Yuma Ishigami, Keiko Hirota, Akiyoshi Fukamizu, Yutaka Suzuki, Tsutomu Suzuki and Hidehito Kuroyanagi
    • 学会等名
      23rd International C. elegans Conference
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [図書] 遺伝学の百科事典2022

    • 著者名/発表者名
      日本遺伝学会 黒柳秀人(分担執筆)
    • 総ページ数
      690
    • 出版者
      丸善出版
    • ISBN
      9784621306604
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実績報告書
  • [備考] 琉球大学大学院医学研究科生化学講座

    • URL

      https://biochem.med.u-ryukyu.ac.jp/research/detail/120

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 東京医科歯科大学プレスリリース

    • URL

      https://www.tmd.ac.jp/files/topics/55271_ext_04_2.pdf

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 琉球大学大学院医学研究科生化学講座

    • URL

      http://biochem.med.u-ryukyu.ac.jp/news/detail/975

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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