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高次クロマチン構造の確立と維持を制御する分子機構

研究課題

研究課題/領域番号 20H03189
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43010:分子生物学関連
研究機関基礎生物学研究所

研究代表者

中山 潤一  基礎生物学研究所, クロマチン制御研究部門, 教授 (60373338)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
17,680千円 (直接経費: 13,600千円、間接経費: 4,080千円)
2022年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2021年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2020年度: 6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円)
キーワード遺伝子 / 発現制御 / ヘテロクロマチン / 分裂酵母 / ヒストン修飾
研究開始時の研究の概要

ヘテロクロマチンは染色体の機能や遺伝子の発現調節に重要な役割を果たしている。ヒストンH3のメチル化修飾は、ヘテロクロマチンの重要なマークとして働き、進化的に保存されたSUV39H/Clr4メチル化酵素によって触媒される。分裂酵母のClr4はRik1やCul4などとともにCLRC複合体を形成しているが、その機能には不明な点が多い。本研究ではCLRCの機能解析を進め、ヘテロクロマチン構造形成の分子機構の解明を目指している。

研究成果の概要

本研究では、分裂酵母のヘテロクロマチン形成に重要なヒストンH3K9メチル化酵素Clr4と、Clr4を含むCLRC複合体に着目し、それらの活性や機能がどのように制御されているか検討を行った。その結果、Clr4はC末端のSETドメインを含む領域を介して、CLRC複合体の構成因子の一つと直接相互作用することを明らかにした。また、Clr4のメチル化活性が、自身のN末端領域とC末端領域の分子内相互作用によって、自己制御されていることを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

真核細胞の染色体に存在するヘテロクロマチンは、染色体の機能やゲノム恒常性の維持、エピジェネティックな遺伝子発現制御に重要な役割を果たしている。ヒストンのメチル化修飾はヘテロクロマチンの重要なマークであり、そのメチル化修飾の制御機構を明らかにする本研究は、高次生命現象を理解する上で重要な課題である。本研究は、ヒストンのメチル化酵素Clr4の制御機構の一端を明らかにした画期的な成果であり、進化的に保存されたヒストンメチル化酵素の活性制御の分子機構の理解にもつながる成果である。

報告書

(4件)
  • 2023 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 3件、 招待講演 2件)

  • [国際共同研究] University of Toronto(カナダ)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Tianjin Medical University(中国)

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [雑誌論文] Regulation of the SUV39H Family Methyltransferases: Insights from Fission Yeast2023

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Rinko、Nakayama Jun-ichi
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 13 号: 4 ページ: 593-593

    • DOI

      10.3390/biom13040593

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Multiple interfaces to recognize nucleosomal targets2021

    • 著者名/発表者名
      Rinko Nakamura, Jun-ichi Nakayama
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 171 号: 3 ページ: 257-259

    • DOI

      10.1093/jb/mvab139

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proteomics-Based Systematic Identification of Nuclear Proteins Anchored to Chromatin via RNA2020

    • 著者名/発表者名
      Kyoko Hiragami-Hamada, Naoki Tani, Jun-Ichi Nakayama
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2161 ページ: 89-99

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-0680-3_8

    • ISBN
      9781071606797, 9781071606803
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for histone variant H3tK27me3 recognition by PHF1 and PHF192020

    • 著者名/発表者名
      Cheng Dong, Reiko Nakagawa, Kyohei Oyama, Yusuke Yamamoto, Weilian Zhang, Aiping Dong, Yanjun Li, Yuriko Yoshimura, Hiroyuki Kamiya, Jun-Ichi Nakayama, Jun Ueda, Jinrong Min
    • 雑誌名

      Elife

      巻: 9

    • DOI

      10.7554/elife.58675

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Mechanisms regulating Clr4/SUV39H histone methyltransferase activity2022

    • 著者名/発表者名
      Rinko Nakamura, Yuriko Yoshimura, Reiko Nakagawa, Jun-ichi Nakayama
    • 学会等名
      Japan-UK Regulation through Chromatin Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Histone modifications and higher-order chromatin assembly2022

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Nakayama
    • 学会等名
      NIBB-COS Workshop in Heidelberg
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ヒストンメチル化酵素Clr4の活性制御機構の解析2022

    • 著者名/発表者名
      中村凜子、吉村ゆり子、中川れい子、中山潤一
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンメチル化酵素Clr4の活性制御機構の解析2022

    • 著者名/発表者名
      中村凜子、吉村ゆり子、中川れい子、中山潤一
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会 (MBSJ2022)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Mechanisms regulating Clr4 histone methyltransferase activity2022

    • 著者名/発表者名
      Rinko Nakamura, Yuriko Yoshimura, Reiko Nakagawa, Jun-ichi Nakayama
    • 学会等名
      The 30th Hot Spring Harbor International Symposium, Chromatin Potential in Development and Differentiation & The 6th Symposium of the Inter-University Research Network for Trans-Omics Medicine
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 分裂酵母のヒストンメチル化酵素Clr4の活性制御機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      中村凜子、吉村 ゆり子、中山 潤一
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第54回研究報告会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンメチル化酵素Clr4の活性制御機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      中村凜子、吉村ゆり子、中川れい子、中山潤一
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ヒストンメチル化酵素 Clr4 の活性制御機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      中村 凜子、吉村 ゆり子、中川 れい子、中山 潤一
    • 学会等名
      第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 分裂酵母ヒストンメチル化酵素複合体CLRCの機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      蜂須賀亜紀、沖昌也、中山潤一
    • 学会等名
      第14回 日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 分裂酵母ヒストンメチル化酵素複合体CLRCの機能解析2020

    • 著者名/発表者名
      蜂須賀亜紀、沖昌也、中山潤一
    • 学会等名
      第53回 酵母遺伝学フォーラム
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 分裂酵母ヒストンメチル化酵素複合体CLRCの機能解析2020

    • 著者名/発表者名
      蜂須賀亜紀、沖昌也、中山潤一
    • 学会等名
      日本分子生物学会 第43回年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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