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鉄硫黄クラスター生合成マシナリーの反応過程における過渡的な中間状態の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20H03204
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分43030:機能生物化学関連
研究機関埼玉大学

研究代表者

高橋 康弘  埼玉大学, 理工学研究科, 名誉教授 (10154874)

研究分担者 藤城 貴史  埼玉大学, 理工学研究科, 准教授 (20740450)
和田 啓  宮崎大学, 医学部, 教授 (80379304)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
18,070千円 (直接経費: 13,900千円、間接経費: 4,170千円)
2023年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2022年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2021年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2020年度: 9,750千円 (直接経費: 7,500千円、間接経費: 2,250千円)
キーワード鉄硫黄クラスター / 鉄硫黄タンパク質 / 生合成 / マシナリー
研究開始時の研究の概要

鉄硫黄(Fe-S)タンパク質は、コファクターとして [2Fe-2S]、[4Fe-4S] などのFe-Sクラスターを持つタンパク質の総称であり、エネルギー代謝から、遺伝子発現の制御にいたるまで、生命活動の根幹を担っている。本研究では、2種類のFe-Sクラスター生合成系、ISCとSUFマシナリーが、それぞれどのようにしてFe-Sクラスターを組み立てるのかという、生合成反応の核心部分を明らかにすることを目的とする。さまざまな解析手法を結集して、“Fe-Sクラスターの中間体”ならびに“構造変換”を捉え、“過渡的な中間状態”の解明に挑む。

研究成果の概要

本研究では、鉄硫黄(Fe-S)クラスターの多様な生合成系について構造と機能の解析を進め、以下の要点を明らかにした。(1)クラスターの硫黄を供給するシステイン脱硫酵素の反応機構・阻害機構を明らかにした。(2)ISCマシナリーの中核成分IscUについて、Fe-Sクラスターの不安定な生合成中間体を保持した状態の構造を捉え、またHscA-HscBによってもたらされるコンフォメーション変化の意義を明らかにした。(3)SUFマシナリーのプロトタイプとして、偏性嫌気性のアーキアやバクテリアに分布するSufB*2C2型を同定し、そのユニークな特性から生合成系の進化的変遷の道筋や要因を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、Fe-Sクラスター生合成システムの作動機構と多様性について、鍵となるいくつかのポイントを世界に先駆けて明らかにすることができた。独自に研究の方向性を見定めて、オリジナルのin vivo実験系とin vitroの生化学的ならびに構造解析を有機的に関連させつつ発展させた成果である。これらはFe-Sクラスター生合成の本質に迫る重要な知見であり、学術的な意義は極めて大きい。

報告書

(5件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (17件) (うち国際学会 2件、 招待講演 4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] The minimal SUF system can substitute for the canonical iron-sulfur cluster biosynthesis systems by using inorganic sulfide as the sulfur source.2024

    • 著者名/発表者名
      Maya Murata, Taichi Murakami, Eiki Yuda, Nanami Mukai, Xintong Zheng, Natsumi Kurachi, Sachiko Mori, Shoko Ogawa, Kouhei Kunichika, Takashi Fujishiro, Kei Wada, and Yasuhiro Takahashi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2024.03.20.586028

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cycloserine enantiomers inhibit PLP‐dependent cysteine desulfurase SufS via distinct mechanisms2022

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Ryosuke、Ogawa Shoko、Takahashi Yasuhiro、Fujishiro Takashi
    • 雑誌名

      The FEBS Journal

      巻: 289 号: 19 ページ: 5947-5970

    • DOI

      10.1111/febs.16455

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of cell death in <i>Bacillus subtilis</i> caused by sesquiterpenes from <i>Chrysopogon</i> <i>zizanioides</i> (L.) Roberty<i> </i>2022

    • 著者名/発表者名
      Shinjyo Y, Midorikawa N, Matsumoto T, Sugaya Y, Ozawa Y, Oana A, Horie C, Yoshikawa H, Takahashi Y, Hasegawa T, Asai K.
    • 雑誌名

      The Journal of General and Applied Microbiology

      巻: 68 号: 2 ページ: 62-70

    • DOI

      10.2323/jgam.2021.09.005

    • ISSN
      0022-1260, 1349-8037
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural diversity of cysteine desulfurases involved in iron-sulfur cluster biosynthesis2022

    • 著者名/発表者名
      Fujishiro Takashi、Nakamura Ryosuke、Kunichika Kouhei、Takahashi Yasuhiro
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 19 号: 0 ページ: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v19.0001

    • NAID

      130008162738

    • ISSN
      2189-4779
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Structure of the Dimeric State of IscU Harboring Two Adjacent [2Fe-2S] Clusters Provides Mechanistic Insights into Cluster Conversion to [4Fe-4S]2021

    • 著者名/発表者名
      Kunichika Kouhei、Nakamura Ryosuke、Fujishiro Takashi、Takahashi Yasuhiro
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 60 号: 20 ページ: 1569-1572

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.1c00112

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evidence for dynamic in vivo interconversion of the conformational states of IscU during iron?sulfur cluster biosynthesis2020

    • 著者名/発表者名
      Sato Sakiko、Matsushima Yumeka、Kanazawa Miaki、Tanaka Naoyuki、Fujishiro Takashi、Kunichika Kouhei、Nakamura Ryosuke、Tomioka Hiroaki、Wada Kei、Takahashi Yasuhiro
    • 雑誌名

      Molecular Microbiology

      巻: 115 号: 4 ページ: 807-818

    • DOI

      10.1111/mmi.14646

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Snapshots of PLP‐substrate and PLP‐product external aldimines as intermediates in two types of cysteine desulfurase enzymes2019

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Ryosuke、Hikita Masahide、Ogawa Shoko、Takahashi Yasuhiro、Fujishiro Takashi
    • 雑誌名

      The FEBS Journal

      巻: 287 号: 6 ページ: 1138-1154

    • DOI

      10.1111/febs.15081

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 創薬基盤の確立を見据えた鉄硫黄クラスター生合成に関わるコア複合体の構造・機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      和田啓
    • 学会等名
      第7回黒潮カンファレンス
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 鉄-硫黄クラスター蛋白質の生合成複合体のクライオ電顕単粒子解析2023

    • 著者名/発表者名
      辻実怜、横山武司、和田啓、田中良和
    • 学会等名
      マルチファセットプロテインズ若手ワークショップ
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] [4Fe-4S]フェレドキシンの高精度結晶構造解析と理論計算に基づいた機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      和田啓、三島正規、永江峰幸、杉島正一、綛田紀子、元山祐美子、北河康隆、海野昌喜
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Structural insights into biosynthesis of a [4Fe-4S] cluster via coupling of two adjacent [2Fe-2S] clusters in the IscU enzyme.2022

    • 著者名/発表者名
      Kouhei Kunichika, Ryosuke Nakamura, Takashi Fujishiro, Yasuhiro Takahashi
    • 学会等名
      錯体化学会第72回討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成に関わるSUF、SUF-like、ISC系の硫黄供給システムの酸化ストレス耐性の比較2022

    • 著者名/発表者名
      槇 千智、室賀 直来、寺畑 拓也、島田 侑希乃、國近 航平、中村 亮裕、藤城 貴史、高橋 康弘
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] メタン生成古細菌のSufB2C2複合体は鉄硫黄クラスター生合成系SUFマシナリーのプロトタイプである2022

    • 著者名/発表者名
      村上 太一、村田 真耶、藤城 貴史、高橋 康弘
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 2つの異なるタイプのシステインデスルフラーゼと基質類似分子との反応2022

    • 著者名/発表者名
      大塚 穂乃、中村 亮裕、小川 翔子、藤城 貴史、高橋 康弘
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Structural and functional analyses of E. coli SufBCD complex involved in iron-sulfur clusters biogenesis.2022

    • 著者名/発表者名
      Kei Wada, Yoshikazu Tanaka, Yasuhiro Takahashi
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成を担う SUFマシナリーの構造機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      和田啓、田中良和、高橋康弘
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Molecular mechanism of the SUF system involved in the iron-sulfur cluster biogenesis.2022

    • 著者名/発表者名
      Kei Wada1, Yoshikazu Tanaka, Yasuhiro Takahashi
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry (AsBIC10)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural basis for biosynthesis of a [4Fe-4S] cluster from two [2Fe-2S] clusters on the IscU enzyme in ISC machinery2022

    • 著者名/発表者名
      Kouhei Kunichika, Ryosuke Nakamura, Takashi Fujishiro, Yasuhiro Takahashi
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry (AsBIC10)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] PLP 依存型酵素システインデスルフラーゼ SufS に対する抗生物質シクロセリンの鏡像異性体間で異なる阻害反応機構2021

    • 著者名/発表者名
      中村亮裕、小川翔子、小松茉里佳、藤城貴史、高橋康弘
    • 学会等名
      第47回生体分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成足場タンパク質 IscU における [2Fe-2S] から [4Fe-4S] へのクラスター変換の構造基盤2021

    • 著者名/発表者名
      國近航平、中村亮裕、藤城貴史、高橋康弘
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成に関与する SufEおよび SufUの硫黄輸送状態の比較2021

    • 著者名/発表者名
      槇千智, 室賀直来, 寺畑拓也, 島田侑希乃, 國近航平, 中村亮祐, 藤城貴史, 高橋康弘
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌における鉄硫黄クラスター生合成系の補助的因子群の解析2020

    • 著者名/発表者名
      相羽花菜、野上和希、飴野佑美子、藤城貴史、高橋康弘
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成足場タンパク質 IscUの[2Fe-2S]クラスター集積型二量体構造とその意義2020

    • 著者名/発表者名
      國近航平、藤城貴史、高橋康弘
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成マシナリーのシステイン脱硫酵素のシクロセリンによる阻害機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      小川翔子、中村亮裕、小松茉里佳、引田理英、藤城貴史、高橋康弘
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 分子統御研究室ホームページ

    • URL

      http://park.saitama-u.ac.jp/~tougyo/Home.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書 2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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