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水素原子位置の観測による創薬標的タンパク質の量子論型基盤構築

研究課題

研究課題/領域番号 20H03377
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 小区分47020:薬系分析および物理化学関連
研究機関国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構

研究代表者

安達 基泰  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, 上席研究員 (60293958)

研究分担者 岡島 俊英  大阪大学, 産業科学研究所, 准教授 (10247968)
高橋 知里  同志社女子大学, 薬学部, 助教 (70833680)
老川 典夫  関西大学, 化学生命工学部, 教授 (80233005)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
17,680千円 (直接経費: 13,600千円、間接経費: 4,080千円)
2022年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2021年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2020年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円)
キーワード酵素 / 補酵素 / 結晶構造解析 / 中性子 / neutron / crystal / protein / hydrogen / drug
研究開始時の研究の概要

タンパク質の最大の特徴の一つは、非常に多くの原子が規則正しく整列し、ユニークな反応場を形成することである。申請者らは、近年、水素原子の原子核位置を決定できる中性子結晶構造解析を行うなかで、通常観測される位置とは異なった位置に水素原子を観測してきている。そのことは、タンパク質がその機能発揮に有利となる特殊な環境を局所的に作り出していることを示唆している。本研究では、創薬標的タンパク質の中でも補酵素をもったタンパク質を研究対象として展開し、中性子結晶構造解析と変異体解析によって、特殊な環境に置かれた水素原子の位置と機能を究明する。

研究成果の概要

本研究では、医薬品設計に関わる5つの酵素(ヒトジヒドロ葉酸還元酵素、ヒトモノアミン酸化酵素、ヒトシトクロムP450 2D6、アミノ酸ラセマーゼ、ヒトDOPA脱炭酸酵素)を対象とし、将来的には中性子結晶構造解析により水素原子を含む高精度な立体構造情報を得ることを目指して、タンパク質試料と結晶の作製に注力した。ヒトジヒドロ葉酸還元酵素については、標的である葉酸とNADPとの3者複合体のX線結晶構造解析に成功した。ヒトシトクロムP450 2D6については、抗うつ薬として用いられるパロキセチンとの相互作用を解析することに成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

近年、水素原子の原子核位置を決定できる中性子結晶構造解析によって、通常観測される位置とは異なった位置に水素原子を観測してきている。そのことは、タンパク質がその機能発揮に有利となる特殊な環境を局所的に作り出していることを示唆している。本研究では、創薬標的タンパク質の中でも補酵素をもったタンパク質を研究対象として展開した。研究の基礎となる試料調製での成果が中心であったが、将来、中性子結晶構造解析の実現によって、量子化学計算での技術開発に貢献し、補酵素の光物理過程の量子ダイナミクス解析の土台となり、タンパク質機能およびタンパク質と薬剤との分子間相互作用の理解を深化する量子論型研究につながる。

報告書

(4件)
  • 2023 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 2件、 招待講演 3件)

  • [国際共同研究] ミュンヘン工科大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] タンパク質の分子論的研究はいずこへ2022

    • 著者名/発表者名
      安達 基泰
    • 雑誌名

      Isotope News

      巻: 779 ページ: 7-10

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Neutron diffraction experiments of green fluorescent protein2021

    • 著者名/発表者名
      Shibazaki Chie, Shimizu Rumi, Kagotani Yuji, Andreas Ostermann, Tobias E. Schrader, Adachi Motoyasu
    • 雑誌名

      Annual Reports / MLZ - Heinz Maier-Leibnitz Zentrum

      巻: 2020 ページ: 52-52

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 水のアクセスと蛋白質ーリガンド解離の関係について2021

    • 著者名/発表者名
      米谷 佳晃, 安達 基泰
    • 雑誌名

      分子シミュレーション学会会誌

      巻: 23 ページ: 182-187

    • NAID

      40022664215

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] 光捕集タンパク質の 2 次元電子分光2020

    • 著者名/発表者名
      篭谷勇児 、安達基泰
    • 雑誌名

      OPTRONICS

      巻: 39(464) ページ: 84-88

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 等温滴定型カロリメトリーを用いた薬物代謝酵素P450と薬物との相互作用測定法の構築2023

    • 著者名/発表者名
      井川 佑美 , 若松 三友紀 , 高橋 知里 , 安達 基泰 , 前川 京子
    • 学会等名
      日本薬学会第143回年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 乳酸菌Weissella viridescens JCM1174の新規2ドメイン型アミノ酸ラセマーゼの大腸菌での発現系の構築と酵素科学的特性の解明2023

    • 著者名/発表者名
      大島 尚哉 , 安達 基泰 , 加藤 志郎 , 老川 典夫
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Recent Activity of D-lab in MLF, J-PARC2021

    • 著者名/発表者名
      Adachi Motoyasu
    • 学会等名
      DEUNET Virtual Meeting
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] タンパク質の中性子結晶構造解析と重水素2021

    • 著者名/発表者名
      安達 基泰
    • 学会等名
      重水素化学研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 乳酸菌Weissella viridescens JCM1174の新規2ドメイン型アミノ酸ラセマーゼの発見と基礎的性質2021

    • 著者名/発表者名
      大島 尚哉、安達 基泰、加藤 志郎、山中 一也、老川 典夫
    • 学会等名
      第16回D-アミノ酸学会学術講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Recent Activity of D-lab in MLF, J-PARC2020

    • 著者名/発表者名
      Motoyasu Adachi
    • 学会等名
      DEUNET Virtual meeting
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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