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細胞構造構成分子の分子交換計測と数理解析に基づくメカノトランスダクション機能解明

研究課題

研究課題/領域番号 20J10828
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
審査区分 小区分90110:生体医工学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

齋藤 匠  大阪大学, 基礎工学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2020-04-24 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2020年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードバイオメカニクス / メカのバイオロジー / FRAP / 拡散 / 細胞内流動 / 細胞内変形 / ストレスファイバー / メカノバイオロジー / 化学反応
研究開始時の研究の概要

細胞内構造物であるストレスファイバー(アクチンを主成分として細胞内で張力を支持)の力学・生化学情報変換機構の解明を目指し、以下の2点に焦点を当てて研究を行う。1.ストレスファイバーが細胞内で張力を支えつつ、細胞外力に感知・応答する機構の解明。2.力学依存的な分子交換計測(分子交換は細胞の恒常性を保つために重要であり、恒常性の欠落は炎症など病気・疾患に関与する)。これらの統合的な研究により、細胞の力学的適応のメカニズムの一端を明らかにする。

研究実績の概要

研究課題「細胞構造構成分子の分子交換計測と数理解析に基づくメカノトランスダクション機能解明」のために,制細胞内の分子交換計測手法を開発した。我々はまず、分子交換を3つのフェーズに分類した:1. 生化学反応と分子拡散の両方が支配的な場合(分子交換の時定数は数秒)、2. 生化学反応と細胞内流動が支配的な場合(時定数は数分を超える)、そして3. 生化学反応と細胞内流動に加え分子高次構造物が変形する場合(2と同様に時定数は数分を超える)。採用初年度には特に1に関する研究で進展があった。具体的には、従来のFRAP計測(代表的な分子交換計測手法)に反応拡散を考慮する数理および遺伝子工学実験を組み合わせ、細胞内分子の反応ドメインごとの化学平衡定数と拡散係数を分離する計測基盤を開発した。採用2年目には、上述した2および3に関する研究で進展があった。これまでの長時間FRAP計測では、取得したデータに含まれる化学反応(生化学情報)や細胞内の流動性や変形といった力学情報を複合的に解釈するモデルがなかった。そのため、ほとんどは比較的短時間の時間に対する輝度データのみを用いて、生化学情報のみを決定していた。また、代替的に、二つ以上の指数関数から成るモデルを用いて、それら指数関数の時定数を決定する手法もあった。それらに対して、我々は新たに、反応―移流方程式に基づくモデルをたて、その解析解をFRAP計測で得られた輝度の時間と空間のデータ(時空間輝度分布)にフィッティングすることで、生化学反応と移流速度を同時に計測する手法を提案した。さらに、連続体力学をFRAPに応用し、移流に加えて変形をとらえるモデルも開発した。これらの研究は細胞内の力学依存的な生化学反応(すなわち分子交換)を理解するための計測基盤を構築するものであり、工学だけでなく、細胞生物学・生化学・細胞力学等の分野に貢献したといえる。

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] What factors determine the number of nonmuscle myosin II in the sarcomeric unit of stress fibers?2021

    • 著者名/発表者名
      Saito, T., Huang, W., Matsui, T.S., Kuragano, M., Takahashi, M., Deguchi, S.
    • 雑誌名

      Biomechanics and Modeling in Mechanobiology

      巻: 20 号: 1 ページ: 155-166

    • DOI

      10.1007/s10237-020-01375-8

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Determining the domain-level reaction-diffusion properties of an actin-binding protein transgelin-2 within cells2021

    • 著者名/発表者名
      Saito Takumi、Matsunaga Daiki、Matsui Tsubasa S.、Noi Kentaro、Deguchi Shinji
    • 雑誌名

      Experimental Cell Research

      巻: 404 号: 1 ページ: 112619-112619

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2021.112619

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mechanosensitive myosin II but not cofilin primarily contributes to cyclic cell stretch-induced selective disassembly of actin stress fibers2021

    • 著者名/発表者名
      Huang Wenjing、Matsui Tsubasa S.、Saito Takumi、Kuragano Masahiro、Takahashi Masayuki、Kawahara Tomohiro、Sato Masaaki、Deguchi Shinji
    • 雑誌名

      American Journal of Physiology-Cell Physiology

      巻: 320 号: 6 ページ: C1153-C1163

    • DOI

      10.1152/ajpcell.00225.2020

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 細胞内高次構造物の力学情報と分子交換の同時計測2022

    • 著者名/発表者名
      齋藤匠, 松永大樹, 出口真次
    • 学会等名
      第32回バイオフロンティア講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Simultaneous measurement of intracellular flow and molecular turnover in stress fibers2022

    • 著者名/発表者名
      Takumi Saito, Daiki Matsunaga, Shinji Deguchi
    • 学会等名
      9th World Congress of Biomechanics
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 生細胞内構造構成分子の分子交換と力学情報の同時計測2021

    • 著者名/発表者名
      齋藤 匠, 松永 大樹, 松井 翼, 出口 真次
    • 学会等名
      第33回バイオエンジニアリング講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Novel strategies for FRAP reveal the complex mechanism of molecular turnover in living cells2021

    • 著者名/発表者名
      Takumi Saito, Daiki Matsunaga, Tsubasa S Matsui, Kentaro Noi, Shinji Deguchi
    • 学会等名
      The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] FRAPと遺伝子組換えを用いた細胞内分子交換計測2020

    • 著者名/発表者名
      齋藤 匠, 松永 大樹, 松井 翼, 野井 健太郎, 出口 真次
    • 学会等名
      第72回日本細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] FRAPと遺伝子組換えを併用した反応拡散分子の細胞内動態解析2020

    • 著者名/発表者名
      齋藤 匠, 松永 大樹, 松井 翼, 野井 健太郎, 出口 真次
    • 学会等名
      第33回バイオエンジニアリング講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] FRAP combined with genetic manipulation reveals the kinetics of actin-binding proteins in cells2020

    • 著者名/発表者名
      Takumi Saito, Daiki Matsunaga, Tsubasa S. Matsui, Shinji Deguchi
    • 学会等名
      Summer Biomechanics, Bioengineering, and Biotransport Conference (SB3C 2020)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] FRAP combined with genetic manipulation reveals the kinetics of actin-binding proteins in cells2020

    • 著者名/発表者名
      Takumi Saito, Daiki Matsunaga, Tsubasa S. Matsui, Kentaro Noi, Shinji Deguchi
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 細胞内タンパク質の複雑な分子交換メカニズムの解析2020

    • 著者名/発表者名
      齋藤 匠, 松永 大樹, 松井 翼, 出口 真次
    • 学会等名
      第31回バイオフロンティア講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-07-07   更新日: 2024-03-26  

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