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ショットガンメタゲノミクスによるシロアリ腸内微生物群集の進化動態の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20J10912
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
審査区分 小区分45020:進化生物学関連
研究機関沖縄科学技術大学院大学

研究代表者

Arora Jigyasa  沖縄科学技術大学院大学, 科学技術研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2020-04-24 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2020年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードmetagenomics / termites / microbes
研究開始時の研究の概要

The main aim of this research project is to provide a detailed view of termite gut microbiome functions and evolution across 150 million years of termite evolution. I will investigate how the gut microbes have evolved across termite lineages with different dietary habits, and aim to answer one of the important questions in the field which is how soil-feeding evolved from wood feeding termite ancestors. The data generated in this research will act as a prime reference for future work on termites and their microbiota.

研究実績の概要

I successfully defended my PhD thesis in March, 2022. The thesis chapter one or
the first AIM has been accepted in the Microbiome journal (impact factor 14.65). I examined the evolution of termite gut microbial functions across 150 million years of evolution.
I also finished the analysis, figures, and manuscript writing for the second AIM of the project, in which I analyzed the gut microbial composition in 202 termite samples across termite evolutionary history. The manuscript for this project is almost ready for submission to a high-impact factor journal.
Finally, the last AIM of the project was analyzed as part of the third chapter of the thesis. This chapter involved examining microbial gene family evolution using phylogenetic methods to investigate the role of Horizonal Gene Transfer and multiple acquisitions from the environment on metabolic genes. The top ten microbial gene families were examined in the thesis chapter, which is now being scaled up to the remaining hundred gene families. The scripts have been standardized, and the manuscript will be ready in the next few months.

現在までの達成度 (段落)

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2022 2020

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] The functional evolution of termite gut microbiota2022

    • 著者名/発表者名
      Jigyasa Arora, Yukihiro Kinjo, Jan Sobotnik, Alec Bucek, Crystal Clitheroe, Petr Stiblik, Yves Roisin, Lucia Zifcakova, Yung Chul Park, Ki Yoon Kim, David Sillam-Dusses, Vincent Herve, Nathan Lo, Gaku Tokuda, Andreas Brune, Thomas Bourguignon
    • 雑誌名

      Microbiome

      巻: NA

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 150 million years of evolution of gut microbiome in termites2020

    • 著者名/発表者名
      Arora Jigyasa
    • 学会等名
      Online talk at: Virtual Genomic Social Hour, California Academy of Sciences.
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Gut microbiome evolution across 150 million years of termite evolution2020

    • 著者名/発表者名
      Arora Jigyasa
    • 学会等名
      Online poster at: Virtual Conference Microbiome, Cold Spring Harbor Laboratory
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

URL: 

公開日: 2020-07-07   更新日: 2024-03-26  

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