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酵母プリオンタンパク質Sup35の線維化を制御する新規添加剤の開発

研究課題

研究課題/領域番号 20J21732
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関筑波大学

研究代表者

西奈美 卓  筑波大学, 理工情報生命学術院, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2020-04-24 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2022年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2021年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2020年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードタンパク質 / 添加剤 / 液-液相分離 / アミロイド / プリオン / 天然変性タンパク質 / プリオンタンパク質 / Sup35 / 溶媒効果 / 膜のないオルガネラ / ゲル
研究開始時の研究の概要

本研究では、プリオンやプリオン様タンパク質の生理学的役割および神経変性疾患の機構を明らかにし、その制御法を確立することを目指している。実験では、主に酵母プリオンSup35を用い、アミロイド化の中間状態として液-液相分離した液滴という状態を新たに仮定し、液滴形成の分子機構およびアミロイド化との関係性を詳しく調べる。さらに、細胞内の夾雑環境下を模倣した共溶質を用い、プリオンの液滴やアミロイドに与える影響を体系的に解析することで、共溶質を用いたプリオンの新たな制御法を確立する。これにより、細胞内に豊富に存在する共溶質の生理学的な役割についても、理解が深まることが期待される。

研究実績の概要

タンパク質の液-液相分離やアミロイドの形成は、生物学的な機能や疾患に関わるとされている。一方、そのメカニズムや制御法は確立されていない。本研究では、タンパク質の液滴やアミロイドおよび凝集の溶液状態の理解を深めるため、タンパク質の構造の安定化剤や凝集抑制剤としてこれまで開発されてきた添加剤が、液滴の安定性やアミロイドへの成熟に与える効果について、酵母プリオンタンパク質Sup35のN末端側の天然変性領域を対象に調べた。変性剤や塩、オスモライト、糖、ポリオール、アミノ酸、アミン化合物、ヘキサンジオール、高分子などの特徴の異なる添加剤を系統的に調べ、液滴やアミロイドの形成に影響するメカニズムを調査した。タンパク質の凝集抑制剤として知られる変性剤やカオトロープは、液滴に対しても抑制する効果を示すことが分かった。タンパク質の凝集を促進する糖やポリオールは、反対に液滴を抑制することが分かった。また、オスモライトの中には凝集と液滴を促進するものがあることが分かった。高分子電解質は、添加濃度に伴い液滴の形成を抑制・促進する効果が観察され、官能基の性質によって液滴からアミロイドの成熟を促進する効果と抑制する効果があることが分かった。一連の結果は、水溶液中でのタンパク質の集合体に関わる相互作用と、凝集と液滴の安定化機構の違いを示唆する結果であり、タンパク質以外の成分がタンパク質の溶液状態に与える影響について洞察を与えた。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Classification of protein solubilizing solutes by fluorescence assay2022

    • 著者名/発表者名
      Nishinami Suguru、Arakawa Tsutomu、Shiraki Kentaro
    • 雑誌名

      International Journal of Biological Macromolecules

      巻: 203 ページ: 695-702

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2022.01.137

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Arginine and its Derivatives Suppress the Opalescence of an Antibody Solution2022

    • 著者名/発表者名
      Shogo Oki, Suguru Nishinami, Yoshitaka Nakauchi, Toshihiko Ogura, Kentaro Shiraki
    • 雑誌名

      Journal of Pharmaceutical Sciences

      巻: 111 号: 4 ページ: 1126-1132

    • DOI

      10.1016/j.xphs.2021.11.018

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Opalescence arising from network assembly in antibody solution2022

    • 著者名/発表者名
      Nakauchi Yoshitaka、Nishinami Suguru、Murakami Yusuke、Ogura Toshihiko、Kano Hideaki、Shiraki Kentaro
    • 雑誌名

      Molecular Pharmaceutics

      巻: 19 号: 4 ページ: 1160-1167

    • DOI

      10.1021/acs.molpharmaceut.1c00929

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] タンパク質溶液の状態はシミュレーションできるのか?2022

    • 著者名/発表者名
      西奈美 卓, 白木 賢太郎
    • 雑誌名

      分子シミュレーション学会誌, アンサンブル

      巻: 24 ページ: 220-224

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Glass-like protein condensate for the long-term storage of proteins2021

    • 著者名/発表者名
      Nakauchi Yoshitaka、Nishinami Suguru、Shiraki Kentaro
    • 雑誌名

      International Journal of Biological Macromolecules

      巻: 182 ページ: 162-167

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2021.04.017

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Aggregation of Hen Egg White Proteins with Additives During Agitation2021

    • 著者名/発表者名
      Hong Taehun、Iwashita Kazuki、Han Jeungmin、Nishinami Suguru、Handa Akihiro、Shiraki Kentaro
    • 雑誌名

      LWT

      巻: Mar 27 ページ: 111378-111378

    • DOI

      10.1016/j.lwt.2021.111378

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 相分離生物学で理解するプリオンの存在意義2020

    • 著者名/発表者名
      西奈美 卓、白木 賢太郎
    • 雑誌名

      日本物理学会誌

      巻: 75 号: 4 ページ: 192-200

    • DOI

      10.11316/butsuri.75.4_192

    • NAID

      130007904154

    • ISSN
      0029-0181, 2423-8872
    • 年月日
      2020-04-05
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Characterization of protein solubilizing additive by fluorescence assay2022

    • 著者名/発表者名
      Suguru Nishinami, Tsutomu Arakawa, Kentaro Shiraki
    • 学会等名
      2022 Colorado Protein Stability Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Network association and glass-like condensation of highly concentrated proteins2022

    • 著者名/発表者名
      Suguru Nishinami, Yoshitaka Nakauchi, Kentaro Shiraki
    • 学会等名
      2022 Colorado Protein Stability Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Liquid-liquid phase separation of prions unraveled by solution additives2020

    • 著者名/発表者名
      Suguru Nishinami
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] 相分離生物学の全貌(現代化学増刊46)2020

    • 著者名/発表者名
      白木 賢太郎 編
    • 出版者
      東京化学同人
    • ISBN
      9784807913466
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-07-07   更新日: 2024-03-26  

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