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クワコとカイコの行動活性の差異を決定する家畜化遺伝子の同定と機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 20J22954
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
審査区分 小区分39050:昆虫科学関連
研究機関東京大学

研究代表者

富原 健太  東京大学, 農学生命科学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2020-04-24 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2022年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2021年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2020年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワードカイコ / クワコ / Quantitative Trait Loci / CRISPR/Cas9
研究開始時の研究の概要

本研究は、カイコ (Bombyx mori) とクワコ (B. mandarina) の行動の差異を産む原因遺伝子を同定し、その遺伝子の機能を明らかにすることで、家畜化の歴史を遺伝子レベルで理解することを目的とする。行動活性に関与する遺伝子が存在するゲノム領域を絞り込み、責任領域内の遺伝子発現情報や配列情報を照らし合わせ、行動活性に関与する遺伝子の候補を選定する。次に、トランスジェニックやノックアウトなどの逆遺伝学的手法を用いて、責任遺伝子の同定並びに機能解析を行う。クワコにおいては、逆遺伝学的手法は未だ確立されていないためCRISPR/Cas9を用いたゲノム編集技術を確立する。

研究実績の概要

<クワコにおけるゲノム編集技術の確立について>
これまでに得られた成果をまとめて、論文として発表した。
<行動活性を司る遺伝子の同定について>
令和3年度に行ったQTL解析によって絞り込まれた領域内の遺伝子について、RNA-seqから得た発現情報と照合して、幼虫の移動量に関与する遺伝子の候補を一つ選定した。次に、本候補遺伝子のノックアウトを行ったが、幼虫の行動活性には影響が見られなかった。この結果に疑問を持ち、条件を変えて再解析を行なったところ、本遺伝子が、QTL領域に含まれないことが判明した。
再解析の結果、最終的に、幼虫の移動距離に関係する6つのQTL領域を同定した。また、検出されたQTL以外のゲノム領域も幼虫の行動量に関係することから、これが非常に多くの遺伝子によって複雑に支配されている、ポリジェニックな形質であることを示した。一方、カイコの染色体をバックグラウンドに、特に強い関与が疑われたQTL領域が座上する染色体1対のみをクワコに置き換えた染色体置換系統 (コンソミック系統) が、正常型カイコより長距離を移動したことから、これらのQTL領域が確かに幼虫の移動距離と関連することを示した。以上の結果は、カイコとクワコの幼虫の移動距離の差異が、非常に多くの遺伝子に支配されている一方、少数の主動因子の関与を特に強く受けていることを示唆している。
現在、ここまでの結果を論文として発表するべく、成果をまとめている。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Recessive embryonic lethal mutations uncovered in heterozygous condition in silkworm semiconsomic strains2023

    • 著者名/発表者名
      Tomihara Kenta、Tanaka Saori、Katsuma Susumu、Shimada Toru、Kobayashi Jun、Kiuchi Takashi
    • 雑誌名

      Insect Biochemistry and Molecular Biology

      巻: 155 ページ: 103933-103933

    • DOI

      10.1016/j.ibmb.2023.103933

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Disruption of a BTB-ZF transcription factor causes female sterility and melanization in the larval body of the silkworm,<i>Bombyx mori</i>2023

    • 著者名/発表者名
      Tomihara Kenta、Kiuchi Takashi
    • 雑誌名

      bioRxiv (preprint)

      巻: NA

    • DOI

      10.1101/2023.04.01.535244

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Allele-specific knockouts reveal a role for apontic-like in the evolutionary loss of larval melanin pigmentation in the domesticated silkworm, Bombyx mori2022

    • 著者名/発表者名
      Kenta Tomihara, Peter Andolfatto, Takashi Kiuchi
    • 雑誌名

      Insect Molecular Biology

      巻: 31 号: 6 ページ: 701-710

    • DOI

      10.1111/imb.12797

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] カイコ突然変異体を利用して 昆虫の色を理解する ─体色形成にかかわるトランスポーターの同定─2022

    • 著者名/発表者名
      富原健太、木内隆史
    • 雑誌名

      蚕糸・昆虫バイオテック

      巻: 91 (2) ページ: 91-103

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Mutations in a β-group of solute carrier gene are responsible for egg and eye coloration of the brown egg 4 (b-4) mutant in the silkworm, Bombyx mori2021

    • 著者名/発表者名
      Tomihara Kenta、Satta Katsuya、Matsuzaki Shohei、Yoshitake Kazutoshi、Yamamoto Kimiko、Uchiyama Hironobu、Yajima Shunsuke、Futahashi Ryo、Katsuma Susumu、Osanai-Futahashi Mizuko、Kiuchi Takashi
    • 雑誌名

      Insect Biochemistry and Molecular Biology

      巻: 137 ページ: 103624-103624

    • DOI

      10.1016/j.ibmb.2021.103624

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 幼虫体色とメスの妊性に関与する単一遺伝子の発見2023

    • 著者名/発表者名
      富原健太、木内隆史
    • 学会等名
      令和5年度蚕糸・昆虫機能利用学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Identification of the gene responsible for the brown egg 4 (b-4) mutant in the silkworm, Bombyx mori2022

    • 著者名/発表者名
      Tomihara K., Satta K., Matsuzaki S., Yoshitake K., Yamamoto K., Uchiyama H., Yajima S., Katsuma S., Osanai-Futahashi M., & Kiuchi T.
    • 学会等名
      XXVI International Congress of Entomology, Helsinki, Finland
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] クワコにおけるCRISPR/Cas9によるゲノム編集2022

    • 著者名/発表者名
      富原健太, 木内隆史
    • 学会等名
      令和4年度蚕糸・昆虫機能利用学術講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] カイコdilute black (bd) 変異体の原因遺伝子の同定2022

    • 著者名/発表者名
      富原健太, 木内隆史
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 第4染色体をクワコに置換したコンソミック系統における胚致死の原因遺伝子の同定2021

    • 著者名/発表者名
      富原健太・小林淳・川本宗孝・豊田敦・勝間進・嶋田透・木内隆史
    • 学会等名
      令和3年度蚕糸・昆虫機能利用学術講演会 (日本蚕糸学会第90回大会)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-07-07   更新日: 2024-03-26  

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