| 研究課題/領域番号 |
20J23792
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| 研究種目 |
特別研究員奨励費
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 国内 |
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| 審査区分 |
小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
森田 真梨 (2020-2021) 京都大学, 医学研究科, 特別研究員(DC1)
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| 特別研究員 |
森田 真梨 (2022) 京都大学, 医学研究科, 特別研究員(DC1)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-24 – 2023-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2022年度)
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| 配分額 *注記 |
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
2022年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2020年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
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| キーワード | KIR / アレル多型 / 同種造血幹細胞移植 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
造血器腫瘍に対する同種移植のドナーはHLA多型の適合性により選定されるが、合併症や再発は依然課題で、新規パラダイムの導入が必要である。キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)多型は、NK細胞免疫を規定し予後に関与する可能性があるが、既報の結果は一定せず、アリル多型に踏み込んだ解析は乏しい。次世代シークエンサーによる高精度全自動化KIRアリルタイピング法を開発し、本邦の移植ドナーとレシピエントの保存試料とレジストリデータを用いて、予後因子となるKIRアリル多型を抽出する。同多型の免疫学的機能を基礎的実験で検証する。以上より、KIR/HLAアリル多型に基づく新規ドナー選定アルゴリズムを提示する。
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| 研究実績の概要 |
Killer cell immunoglobulin-like receptor(KIR)はNK細胞受容体の一つで、Human Leukocyte Antigen(HLA)と会合しNK細胞の機能を調整する。KIR遺伝子領域は19番染色体にあり、全部で17遺伝子座からなる。遺伝子座の構成が異なるKIRハプロタイプが複数存在するため、KIR領域はアレル多型に加えてコピー数多型を持つ。同種造血幹細胞移植ではKIRとHLAのアレルの組み合わせが両者の会合親和性を規定しNK細胞免疫を調節すると考えられるが、正確なタイピング手法が確立しておらず、バイオマーカーとしての開発が困難であった。
2020年度は全ゲノムシークエンス(Whole genome sequencing, WGS)データを用いて全17KIR遺伝子のコピー数とアレル、ハプロタイプの推定法と融合遺伝子検出法を開発した。昨年度から今年度にかけては、日本人約2,000人のWGSからKIRハプロタイプを決定し、その情報をもとに、15種類の機能性KIR遺伝子それぞれに対して全長を増幅するPCRプライマーの配列を選定した。KIR遺伝子型を決定した日本人サンプルを陽性コントロールとして検証した結果、日本人の主要なハプロタイプでは高感度に各KIR遺伝子を増幅できた。さらに、ロングリードシーケンサーに対応した実験手法およびKIRアレルタイピング手法を開発し、低コストでKIR全長配列を正確に得ることができるようになった。開発手法により成人T細胞白血病に対する非血縁骨髄移植264例のドナー・レシピエントのKIRアレルタイピングを行なった。現在、KIR/HLAのアレル・アミノ酸多型と予後との網羅的な関連解析を行なっている。
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| 現在までの達成度 (段落) |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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