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糖ガラスに包埋されたタンパク質の構造物性から解き明かす極限環境耐性の分子機構

研究課題

研究課題/領域番号 20K03878
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
研究機関群馬大学

研究代表者

平井 光博  群馬大学, その他部局等, 名誉教授 (00189820)

研究分担者 中川 洋  国立研究開発法人日本原子力研究開発機構, 原子力科学研究部門 原子力科学研究所 物質科学研究センター, 研究主幹 (20379598)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2021年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2020年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード極限環境耐性 / クリプトビオシス / 糖 / ガラス転移 / 蛋白質 / 食品科学 / 放射光X線散乱 / 中性子散乱 / 食品保存 / トレハロース / 水和 / ガラス / 動力学転移 / 中性子散 / 極限環境 / 分子混雑 / 糖ガラス / タンパク質
研究開始時の研究の概要

本研究では,糖ガラス包埋タンパク質の構造とダイナミックスの物性特性を実験・理論の
両面から明らかにする。「糖のガラス化」と「環境耐性」の関係を直接観測・解析し,分子レベルで解明した例は今までにない。そのための研究手法として,中性子逆コントラストマッチング法を用いた中性子弾性・非弾性・準弾性散乱測定を中心として研究を推進し,糖の濃厚溶液状態,ラバー状態,ガラス状態の構造物性と,それらの各状態下のタンパク質の構造とダイナミックス(分子内の拡散的な運動状態,低エネルギー励起)をそれぞれ分別して観測,解析を行う。

研究成果の概要

生物の極限環境耐性や細胞やリポソーム製剤の低温保存,食品の品質管理や長期保存には,水に代わって生体成分や細胞膜などを保護する「適合溶質」として糖の役割の理解が重要である。本研究は,放射光X線と中性子線の相補利用により,濃厚糖溶液や糖ガラス・ラバーに包埋されたタンパク質の特性(立体構造,内部構造,水和状態)を世界で初めて直接観測・解析した。その結果,5 ~ 65%w/wの糖溶液中ではタンパク質の構造と水和シェルはほぼ保存される一方,含水率15%w/w以下の非流動状態(ラバー&ガラス状態)の糖中では,水和シェルが糖に置換し,よりコンパクトな構造が安定化することが明らかになった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

得られた成果は,乾燥や低温などの極端環境に対する動物の糖の含蓄による耐性機構の理解に留まらず,細胞やリポソーム製剤の新たな保存法の開発や,糖のガラス/ラバー状態を利用した食品の品質管理や長期保存法の創生へ繋がる。

報告書

(5件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 3件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (13件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Fibrillization Process of Human Amyloid-Beta Protein (Ab) under a Molecular Crowding Environment Mimicking the Interior of Living Cells Using Cell Debris2023

    • 著者名/発表者名
      Hirai Mitsuhiro、Arai Shigeki、Iwase Hiroki
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 28 号: 18 ページ: 6555-6555

    • DOI

      10.3390/molecules28186555

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural Properties of Proteins Embedded in Sugar-Glass and/or Sugar-Rubber2023

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro HIRAI, Shigeki ARAI, Hiroshi NAKAGAWA, and Hiroki IWASE
    • 雑誌名

      Photon Factory Activity Report 2022

      巻: 40

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Magnetic field effects on the structure and molecular behavior of pigeon iron?sulfur protein2022

    • 著者名/発表者名
      Arai Shigeki、Shimizu Rumi、Adachi Motoyasu、Hirai Mitsuhiro
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 31 号: 6 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1002/pro.4313

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Study of protein structures embedded in sugar glass2022

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Hirai, Hiroki Iwase, Shigeki Arai, and Hiroshi Nakagawa
    • 雑誌名

      MLF実験報告書

      巻: 2020A ページ: 1-2

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Stability of protein structure in sugar and polyol solution at low temperature2021

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Hirai, Hiroki Iwase, Shigeki Arai, and Hiroshi Nakagawa
    • 雑誌名

      MLF実験報告書

      巻: 2019A ページ: 1-2

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Position Dependency of the Scattered Intensity in the Time-of-flight Backscattering Spectrometer DNA2021

    • 著者名/発表者名
      Matsuura Masato、Yamada Takeshi、Tominaga Taiki、Kobayashi Makoto、Nakagawa Hiroshi、Kawakita Yukinobu
    • 雑誌名

      the Proceedings of the 3rd J-PARC Symposium (J-PARC2019)

      巻: 1 ページ: 011068-011068

    • DOI

      10.7566/jpscp.33.011068

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Quartz Cell for a Backscattering Spectrometer2021

    • 著者名/発表者名
      Tominaga Taiki、Kawakita Yukinobu、Nakagawa Hiroshi、Yamada Takeshi、Shibata Kaoru
    • 雑誌名

      the Proceedings of the 3rd J-PARC Symposium (J-PARC2019)

      巻: 1 ページ: 011068-011068

    • DOI

      10.7566/jpscp.33.011086

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Short-Distance Intermolecular Correlations of Mono- and Disaccharides in Condensed Solutions: Bulky Character of Trehalose2020

    • 著者名/発表者名
      Hirai Mitsuhiro、Ajito Satoshi、Iwasa Tatsuo、Wen Durige、Igarashi Noriyuki、Shimizu Nobutaka
    • 雑誌名

      ACS Omega

      巻: 5 号: 19 ページ: 10815-10825

    • DOI

      10.1021/acsomega.0c00451

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Sugars can protect hydration shell of proteins and stabilize their native structures in crowded molecular environment: clarified by complemental use of X-rays and neutrons2020

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Hirai
    • 雑誌名

      SPring-8/SACLA Research Frontiers

      巻: 23 ページ: 13-14

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterization of Localization, Ligand Binding, and pH-Dependent Conformational Changes of Two Chemosensory Proteins Expressed in the Antennae of the Japanese Carpenter Ant, Camponotus Japonicus2020

    • 著者名/発表者名
      Wen Durige、Li Xing、Geng Xiong、Hirai Mitsuhiro、Ajito Satoshi、Takahashi Kosuke、Ozaki Mamiko、Hojo Masaru K.、Uebi Tatsuya、Iwasa Tatsuo
    • 雑誌名

      Zoological Science

      巻: 37 号: 4 ページ: 371-371

    • DOI

      10.2108/zs190138

    • NAID

      40022331098

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 中性子散乱による蛋白質の水和の研究2020

    • 著者名/発表者名
      中川 洋、味戸 聡志
    • 雑誌名

      低温生物工学会誌

      巻: 66 号: 2 ページ: 83-92

    • DOI

      10.20585/cryobolcryotechnol.66.2_83

    • NAID

      130007991392

    • ISSN
      1340-7902, 2424-1555
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Aggregate formation of Human Amyloid-beta Protein in cell debris crowding environment closely resembling the intracellular environment2023

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Hirai, Hiroki Iwase, Shigeki Arai
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Structural studies of magnetic field-responsive proteins by small-angle X-ray scattering analysis2023

    • 著者名/発表者名
      Shigeki Arai, Rumi Shimizu, Motoyasu Adachi, Mitsuhiro Hirai
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 濃厚な糖溶液の構造:単糖類と二糖類の特性の比較とトレハロースの特異性2022

    • 著者名/発表者名
      平井光博
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 糖ガラスに包埋されたタンパク質の構造安定性2021

    • 著者名/発表者名
      平井光博, 新井栄揮, 岩瀬裕希, 中川洋, 清水信隆
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 糖ガラスに包埋タンパク質の構造2021

    • 著者名/発表者名
      平井光博, 新井栄揮, 中川洋, 味戸聡志, 岩瀬裕希
    • 学会等名
      量子ビームサイエンスフェスタ
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 糖ガラスに包埋されたタンパク質の構造安定性2021

    • 著者名/発表者名
      平井光博、新井栄揮、中川洋、味戸聡志、岩瀬裕希
    • 学会等名
      2020年度 量子ビームサイエンスフェスタ
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 磁気受容蛋白質候補ISCA1のSAXS解析2021

    • 著者名/発表者名
      新井栄揮、清水瑠美、安達基泰、味戸聡志、平井光博
    • 学会等名
      2020年度 量子ビームサイエンスフェスタ
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 蛋白質の階層構造ダイナミクスの解明2021

    • 著者名/発表者名
      中川洋、井上倫太郎、小田隆、矢木-内海真穂、斉尾智英、苙口友隆、長田裕也、杉山正明、佐藤衛、川北至信、岩瀬裕希、富永大輝、高田慎一
    • 学会等名
      2020年度 量子ビームサイエンスフェスタ
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 磁気受容蛋白質第二候補ISCA1の分子挙動2020

    • 著者名/発表者名
      新井 栄揮 , 清水 瑠美 , 安達 基泰 , 味戸 聡志, 平井 光博
    • 学会等名
      日本生物物理学会第58回年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 溶液中の超分子の配向挙動:磁場強度,濃度,有効電荷に対する依存性2020

    • 著者名/発表者名
      平井光博
    • 学会等名
      日本生物物理学会第58回年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 中性子・放射光 X 線散乱の相補利用の基礎:生命科学への応用2020

    • 著者名/発表者名
      平井光博
    • 学会等名
      日本中性子科学会第20回年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 中性子準弾性散乱による生体物質の低エネルギーダイナミクス研究と今後の展望2020

    • 著者名/発表者名
      中川洋
    • 学会等名
      物性研短期研究会-中性子散乱研究の現状とJRR-3再稼働後の展望-
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 量子ビーム散乱法と分子シミュレーションによるマルチドメイン蛋白質の溶液動態解析2020

    • 著者名/発表者名
      中川洋
    • 学会等名
      日本中性子科学会第20回年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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