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信頼性の低い分子部品から信頼性の高いDNA回路を創るための基礎論と設計法

研究課題

研究課題/領域番号 20K04549
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分21040:制御およびシステム工学関連
研究機関九州工業大学

研究代表者

中茎 隆  九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授 (30435664)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円)
キーワード分子ロボティクス / DNA回路 / 合理的設計 / 制御理論
研究開始時の研究の概要

本研究では、(1)信頼性の低い分子部品から信頼性の高いDNA回路を設計するための基礎論を確立し、(2)分子ロボットに搭載可能な高機能な制御回路を設計する。高機能な制御回路を設計することは、多種の分子部品を組み合わせた複雑なDNA回路を設計することを意味する。副反応はDNA回路の規模と共に爆発的に増加し、DNA回路の機能不全を引き起こす。「高機能な制御回路」を設計するためには、「信頼性の高いDNA回路」の設計法を確立する必要がある。

研究成果の概要

研究代表者らによって過去に構築された基礎理論「Finite-time regulation property」を発展させ,DNA反応系を2つの時間スケールモデルに変換し,DNA回路の動特性を制御工学における周波数応答解析にて評価する解析法を確立した。また,光応答性分子アゾベンゼンを用いて,DNAフィードバック制御回路を長時間駆動する方法法も確立した。
広く当該分野の魅力を社会に発信すべく,英語書籍「Molecular Robotics」の反応系設計に関する章の取りまとめと執筆(分担)を行い,体系的に当該分野における技術状況をまとめた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

生体分子で構成される分子ロボットは,様々な要素技術が統合された知的システムである。医療分野での応用が期待されている分子ロボットを実用化へと進展させる上で,高機能なDNA制御回路の実現が求められている。DNA回路の実態は化学反応系であり,その構成分子であるDNA鎖が分子部品となる。本研究では,DNA回路という高次非線形系に対して,特異摂動理論に基づく実用的な解析法を提案しており,制御理論の新たな拡張性を示唆している。また,分子ロボットの制御に必要なDNAフィードバック制御器を長時間駆動する設計法の確立は,分子ロボットの社会実装を進める上で必要不可欠となる技術である。

報告書

(4件)
  • 2023 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Molecular Cybernetics: Challenges toward Cellular Chemical Artificial Intelligence2022

    • 著者名/発表者名
      Murata, S., Toyota, T., Nomura, S. I. M., Nakakuki, T., & Kuzuya, A.
    • 雑誌名

      Advanced Functional Materials

      巻: 32(37) 号: 37 ページ: 2201866-2201866

    • DOI

      10.1002/adfm.202201866

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Renewable DNA Proportional-Integral Controller with Photoresponsive Molecules2022

    • 著者名/発表者名
      Tamba Masaaki、Murayama Keiji、Asanuma Hiroyuki、Nakakuki Takashi
    • 雑誌名

      Micromachines

      巻: 13 号: 2 ページ: 193-193

    • DOI

      10.3390/mi13020193

    • NAID

      120007186030

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] DNA concentration regulator that can be driven for a long time2022

    • 著者名/発表者名
      Takashi Nakakuki, Keiji Murayama, Hiroyuki Asanuma
    • 雑誌名

      New Generation Computing

      巻: -

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] New Approach to Frequency Response Analysis of Biomolecular Circuits2021

    • 著者名/発表者名
      Keitaro Koga, Takashi Nakakuki
    • 雑誌名

      2021 60th Annual Conference of the Society of Instrument and Control Engineers of Japan (SICE2021)

      巻: -

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Renewable implementation of rational biomolecular systems design2020

    • 著者名/発表者名
      Masaaki Tamba, Takashi Nakakuki
    • 雑誌名

      Proceedings of SICE Annual Conference (SICE2020)

      巻: - ページ: 300-307

    • DOI

      10.23919/sice48898.2020.9240329

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 分子ブースターによる DNA 鎖置換反応の加速効果の定量評価2022

    • 著者名/発表者名
      川野隆宏,麻生かおり,嶋田直彦,丸山厚,中茎隆
    • 学会等名
      計測自動制御学会 システム・情報部門 学術講演会 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 条件反射を獲得する分子反応回路の設計2021

    • 著者名/発表者名
      中茎隆
    • 学会等名
      細胞を創る研究会14.0(CellSynth14)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光応答性分子アゾベンゼンを利用した再利用可能な可能なDNA回路の設計法2020

    • 著者名/発表者名
      丹波正明,中茎隆
    • 学会等名
      第4回分子ロボティクス年次大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 光反応制御を用いた濃度レギュレータに関する研究2020

    • 著者名/発表者名
      秋田実,中茎隆
    • 学会等名
      第4 回分子ロボティクス年次大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Design Theory of Molecular Robots in Book "Molecular Robotics"2022

    • 著者名/発表者名
      Takashi Nakakui (Editor: Satoshi Murata)
    • 総ページ数
      296
    • 出版者
      Springer Singapore
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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