• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

固液界面を利用した水溶液中のタンパク質振動スペクトルの測定と分子間相互作用の検出

研究課題

研究課題/領域番号 20K05415
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分32010:基礎物理化学関連
研究機関筑波大学

研究代表者

近藤 正人  筑波大学, 数理物質系, 助教 (20611221)

研究分担者 石橋 孝章  筑波大学, 数理物質系, 教授 (70232337)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード生体分子 / 振動スペクトル / 固液界面 / 振動和周波発生分光 / 全内部反射ラマン分光 / 脂質膜 / シリカコート / シランカップリング / 界面 / 基板支持脂質二分子膜 / シリカコート基板 / タンパク質
研究開始時の研究の概要

本研究では,固体と液体の界面を利用して,水溶液中のタンパク質の振動スペクトルを高感度に得る新しい方法論を確立する.具体的には,フッ化カルシウム(CaF2)基板と水溶液界面に,水溶性タンパク質をその配向を制御して保持した試料を準備する.この試料を,界面選択的な振動分光法である振動和周波発生(VSFG)分光で測定する.タンパク質分子を特定の配向に制御された状態で界面に局在させることで,興味あるタンパク質およびこれに水和して特定の配向を持った水分子の振動スペクトルだけを得る.この方法を,水溶液中でのタンパク質変性に伴う構造変化や分子間相互作用変化を捉える研究に応用する.

研究成果の概要

固体基板と水溶液の固液界面にタンパク質を保持し,界面敏感な振動分光法を適用することで,タンパク質の振動スペクトルを十分に水と接した状態で高感度に得る.その実現に向け,フッ化カルシウムにシリカ薄膜をコートした基板の作製と高品質化に取り組んだ.シリカコート面に,タンパク質をシランカップリングさせて保持する計画であったが,途中,作製される基板のコート面の平面性に問題が生じるようになり,計画を進めることが困難な状況となった.そこで,計画を見直し,この問題に影響されずに行える実験として,固液界面の脂質二分子膜と相互作用したペプチドの振動スペクトル測定に挑んだ.結果,そのラマンバンドの検出に成功した.

研究成果の学術的意義や社会的意義

界面敏感なラマン分光法で,界面にある脂質膜と相互作用した膜結合ペプチドの振動スペクトルを検出できたことが本研究の主な成果である.概要の項目で述べたように,途中に計画を見直したが,当初着目した「界面を利用する」という独自の視点で取り組んだ研究である.膜結合ペプチドは,抗生物質としての重要な働きを持つ.その抗菌作用は,ペプチドが細胞膜と結合し,膜に侵入して孔をあけることで発現する.抗菌作用の機構を理解するには,膜とペプチドの相互作用を調べることが不可欠である.本研究の学術的意義は,こうした相互作用を,界面を利用した新しい視点から研究する方法を与えたことにある.

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Total Internal Reflection Raman Spectra of Alamethicin Interacting with Supported Lipid Bilayers at a Silica/Water Interface2022

    • 著者名/発表者名
      Masato Kondoh, Arisa Sano, Izuru Kawamura, Taka-aki Ishibashi*
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 126 号: 50 ページ: 10712-10720

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.2c06371

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Time-resolved infrared spectroscopy with multivariate analysis on photoinduced proton transfer in aromatic urea-acetate anion complex2022

    • 著者名/発表者名
      Masato Kondoh, Hayato Honda, Kei Togasaki, Yoshinobu Nishimura, Tatsuro Arai, Taka-ak Ishibashi*
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 126 号: 4 ページ: 912-921

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.1c09526

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 全内部反射ラマン分光による膜結合ペプチドと基板支持脂質二分子膜の相互作用の観測2022

    • 著者名/発表者名
      近藤正人,佐野有里紗,鈴木沙弥,石橋孝章
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] リン脂質二分子膜中のグラミシジンAの全内部反射ラマンスペクトル測定2022

    • 著者名/発表者名
      鈴木沙弥,近藤正人,石橋孝章
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 4’-ジヘキシルアミノ-4-スルホアゾベンゼン水溶液上の脂質単分子膜のHD-VSFG分光2022

    • 著者名/発表者名
      篠田亮介,近藤正人,百武篤也,石橋孝章
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Time-resolved IR spectroscopy of photo-induced ring opening and closure reactions between 2-hydroxychalcone and flav-3-en-2-ol2021

    • 著者名/発表者名
      Masato Kondoh, Taka-aki Ishibashi
    • 学会等名
      The 2021 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 全内部反射ラマン分光による固液界面リン脂質二重膜とアラメチシンの相互作用観測の試み2021

    • 著者名/発表者名
      佐野有里紗,近藤正人,川村出,石橋孝章
    • 学会等名
      2021年日本分光学会年次講演会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] VSFG分光で観るSHG活性色素Ap3の平面支持脂質二重膜への吸脱着過程2021

    • 著者名/発表者名
      近藤正人,中島晃希,新井達郎,石橋孝章
    • 学会等名
      第15回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 非光反応性タンパク質の紫外光励起過渡回折格子信号とその起源の検討2021

    • 著者名/発表者名
      永山弘季,近藤正人,田島優衣,石橋孝章
    • 学会等名
      第15回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 固液界面におけるリン脂質二重膜と膜透過ペプチドの全内部反射ラマンスペクトル測定2021

    • 著者名/発表者名
      佐野有里紗,近藤正人,川村出,石橋孝章
    • 学会等名
      第15回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] HD-VSFG分光法で観るSHGプローブ色素AP3と水上脂質単分子膜の相互作用2020

    • 著者名/発表者名
      中島晃希,近藤正人,新井達郎,石橋孝章
    • 学会等名
      2020年度日本分光学会年次講演会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] リン脂質/コレステロール混合二重膜の全内部反射ラマン分光2020

    • 著者名/発表者名
      佐野有里紗,近藤正人,石橋孝章
    • 学会等名
      2020年度日本分光学会年次講演会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] HD-VSFG分光で観る脂質二分子膜の構造に対するコレステロールの影響2020

    • 著者名/発表者名
      筑波標,近藤正人,石橋孝章
    • 学会等名
      2020年度日本分光学会年次講演会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi