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環状リガンドの配座制御を基盤としたタンパク質局在の光制御法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 20K05702
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分37010:生体関連化学
研究機関東北大学

研究代表者

小和田 俊行  東北大学, 多元物質科学研究所, 助教 (40584397)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2022年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード光応答性分子 / タンパク質二量化 / フォトクロミック / 蛍光イメージング / 細胞 / 蛋白質二量化 / 光操作 / タンパク質二量体化 / フォトクロミック化合物
研究開始時の研究の概要

タンパク質が細胞内で機能を発揮する時には,特定の場所へ局在移行が起こる.光を用いて可逆的にタンパク質局在を制御できれば,任意のタイミングでタンパク質機能の発現誘導が可能となり,複雑な生命機構を理解する基盤技術となり得る.本研究では,タグタンパク質の光応答性環状リガンドを開発し,タンパク質二量化剤へと展開することで,細胞内タンパク質局在の光制御法を確立する.さらに開発したタンパク質局在制御技術を,がん関連タンパク質の局在操作技術へと発展させ,疾患機構の解明や治療薬開発への貢献を目指す.

研究成果の概要

細胞内タンパク質局在の光制御法の確立を目指し、タンパク質タグに対する光応答性環状リガンドの合成に取り組んだ。併せて、2種類のタンパク質タグを光照射依存的に会合・解離させることが可能なフォトクロミックタンパク質二量化剤を開発した。この二量化剤を用いて生細胞内のタンパク質局在の光制御を達成するとともに、マイトファジー誘導の光制御へと展開した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

細胞内で多くのタンパク質は特定のタイミングで局在を変化させ、その機能を発現している。したがって、細胞内タンパク質の局在制御法は複雑な生命機序を理解する上で強力な基盤技術である。しかし、既存の光操作技術である光遺伝学(オプトジェネティクス)やケージド化合物を用いた化学的タンパク質二量化法では、二量体形成の光可逆性などに課題が残されていた。本研究で開発したフォトクロミックタンパク質二量化剤を用いることで、細胞内タンパク質局在の迅速かつ可逆的な光制御、ならびに細胞内シグナル伝達の活性化を達成した。本手法はタンパク質機能の解明に有用であり、今後、疾患の分子機構理解へと繋がると期待される。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (45件)

すべて 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (35件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件) 図書 (1件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Arylazopyrazole-Based Photoswitchable Inhibitors Selective for Escherichia coli Dihydrofolate Reductase2023

    • 著者名/発表者名
      Himadri S. Sarkar, Takato Mashita, Toshiyuki Kowada, Satoshi Hamaguchi, Toshizo Sato, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi, Toshitaka Matsui, and Shin Mizukami*
    • 雑誌名

      ACS Chem. Biol.

      巻: 18 号: 2 ページ: 340-346

    • DOI

      10.1021/acschembio.2c00749

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clip to Click: Controlling Inverse Electron-Demand Diels窶鄭lder Reactions with Macrocyclic Tetrazines2022

    • 著者名/発表者名
      Ira Novianti, Toshiyuki Kowada, and Shin Mizukami*
    • 雑誌名

      Org. Lett.

      巻: 24 号: 17 ページ: 3223-3226

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.2c01010

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantitative and Repetitive Control of Subcellular Protein-Protein Interaction Using a Photochromic Dimerizer2022

    • 著者名/発表者名
      Mashita Takato、Kowada Toshiyuki、Yamamoto Hayashi、Hamaguchi Satoshi、Matsui Toshitaka、Mizukami Shin
    • 雑誌名

      ChemRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.26434/chemrxiv-2022-7vq8s

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Organelle-Level Labile Zn<sup>2+</sup> Mapping Based on Targetable Fluorescent Sensors2022

    • 著者名/発表者名
      Liu Rong、Kowada Toshiyuki、Du Yuyin、Amagai Yuta、Matsui Toshitaka、Inaba Kenji、Mizukami Shin
    • 雑誌名

      ACS Sensors

      巻: 7 号: 3 ページ: 748-757

    • DOI

      10.1021/acssensors.1c02153

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Optical Manipulation of Subcellular Protein Translocation Using a Photoactivatable Covalent Labeling System2021

    • 著者名/発表者名
      Kowada Toshiyuki、Arai Keisuke、Yoshimura Akimasa、Matsui Toshitaka、Kikuchi Kazuya、Mizukami Shin
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 60 号: 20 ページ: 11378-11383

    • DOI

      10.1002/anie.202016684

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Protocol for synthesis and use of a turn-on fluorescent probe for quantifying labile Zn2+ in the Golgi apparatus in live cells2021

    • 著者名/発表者名
      Kowada Toshiyuki、Watanabe Tomomi、Liu Rong、Mizukami Shin
    • 雑誌名

      STAR Protocols

      巻: 2 号: 2 ページ: 100395-100395

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2021.100395

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Quantitative Imaging of Labile Zn2+ in the Golgi Apparatus Using a Localizable Small-Molecule Fluorescent Probe2020

    • 著者名/発表者名
      Kowada Toshiyuki、Watanabe Tomomi、Amagai Yuta、Liu Rong、Yamada Momo、Takahashi Hiroto、Matsui Toshitaka、Inaba Kenji、Mizukami Shin
    • 雑誌名

      Cell Chemical Biology

      巻: 27 号: 12 ページ: 1521-1531

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2020.09.003

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] フォトクロミック蛋白質二量化剤を用いた生細胞内蛋白質局在の光制御2023

    • 著者名/発表者名
      佐藤 歳三、小和田 俊行、濱口 聡志、松井 敏高、水上 進
    • 学会等名
      日本化学会第103春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Development of fast blinking fluorophores for real-time single-molecule super-resolution imaging2023

    • 著者名/発表者名
      Bochao Li, Toshiyuki Kowada, Takahiro Fujiwara, Shin Mizukami
    • 学会等名
      日本化学会第103春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質ラベル化の光制御法の開発と生命システムの理解2023

    • 著者名/発表者名
      小和田 俊行
    • 学会等名
      日本化学会第103春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] タグ融合蛋白質の細胞内分解を光制御する機能性化合物の開発2023

    • 著者名/発表者名
      松尾 章弘、小和田 俊行、Himadri S. Sarkar、松井 敏高、水上 進
    • 学会等名
      日本化学会第103春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative imaging of organellar labile Zn2+ using localizable small-molecule fluorescent probes2022

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Kowada
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (AsBIC10)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Development of small-molecule fluorescent probes for the quantitative analysis of labile Zn2+ in cells2022

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Kowada
    • 学会等名
      第60回生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光可逆的蛋白質ラベル化法に基づく細胞内蛋白質局在の光制御2022

    • 著者名/発表者名
      小和田俊行, 間下貴斗, 山本 林, 松井敏高, 水上進
    • 学会等名
      第16回日本分子イメージング学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative Mapping of Subcellular Labile Zn2+ Concentrations Using Localizable Small-Molecule Fluorescent Probes2022

    • 著者名/発表者名
      Rong Liu, Toshiyuki Kowada, Toshitaka Matsui, Shin Mizukami
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (AsBIC10)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Time-Lapse Ratiometric Imaging of Mitochondrial pH during Mitophagy Using a Localizable Fluorescent Probe2022

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Kowada, Risa Ito, Makoto Iwashita, Toshitaka Matsui, Shin Mizukami
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (AsBIC10)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Activatable Click Reaction using Macrocyclic Tetrazines2022

    • 著者名/発表者名
      Ira Novianti, Toshiyuki Kowada, Shin Mizukami
    • 学会等名
      第22回東北大学多元物質科学研究所研究発表会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 光可逆的かつ定量的なタンパク質ラベル化を可能とするフォトクロミックリガンドの開発2022

    • 著者名/発表者名
      浜口 聡志, 小和田 俊行, 間下 貴斗, Himadri S. Sarkar, 松井 敏高, 水上 進
    • 学会等名
      第16回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 光可逆的蛋白質ラベル化法に基づく細胞内蛋白質局在の光制御2022

    • 著者名/発表者名
      小和田俊行, 間下貴斗, 山本 林, 松井敏高, 水上進
    • 学会等名
      クロススケール新生物学 第2回領域会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 光可逆的タンパク質ラベル化技術を利用したタンパク質局在の光制御2022

    • 著者名/発表者名
      間下 貴斗 , 小和田 俊行 , 松井 敏高 , 水上 進
    • 学会等名
      日本化学会 第102春季年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Controlling IEDDA Reaction with Macrocyclic Tetrazines2022

    • 著者名/発表者名
      Ira Novianti, Toshiyuki Kowada, Shin Mizukami
    • 学会等名
      日本化学会 第102春季年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 局在型レシオ蛍光プローブを用いた細胞内局所pHの定量イメージング2022

    • 著者名/発表者名
      岩下 誠、小和田 俊行、伊藤 理紗、松井 敏高、水上 進
    • 学会等名
      日本化学会 第102春季年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of a chemical biology tool enabling reversible optical control of protein labeling2021

    • 著者名/発表者名
      Himadri Sekhar Sarkar, Takato Mashita, Toshiyuki Kowada, Toshitaka Matsui, Shin Mizukami
    • 学会等名
      The 10th Annual Conference Of The International Chemical Biology Society (ICBS2021)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 細胞小器官内遊離Zn2+の濃度定量と動態観察を可能とする小分子蛍光プローブの開発2021

    • 著者名/発表者名
      小和田俊行, 劉 熔, 杜 雨音, 松井敏高, 水上 進
    • 学会等名
      第15回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 初期分泌経路における亜鉛濃度制御が小胞体―ゴルジ体シャペロンERp44の機能をコントロールする2021

    • 著者名/発表者名
      天貝佑太, 山田 桃, 渡邊朝美, 小和田俊行, 楢本悟史, 渡部 聡, 経塚淳子, Roberto Sitia, 水上 進, 稲葉謙次
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 共有結合型蛋白質ラベル化技術を利用した細胞内蛋白質二量化の光制御2021

    • 著者名/発表者名
      小和田俊行, 荒井啓介, 吉村彰真, 松井敏高, 菊地和也, 水上 進
    • 学会等名
      第15回日本分子イメージング学会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of fluorescent probes for visualizing Zn2+/H+ dynamics in living cells2021

    • 著者名/発表者名
      小和田俊行, 松井敏高, 水上 進
    • 学会等名
      学術変革領域(A)クロススケール新生物学 第一回領域会議
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of photo-reversible protein labeling system2021

    • 著者名/発表者名
      間下貴斗, 小和田俊行, 松井敏高, 水上 進
    • 学会等名
      学術変革領域(A)クロススケール新生物学 第一回領域会議
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 細胞内pH変化のリアルタイムイメージング用蛍光プローブの開発2021

    • 著者名/発表者名
      岩下 誠, 小和田俊行, 伊藤理紗, 松井敏高, 水上 進
    • 学会等名
      第21回東北大学多元物質科学研究所研究発表会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of novel fluorescent probes for detection of extracellular sulfatases2021

    • 著者名/発表者名
      Yi Ding, Kashfia Ahamed, Toshiyuki Kowada, Norihiko Sasaki, Toshitaka Matsui, Shin Mizukami
    • 学会等名
      第21回東北大学多元物質科学研究所研究発表会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Quantitative imaging of labile Zn2+ using organelle-localizable fluorescent probes2021

    • 著者名/発表者名
      Rong Liu, Toshiyuki Kowada, Toshitaka Matsui, Shin Mizukami
    • 学会等名
      第15回日本分子イメージング学会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 共有結合型蛋白質ラベル化技術を利用した細胞内蛋白質二量化の光制御2021

    • 著者名/発表者名
      小和田俊行, 荒井啓介, 吉村彰真, 松井敏高, 菊地和也, 水上進
    • 学会等名
      第15回日本分子イメージング学会学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Visualization and quantification of labile Zn2+ in the acidic subcellular compartments using a small-molecule fluorescent probe2021

    • 著者名/発表者名
      Yuyin Du, Rong Liu,小和田俊行, 松井敏高,門倉 広,稲葉謙次,水上 進
    • 学会等名
      第32回万有仙台シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 細胞外スルファターゼ活性を検出する蛍光プローブの開発2021

    • 著者名/発表者名
      Kashfia Ahamed, Toshiyuki Kowada, Norihiko Sasaki, Shin Mizukami
    • 学会等名
      日本化学会第101春季年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Quantitative Mapping of Cellular Labile Zn2+ via Development of Hybrid Fluorescent Probes2021

    • 著者名/発表者名
      劉熔, 小和田俊行, 松井敏高, 水上進
    • 学会等名
      日本化学会第101春季年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 細胞小器官局在化蛍光プローブの開発と細胞内遊離亜鉛の定量イメージング2020

    • 著者名/発表者名
      小和田俊行, 渡邊朝美, 天貝佑太, 劉 熔, 山田 桃, 高橋泰人, 松井敏高, 稲葉謙次, 水上 進
    • 学会等名
      第29回日本バイオイメージング学会学術集会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 哺乳動物細胞分泌経路における亜鉛調節とタンパク質品質管理2020

    • 著者名/発表者名
      天貝佑太,山田桃,渡邊朝美,小和田俊行,楢本悟史,渡部聡,経塚淳子,Roberto Sitia,水上進,稲葉謙次
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 標的タンパク質への親和性を光制御可能なフォトクロミックリガンドの開発2020

    • 著者名/発表者名
      間下 貴斗, 小和田 俊行, Himadri S. SARKAR, 高橋 泰人, 松井 敏高, 水上 進
    • 学会等名
      第14回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Quantitative Mapping of Organellar Labile Zn2+ via the Development of Hybrid Fluorescent Probes2020

    • 著者名/発表者名
      劉 熔, 小和田 俊行, 松井 敏高, 水上 進
    • 学会等名
      第14回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 光可逆的な蛋白質ラベル化を可能とするリガンドの開発2020

    • 著者名/発表者名
      間下 貴斗, 小和田 俊行, SARKAR S. Himadri, 高橋 泰人, 松井 敏高, 水上 進
    • 学会等名
      第31回万有仙台シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Subcellular Labeling Performances of Tetrazine-trans-Cyclooctene Cycloadditions and Their Products2020

    • 著者名/発表者名
      Ira Novianti, Toshiyuki Kowada, Shin Mizukami
    • 学会等名
      第20回東北大学多元物質科学研究所研究発表会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Escherichia coli dihydrofolate reductase-selective photoswitchable inhibitors enabling reversible optical control of protein labeling2020

    • 著者名/発表者名
      Himadri Sekhar Sarkar, Takato Mashita, Toshiyuki Kowada, Ming Ming Yem, Satoshi, Watanabe, Kenji Inaba, Toshitaka Matsui, Shin Mizukami
    • 学会等名
      第20回東北大学多元物質科学研究所研究発表会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Live Cell Imaging (Long-Term Mg2+ Imaging in Live Cells with a Targetable Fluorescent Probe)2021

    • 著者名/発表者名
      Priya Ranjan Sahoo, Toshiyuki Kowada, Shin Mizukami
    • 総ページ数
      447
    • 出版者
      Humana, New York, NY
    • ISBN
      9781071612576
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [備考] 東北大学多元物質科学研究所 水上研究室

    • URL

      http://www2.tagen.tohoku.ac.jp/lab/mizukami/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実施状況報告書 2020 実施状況報告書
  • [産業財産権] 外部刺激応答性クリック反応技術2021

    • 発明者名
      水上進、ノヴィアンティ イラ、小和田俊行
    • 権利者名
      水上進、ノヴィアンティ イラ、小和田俊行
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2021
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 外国

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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