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遺伝子発現とアミノ酸動態の解析によるD-アミノ酸誘導性タンパク質発現の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K05729
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分37020:生物分子化学関連
研究機関徳島大学

研究代表者

川上 竜巳  徳島大学, 大学院社会産業理工学研究部(生物資源産業学域), 准教授 (90380120)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード遺伝子発現 / D-アミノ酸 / 転写因子 / 超好熱アーキア / アミノ酸ラセマーゼ
研究開始時の研究の概要

高等生物やバクテリアにおいて、D-アミノ酸が重要な生理機能を担うことが分かってきている。申請者は、第3のドメインに分類される超好熱アーキアもD-アミノ酸に対して生理的な作用を示すことを初めて明らかにした。本研究では、D-アミノ酸培養によって発現する遺伝子の網羅的同定と酵素の機能構造解析や誘導前後のアミノ酸動態の解析を通じて、アーキアにおいてD-アミノ酸がどのような生理作用を示すのかを明らかにする。

研究成果の概要

本研究では、遺伝子発現解析やEMSA解析、エックス線結晶構造解析などを用いて、超好熱アーキアPyrococcus horikoshii OT3におけるアミノ酸ラセマーゼ(BAR)の発現誘導メカニズムの解明を試み、D-アミノ酸が転写因子と結合することで遺伝子発現を制御していることを見出した。このことはD-アミノ酸がアーキアにおいて生理活性物質として機能することを示す初めての成果である。

研究成果の学術的意義や社会的意義

今回の研究で、超好熱アーキアがD-アミノ酸を生理機能物質として利用していることを初めて明らかにした。D-アミノ酸の生体内における生理機能はヒトなどの高等生物やバクテリアにおいても知られており、アーキアの中でも共通祖先に近いとされる超好熱アーキアでのD-アミノ酸機能の発見は進化の観点からも興味深い。今後のD-アミノ酸研究の新たな基盤づくりに貢献できたと考えている。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Crystal structure of a novel type of ornithine δ-aminotransferase from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii2022

    • 著者名/発表者名
      Kawakami Ryushi、Ohshida Tatsuya、Hayashi Junji、Yoneda Kazunari、Furumoto Toshio、Ohshima Toshihisa、Sakuraba Haruhiko
    • 雑誌名

      International Journal of Biological Macromolecules

      巻: 208 ページ: 731-740

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2022.03.114

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] PH0140転写因子によるアミノ酸ラセマーゼ遺伝子クラスターの発現制御2022

    • 著者名/発表者名
      川上竜巳、河瀬智紀、上原太良、櫻庭春彦、大島敏久
    • 学会等名
      極限環境生物学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 超好熱アーキアPyrococcus horikoshii のD-アミノ酸培養における遺伝子発現解析2022

    • 著者名/発表者名
      河瀬智紀、佐藤樹夫、川上竜巳
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本・中四国・関西支部合同大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 放線菌 Rhodococcus opacus B4株由来 L-アミノ酸オキシダーゼの大腸菌発現と機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      佐藤樹夫、河瀬智紀、川上竜巳
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本・中四国・関西支部合同大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 超好熱アーキアPyrococcus horikoshii におけるL-Ile/D-allo-Ileによるアミノ酸ラセマーゼ遺伝子の発現制御2022

    • 著者名/発表者名
      川上竜巳、河瀬智紀、佐藤樹夫、櫻庭春彦、大島敏久
    • 学会等名
      極限環境生物学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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