| 研究課題/領域番号 |
20K06102
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(C)
|
| 配分区分 | 基金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 審査区分 |
小区分39060:生物資源保全学関連
|
|---|
| 研究機関 | 国立研究開発法人国立環境研究所 |
|---|
研究代表者 |
深谷 肇一 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 主任研究員 (30708798)
|
|---|
| 研究分担者 |
今藤 夏子 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 主任研究員 (10414369)
角谷 拓 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 室長 (40451843)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2023-03-31
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2022年度)
|
| 配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2022年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2021年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2020年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
|
|---|
| キーワード | 環境DNAメタバーコーディング / サイト占有モデル / 調査設計 / 魚類群集 |
|---|
| 研究開始時の研究の概要 |
野外において生息種を網羅的に把握するための新しい観測手法として、環境DNAメタバーコーディングが広く利用され始めている。本研究では、環境DNAメタバーコーディングにおける偽陰性の種検出誤差に適切に対処し、正確かつ効率的に種多様性の評価・予測を行うための統計的な枠組みを構築する。提案手法を淡水魚類を対象とした環境DNAメタバーコーディングデータに適用してその有効性を検証するとともに、提案手法を実装したプログラム群を一般に公開し、検出誤差に頑健な環境DNAメタバーコーディングの普及を目指す。
|
| 研究成果の概要 |
環境DNAメタバーコーディングは、多数の種の分布データを効率的に収集できる環境DNA分析の技術である。しかし、本手法の応用において生じる種検出の誤差（偽陰性と偽陽性）は得られるデータの解釈を困難にしており、信頼性の高い調査を実現するためには種検出の誤差に対処するための手法開発が求められる。本研究では環境DNAメタバーコーディングにおける偽陰性の種検出誤差に着目し、これに適切に対処し、正確かつ効率的に種多様性の評価・予測を行うための統計的手法を構築した。また、それを簡便に利用するためのソフトウェアを開発した。
|
| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
生物多様性の保全において、野外の種多様性を定量的に把握・監視することは重要である。しかし、そのための生態調査は高価かつ侵襲的であることが多く、効率的な保全計画の実現を困難なものにしている。環境DNAメタバーコーディングはこの問題に対する解決策として大きな可能性を秘めているが、解決すべき技術的課題も残されており、種の検出誤差の問題はその1つである。偽陰性を踏まえた種多様性評価のためのデータ解析手法を提供する本研究は、環境DNAメタバーコーディングを検出誤差に対して頑健な手法に変えることで、その費用対効果と信頼性の向上に貢献する。
|
