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ATP 合成酵素のプロトン駆動力から回転エネルギーへの変換機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K06514
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

岸川 淳一  大阪大学, 蛋白質研究所, 助教 (80599241)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2020年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード回転分子モーター / V-ATPase / クライオ電子顕微鏡 / 単粒子解析 / 膜タンパク質 / ATP 合成酵素 / 低温電子顕微鏡
研究開始時の研究の概要

ATP 合成酵素はプロトンの濃度勾配を回転エネルギーに変換することで、その機能を発揮している。エネルギーの変換を担う膜内在性部分の構造解析をすることで、そのメカニズムを明らかにする。
調製した ATP 合成酵素の膜内在性部分の単粒子解析によって、その詳細構造の解明を目指す。また、複数状態の構造を明らかにすることで、ATP 合成酵素の反応メカニズムに迫る。

研究成果の概要

ATP合成酵素は、生体膜の内外に形成されたプロトン駆動力を回転エネルギーに変換することで、ATPを合成する。この酵素がどのようにプロトン駆動力を回転エネルギーに変換しているかは未だに不明である。本研究では、好熱菌由来ATP合成酵素を材料として、その高分解能構造からエネルギー変換機構の解明を目的とする。
クライオ電子顕微鏡を用いた単粒子解析により、ATP合成酵素の膜内在性ドメインの高分解能構造を得た。得られた構造から、プロトン輸送に重要な残基のプロトン化状態を明らかにすることができた。現在、得られた構造をもとに、分子シミュレーションを行うことで、エネルギー変換機構について議論を行っている。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ATP合成酵素は、ATPの合成とプロトン輸送を回転によって共役するユニークなタンパク質である。親水性部分でATPの合成、膜内在性部分でイオンの輸送を行う。親水性部分は、一分子回転観察などにより詳細に調べられている。一方で、膜内在性でのプロトン輸送機構は不明な点が多かった。本研究で得られた知見は、この輸送機構の原子レベルでの解明に光を当てるものであり、学術的な意義が深い。また、回転分子モーターは非常に精密な機械と捉えることもでき、その機構が分かることは、生物工学的にも興味深い。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2023 2022 2020

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 2件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Cryo-EM analysis of V/A-ATPase intermediates reveals the transition of the ground-state structure to steady-state structures by sequential ATP binding2023

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi Atsuko、Kishikawa Jun-ichi、Mitsuoka Kaoru、Yokoyama Ken
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 号: 2 ページ: 102884-102884

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.102884

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of MotA, a flagellar stator protein, from hyperthermophile2023

    • 著者名/発表者名
      Tatsuro Nishikino, Norihiro Takekawa, Duy Phuoc Tran, Jun-ichi Kishikawa, Mika Hirose, Sakura Onoe, Seiji Kojima, Michio Homma, Akio Kitao, Takayuki Kato and Katsumi Imada
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 631 ページ: 78-85

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.09.072

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cryo-EM structures of Na+-pumping NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae2022

    • 著者名/発表者名
      Kishikawa Jun-ichi、Ishikawa Moe、Masuya Takahiro、Murai Masatoshi、Kitazumi Yuki、Butler Nicole L.、Kato Takayuki、Barquera Blanca、Miyoshi Hideto
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 4082-4082

    • DOI

      10.1038/s41467-022-31718-1

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structures of multisubunit membrane complexes with the CRYO ARM 2002022

    • 著者名/発表者名
      Gerle Christoph、Kishikawa Jun-ichi、Yamaguchi Tomoko、Nakanishi Atsuko、?oruh Orkun、Makino Fumiaki、Miyata Tomoko、Kawamoto Akihiro、Yokoyama Ken、Namba Keiichi、Kurisu Genji、Kato Takayuki
    • 雑誌名

      Microscopy

      巻: 71 号: 5 ページ: 249-261

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfac037

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural basis of unisite catalysis of bacterial F0F1-ATPase2022

    • 著者名/発表者名
      Nakano Atsuki、Kishikawa Jun-ichi、Nakanishi Atsuko、Mitsuoka Kaoru、Yokoyama Ken
    • 雑誌名

      PNAS Nexus

      巻: 1 号: 3

    • DOI

      10.1093/pnasnexus/pgac116

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural snapshots of V/A-ATPase reveal the rotary catalytic mechanism of rotary ATPases2022

    • 著者名/発表者名
      Kishikawa J.、Nakanishi A.、Nakano A.、Saeki S.、Furuta A.、Kato T.、Mistuoka K.、Yokoyama K.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 1213-1213

    • DOI

      10.1038/s41467-022-28832-5

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Single particle cryo-EM of prokaryotic V/A-ATPase during catalytic cycle2022

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Kishikawa
    • 学会等名
      48th Indian Biophysical Society Meeting
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Structural snapshots of V/A-ATPase reveal the rotary catalytic mechanism of rotary ATPases2022

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Kishikawa, Atsuko Nakanishi, Atsuki Nakano, Ken Yokoyama
    • 学会等名
      第60回 日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Mechanical inhibition of isolated Vo from V/A-ATPase for proton conductance.2020

    • 著者名/発表者名
      岸川淳一、中西温子、古田綾、加藤貴之、難波啓一、玉腰雅忠、光岡薫、横山謙
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 好熱菌 V 型 ATPase の 単粒子解析から分かってきたこと2020

    • 著者名/発表者名
      岸川淳一
    • 学会等名
      第10回分子モーター討論会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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