• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

時分割X線結晶構造解析によるアクチンATP加水分解反応の活写

研究課題

研究課題/領域番号 20K06522
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関岡山大学

研究代表者

武田 修一  岡山大学, 異分野基礎科学研究所, 特任助教 (50509081)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードアクチン / ATP加水分解 / X線結晶構造解析 / 細胞骨格 / 時分割結晶構造解析
研究開始時の研究の概要

アデノシン3リン酸 (ATP) は生体で最も普遍的なエネルギー貯蔵分子であり、その加水分解機構を原子構造レベルで理解することは極めて重要な課題である。真核生物の細胞骨格タンパク質アクチンは、繊維体への重合に伴い結合ATPを加水分解することで、ダイナミックな性質を示す。本研究では結晶中におけるアクチンATP加水分解を時分割X線構造解析で捉え、その反応過程を活写することを目標とする。

研究実績の概要

アクチン繊維は、ATP加水分解によってダイナミックに重合・脱重合を繰り返すことで、細胞運動の駆動力を産む。繊維中のアクチン分子は単量体(globular: G型)とは異なるF(filament)型コンフォメーションを取り(Oda, Nature, 2009)、ATP加水分解はF型アクチンのみで起こる。近年のクライオ電子顕微鏡技術の発展によって、3.1オングストローム分解能のアクチン繊維構造が報告されている(Merino, Nat Struct Mol Biol, 2018; Chou, PNAS, 2019)。しかしこれらの“近原子分解能”構造では、加水分解反応の肝である水分子は同定できない。タンパク質中の水分子位置の判別にはX線結晶構造解析が適しているが、その不定長の繊維に会合する性質ゆえ、これまでアクチン繊維の単結晶化は不可能であった。申請者は最近アクチン結合タンパク質との共結晶化によって、F型アクチンの高分解能結晶構造を決定することに成功した。本研究ではこの系を用いて、時分割X線結晶構造解析法によってアクチンATP加水分解を結晶中で捉えることを最終目標とする。ATPは生体内で最も普遍的に利用されているエネルギー通貨であり、その加水分解反応機構の解明はアクチン研究分野に留まらず、物質代謝や核酸合成など、細胞内で起こるATPをエネルギー源とする化学反応全般を理解する上で非常に重要である。また、F型アクチンシステムを利用して、アクチンATP加水分解反応に関して幅広い知見を得ることも目的とする。本年度はカルシウムイオンを配位したF型アクチンの結晶構造解析を試みた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

本年度においては細胞内に豊富に存在するマグネシウムイオンではなく、カルシウムイオンを配位したアクチンの結晶構造解析を行なったところ、興味深い構造変化が観察された。

今後の研究の推進方策

今後の目標として、異なるカチオン配位アクチン構造の同定を試み、さらにアクチン結晶中でのATP加水分解反応を経時的に観察する試みにも挑む予定である。

報告書

(4件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2024 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Mutagenic analysis of actin reveals the mechanism of His161 flipping that triggers ATP hydrolysis2023

    • 著者名/発表者名
      Iwasa Mitsusada、Takeda Shuichi、Narita Akihiro、Ma?da Yuichiro、Oda Toshiro
    • 雑誌名

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      巻: 11 ページ: 1105460-1105460

    • DOI

      10.3389/fcell.2023.1105460

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural and biochemical evidence for the emergence of a calcium-regulated actin cytoskeleton prior to eukaryogenesis2022

    • 著者名/発表者名
      Akil Caner、Tran Linh T.、Orhant-Prioux Magali、Baskaran Yohendran、Senju Yosuke、Takeda Shuichi、Chotchuang Phatcharin、Muengsaen Duangkamon、Schulte Albert、Manser Edward、Blanchoin Laurent、Robinson Robert C.
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 5 号: 1 ページ: 890-890

    • DOI

      10.1038/s42003-022-03783-1

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structures and mechanisms of actin ATP hydrolysis2022

    • 著者名/発表者名
      Kanematsu Yusuke、Narita Akihiro、Oda Toshiro、Koike Ryotaro、Ota Motonori、Takano Yu、Moritsugu Kei、Fujiwara Ikuko、Tanaka Kotaro、Komatsu Hideyuki、Nagae Takayuki、Watanabe Nobuhisa、Iwasa Mitsusada、Ma?da Yuichiro、Takeda Shuichi
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 119 号: 43

    • DOI

      10.1073/pnas.2122641119

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Crystal structure of human V-1 in the apo form2021

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Takeda, Ryotaro Koike, Takayuki Nagae, Ikuko Fujiwara, Akihiro Narita, Yuichiro Maeda, Motonori Ota
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr F Struct Biol Commun

      巻: 77 号: 1 ページ: 13-21

    • DOI

      10.1107/s2053230x20016829

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insights into the regulation of actin capping protein by twinfilin C-terminal tail2021

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Takeda, Ryotaro Koike, Ikuko Fujiwara, Akihiro Narita, Makoto Miyata, Motonori Ota and Yuichiro Maeda
    • 雑誌名

      J Mol Biol

      巻: 433 号: 9 ページ: 166891-166891

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2021.166891

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] BL2S1で明らかとなった細胞骨格タンパク質アクチンの高精細構造2024

    • 著者名/発表者名
      武田修一
    • 学会等名
      第12回名古屋大学シンクロトロン光研究センターシンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ゲルゾリンタンパク質フラグミンによるアクチン繊維切断機構2024

    • 著者名/発表者名
      武田修一, Linh T. Tran, 小田俊郎, 渡邉信久, 永江峰幸, 藤原郁子, Robert C. Robinson, 成田哲博, 前田雄一郎
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議 2024
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] F型アクチン結晶構造解析から明らかとなったATP加水分解機構2022

    • 著者名/発表者名
      4.兼松 佑典, 成田 哲博, 小田 俊郎, 小池 亮太郎,  太田 元規, 鷹野 優, 森次 圭, 藤原 郁子, 田中 康太郎, 小松 英幸, 永江 峰幸, 渡邉 信久, 岩佐 充貞, 前田 雄一郎, 武田 修一
    • 学会等名
      令和4年(2022年)度日本結晶学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] X線小角散乱および単結晶解析で探るアクチン繊維切断タンパク質フラグミンの作用機序2022

    • 著者名/発表者名
      武田修一, 杉本泰信, 小田俊郎
    • 学会等名
      第10回名古屋大学シンクロトロン光研究センターシンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ツインフィリン C末端尾部によるアクチンキャッピングタンパク質制御機構2022

    • 著者名/発表者名
      武田 修一, 小池 亮太郎, 藤原 郁子, 成田 哲博, 宮田 真人, 太田元規, 前田 雄一郎
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議2022
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ツインフィリン C末端尾部によるアクチンキャッピングタンパク質制御機構2021

    • 著者名/発表者名
      武田 修一, 小池 亮太郎, 藤原 郁子, 成田 哲博, 宮田 真人, 太田元規, 前田 雄一郎
    • 学会等名
      令和3年度日本結晶学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi