研究課題/領域番号 |
20K06523
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分43020:構造生物化学関連
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研究機関 | 京都大学 |
研究代表者 |
三木 邦夫 京都大学, 理学研究科, 名誉教授 (10116105)
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研究分担者 |
藤橋 雅宏 京都大学, 理学研究科, 助教 (10397581)
玉田 太郎 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学領域, グループリーダー(定常) (50391248)
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研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2025-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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配分額 *注記 |
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2021年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
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キーワード | 電子伝達タンパク質 / 精密構造解析 / 中性子線回折 / 放射光X線回折 / 電荷密度解析 |
研究開始時の研究の概要 |
タンパク質の反応メカニズムをその電子構造にもとづいて理解することを目的として,放射光と中性子線を連携利用した電子伝達タンパク質の高分解能精密構造解析を行い,その方法論の確立と汎用化を目指す.光合成電子伝達系や肝ミクロソーム電子伝達系ではたらくタンパク質を対象に,タンパク質の機能に直結する電子構造を明らかにする構造解析技術を確立して,それぞれのタンパク質が担う化学反応の直接的な理解を深める.
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研究実績の概要 |
電子伝達タンパク質を対象に,放射光X線と中性子線の併用によって,両者の特徴を活かして融合させた高分解能・高精度の精密構造解析を行い,それぞれのタンパク質での電子伝達機構に直接かかわる水素原子や外殻電子の挙動を明らかにすることを目指した. 光合成細菌で反応中心複合体への電子伝達を担う高電位鉄イオウタンパク質(HiPIP)については,これまで得られた中性子回折データを用いた精密化を行った.構造精密化プログラム,SHELXLを用いて水素原子を含めた構造精密化を行い,0.9A分解能の中性子構造を明らかにした.また,同一結晶を用いて,SPring-8のBL41XUにおいて波長0.35AでのX線回折データ測定を行い,0.56A分解能のX線データの取得に成功した.これらの結果,タンパク質中の水素原子の分極を明らかにして,このタンパク質の重要な機能である酸化還元反応の新たな側面を理解することが可能になった. 肝ミクロソームの電子伝達系ではたらくNADH-シトクロムb5還元酵素(b5R)については,論文作成に向けて酸化還元タンパク質におけるヒドリドおよびプロトン移動反応について研究動向を調査し,b5Rにおける移動反応に重要な立体構造の要因を検証した.また,b5Rの電子伝達パートナーであるシトクロムb5については,酸化型の良質な大型結晶を得ることに成功し,研究用原子炉JRR-3における中性子回折実験を行い,1.8A分解能の回折点を確認することができた.
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
コロナ禍の影響による当初計画からの遅れは,回折データ測定などについて,研究計画の実施方法の修正なども行った結果,概ね取り戻すことができた.
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今後の研究の推進方策 |
当初の研究計画を遂行して,研究目的を達成できるよう,実験内容の修正,調整も行って,円滑に研究を推進する.
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