研究課題/領域番号 |
20K06523
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分43020:構造生物化学関連
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研究機関 | 京都大学 |
研究代表者 |
三木 邦夫 京都大学, 理学研究科, 名誉教授 (10116105)
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研究分担者 |
藤橋 雅宏 京都大学, 理学研究科, 助教 (10397581)
玉田 太郎 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学領域, グループリーダー(定常) (50391248)
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研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2021年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
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キーワード | 電子伝達タンパク質 / 精密構造解析 / 中性子線回折 / 放射光X線回折 / 電荷密度解析 |
研究開始時の研究の概要 |
タンパク質の反応メカニズムをその電子構造にもとづいて理解することを目的として,放射光と中性子線を連携利用した電子伝達タンパク質の高分解能精密構造解析を行い,その方法論の確立と汎用化を目指す.光合成電子伝達系や肝ミクロソーム電子伝達系ではたらくタンパク質を対象に,タンパク質の機能に直結する電子構造を明らかにする構造解析技術を確立して,それぞれのタンパク質が担う化学反応の直接的な理解を深める.
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研究実績の概要 |
二種の電子伝達タンパク質を対象に,放射光X線と中性子線を併用した高分解能・高精度の精密構造解析を行い,それぞれの構造における水素原子や外殻電子の振る舞いを明らかにすることで,タンパク質の機能の直接的理解を目指した. 光合成細菌で反応中心複合体への電子伝達を担う高電位鉄イオウタンパク質(HiPIP)については,これまで得られていた分解能を上回る中性子回折データの取得を目指した測定を行った.2021年に運転再開した研究用原子炉JRR-3において,より高分解能の中性子回折データが収集できるよう改良した生体高分子用回折装置BIX-3を用いて測定を行い,昨年度報告した解析結果における1.2A分解能を大幅に上回る0.9A分解能の回折データの収集に成功した.新たに取得した回折データを用いて構造解析・構造精密化を行い,得られた構造の検討を進めている. 肝ミクロソームの電子伝達系ではたらくNADH-シトクロムb5還元酵素(b5R)については,b5Rの関与する酸化還元反応サイクルにおける酸化型の中性子結晶構造解析,および還元型のX線結晶構造解析を継続し,それぞれの構造精密化を完了した.その結果,高分解能中性子構造解析では,異なるpH(pD)において,FADからタンパク質表面への水素結合ネットワークでのプロトン化に違いがあることが明らかになり,酸化型の安定化に寄与する補因子周辺の水素結合の詳細を明らかにすることができた.また還元型の高分解能X線構造解析では,補因子に結合する水素原子の電子密度の観測に成功し,ヒドリド移動に重要な補因子の詳細な立体構造情報を得ることができた.
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
これまでのコロナ禍の影響を受けて,回折データ測定については当初計画からの遅れは完全には取り戻せていないが,研究計画の実施方法の修正などにより,当初計画に近い進捗状況にすることができた.
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今後の研究の推進方策 |
当初の研究計画を遂行できるように,実験内容の修正も含めて,円滑な研究推進を行う予定である.
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