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高機能ペプチドとAFM分子計測・操作による増殖因子受容体の活性化機構の解明と制御

研究課題

研究課題/領域番号 20K06553
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43030:機能生物化学関連
研究機関金沢大学

研究代表者

酒井 克也  金沢大学, がん進展制御研究所, 准教授 (10523318)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード受容体 リガンド / 環状ペプチド / mRNA display / タンパク質工学 / HS-AFM / HGF-MET / 受容体 / サイトカイン・増殖因子 / タンパク質エンジニアリング / NASH / lasso-graft / ペプチド / AFM / 抗体改変 / 高機能ペプチド / 増殖因子
研究開始時の研究の概要

本研究は、HGF-MET受容体を標的分子例として、高速原子間力顕微鏡 (高速AFM) の1分子動態計測・操作と高機能環状ペプチドを増殖因子-受容体研究に展開することで、従来の研究法、技術では困難であった受容体活性化の分子機構の解明と受容体の人為制御を達成することを計画している。次の3つの研究を行う。1)MET活性化の構造基盤解明とがん病態との関連、2)環状ペプチド固相化AFMプローブによる受容体の空間力学制御、3)分子ツールと治療を志向した環状ペプチド提示抗体による受容体制御。

研究成果の概要

増殖因子受容体活性化の構造基盤の解明と高度な受容体制御を達成するために、以下の研究を進めた。1)生細胞膜上で短時間ごく微量に形成される増殖因子ー受容体のnativeな活性複合体の構造を解析するために、native複合体を化学架橋によって固定し分離精製する系を確立し、AFM観察およびクライオ電子顕微鏡による高解像度の構造解析を進めている。2)環状ペプチド固相化AFMプローブを使用して非標識受容体をリアルタイムかつ実空間で認識する方法を検証し開発した。3)抗体Fcのループ構造に受容体結合環状ペプチドを提示することで、半減期が長い、血液脳関門を通過する増殖因子ミメティックの作成を可能にした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

1) 本研究で確立した手法はこれまで困難であった受容体活性化複合体の構造解析を可能にし、この構造情報は創薬などに役立つと考えられる。2) タンパク質結合環状ペプチドを固定したプローブを用いたHS-AFMによって非標識タンパク質をリアルタイムかつ実空間で認識する方法は、nativeな状態で分子認識を可能にし、広範な応用が考えられる。3) 受容体結合環状ペプチドを抗体Fc内に提示することによって血中半減期が短い、脳内に到達しないといった増殖因子の欠点を克服する増殖因子ミメティックの作成を可能にした。この成果は増殖因子の治療適応を拡大する技術基盤となると考えられる。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 4件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 3件、 招待講演 6件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] A feedback loop between lamellipodial extension and HGF-ERK signaling specifies leader cells during collective cell migration2022

    • 著者名/発表者名
      Hino Naoya、Matsuda Kimiya、Jikko Yuya、Maryu Gembu、Sakai Katsuya、Imamura Ryu、Tsukiji Shinya、Aoki Kazuhiro、Terai Kenta、Hirashima Tsuyoshi、Trepat Xavier、Matsuda Michiyuki
    • 雑誌名

      Developmental Cell

      巻: 57 号: 19 ページ: 2290-2304

    • DOI

      10.1016/j.devcel.2022.09.003

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Designing receptor agonists with enhanced pharmacokinetics by grafting macrocyclic peptides into fragment crystallizable regions2022

    • 著者名/発表者名
      Sakai Katsuya、Sugano-Nakamura Nozomi、Mihara Emiko、Rojas-Chaverra Nichole Marcela、Watanabe Sayako、Sato Hiroki、Imamura Ryu、Voon Dominic Chih-Cheng、Sakai Itsuki、Yamasaki Chihiro、Tateno Chise、Shibata Mikihiro、Suga Hiroaki、Takagi Junichi、Matsumoto Kunio
    • 雑誌名

      Nature Biomedical Engineering

      巻: 7 号: 2 ページ: 164-176

    • DOI

      10.1038/s41551-022-00955-6

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Macrocyclic Peptide-Conjugated Tip for Fast and Selective Molecular Recognition Imaging by High-Speed Atomic Force Microscopy2021

    • 著者名/発表者名
      L. Pupplin, D. Kanayama, N. Terasaka, K. Sakai, N. Kodera, K. Umeda, A. Sumino, M. Arin, W. Wei, H. Tanaka, T. Fukuma, H. Suga, K. Matsumoto, M. Shibata
    • 雑誌名

      ACS Applied Materials & Interfaces

      巻: 13(46) 号: 46 ページ: 54817-54829

    • DOI

      10.1021/acsami.1c17708

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] De novo peptide grafting to a self-assembling nanocapsule yields a hepatocyte growth factor receptor agonist2021

    • 著者名/発表者名
      Komatsu Yamato、Terasaka Naohiro、Sakai Katsuya、Mihara Emiko、Wakabayashi Risa、Matsumoto Kunio、Hilvert Donald、Takagi Junichi、Suga Hiroaki
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 24 号: 11 ページ: 103302-103302

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.103302

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dimer interface in natural variant NK1 is dispensable for HGF-dependent Met receptor activation.2021

    • 著者名/発表者名
      Yumiko Tahira, Katsuya Sakai, Hiroki Sato, Ryu Imamura, and Kunio Matsumoto
    • 雑誌名

      Int. J. Mol. Sci.

      巻: 22 号: 17 ページ: 9240-9240

    • DOI

      10.3390/ijms22179240

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Lasso-grafting of macrocyclic peptide pharmacophores yields multi-functional proteins2021

    • 著者名/発表者名
      Mihara E, Watanabe S, Bashiruddin N, Nakamura N, Matoba K, Maini R, Yin Y, Sakai K, Arimori T, Matsumoto K, Suga H, and Takagi J.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 1543-1543

    • DOI

      10.1038/s41467-021-21875-0

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The constitutive high affinity Met binding site in the kringle domain is dispensable for the signaling activity of hepatocyte growth factor.2020

    • 著者名/発表者名
      Umitsu M, Sakai K, Tamura-Kawakami K, Matsumoto K, Takagi J.
    • 雑誌名

      JOURNAL OF BIOCHEMISTRY

      巻: - 号: 6 ページ: 577-586

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa006

    • NAID

      40022260383

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Proteasomal degradation of polycomb-group protein CBX6 confers MMP-2 expression essential for mesothelioma invasion2020

    • 著者名/発表者名
      Sakai Katsuya、Nishiuchi Takumi、Tange Shoichiro、Suzuki Yoshinori、Yano Seiji、Terashima Minoru、Suzuki Takeshi、Matsumoto Kunio
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 16678-16678

    • DOI

      10.1038/s41598-020-72448-y

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cyclic Peptide-Based Biologics Regulating HGF-MET.2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Sato, Ryu Imamura, Hiroaki Suga, Kunio Matsumoto, Katsuya Sakai
    • 雑誌名

      International journal of molecular sciences

      巻: 21 号: 21 ページ: 7977-7977

    • DOI

      10.3390/ijms21217977

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Expanding therapeutic potential of growth factors by lasso-grafting.2022

    • 著者名/発表者名
      Sakai K, Rojas-Chaverra NM, Sato H, Imamura R, Voon CCD, Suga H, Takagi J, Matsumoto K.
    • 学会等名
      Duke-NUS-KUCRI Junior Staff Meeting
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ラッソグラフトを用いた人工成長因子による治療可能性の拡大2022

    • 著者名/発表者名
      酒井克也, Rojas-Chaverra NM, 揚山直英, 片貝祐子, 高木淳一, 菅裕明, 松本邦夫
    • 学会等名
      霊長類医科学フォーラム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 環状ペプチドファルマコフォア内挿型の組換えアゴニストによる組織再生治療の試み2021

    • 著者名/発表者名
      酒井克也, 三原恵美子,中村希,渡邉咲耶子,佐藤拓輝,今村龍,菅裕明,高木淳一,松本邦夫
    • 学会等名
      第94回生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Peptide-grafted Proteins and Nanometorology for Targeting and Understanding of Growth Factor Receptor2020

    • 著者名/発表者名
      酒井克也
    • 学会等名
      1st WPI NanoLSI-iCeMS Joint Symposium
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] MET受容体の人為制御と構造基盤2020

    • 著者名/発表者名
      酒井克也, 高木淳一, 菅裕明, 柴田幹大, 松本邦夫
    • 学会等名
      第93回 日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 環状ペプチドとタンパク質エンジニアリングに基づく人工Met受容体アゴニスト2020

    • 著者名/発表者名
      酒井克也
    • 学会等名
      第15回生命医科学研究所ネットワーク国際シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [産業財産権] 人工タンパク質及び医薬組成物2022

    • 発明者名
      佐古佑介,平井秀憲,松本邦夫,酒井克也
    • 権利者名
      佐古佑介,平井秀憲,松本邦夫,酒井克也
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-11-21  

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