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近赤外光適応型酸素発生光合成の多様性と機構の解明、理論解析

研究課題

研究課題/領域番号 20K06684
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関名古屋大学

研究代表者

伊藤 繁  名古屋大学, 理学研究科, 名誉教授 (40108634)

研究分担者 木村 明洋  名古屋大学, 理学研究科, 助教 (20345846)
井原 邦夫  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 准教授 (90223297)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 完了 (2024年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2023年度: 260千円 (直接経費: 200千円、間接経費: 60千円)
2022年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードphotosynthesis / oxygen evolution / far red light / chlorophyll d / chlorophyll f / reaction center / photosynthesis model / theoretical model / 光合成 / クロロフィルf / クロロフィルd / クロロフィルa / 近赤外光 / 理論モデル / 光反応 / シアノバクテリア / 光合成反応中心 / 酸素発生 / クロロフィルーf / クロロフィルーd / 構造決定 / 励起子理論 / クロロフィル / 励起エネルギー移動 / 励起子理論モデル / 遠赤外光合成 / 蛍光寿命 / 光合成細菌 / 光化学系Ⅰ反応中心 / 光エネルギー利用 / 励起エネルギー移動理論 / 進化 / 環境適応 / タンパク質構造決定
研究開始時の研究の概要

近年発見された、 Chl a(クロロフィルa)より長波長に吸収帯をもつ① Chl d, ②Chl f, ③会合型Chl a (red-Chl a)色素(図1)のいずれかにより、700-800nmの近赤外光だけでも光合成可能なシアノバクテリア、藻類、コケの「近赤外光を使う酸素発生型光合成(FR-O2型光合成)」の光反応機構を検討する。生化学、生物物理的解析、ピコ秒レーザ分光実験などを行い、励起子理論モデルを用いて理論解析する。さらに広範な「FR-O2型光合成系」を調べ、従来の可視光型光合成との違い、多様性、変動範囲、限界を確認し、その「秘められた能力」を理解して応用を考える。

研究成果の概要

植物とシアノバクテリアの行う酸素発生光合成は、可視光のエネルギーを利用し、生命の使うほぼ全エネルギーを供給する。H2Oを可視光のエメルギーで分解し、副産物O2を大気中に放出し、取り出した電子でCO2を生命中に固定して、生命活動を支える。しかし近年、常識を覆す近赤外光のみで酸素発生をする光合成系が、我々も関わり発見された。これらは新型色素クロロフィルdやf(Chl d, Chl f)を使う。
新型dーf型反応中心を対象に実験と理論両面から研究を進めた。理論家と協力し、「反応中心の理論モデル」を分子構造に基づき作成し、「なぜ、この構造が必要なのか?」を理論モデルも使い検討した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

植物の行う酸素発生型光合成では,クロロフィルa(Chl a)が吸収する可視光が必要である。しかし近年、我々も発見にかかわったクロロフィルd(Chl d)を使う系や、Chl f を使う酸素発生光合成は エネルギーの低い近赤外光(FR光)で、同じことができる。Chl f やChl dを使う光合成系の構造と作動原理をしらべた。分子構造を利用して、計算機内に、50-100分子のChlを内部にもつ光合成分子モデルを作成し、理論的にしらべた。この結果は、光合成の作動原理の理解に新しい概念をあたえ、光合成生物の生息域の推定や、人工光合成系の設計などにも役だつ。

報告書

(6件)
  • 2024 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (43件)

すべて 2025 2024 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 2件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (34件) (うち国際学会 14件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Key Chlorophyll a Molecules in the Uphill Energy Transfer from Chlorophyll f to P700 in Far-Red Light-Adapted Photosystem I2025

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Yuka、Okochi Mikihito、Itoh Shigeru、Kimura Akihiro
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 129 号: 2 ページ: 599-610

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.4c05007

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Experimental and Theoretical Mutation of Exciton States on the Smallest Type-I Photosynthetic Reaction Center Complex of a Green Sulfur Bacterium Chlorobaclum tepidum2024

    • 著者名/発表者名
      Kimura Akihiro、Kitoh-Nishioka Hirotaka、Kondo Toru、Oh-oka Hirozo、Itoh Shigeru、Azai Chihiro
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 128 号: 3 ページ: 731-743

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c07424

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書 2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Theoretical Model of the Far-Red-Light-Adapted Photosystem I Reaction Center of Cyanobacterium <i>Acaryochloris marina</i> Using Chlorophyll <i>d</i> and the Effect of Chlorophyll Exchange2022

    • 著者名/発表者名
      Kimura Akihiro、Kitoh-Nishioka Hirotaka、Aota Toshimichi、Hamaguchi Tasuku、Yonekura Koji、Kawakami Keisuke、Shinzawa-Itoh Kyoko、Inoue-Kashino Natsuko、Ifuku Kentaro、Yamashita Eiki、Kashino Yasuhiro、Itoh Shigeru
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 126 号: 22 ページ: 4009-4021

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.2c00869

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Exciton quenching by oxidized chlorophyll Z across the two adjacent monomers in a photosystem II core dimer.2022

    • 著者名/発表者名
      Ahmed Mohamed, Shunsuke Nishi, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Shigeru Itoh, Hiroshi Fukumura, Yutaka Shibata
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: 154 号: 3 ページ: 277-289

    • DOI

      10.1007/s11120-022-00948-1

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Comparative genomic analysis of the marine cyanobacterium Acaryochloris marina MBIC10699 reveals the impact of phycobiliprotein reacquisition and the diversity of Acaryochloris plasmids2022

    • 著者名/発表者名
      Haruki Yamamoto, Kazuma Uesaka, Yuki Tsuzuki, Hisanori Yamakawa, Shigeru Itoh, Yuichi Fujita
    • 雑誌名

      Microorganisms

      巻: 10(7) 号: 7 ページ: 1374-1374

    • DOI

      10.3390/microorganisms10071374

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Effects of light and oxygen on chlorophyll d biosynthesis in a marine cyanobacterium Acaryochloris marina.2022

    • 著者名/発表者名
      Yuki Tsuzuki, Yusuke Tsukatani, Hisanori Yamakawa, Shigeru Itoh, Yuichi Fujita, and Haruki Yamamoto
    • 雑誌名

      Plants

      巻: 11 号: 7 ページ: 915-915

    • DOI

      10.3390/plants11070915

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Direct Energy Transfer from Allophycocyanin-Free Rod-Type CpcL-Phycobilisome to Photosystem I2021

    • 著者名/発表者名
      Tomoyasu Noji, Mai Watanabe, Takehisa Dewa, Shigeru Itoh, Masahiko Ikeuchi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. Lett.

      巻: 12 号: 28 ページ: 6692-6697

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.1c01763

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure of the far-red light utilizing photosystem I of Acaryochloris marina2021

    • 著者名/発表者名
      Hamaguchi Tasuku、Kawakami Keisuke、Shinzawa-Itoh Kyoko、Inoue-Kashino Natsuko、Itoh Shigeru、Ifuku Kentaro、Yamashita Eiki、Maeda Kou、Yonekura Koji、Kashino Yasuhiro
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 2333-2333

    • DOI

      10.1038/s41467-021-22502-8

    • NAID

      120007032350

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comparison between the Light-Harvesting Mechanisms of Type-I Photosynthetic Reaction Centers of Heliobacteria and Photosystem I: Pigment Site Energy Distribution and Exciton State2021

    • 著者名/発表者名
      Kimura Akihiro、Kitoh-Nishioka Hirotaka、Shigeta Yasuteru、Itoh Shigeru
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 125 号: 15 ページ: 3727-3738

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.0c09400

    • NAID

      120007175366

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Theoretical analysis of the light-harvesting process in C. thermophilum type-I reaction center that binds three different species of chlorophyll molecules2024

    • 著者名/発表者名
      Shimooka, W.; Kitoh-Nishioka, H.; Itoh S.; Kimura, A
    • 学会等名
      IUPAB 2024(国際学会)
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Molecular Docking Simulations at Quinone Binding Site in Photosynthetic Reaction Centers2024

    • 著者名/発表者名
      Takagi, A.; Itoh, S.; Kimura, A.; Kitoh, H
    • 学会等名
      UPAB 2024(国際学会)
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparison of PSI and bacterial type-I RCs by theoretical studies of exciton states and quinone docking simulation2024

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Itoh, Hirotaka Kitoh-Nishioka, Ayumu Takagi, Akihiro Kimura
    • 学会等名
      2nd Asia-Oceania International Congress on Photosynthesis (AOICP)(国際学会)
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 9 種のクロロフィル f 産生シアノバクテリアのPSI,PSII 色素系の多様性と反応機構2024

    • 著者名/発表者名
      伊藤繁,北崎翔,大野智輝,山川壽伯,宮下英 明
    • 学会等名
      第65回 日本植物整理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 多種色素からなるアシドバクテリア C. thermophilum が持つI型反応中心の光捕集機構解析2024

    • 著者名/発表者名
      下岡渉、鬼頭宏任、伊藤繁、木村明洋
    • 学会等名
      第65回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] I型反応中心の光捕集機構の原理2023

    • 著者名/発表者名
      伊藤繁、鬼頭宏任、木村明洋
    • 学会等名
      第64回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 多様なI型反応中心の光捕集機構を理論で俯瞰する2023

    • 著者名/発表者名
      木村明洋、 鬼頭宏任、伊藤繁
    • 学会等名
      第13回日本光合成学会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 緑色硫黄細菌、ヘリオバクテリア、A. marina、T. elongatusのI型反応中心光捕集理論モデル2023

    • 著者名/発表者名
      木村明洋、鬼頭宏任、伊藤 繁
    • 学会等名
      第30回 光合成セミナー2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] I型反応中心3種の励起子モデルをベイズ最適化2023

    • 著者名/発表者名
      下岡 渉、鬼頭宏任、伊藤 繁、木村明洋
    • 学会等名
      第30回 光合成セミナー2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 光合成タンパク質における励起エネルギー移動の計算機シミュレーション2023

    • 著者名/発表者名
      鬼頭 宏任、下岡 渉、伊藤 繁、木村明洋
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ベイズ最適化による光合成I型反応中心3種の励起子モデルの修正2023

    • 著者名/発表者名
      下岡渉、鬼頭宏任、伊藤繁、木村明洋
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] I型光合成反応中心の多様性と光捕集機構2023

    • 著者名/発表者名
      木村 明洋、 鬼頭 宏任、伊藤 繁
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Auto Dock vina を用いたT. elongatus 光化学系Iのキノン結合サイトにおける分子結合シミュレーション2023

    • 著者名/発表者名
      高木歩夢、伊藤繁、木村明洋、鬼頭宏任
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 光合成反応中心内の色素が持つサイトエネルギーをアミノ酸単位で粗視化する試み2023

    • 著者名/発表者名
      松下 将典、鬼頭 宏任、伊藤 繁、下岡 渉、木村 明洋
    • 学会等名
      2023年度 生物物理学会中部支部討論会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] I型反応中心の光捕集機構の原理2023

    • 著者名/発表者名
      伊藤繁、鬼頭宏任、木村明洋
    • 学会等名
      第64回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ベイズ最適化によるI型反応中心の励起子ハミルトニアンの修正2023

    • 著者名/発表者名
      下岡 渉、木村明洋 、鬼頭宏任、伊藤 繁
    • 学会等名
      日本物理学会2023年春季大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 新発見の遠赤色光型光化学系Iを用いた光合成光捕集効率向上への計算機実験2023

    • 著者名/発表者名
      中村有花、大河内幹仁、伊藤 繁、木村明洋
    • 学会等名
      日本物理学会2023年春季大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 緑色硫黄細菌 I 型反応中心の励起状態の理論計算と主要 BChl-a 除去実験2022

    • 著者名/発表者名
      伊藤繁、木村明洋、鬼頭宏任、浅井智広、大岡宏造
    • 学会等名
      第12回日本光合成学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 遠赤色光型反応中心 A. marina PSI の 光捕集におけるクロロフィル d の役 割:クロロフィル a を持つ T. elongatus PSI との比較2022

    • 著者名/発表者名
      木村明洋、鬼頭宏任、青田俊道、浜口祐、米倉功治、川上恵典、新沢-伊藤恭子、井上-菓子野名津子、伊福健太郎、菓子野康浩、山下栄樹、伊藤繁
    • 学会等名
      第12回日本光合成学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 異なる色素種をもつ多様な光化学系I型反応中心上での励起エネルギー移動機構の理論的研究2022

    • 著者名/発表者名
      中村有花、下岡渉、鬼頭宏任、伊藤繁、木村明洋
    • 学会等名
      量子生命科学会第4回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Exciton states on the Type-I reaction center of green sulfur bacterium Chlorobaculum tepidum studied by genetic manipulation of bacteriochlorophyll a and the structure-based theoretical modeling2022

    • 著者名/発表者名
      Chihiro Azai, Hirozo Oh-oka, Hirotaka Kitoh-Nishioka, Akihiro Kimura, Shigeru Itoh
    • 学会等名
      International Congress on Photosynthesis Research 2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ヘリオバクテリア反応中心におけるChl-aFからBChl-gへの励起エネルギー移動速度の理論的解析2022

    • 著者名/発表者名
      下岡 渉、木村明洋 、鬼頭宏任、伊藤 繁
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 遠赤色光に適応した光化学系Iの光捕集におけるChlorophyll-fとRed-Chlorophyllの役割に関する理論的研究2022

    • 著者名/発表者名
      中村有花、大河内幹仁、伊藤 繁、木村明洋
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 緑色硫黄細菌の最小 I 型反応中心の光捕集機構:遺伝子操作的改変と理論的検討2022

    • 著者名/発表者名
      浅井智広、大岡宏造、伊藤繁、鬼頭宏任、木村明洋
    • 学会等名
      第64回 日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] クロロフィルdを持つ遠赤色光型反応中心 A.marina 光化学系Ⅰの光捕集機構に関する理論解析2022

    • 著者名/発表者名
      木村明洋, 鬼頭宏任, 青田俊道, 浜口祐, 米倉功治, 川上恵典, 新沢-伊藤恭子, 井上-菓子野名津子, 伊福健太郎, 菓子野康浩, 山下栄 樹, 伊藤繁
    • 学会等名
      日本物理学会 第77回年次大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chlorophyll f を含む遠赤色光型光化学系1の光捕集におけるRed-Chlorophyll の役割に関する理論的研2022

    • 著者名/発表者名
      中村有花、大河内幹仁、伊藤繁、木村明洋
    • 学会等名
      日本物理学会 第77回年次大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヘリオバクテリアI型反応中心の光捕集機構の理論解析:光化学系Iとの機能的差異2021

    • 著者名/発表者名
      木村明洋, 鬼頭宏任, 重田育照, 伊藤繁
    • 学会等名
      第11回日本光合成学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] I型光合成反応中心の構造と機能の多様性:ヘリオバクテリア反応中心と光化学系Iとの比較2021

    • 著者名/発表者名
      木村明洋, 鬼頭宏任, 重田育照, 伊藤繁
    • 学会等名
      第28回「光合成セミナー2021
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 細菌と植物のもつ多様な光合成 I 型反応中心の光捕集機能に関する比較2021

    • 著者名/発表者名
      村明洋、鬼頭宏任、浜口祐、米倉功治、川上恵典、菓子野康浩、浅井智広、大岡宏造、伊藤繁
    • 学会等名
      量子生命科学会 第3回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] A. marina の光化学系 I の光捕集機構:T. elongatus の光化学系 I との比較2021

    • 著者名/発表者名
      木村明洋,鬼頭宏任,浜口祐,米倉功治,川上恵典,菓子野康浩,伊藤繁
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヘリオバクテリア I 型反応中心と PSI の in silico モデル比較 : 色素サイトエネルギー分布と励起移動2021

    • 著者名/発表者名
      木村明洋, 鬼頭宏任, 重田育照, 伊藤繁
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] ヘリバクテリアI 型反応中心とPSIのin silico モデル比較 : 色素サイトエネルギー分布と励起移動2021

    • 著者名/発表者名
      木村明洋, 鬼頭宏任, 重田育照, 伊藤繁
    • 学会等名
      生物物理学会中部支部会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] ヘリオバクテリアI型反応中心の光捕集機構の理論解析:光化学系Iとの機能的差異2020

    • 著者名/発表者名
      木村明洋, 鬼頭宏任, 重田育照, 伊藤繁
    • 学会等名
      日本物理学会 2020年 秋季大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] ヘリオバクテリアI型反応中心と光化学系Iにおける光捕集機能の解析と比較2020

    • 著者名/発表者名
      木村明洋, 鬼頭宏任, 重田育照, 伊藤繁
    • 学会等名
      量子生命科学会 第2回大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2026-01-16  

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