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イチイ科植物タキサジエン代謝系遺伝子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 20K06686
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関京都大学

研究代表者

草野 博彰  京都大学, 生存圏研究所, 研究員 (80447929)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード二次代謝 / メタボローム解析 / トランスクリプトーム解析 / NPF輸送体 / BAHDアシル基転移酵素 / イチイ / タキサジエン系化合物 / メタボローム分析 / シトクロムP450 / 生合成酵素 / 膜輸送体 / メタボローム
研究開始時の研究の概要

植物特化代謝経路の成立には細胞内での空間的制御が必須だが、生合成酵素および膜輸送体といった具体的な実体を伴った説明は未だなされていない。本研究ではイチイ科植物のタキサジエン系化合物群をモデルとし、その生合成系酵素および膜輸送体を同定することで空間的制御の実体的な理解を目指す。生合成酵素や膜輸送体はその基質特異性により生合成経路の空間的制御に選択性を与える鍵である。本研究では独自開発のイチイの形質転換技術、高効率ゲノム編集システム、メタボローム分析法などを組み合わせることでイチイの遺伝子欠損体を使った遺伝子機能の解析を行い、これらをコードする遺伝子を同定する。

研究成果の概要

イチイが産生するタキサジエン系化合物には抗がん薬として利用されるパクリタキセルやその類縁薬品の原料となる中間体化合物が含まれる。この化合物群の生合成の仕組みについては未解明な部分が多く、目下パクリタキセルの安定供給を目指す研究開発の主要な障壁となっている。本研究では細胞内区画の利用に関わる輸送体や生合成酵素をコードする遺伝子の同定を目的とした。生物情報学と合成生物学を駆使した手法で輸送体3種と新規酵素遺伝子2種を同定し、酵母での反応系を大幅に改善した。これらの成果は、新たに開発した解析手法の有効性を示したと同時に、合成生物学的な技術開発に資すると考えられる。

研究成果の学術的意義や社会的意義

タキサジエン系化合物の生合成に関する未解明部分は抗がん薬パクリタキセルの持続的供給を目指す研究開発の障壁となっている。イチイは遺伝子研究が困難な木本植物であるため、研究基盤の整備が重要な課題であるほか、異種生物での生合成の再現が主な研究目的として想定される研究対象である。本研究ではゲノム・メタボローム等の大規模情報とその解析ツール群を開発し、酵母で機能する遺伝子セットの解明と、反応系の最適化に成功した。これらの成果は今後の遺伝子同定研究に大きなヒントを与えるほか、パクリタキセルの合成生物学的生産技術開発に資する成果であると考えられる。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 1件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 1件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Creation of a potato mutant lacking the starch branching enzyme gene <i>StSBE3</i> that was generated by genome editing using the CRISPR/dMac3-Cas9 system2021

    • 著者名/発表者名
      Takeuchi Ami、Ohnuma Mariko、Teramura Hiroshi、Asano Kenji、Noda Takahiro、Kusano Hiroaki、Tamura Koji、Shimada Hiroaki
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology

      巻: 38 号: 3 ページ: 345-353

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.21.0727a

    • NAID

      130008091560

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • 年月日
      2021-09-25
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Overexpression of rice OsLEA5 relieves the deterioration in seed quality caused by high-temperature stress2021

    • 著者名/発表者名
      Miyazaki Kaho、Ohkubo You、Yasui Hiroto、Tashiro Ryoka、Suzuki Rintaro、Teramura Hiroshi、Kusano Hiroaki、Shimada Hiroaki
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology

      巻: 38 号: 3 ページ: 367-371

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.21.0603a

    • NAID

      130008091605

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • 年月日
      2021-09-25
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A simple method for <i>in planta</i> tomato transformation by inoculating floral buds with a sticky <i>Agrobacterium tumefaciens</i> suspension2021

    • 著者名/発表者名
      Honda Chika、Ohkawa Kaoru、Kusano Hiroaki、Teramura Hiroshi、Shimada Hiroaki
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology

      巻: 38 号: 1 ページ: 153-156

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.20.0707a

    • NAID

      130008002845

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • 年月日
      2021-03-25
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of novel SUMO family genes in the rice genome2021

    • 著者名/発表者名
      Teramura Hiroshi、Yamada Kazuma、Ito Kahori、Kasahara Keisuke、Kikuchi Tsubasa、Kioka Naoya、Fukuda Masato、Kusano Hiroaki、Tanaka Katsunori、Shimada Hiroaki
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 96 号: 1 ページ: 25-32

    • DOI

      10.1266/ggs.20-00034

    • NAID

      130008035879

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 年月日
      2021-02-01
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dissection of a rice OsMac1 mRNA 5’ UTR to uncover regulatory elements that are responsible for its efficient translation2021

    • 著者名/発表者名
      Mutsuro-Aoki Hiromi、Teramura Hiroshi、Tamukai Ryoko、Fukui Miho、Kusano Hiroaki、Schepetilnikov Mikhail、Ryabova Lyubov A.、Shimada Hiroaki
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 16 号: 7 ページ: e0253488-e0253488

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0253488

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] AtFLL2, a member of the FLO2 gene family, affects the enlargement of leaves at the vegetative stage and facilitates the regulation of carbon metabolism and flow2020

    • 著者名/発表者名
      Sato Nonoka、Kihira Miho、Matsushita Ryoko、Kaneko Chihiro、Ishii Yohei、Yin Yong-Gen、Kawachi Naoki、Teramura Hiroshi、Kusano Hiroaki、Shimada Hiroaki
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 84 号: 12 ページ: 2466-2475

    • DOI

      10.1080/09168451.2020.1812374

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Apple latent spherical virus (ALSV)-induced gene silencing in a medicinal plant Lithospermum erythrorhizon2020

    • 著者名/発表者名
      Izuishi Yuki, Isaka Natsumi, Li Hao, Nakanishi Kohei, Kageyama Joji, Ishikawa Kazuya, Shimada Tomoo, Masuta Chikara, Yoshikawa Nobuyuki, Kusano Hiroaki, Yazaki Kazufumi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 13555-13555

    • DOI

      10.1038/s41598-020-70469-1

    • NAID

      120007175169

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 生データの目視でメタボロミクスをするためのツールGrassHopperのご紹介2022

    • 著者名/発表者名
      草野博彰
    • 学会等名
      質量分析インフォマティクス研究会・第7回ワークショップ
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] イチイ培養細胞と酵母を使ったタキサン化合物生合成系の開発2022

    • 著者名/発表者名
      草野博彰、南洋、加藤義博、金沢香織、李豪、飛松裕基、杉山暁史、多葉田誉、矢崎一史
    • 学会等名
      第39回日本植物バイオテクノロジー学会(堺)大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 新規LC-MSデータ解析ツールGrassHopperを用いた植物代謝物の解析2021

    • 著者名/発表者名
      草野博彰、南洋、加藤嘉博、金沢香織、李豪、杉山暁史、多葉田誉、矢崎一史
    • 学会等名
      第38回日本バイオテクノロジー学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ジャガイモのアミロペクチン合成に関わるデンプン枝つけ酵素遺伝子欠損変異体の作出と形質の評価2021

    • 著者名/発表者名
      竹内亜美、浅野賢治、野田高弘、草野博彰、大沼万里子、高橋史憲、田村浩二、島田浩章
    • 学会等名
      第38回日本バイオテクノロジー学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 新しいLC-MSデータ解析ツールGrassHopperを用いた植物代謝物の解析2021

    • 著者名/発表者名
      草野博彰、南洋、加藤嘉博、金沢香織、李豪、杉山暁史、多葉田誉、矢崎一史
    • 学会等名
      第31回イソプレノイド研究会例会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] A metabolomic approach for the functional analysis of taxane compound transporters from yew2021

    • 著者名/発表者名
      Kusano Hiroaki, Minami Hiroshi, Kato Yoshihiro, Kanazawa Kaori, Sugiyama Akifumi, Tabata Homare, Yazaki Kazufumi
    • 学会等名
      The 62nd Annual Meeting of the Japanease Society of Plant Physiologists
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] LC-MSデータ解析ツールGrassHopper

    • URL

      https://github.com/kusano-kyotouniv/GrassHopper

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [産業財産権] イチイ属の毛状根の製造方法2020

    • 発明者名
      南洋、草野博彰、矢崎一史、加藤義博、多葉田誉
    • 権利者名
      南洋、草野博彰、矢崎一史、加藤義博、多葉田誉
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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